Brassica napus (rape): 106437798
Help
Entry
106437798 CDS
T04128
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
bna
Brassica napus (rape)
Pathway
bna03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bna00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
106437798
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
bna03019
]
106437798
Messenger RNA biogenesis [BR:
bna03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
106437798
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
OB_RNB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106437798
NCBI-ProteinID:
XP_048631089
LinkDB
All DBs
Position
A3:8056019..8058010
Genome browser
AA seq
408 aa
AA seq
DB search
MESDQGKLFIGGISWDTDENLLKEYFANYGEVLQVTVMREKATGRPRGFGFVAFSDPAVI
DRVLQEKHHIDNRDVDVKRAMSREEQSPGGRPGGFNASRSFDSGANVRTKKIFVGGLPPA
LTSDEFRAYFETYGPVSDAVIMIDQATQRPRGFGFVSFDSEDSVDLVLHKTFHDMNGKQV
EVKRALPKDANPGIAGGGRGGSGGFPGYGGGSGGSGYEGGRVDSSSRYMPPQNVGSGYPP
YGASGYGTGYGYGSNGVGYGGFGGYANPAGAPYGNPAGVPGAGFGSGPRSSWGGQAPTGY
SNVGYGNAAAPWVGGSGPGSAVMGQGGGASAGYGSSQGYGYGGNDASYGAPSGYGAVGGR
PGSMPNSHGGGYADGSDGSGGYGNLNHQGNGQAGYGGGYGNVRQAQQQ
NT seq
1227 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatcagatcaggggaagctgtttatcggcgggatttcatgggacactgacgagaat
ctcctgaaggagtacttcgccaattacggcgaggttttgcaggtgacggtgatgcgagag
aaagctacaggtcgtcctcgaggattcggattcgtcgcattctccgatccagctgtcatt
gatagggttcttcaggagaagcaccatatcgataatagagatgttgatgtgaagagagca
atgtctagagaagagcagagtcctggtgggagaccagggggttttaatgcttctaggagt
tttgatagcggcgctaacgttcgtaccaagaagatatttgtcggaggtttgcctcccgct
ttaacatcagacgagtttcgggcctacttcgagacttacggccctgttagcgatgcggtc
attatgattgaccaggcaacacagcgtcctagagggtttggttttgtttcatttgactcg
gaggattctgttgaccttgttttgcacaagactttccacgatatgaatggtaaacaagta
gaggtcaaaagagctcttcctaaagatgctaatcctggaatagctgggggtggtcgcggt
ggctctggaggtttccccggatatggtggtggttctggtggaagtggctatgagggtggt
cgtgttgattcgagtagtagatacatgccgcctcaaaacgttggaagtggttaccctcct
tatggtgcttctgggtatggtactggttatggttatggcagcaacggtgttggttacggc
ggttttggagggtacgcgaatccagctggtgcgccatacgggaatccagctggtgtccct
ggagctgggtttggaagtggtccaagaagttcatggggaggacaagctccaacgggttac
agtaatgtgggatatggaaatgctgctgctccgtgggttggtggttcgggtcccggttca
gcagtgatgggtcaaggaggaggtgcgtctgcaggttatggcagtagtcaaggttatggc
tatggtggaaatgatgcgtcttatggggctccatctggttatggtgcagttggtggacgg
cctggaagtatgcctaacagccatggcggtggctatgccgatggttcagatggctctgga
ggctatgggaatctgaatcaccaagggaatgggcaagctggttatggtggaggttatgga
aatgttaggcaagctcaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
