KEGG   Brugia malayi (filaria): BM_BM6122
Entry
BM_BM6122         CDS       T01050                                 
Symbol
Bma-hmr-1
Name
(RefSeq) Cadherin domain containing protein
  KO
K27892  neural-cadherin
Organism
bmy  Brugia malayi (filaria)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bmy00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04515 Cell adhesion molecules [BR:bmy04515]
    BM_BM6122 (Bma-hmr-1)
Cell adhesion molecules [BR:bmy04515]
 Cadherins
  Cadherin related
   BM_BM6122 (Bma-hmr-1)
SSDB
Motif
Pfam: Cadherin RET_CLD1 Cadherin_pro FN3_Tor_3rd Cadherin_CELSR2_9th
Other DBs
NCBI-GeneID: 6100202
NCBI-ProteinID: XP_042935799
UniProt: A0A4E9FH62
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1743 aa
MLYFWLILHLNIIYLISDIGCYQDKPKIFTVRSDAPLGWLISDLVEDGHCPWYGHCLLHT
SNQSHYFQIINNRLCTKKSIRQLENRSVAIMMMEITTKPEQIFIVNVNIARNSTPSFSFD
IYNITLENDITPEMMIPFETDITMVNVSNSTDLQISIISNSTNLPFILTHNRKQNIHCAK
LYVSRRLKSTDETFRSFYIGALDKHNLIRLAVARIDVNFKKLPISGPKFSNMNYFRQFDK
LSPHVTVLRVTAKSSKGTVVYRIEPENVPFDVTPFSGNVFSRYGISNGEYFFNIIATDSF
AQEARANVRILIGSRIDPKRQFKKLKSKGTRHRRSRKDFGDEIVLTLKENHPIGLLEEKI
NLRPDEKVIFAPATTDYLKIHGNGLIELIKPLNYEFEMSHQAAVQISGMFKVRVQMIRME
VLDVDEPPTFLNGPKPYKAVVAYDQPIGMHIYKFVARDEAGDGDDNVEYRLINTEPRGTF
TVDPVSGVVQTALKHYKPGETYRIFVQARDRTPTDPEISQDSEVAVLEVFAGDRAPQFVE
QQYTVLVPENTEIGSSIIAIRAECFKPIDKRRSKGKLSYQLYLDTSLTERELSSYFTIDA
ESGLVQLTKALDYDDDTLPKHHQLKVIAQEDGRESEVPLDIYIKDINDNIPIFTQPIYSA
TIKEDIPTGYTILTVEADDKDNGENARIRYTLDDDNFIINDQGEISAGRRLDADQNRERF
FIYRFNVTATDYGEPSLSSSAMVHIRTENSNDEAPIFIPNATYHAFVAEDAQSGTPIVQI
QAIDPDRDQVFYAFLLSNGEETSATELFEIDRDTGLIRLGLNVKPEDLLHEESPYNLTIV
ARDDGSCCGDDASELHMQTATVTIDIADVNNNKPEFRSCDTYSNIAKIEEGDYKTNAPVI
LKVVATDEDSPPNGEIVYSLYYSQSESRKPFVINPETGELRPSPFVRFDREQRTQEEVTV
KATDKGERPLIGFCQFTVQVLDINDNAPQFDRSFYETSISRNVDIGYSVITVFADDADAP
QNARITYSLAEDTLAEKEHHKDFEFFQIINENSGEISLANQIPSYKDRFVFNVIADDHGV
PFAQRSAVQVVVNVHEKQQSAPQWQTTDECKTTVVVDEDIPINSVLFRCLAIPGDGPKSP
ISYKMANGASRGTNHEMHFREFLEKTNGRDWVVVRNMIGLDYEQQQNYTLTITAMDMRSL
ITSDKQLHVIVRDKNDAVPRFTVDLFTGTIEEEQTPKEFLTKYNGNPIAVVKAEDADSPG
PQSEVRYRIISDGDSGAARLFRIDELTGGIFPLEIFDREKNDSFIFDVEARDNVPSSLPG
ASGPNKDIVKVQIFVIDINDNPPYFEQTRYEARVAENEGINEDVITVKAYDLDRLPNLKY
DLYGVYGGRIPFGVRTDSGAIFIKEPLDYEKENVYHMKLFVTDGKHNATTDLYVYIDDVN
DNAPQFEKDLYEITIFEEDRDIPKTLFIVRATDADKQDESSKIVYRLEGQGVGEFFRVDQ
YSGDIEVIRPLDRDPPAGVSVWKFIVQAIDDNGHGLIGYADVQVNLRDINDNAPIFASNL
FGTIDENRDPGDEGVFVMTVTATDYDDPRTDNARLEYSIVINKEIDGEPVFRIVPSNGKI
YAMRKMDRELPSEKQFVIEIRAIDKGIPSLEGIGNVTIRVIDVNDNEPYFDKELYVGSVV
ETASIGSAVISVSALDKDTEAIDNIFIYELMDEHQYFYVTTETGSSSTSVGVLRVKKVFF
MLN
NT seq 5232 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctgtatttctggctcattcttcacctaaatatcatttatttgatttcagatattgga
tgttatcaagataagccaaaaattttcactgttcgatcagatgcgccattaggatggctt
atctctgaccttgttgaagatggacattgtccatggtatggtcattgcttattgcacacc
tcaaatcagtcgcattattttcaaatcattaataataggttatgtacaaaaaaatcaata
agacagctagaaaatcgatcagtagctattatgatgatggaaattacaacaaaaccagaa
caaatatttattgttaatgtgaatattgcaagaaattcaacgccatctttttcatttgat
atatacaatattaccttggaaaatgatatcacacctgaaatgatgattccatttgaaaca
gacataacaatggtgaatgtatctaattcaacagatctacaaatatcaattatttcaaat
tcaacaaatttaccttttatactcactcataacaggaagcaaaatattcattgtgcaaag
ttatacgtttcacgtcgattgaagtcaactgacgaaacttttcgatcattttatatcggt
gcattagataagcataatttgattcgtttggcggtagcacgaattgatgtcaatttcaaa
aaattgcccataagtggacccaaattcagtaatatgaattactttagacaatttgataag
ctatcacctcatgtgactgtactaagagttacagcaaaatcatcaaaaggtactgttgta
tatcgaattgaaccggaaaatgttccattcgatgttacacctttttccggtaatgtattc
agtcgttatggtatatcaaatggcgaatatttttttaatattattgctactgattcattt
gcacaggaagcacgtgctaatgttcgaattttgattggttcacggattgatccaaaacga
caattcaaaaaattaaaaagtaaaggtacacgtcatcgacgtagtagaaaagattttggt
gatgaaattgtgctaacactaaaagaaaatcatccaattggattactggaagagaaaata
aaccttcggcctgacgagaaggttatctttgcgccagcaacaacggattatcttaaaata
catggtaatggattaatagagcttatcaaacctttgaattatgaattcgaaatgtcgcat
caagcagctgtacagattagcggtatgttcaaagttcgtgtacaaatgataagaatggaa
gtattagatgtagacgaaccgccaacatttctaaatggaccaaagccatataaagctgtg
gtagcatatgatcaaccaattggaatgcatatttataaatttgttgctcgtgatgaagca
ggtgatggtgatgataatgttgaatatcggcttatcaataccgaacctcgaggtacattt
acggttgatccagtaagtggtgtggtgcaaacagcattgaaacattataaaccaggtgaa
acctaccgtatttttgttcaggcacgagatcgaacaccaacagatcctgaaatttcgcag
gatagtgaagttgcagtactggaagtatttgctggtgatcgtgcaccgcaatttgttgag
caacagtatacagttcttgttccggaaaatactgaaattggctccagcataatagctatc
agagcagaatgttttaaaccaattgataagcgacgtagcaaaggtaaattatcatatcaa
ttatatttggatacaagtttaactgaacgtgaattatcatcatactttacaattgatgct
gaaagtggcttagttcaattgacaaaagcgcttgattatgatgatgatacactaccaaag
catcatcaattaaaagttattgcgcaagaagatggtcgagaaagtgaagtaccattagat
atttatataaaagatatcaatgataatattcctatctttacacaacctatctatagtgct
acaattaaagaagatataccaactggttatacgattcttacagtggaagcagatgataaa
gataatggtgaaaatgctcgaattaggtataccttagatgatgataactttataatcaat
gatcaaggtgagatatcagctggcagacgtcttgacgctgatcaaaatcgagaacgcttc
ttcatttatcgttttaatgttaccgcaactgattacggtgaaccatcattaagtagtagt
gctatggtacatattcgtacagaaaattcaaatgatgaagcaccaattttcattcctaat
gcaacttatcatgcatttgttgctgaagatgctcaaagtggtacaccaatagtacaaatt
caagcaattgatccagatcgagatcaggttttctatgcatttctattatcaaatggtgaa
gaaacatcagcaactgaattatttgaaattgatagagatacaggattgattagacttgga
ttaaacgtaaaaccggaagatcttttacacgaagaatcaccgtacaacctgacaatagtg
gcacgagatgacggatcatgctgcggagatgacgcaagtgaacttcatatgcaaactgct
acggttactattgatatcgcagatgtaaacaacaacaaacctgaatttcgtagttgtgac
acttatagtaatatagcaaaaattgaagaaggtgattataaaactaatgcaccagttatt
ttaaaggtagttgcaacagatgaagattcaccaccaaacggagaaattgtgtattcgtta
tattattcacagtctgaatctcgtaaaccgtttgtcataaatcctgaaacaggtgaactg
agaccatcaccatttgtgcgctttgatcgtgaacaaagaacgcaagaagaagttacagta
aaagcaacagataaaggtgaaagaccattgataggcttttgtcaatttactgtacaagtt
cttgatataaatgataatgcgccacaatttgatcgatcattttatgaaacttcaatctcg
agaaatgttgacatcgggtattcggtgataacagtctttgcggatgatgcggatgcgcca
cagaatgctcgaattacttactcattagctgaagatacgttagctgaaaaggaacatcac
aaagattttgaattttttcaaataattaatgaaaatagtggtgaaatttcgttagctaat
caaattccatcatataaagatcgttttgtttttaacgttatagcagatgatcatggagta
ccatttgcgcaacgaagtgcagtgcaagttgttgtgaatgttcatgaaaagcaacaaagt
gcgccacaatggcaaacaactgatgaatgtaagacaacagttgtagtggacgaggatatt
cctattaattcggtgctttttcgttgcttagcaattccaggtgatggtccaaagagtcca
atttcatataagatggcaaatggtgccagtcgtggtaccaatcatgaaatgcattttcgt
gaattcctggagaaaacaaatgggcgagattgggttgttgttagaaatatgattggatta
gattatgagcaacaacagaattatactttaacaataactgctatggatatgcgtagtttg
ataacatctgataagcaacttcatgttatagtacgtgataagaatgatgcagttccacga
tttacggttgatcttttcacgggtaccattgaagaagaacaaacaccaaaggaatttctt
actaaatacaatggtaatcctatagcggtagttaaagcagaggatgcagattctccggga
ccacaatcagaagtacgttaccggattattagtgatggtgatagcggtgcggcacgatta
ttccggattgatgagttaactggtggaatatttccacttgagatttttgatcgagaaaaa
aatgattcatttatatttgatgttgaagcacgtgataatgttccatcaagtttacctggt
gcttcaggaccgaataaagatattgttaaagtacaaatttttgtgattgatatcaatgat
aatccaccatattttgagcaaactcgttatgaggctcgagttgctgaaaatgagggaatt
aatgaagatgtaattacggtgaaagcatatgacttagatcgattgccaaatcttaaatat
gatttatatggtgtatatggtggacgaataccattcggtgttcgaaccgattccggtgca
atttttattaaagaaccacttgattatgaaaaggaaaatgtatatcatatgaaactattc
gtaacagatggtaaacataatgctacaacggatttgtatgtttacattgatgatgtaaat
gataatgcacctcaatttgagaaggatttatatgagattacaatatttgaggaagaccga
gatataccgaagacattgttcattgtcagagctaccgatgctgataagcaagatgaatca
tcaaaaattgtttatcgtctcgaaggacaaggtgttggcgaattctttcgggttgatcaa
tatagtggtgatattgaagtgataagaccgcttgatcgtgatcctccagctggtgtatct
gtttggaagtttattgtacaagcaattgatgataatggtcatggattgattggttacgct
gatgtacaggtgaatttacgcgacattaatgataatgcaccaatatttgctagtaattta
tttggaacaattgatgaaaatcgtgatcctggagatgaaggagtgtttgtgatgacagtt
acagcaacagattatgatgatccacgaactgataatgctcgacttgagtatagcattgtg
ataaataaagaaattgatggtgaaccagttttccggattgttccaagtaacggaaaaatt
tatgctatgcgaaaaatggatcgtgaattgccatccgaaaaacaatttgttattgaaatt
cgagctattgataaaggcataccatcacttgaaggaataggaaatgtgacaattcgagtg
atagatgtaaatgataatgagccatattttgataaggaattatatgttggatcagttgtg
gaaactgcatcaattggttcagcagttattagtgtatctgctttagataaagatactgaa
gcaattgataatatttttatctatgaattaatggatgaacatcaatatttttatgtgaca
acagaaactggttcaagtagtacaagtgttggagttcttcgagttaaaaaggttttcttc
atgttaaattag

DBGET integrated database retrieval system