Brassica oleracea (wild cabbage): 106336858
Help
Entry
106336858 CDS
T04124
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
boe
Brassica oleracea (wild cabbage)
Pathway
boe03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
boe00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
106336858
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
boe03019
]
106336858
Messenger RNA biogenesis [BR:
boe03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
106336858
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
OB_RNB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106336858
NCBI-ProteinID:
XP_013631269
UniProt:
A0A0D3BSF5
LinkDB
All DBs
Position
C4:complement(9695775..9697455)
Genome browser
AA seq
397 aa
AA seq
DB search
MESDQGKLFIGGISWETDENILREYFSNFGEVLQVTVMRDKATGRPRGFGFVAFSDPAVI
DRVLQDKHHIDNRDVDVKRAMSRDEQSPAGRQGGFNGSRSFDSGANVRTKKIFVGGLPPA
LTSDEFRAYFETYGPVSDAVIMIDQATQRPRGFGFVSFDSEDSVDLVLHKTYHDLSGKQV
EVKRALPKDANPGMAGGGGRSGGGFPGYGGSGGSGYESRVDSNRYMPPQNAGSGYPPYGA
ASGYGTGYGYGSNGAGYGGFGGGYGNPSGAPYGNPGGPGAGFGSGPRPSWEGQAPSGYGN
NVGYGNAAAAPWGGSGPGSAVMGQGGASAGYGSQGYGYGGNDSSYGTQSGYGAVGGRPNS
HGGGYADVSDGSGGYGNHQVNGQAGYGGGYGRQAQQQ
NT seq
1194 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatcagatcagggaaagctatttatcggcgggatttcatgggaaaccgacgagaat
attctgagagaatacttcagcaatttcggagaggttttgcaggtgacggtgatgcgagat
aaagctacaggtcgtcccagaggattcggattcgtcgcattctccgatcccgccgttatt
gatagagttctccaggacaagcatcatatcgataatagagatgttgatgtgaagagagca
atgtctagagacgagcagagtcctgcagggagacaagggggttttaatggttctaggagt
tttgatagtggtgctaacgttaggaccaagaagatattcgttggtggtttgcctcctgct
ttaacatcagatgagtttagggcttacttcgagacttacggtcctgtgagcgatgcggtt
attatgattgaccaggccacacagcgtcctagagggtttgggtttgtttcattcgactct
gaagattcggttgaccttgttttacacaagacttaccacgatttaagcggtaaacaagtg
gaagttaagagagctcttcctaaagatgctaaccctggaatggcaggaggtggtggtcgc
agcggcggtggtttcccgggctacggtggttctggtggaagtggctacgagagtcgtgtt
gattccaatagatacatgccgcctcaaaacgctggaagtggttatcctccttatggtgct
gcttctgggtatggtactggctatggttatggaagcaacggtgcaggttatgggggtttt
ggaggagggtatggcaatccatctggtgcgccgtatgggaatcctggtggccctggagct
ggttttggaagtggtccgagaccttcatgggaaggtcaagcaccatcgggttatggtaac
aacgtgggatatggaaatgctgctgctgctccttggggtggttctggtccaggttcagca
gtgatgggtcaaggaggtgcatctgcaggttatggcagccagggttatggctatggtgga
aatgattcctcttatggaacacaatctggttatggtgcagtcggtgggcggcctaacagc
catggtggtggctatgctgatgtttctgatgggtctggaggctatggaaaccaccaagtg
aacgggcaagctggatatggcggaggttatggtagacaagctcaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
