Halobacteriovorax marinus: BMS_0540
Help
Entry
BMS_0540 CDS
T01659
Name
(GenBank) putative PE-PGRS family protein
Organism
bmx
Halobacteriovorax marinus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PDR_CDR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBW25451
UniProt:
E1X4M1
LinkDB
All DBs
Position
561880..563499
Genome browser
AA seq
539 aa
AA seq
DB search
MNNSRTKTTWKHYLIAAGFTLTHSMIASADQGVFSDCQYAGESKEMCYKMVMASEYGGEI
DCVECLFYEQPEQNKLAETLGVVAGPLAFLGASYFGAKYQYKGQKAWANAYEAGHTACTT
RFNSYLNYSTERGATPISPGDAESFASSCGAGGSLGIGGGYGGYGGMYGNGYGGFGNPFL
SAGYSPGFMGGMMGPNFGGGIYGGFGGGNMGFGGGLGLGLGLGAMNGLFGNGSGLGGGIN
IGIGGGIGMGGGLGMGGMYPGGFGMGGNPYGGIYGGIGGGFGYPGMGGGVYGPGLGGGIN
IGLGGGLGGLGGGMGYPGMGGGLGGGINIGLGGGLGGLGGGMGYPGMGGGIYGGVGYPGM
GGGIYGGAGYPGMGGIYGGAGYPGMGGIYGGGYPGGGLYNNGMGGIYGAGILPGSMGLNP
WGAGGANGSYWNNSGGWNGGLNNGMYSQYQQQMQQQYQQNADIQGQVQAGYARAQGNQIT
SQAANQALYQNYQNAAQDLYSNSYYGGGNTINPYANGSMYSVGNLGLNFGVNAGGYVGF
NT seq
1620 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataactcaagaacaaagacaacatggaagcactatctaatcgcagcaggctttacg
ttgactcattccatgattgcttcggctgatcaaggtgtgtttagcgattgccaatacgct
ggggaaagtaaagagatgtgttacaaaatggtcatggcttctgaatatgggggtgaaatt
gactgtgttgagtgtttattctacgaacagccggagcaaaataagcttgctgaaactctt
ggtgttgtggccggaccactagcgtttttaggcgcttcatatttcggtgctaaatatcaa
tataaaggtcaaaaggcttgggccaatgcttatgaagctggtcatactgcttgtactaca
agatttaattcatatttaaattactcaactgaaagaggggccactccaatttcaccagga
gatgcagaatcatttgcaagctcgtgtggtgctggaggatctcttggtatcggtggaggc
tacggcggttacggtggaatgtacggtaatggctatggtggtttcggaaatccatttctc
tcggcgggatattctcctggctttatgggtggaatgatggggccaaactttggtggcgga
atttacggtggatttggcggcggaaatatgggcttcggtggaggtctagggcttggactt
ggtctaggtgctatgaatggattatttggaaatggaagcggcctaggtggaggcattaac
attggtatcggtggtggcatcggtatgggtggtggccttggaatgggtggaatgtatcca
ggtggtttcggtatgggtggtaatccatacggtggaatctatggaggcattggcggtgga
tttggttatccaggaatgggtggcggagtttacggcccaggactcggtggcggaattaat
attggtctaggcggtggtctaggtggtctcggcggaggtatgggttaccctggaatgggt
ggcggccttggcggaggaattaatattggtctaggcggtggtctaggtggtctcggtgga
ggtatgggttatccaggaatgggtggcggaatctacggtggagtaggttacccaggtatg
ggtggcggaatctatggtggagccggatatccaggaatgggcggaatctacggtggagcc
ggatatccaggaatgggtggaatctatggtggaggatacccaggtggtggactttataat
aatggaatgggtggcatctatggtgcgggaattcttccaggttcaatgggattaaaccct
tggggagctggtggagctaacggttcatactggaataactctggtggctggaacggtggt
ctcaataatggaatgtacagtcagtaccaacaacaaatgcagcaacaataccaacagaat
gctgacattcaaggtcaggttcaagcaggatatgcaagagcacaggggaatcagattaca
agccaagcggcaaatcaggcgttgtatcagaactatcagaatgcggcacaagacctctac
tctaattcatattacggcggtgggaatacaatcaatccatacgcaaatggatcgatgtac
tcagttggtaatttaggtctaaactttggcgttaatgctggaggatatgtaggcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system