KEGG   Bombilactobacillus thymidiniphilus: MOO47_03320
Entry
MOO47_03320       CDS       T08331                                 
Name
(GenBank) sigma 54-interacting transcriptional regulator
Organism
bog  Bombilactobacillus thymidiniphilus
SSDB
Motif
Pfam: Sigma54_activat PRD Sigma54_activ_2 AAA AAA_5 AAA_16 AAA_22 Mg_chelatase EIIA-man AAA_14 RuvB_N AAA_2 SLFN-g3_helicase AAA_29
Other DBs
NCBI-ProteinID: UQS84195
LinkDB
Position
complement(616314..619046)
AA seq 910 aa
MLKEQIAAAVKKNTVAAQKKYQVLDTQALGRQMKVKRNTISHYLNVLWREQKLIKVNSRP
VIFWDRQVLEDTYHVSLQAEYVSQQALQAILQTASSRDNAVLDHIIGSQGSLYVPLERLK
AAAGYPDTGLPMLITGSTGSGKSFLARAYYDYCVEQGYLSDTARFLQLNCAEYADNPELL
TSNLFGYRQGAFTGATQNKTGLFDEADGGVLFLDEIHRLNAKGQEKLFRYLDTGLISPLG
ETKNSQKVRVRLVFATTENLDSYFLDTFLRRVPIQITLPPLKDRNDSEIASLVKLFYLRQ
SQKIKKTITVDQTVVRILKTNNYSHNVGELKNAVIISVANALQRGEDKAQLAVNVVDLPS
DILQTVTLLPDIRSKQLVITPQATLQQLIGAKQPANNVIQKTINSWLQVYQTTNNSADFW
SNCLGVLNHLCDDLMFKSATQVCPLPLSFYKNFFQGELKQIALQNHLRVNGNMAMLLSYY
FYRRQTAMVELSPKQQQICQKLVTHFQQTDPKLWAIVTEMHNLIVQNTKLQNSMADQLFL
YFYLHDKMQEIPRQTLRCIVLAHGYSTASSIADVANELTGEHLLDALDMPIDIQVPEIGR
KVDNYAHSLTQVTGLIALVDMGSLADIKKYLQPDLTFPIAVMTNVSTQSALVTAQSIQNQ
LPLQDIMEAVSQQVVTTKQVIYPPTIKKNLIITCCLTGIGTANKIRQLLMASLPEDSDLE
VQSFEYSHLKDSSQLAFLQQIYNIVFVIGTIDPEVKEVKYYPLETIISGTNAAALKNLLA
NYLTKAQLAEFNKHLIRNFTLERVINSLTILDANIVMQNIDLALERYTKLSQQELSNMTR
MSLYVHVSCLIERVVRNEPITTYDMHQISDTNQKITLKNIQKAFSVIEDCYSVKIPLAEY
GYIYDIIVAN
NT seq 2733 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttaaaagaacagattgcggcggctgtcaaaaaaaatactgttgcggcgcaaaaaaag
tatcaagtcctagatacgcaggcgttaggccgtcagatgaaagttaagcgaaacacaatc
agtcattacttgaatgttttatggcgcgaacaaaaactcataaaagttaattcacgtccc
gtgattttttgggatcggcaagtgttggaagatacttatcatgtgtctttgcaagcagag
tatgtttcacagcaagccttgcaagcaattttgcaaacggcgtcatcccgagataatgct
gttttggatcatattattggtagccaaggatctttatatgtgccgttggagcgtttgaaa
gctgcggcgggttatccagacaccggcctaccaatgttaattactggttcgactggctcg
gggaaaagttttttggcacgagcttattatgattattgtgttgaacaagggtatttaagc
gatacggcgcgctttttgcaattgaattgtgctgaatatgcggataatcccgaactcttg
actagtaatttatttggttatcgccaaggtgcttttactggagctacacaaaataaaacc
gggctttttgatgaagctgatggtggcgtcttatttttagatgaaatccatcgtttgaac
gctaaaggacaagaaaaactatttcgctatctagacactggattgatctcgccattagga
gaaactaaaaatagccagaaggtacgagtacgcttggtttttgctacaactgaaaattta
gatagttattttttggatacttttttacgccgggtgcctattcaaattacgttaccgccg
ttaaaagatcgtaatgattcggaaattgccagtctggttaagttattttatttacggcaa
tcccaaaaaatcaaaaaaacaatcactgtagatcaaacggttgttcgaatactaaaaacg
aataattattctcataacgtaggcgaactcaaaaatgcggtgattatttcagtggcaaat
gctttacaacgtggggaagataaggcacagctagcggtcaatgtggttgatttgcctagt
gatattttacagacggtaacattgctgcccgatatccggtcaaaacagctggttattacg
ccacaagcgactttgcaacagttaattggcgccaaacagccagctaataatgttattcaa
aaaacaattaattcctggctacaagtgtaccaaactactaataattcggcagatttttgg
agtaattgtctaggcgttttgaatcatttatgtgatgatttgatgtttaaatctgcgaca
caagtttgtcctttaccgctatccttttataaaaacttttttcaaggtgaattaaaacaa
attgcgctacaaaatcatttgcgggtgaatggcaatatggcgatgttgttgtcatattac
ttttatcggcgccaaacagcaatggttgaattatcacctaagcagcaacaaatctgccaa
aaattagtgactcattttcaacaaactgatccaaaattatgggcaattgttactgagatg
cataatttgattgtgcaaaatacgaagcttcaaaattcaatggcagatcaattgttttta
tacttctatttgcacgataaaatgcaagaaattcctcgtcagacattaagatgtatcgtt
ttggcacacgggtattccactgcaagcagtattgctgatgtggcaaatgagttgaccggt
gagcatttgttggatgctttggatatgccaatcgatattcaagtgcccgagattggcaga
aaagttgataactatgcgcattctttgacgcaagttactggattaattgctttggtagat
atgggatctttagctgacatcaaaaaatatttgcagcctgatttaacttttccgattgct
gtgatgaccaatgtttccacgcaatctgctttagtgaccgcgcaaagtattcaaaatcaa
ttgccattgcaagatattatggaagcagtctcacagcaagtggtgacgactaagcaagtt
atttatccgccaaccattaagaaaaatttgattattacttgctgcttaacaggtattggt
actgctaataaaattcggcagcttttaatggctagtttgccagaagatagcgatttagaa
gtgcaatcttttgagtatagtcacttgaaagattcatcgcaattggcttttttgcaacaa
atttataatattgttttcgtgattgggacgattgatcctgaggtgaaagaagtaaaatat
tatcctttagagacgattatttcaggcactaatgcagctgctttaaagaatcttttggca
aattatttaactaaagcacaattggcagaatttaataagcatttaattcgtaattttact
ttagagcgcgtgattaattctttaactattttagatgctaatattgttatgcaaaatatt
gatctggctttagagcgctataccaagcttagtcaacaagagctttctaacatgacgcga
atgtctttatatgttcatgtcagctgcttgattgagcgtgttgtgcgaaatgaaccgatc
acaacttatgatatgcaccagattagtgacactaatcaaaaaatcactttaaaaaatatt
caaaaagcttttagtgtcattgaagattgctatagtgtcaaaatacctttagcagaatat
ggttatatttatgatattatcgttgctaattaa

DBGET integrated database retrieval system