Brassica napus (rape): 106388035
Help
Entry
106388035 CDS
T04128
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
bna
Brassica napus (rape)
Pathway
bna03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bna00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
106388035
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
bna03019
]
106388035
Messenger RNA biogenesis [BR:
bna03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
106388035
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_RdRP1_2
OB_RNB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106388035
NCBI-ProteinID:
XP_013683459
UniProt:
A0A816I590
LinkDB
All DBs
Position
C3:10563438..10565450
Genome browser
AA seq
406 aa
AA seq
DB search
MESDQGKLFIGGISWDTDENLLKEYFANYGEVLQVTVMREKATGRPRGFGFVAFSDPAVI
DRVLQEKHHIDNRDVDVKRAMSREEQSPGGRPGGFNASRSFDSGANVRTKKIFVGGLPPA
LTSDEFRAYFETYGPVSDAVIMIDQATQRPRGFGFVSFDSEDSVDLVLHKTFHDMNGKQV
EVKRALPKDANPGIAGGGGGRGGSGGFPGYGGSGYEGGRVDSSNRYMQPQNAGSGYPPYG
ASGYGTGYGYGSNGVGYGGFGGYGNPAGAPYGNPAGVPGAGFGSGPRSSWGGQAPSGYGN
VGYGNAAAPWVGGSGPGSAVMGQGGGASAGYGSSQGYGYGGNDSSHGAPSGYGAVGGRPG
SMPNSHSGGYADGSDGSGGYGNLNHQGNGQVGYGGGYGNGRQAQQQ
NT seq
1221 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatcagatcaggggaagctgtttatcggcgggatttcatgggacaccgacgagaat
ctcctgaaagagtacttcgccaattacggcgaggttttgcaagtgacggtgatgcgagag
aaagctacaggtcgtcctcgaggattcggattcgtcgcgttctccgatcccgccgtcatt
gatagggttcttcaggagaagcaccacatcgataacagagatgttgatgtgaagagagca
atgtctagagaagagcagagtcctggtggaagaccagggggttttaatgcttctaggagt
tttgatagcggcgctaacgttcgtaccaagaagatattcgtcggaggtttgcctcccgct
ttgacatcagacgagtttcgggcctacttcgagacgtacggccctgttagcgatgcagtc
attatgattgaccaggcaacacagcgtcctagagggtttgggtttgtttcgtttgactct
gaggattctgttgaccttgttttgcacaagactttccacgatatgaatggtaaacaagta
gaagtcaaaagagctcttcctaaagatgctaatcctggaatagctgggggagggggtggt
cgtggtggctctggaggtttcccggggtatggtggaagtggctatgagggtggtcgtgtt
gattcgagtaatagatacatgcagcctcaaaacgctggaagtggttatcctccttatggt
gcttctgggtatggtactggttatggttatggcagcaacggtgtaggttacggcggtttt
ggagggtatgggaatccagctggtgcgccttacgggaatccagctggtgtccctggagct
gggtttggaagtggtccaagaagttcatggggaggccaagctccatcgggttacggtaat
gtgggatatggaaatgctgctgctccgtgggttggtggttcgggtcccggttcagcagtg
atgggtcaaggaggaggtgcttctgcaggttatggcagtagtcaaggttatggctatggt
ggaaatgattcgtctcatggggctccatctggttatggtgcagttggtggacggcctgga
agtatgcctaatagccatagcggtggctatgctgatggttcagatggctctggaggctat
gggaatctgaatcaccaagggaatgggcaagttggttatggtggaggttatggaaatggt
aggcaagctcaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
