KEGG   Brassica oleracea (wild cabbage): 106294734
Entry
106294734         CDS       T04124                                 
Name
(RefSeq) ABC transporter C family member 8 isoform X1
Organism
boe  Brassica oleracea (wild cabbage)
SSDB
Motif
Pfam: ABC_tran ABC_membrane SMC_N AAA_29 MMR_HSR1 AAA_16 Dynamin_N AAA_22 RsgA_GTPase AAA_23 MeaB nSTAND1 FKBP_N_2 DO-GTPase2 DUF87 YobI-ATPase
Other DBs
NCBI-GeneID: 106294734
NCBI-ProteinID: XP_013585819
UniProt: A0A0D3CHM1
LinkDB
Position
C5:32587071..32593109
AA seq 1465 aa
MAVLIEDLPWCDVELNLGSKCLQRTAIDLVNLLFLSFFYLLLVAGCVSQRFTLGSRKKGW
IFVAAAICCAATSIIYLGAGLKNLIASANDEVSWVACFVEGLIWVSLTVSLLVNGSKWIK
ILASVWWVSFALLDSAAKIEILSQGKSIRMFDIITWLISLLLLLCSWMNLRSSPEAQDYS
TAGLSDPLLAENSKKNSARLATARFFSFLSFSWMNSLLSLGFKKPLTPDDIPSVVPEDEA
ELAYTKFSKAWDDALLSEPEGAKERNLVFRAVAKVYFKENILTAVCALFRTIAVVSLPLM
LYVFVDYANSDHRDLRTGFFNLACLVMLKLVESLSMRHWYFAARRSGMRIRSALMVAAYK
KQLKLSSLGRKRHSSGEIVNYIAVDAYRMGEFLWWFHSGWSLTLQLLLSTAVLFGVVGIG
AVPGLILLLLCGLLNLPFAKMLQNCQTQFMIAQDKRLRSTSEILNSMKVIKLQSWEEEFK
KQIESCRDEEFKWLAKAQLTKAFGTFLYWMSPTIVSSVIFVGCALMNSAPLNASTIFTVL
ATLRVMSEPVRVIPEAISAIIQVNVSFDRINNFLLDDELKTDEIGRSGMEKSGTAVDIQA
GNFSWDPETKHPTLRNINLEIKNGQKVAVCGPVGAGKSSLLHAVLGEIPKVSGTVKVSGS
IAYVSQTSWIQSGTIRDNILYGKPMETRRYNAAIKACALDKDINDFGHGDLTEIGQRGLN
LSGGQKQRIQLARAVYADADVYLLDDPFSAVDAHTAGVLFHKCVEDSLREKTVILVTHQV
EFLSEVDQILVMEEGRITQLGKYDELLMMGTAFKQLVNAHNDAVTVLPLASNESLGDLTK
VGRDREIGNIQVVEKIEEEITTTTNVPGAQLTQEEEKEAGYVGLKPFLDYLNVSRGWFLL
SSSVLGQVGFVVFQAASTYWLAYGIGIPNLTATMLIGVYSVISTLSAGFVYARAVTTAHL
GLKASKAFFSGFTNAVFKAPMLFFDSTPVGRILTRASSDLNVLDFDIPFAIIFVVSPAVE
LTAALIVMTYVTWQVIIIALLALAATKVVQEYYLASARELIRINGTTKAPVMNYAAETSL
GVVTIRAFGTVDRFLKNYLSLVDADAVLFFLSNAAMEWVILRIETLQNLTLFTCALLLIL
IPKGYIAPGLVGLSLSYALTLTQTQVFLTRWYCTLSNSIISVERIKQYMSIPAEHPAVVD
DKRPPSSWPSSGTIHLQELKIRYRPNAPLVLKGISCTFREGTRVGVVGRTGSGKSTLISA
LFRLVEPASGCILIDGIDISKIGLKDLRMKLSIIPQEPTLFRGCIRTNLDPLGVYSDDEI
WKALEKCQLKATISNLPNKLDSSVSDEGENWSVGQRQLFCLGRVLLKRNKILVLDEATAS
IDSATDAIIQRIIREEFADCTVVTVAHRVPTVIDSDMVMVLSFGDLVEYNEPSKLMETDS
YFSKLVAEYWASCRGNSSQNLQVHI
NT seq 4398 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcggttttgattgaggaccttccatggtgtgacgttgaactgaatcttggctctaaa
tgcttacagagaacggccatagatctcgttaatctactgttcctctccttcttctacttg
ctcttggtagctggttgtgtttcacagcgttttactcttgggagccgcaaaaaaggctgg
atctttgttgctgcagctatatgctgtgctgctactagcattatatatcttggtgctgga
ctgaagaatctgattgctagtgccaatgatgaagtctcctgggttgcttgctttgttgaa
gggctcatttgggtctcacttacggtttcactgcttgttaacggctccaagtggatcaag
attctcgcatcggtttggtgggtgtcttttgctttgctggattcagcagcaaagattgag
atactttctcaggggaaaagcatcagaatgtttgacatcattacctggctgataagcctt
ttgcttcttctttgctcctggatgaacttgagatcttctccagaagctcaagattacagc
acagcaggtctttctgatcctttattagctgagaattctaagaaaaactcggcaaggtta
gcaacagctagatttttcagctttctatccttctcttggatgaactctttactctcgttg
ggcttcaagaaaccattaaccccagacgatatcccaagtgttgtcccggaggatgaggct
gagttagcttacactaaattctccaaagcatgggatgatgctcttctctcagagccagag
ggagccaaggaaagaaacttggtgttcagagccgttgcaaaagtctacttcaaggagaac
atactcacagcagtttgtgcactcttccgaacaatagctgtagtatctcttccactaatg
ctatacgtctttgtggattacgcaaacagtgaccaccgtgatctccgcactggtttcttc
aacttagcttgtctagttatgctgaagcttgttgagtccttgtcaatgagacactggtac
tttgcagcaagaagatcagggatgaggattagatcagcgctgatggtcgctgcgtataaa
aagcagctgaagctatcaagcttagggaggaaaaggcattcgtctggagagattgtgaac
tacatcgccgtggatgcgtaccgaatgggagagttcttgtggtggttccactcaggatgg
agccttacgctgcagcttttgctttccacagctgtacttttcggagtagttggaatagga
gctgttccaggtttgattcttcttctcctctgcggtcttcttaatctcccgtttgcaaag
atgctgcagaactgccagacccagttcatgatcgcgcaggataaacgattaagatccact
tcggagattctgaacagtatgaaagtcattaagctgcagtcatgggaagaggagttcaag
aaacagatagagtcttgccgtgatgaggagttcaaatggttggctaaggctcagctgaca
aaggcctttggtactttcttgtattggatgtctccaacaatagtttcttctgttatcttt
gtggggtgtgctttaatgaacagcgcgccgctgaacgcaagcaccatcttcacggtttta
gctacgctgagagttatgtcagagccggttagagttatacctgaggcgatttctgctatc
atccaagtgaacgtctcttttgataggatcaacaactttttgcttgatgatgagctcaag
accgacgagattggaagaagtggtatggagaagtctggaacagcagttgatatacaagca
ggaaacttcagttgggatccagaaactaagcatccaactcttcgaaatataaatttggaa
attaagaatgggcaaaaagttgctgtttgtggaccagttggtgcaggtaaatcgtctctg
ttgcatgcagtgctcggagaaatacctaaagtttcaggaactgtaaaggtctctgggtcc
atcgcttatgtttctcagacctcttggatccaaagtggtaccatcagggataacatcctc
tatgggaagccaatggaaactagacgatataacgctgctattaaagcatgtgctttggat
aaggacataaatgattttggacatggtgacctcacagagataggacaaagagggcttaac
ttgagcggagggcaaaagcaaaggattcagctggcacgtgctgtttatgcagatgctgat
gtttacctccttgatgatccttttagtgctgttgatgcacatacagctggagttcttttt
cataaatgtgttgaggactcgctgagggagaaaactgtcattctggtcactcaccaagtt
gaattcctctcagaagttgatcaaattctggttatggaagaaggaagaatcactcagtta
ggaaagtatgatgagctcttaatgatgggaacggcattcaaacagctggtgaatgctcat
aacgatgcagtaactgtgttacctttggctagtaatgaaagcctaggagatcttaccaaa
gtgggcagagacagagagataggaaacatccaggttgtagagaaaatcgaagaagagatc
acaacaacaaccaatgttccaggggcacaacttacgcaggaagaggaaaaagaggcgggc
tatgttggattgaaacctttcttggactatttaaatgtctccagaggatggtttcttctg
tcgtcaagcgtattgggtcaggtaggctttgtagtttttcaagccgcatcaacatactgg
ctggcttatggaattgggatccctaatctcacagcaacaatgcttattggagtctatagc
gtcatctcaactcttagtgctggttttgtatacgcgagagctgtaacgactgcccatctt
ggactaaaagcttctaaagctttcttctctggtttcacaaatgcagtcttcaaagcacca
atgcttttctttgattctactccagttggacgcattctcacccgagcatcatctgattta
aacgtcttggactttgacattccatttgcaatcatatttgtggtatcacctgctgtcgag
ctcactgctgctctaatcgtcatgacatatgtgacatggcaagttatcattatcgctctt
cttgctttagcggccacgaaagttgttcaggagtactatttagcctccgcaagggagctt
attaggatcaatggaacaacgaaagctccagtgatgaactatgctgcagaaacctcgctt
ggagtggtgacaataagagcttttggaactgtagatagattccttaaaaactacctaagc
ctggtggatgcagatgctgtgctgttctttctgtctaatgcagccatggagtgggtgatt
ctgaggatagagactcttcagaatttgactttgttcacttgtgcacttctgcttatcctt
attcccaagggctacatagctccaggtcttgttgggctttcactatcctatgcactaaca
ctgacacaaactcaggtgtttctaaccagatggtattgtaccttatcaaattcaatcatt
tcggtagagaggataaaacagtatatgagcataccagcagagcatcctgctgttgttgat
gataaaaggccaccttcctcatggccatccagtggtaccattcacttgcaggaacttaag
ataagataccggcccaatgctcccttggttctcaaaggaatctcttgcacattcagggaa
gggacaagagtgggagttgtggggagaacgggaagtgggaaaagcacgttgatcagtgct
ttgttccggttggtagaaccagcaagtggttgtatattgattgatggcattgacataagt
aagattggtctaaaagacctgagaatgaaactcagcatcattcctcaagaaccaactctc
ttccgtggctgcataaggaccaaccttgatcctttaggtgtttactccgacgatgaaata
tggaaggctcttgagaagtgtcagcttaaggccaccattagcaatctacctaataaactt
gattcttcagtgagtgatgaaggagagaactggagcgtgggacagaggcagctgttctgt
cttggaagagtcttattaaagagaaacaaaatattggtgttggatgaagctacggcttcc
atagattcagccactgatgccatcatccagagaatcataagagaggagttcgcagattgc
acggtggtaacagttgcacatagagttccaacggttatagatagtgacatggtcatggtt
ctctcctttggtgatcttgtggagtacaacgagccttcaaagctgatggagactgattct
tacttctccaagctcgttgctgagtattgggcaagctgcagaggaaactcttctcagaat
ctacaagttcacatctaa

DBGET integrated database retrieval system