Bacteroides mucinivorans: VCM39_10040
Help
Entry
VCM39_10040 CDS
T11858
Name
(GenBank) lipopolysaccharide biosynthesis protein
Organism
bmuc Bacteroides mucinivorans
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt
DUF412
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XNS72656
LinkDB
All DBs
Position
complement(2725663..2727171)
Genome browser
AA seq
502 aa
AA seq
DB search
MVTKKTLINNSLSGLVQLIITALLTFICIPVFINKLGVELYGVFAIVSVIGNLNIFANLG
LNTSLIKYISEQGKCPDSENDIFSSLLIIGVIIIPITILAFILNRFLLIDVLNIPIQYYE
QTKTLLFSLLISNFLLIVGQILTAVLDALQKIYLTNFAQLIYSIIYWGGIICVTSLGYNL
ESIGWAVFIAAASWFLFVIGSFYVYWGPIKPYKLRQQFIPVAKKQLLFGGKVYTSGLIGF
CNEPLFKIIVSNIFGMHVVAYLEIALKVRVQLTSIFSKLTMPLLPYLSQLTDKQSIAKLI
KDLTSKLFLLVLPVCGMLFVGCEEIVSLWLRTDIFNYTIFIIGLVVPYLIFSPLTLPIYI
YLTAKGHPGKTVVFQSLSVVINICVFFILYKFTNEYTIIISNILSYFVSYLLGLYYQKKY
LAIHYKMNRSYMLKILILISIFMVIYFLKFYISSDILKLLFISISIPVMTIWIYKHLKIV
TIDDLTRYFSDSKIANRIYKII
NT seq
1509 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaccaaaaagacattgataaataattctttaagtgggttagtgcagcttattata
actgcactacttacttttatatgtattcctgtttttatcaataaattaggagtcgaatta
tatggagtatttgctattgtgtctgtaattgggaatctgaatatattcgcaaacttggga
ttaaatacttcactaataaaatatatttccgaacaaggtaaatgtccggattcagaaaat
gatattttttcttcattattaattattggggttataatcatacctattacaatattagcc
ttcatacttaatcgatttctactaatagacgtattaaatatcccaatacaatattatgaa
cagacaaaaacattactattttcactcctaatctctaactttttattaattgtaggacaa
attctcacagcagtacttgatgctttgcaaaaaatataccttactaattttgctcaatta
atctatagtatcatttattggggaggaattatatgtgtaacgagtttgggatataacctt
gaaagcatcggttgggctgtatttatagcagccgctagttggtttctatttgtaattggt
tccttttacgtctactgggggcctataaagccttacaagcttcgacaacaatttatccct
gtagccaaaaaacagttattgtttggaggtaaagtatatacctccggtcttatcggtttt
tgtaacgaacctctatttaaaataatagtatcaaacattttcgggatgcatgtggttgct
tatcttgaaattgcattaaaagtaagagtccaattaacaagtatattttccaagttaact
atgccattgcttccatacttatctcagttaacagataaacaatcaatagccaaattaata
aaagacttaacctccaaactatttcttttagtattgcctgtttgtggtatgttatttgtc
ggatgtgaagagattgttagtttatggcttcgtaccgatattttcaattataccatcttc
atcataggcttagttgttccatatttaatattttcaccattgactttacctatatatata
tatctaactgctaaaggccatccgggtaaaaccgttgtttttcaatcactttctgtcgtc
attaatatttgtgtattttttatactttataaatttacaaatgaatacacaattattatt
tctaatattctttcgtattttgtcagttatttattagggctttattatcaaaaaaaatat
ttagccattcattataaaatgaaccgttcatacatgctaaaaatacttattctaatctca
atattcatggttatttattttttgaaattttatattagctctgatattttaaaactatta
ttcatctctataagtattccagttatgaccatatggatatacaagcatctaaagattgta
actattgatgatttaacaagatatttttccgatagtaaaattgctaatcgtatttataag
ataatataa
DBGET
integrated database retrieval system
