Borrelia sp. HM: BKFM_00576
Help
Entry
BKFM_00576 CDS
T08772
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
boq
Borrelia sp. HM
Pathway
boq03030
DNA replication
boq03430
Mismatch repair
boq03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
boq00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
BKFM_00576 (dnaE)
03430 Mismatch repair
BKFM_00576 (dnaE)
03440 Homologous recombination
BKFM_00576 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
boq03032
]
BKFM_00576 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
boq03400
]
BKFM_00576 (dnaE)
Enzymes [BR:
boq01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
BKFM_00576 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
boq03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
BKFM_00576 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
boq03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
BKFM_00576 (dnaE)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCR21995
LinkDB
All DBs
Position
598386..601835
Genome browser
AA seq
1149 aa
AA seq
DB search
MDMDLKVKFVHLHVHSDYSLLDGAAKITDIIAKAKKCNMSHIALTDHGNLFGAIKFYREA
KKAGIKPIIGIEAYMSSNSKHIKKNDELGKPYYHLILLAKNELGYKNLLKLTSVSYLEGF
YYRPRIDKSDIEKYSKGLICTSACIGGIIPQLIIAGRFDDAKNEILWFKTVFGDDFYLEL
QRHGIKQQDIVNEKLIDYSRELNIPLTVSNDSHYVNKEDAKAQDIIICIGTGSKISDPNR
LKMETDEFYIKSQEEMCELFKDLPEALANTLKIAEKCDEFEIQFPGPIFPEYQVPSEFST
LGQYLEYLTFEGLKFRYDNISDSIKERAFYELSTIIKMGFEAYFLIVWDFIKFAHDNGIP
VGPGRGSGAGSIVAYALRVTDIDPLKYNLLFERFLNPERVSMPDFDIDFCFEGRDEVIKY
VTSKYGEDRVAQIITFGTLKPKAVFKDVGRVLDIPFSESNELTKLIPDGPKVCLREVFTD
GALGTYLNKGPLYNELMNAALVLEGMNRHVSTHAAGIVIARTTLTDYVPLYKDYKQNTVS
TQYTMDLLEDCGLVKMDFLGLKTLTLIKNAEDLIKITNPDFSIANISDSDPKTFKMLAEG
RSASVFQFESEGMQQVLREAKPDSIEDLIALNALYRPGPMQFIPQFISAKTGTKRIKYPH
PDLKDVLKPTYGVIVYQEQVMEVARIIGGFSLGKADILRRAMGKKKEDEMNKMKVDFIKG
AISKGYDESLAKDIFELLKPFANYGFNKSHAAAYSLIAYQTAYLKANYPEDFMAANLTNE
INNTEKLSYYIEEAKLIGIDILKPDINQSFKEFRVVDCKISYGLNGIKNIGGSMVDLIIS
ERQENGEYKSFEDFVRRVDDKVINKKFLEAAIKSGLFDSLGQNRRTLFENLDRLIDVITQ
DKNDKRFGQNSLFATFEAQDVAYKSFSYDIFEEYSYLELLGFEKELLGFYVSGHPLDPYK
TEIEYFTDLNILEDLAIKKDSIVKFAGILNSIKVIHTKKNNARMAFAVIENFKGTMDIVV
FTENYEKYKHLFIEGDVIGVIGKLTFNRDKFSIIAEKILSINEISFNKINNLYIKLFSER
LNDSHLLYSLKDKILNLEDNTGFSNVYLYLKNDDKSFKLKMNLTLNFKPDEFKLNALRSS
EIVEDVWCD
NT seq
3450 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatatggatttaaaagttaaatttgttcatttgcatgttcattcagattattctctc
ttagatggggctgccaagattacagatattatagcaaaagcaaaaaaatgcaatatgtct
catattgcattaacagatcatggtaatctttttggtgctattaagttttatagggaggca
aaaaaagctggaataaagcctataattggcattgaagcttatatgtcaagtaattcaaag
catataaagaaaaatgatgaacttggaaaaccttattatcatttaattcttcttgcaaag
aatgagttaggctataagaatttattgaaactaacaagtgtttcttatcttgagggattt
tattatcgtccaaggatagataagagtgacattgaaaaatattctaaggggcttatttgc
acatctgcatgtattggtggcattattccccaattaattattgcaggtagatttgatgac
gcaaaaaatgaaattctttggtttaaaactgtttttggtgatgatttttatctcgagctt
caacgtcatggcattaagcaacaggatatagtgaatgaaaaattaatagattattctaga
gaacttaatattccactaactgtgtctaatgattctcattatgtaaataaagaagatgca
aaagctcaagatattattatatgcattggaactggttctaagataagtgatcccaataga
cttaaaatggagacagatgaattttacattaaatctcaagaagagatgtgtgaactattt
aaggatttgccagaagctttagcaaatactttaaaaattgctgaaaaatgtgatgaattt
gagattcaatttccaggtcctatttttcctgaatatcaggtacctagtgaattttctact
cttggtcagtatttggaatatttgacatttgaaggtttaaaatttagatatgacaatata
agtgatagtattaaagaacgtgctttttatgaactctcgacaatcattaagatgggattt
gaagcatattttttaattgtttgggattttattaaatttgctcatgataatggtattcca
gttggtcctgggcgtggttctggtgctggttctattgttgcatatgctcttagagttaca
gatattgatcccttgaaatacaatttgctttttgagagatttttaaatcctgagcgtgta
tctatgcctgattttgatattgatttttgctttgaaggtagagatgaggttataaagtat
gttacaagtaaatatggtgaggatagagttgcacagataattacttttggaactttaaaa
cctaaagctgtgtttaaggatgtgggaagagttttagatattcctttttctgaatctaat
gaacttactaagcttattcctgatggtcctaaggtttgtttaagagaagtttttactgat
ggagctttggggacttatttaaataagggtcctctttataatgaattgatgaatgcagca
cttgttcttgagggtatgaataggcatgtttcaactcatgcagcaggtattgtaattgca
agaaccactttaacagattatgttccactttataaagattataagcaaaacacagtttct
acacagtataccatggatttattagaagactgtggtcttgtaaagatggattttcttggg
cttaagacattaactttgataaagaatgcagaagatctcattaagattactaatcctgat
tttagtattgctaatatttctgatagtgatcctaaaacttttaagatgcttgctgaggga
cgtagtgcttctgtttttcagtttgaatctgaaggtatgcagcaagttttaagggaagct
aaacctgatagtattgaagatttaattgctttaaatgctctttatcgtccagggcctatg
cagtttatacctcaatttatttcagctaagacagggactaagcggattaaatatccccat
ccagatctaaaagatgttttaaagccgacttatggagttattgtttatcaagagcaagtg
atggaagttgcaaggattattggtggattttctcttggaaaagcagatattttaaggcgt
gcaatgggcaagaagaaagaagatgagatgaataagatgaaggttgattttataaaaggt
gctattagcaagggttatgatgagagtcttgctaaggatatatttgagcttttaaagcct
tttgctaattatggatttaataaatctcatgcagctgcatactctttaatagcttatcaa
acagcatatcttaaggctaattatcctgaggattttatggctgcaaacttaacaaatgag
attaataacactgagaagctctcctattacattgaagaagcaaaattaatcggaatagat
attttaaaacctgatataaatcagtcttttaaagagtttcgtgtagtagattgtaagatt
tcttatggtcttaatgggattaagaatattggtggttcaatggtggatcttataatttct
gagagacaagagaatggagaatataagtcttttgaagattttgttagaagagtagatgat
aaagttataaataaaaaatttcttgaggctgcaataaagtctggactttttgacagcctt
ggtcaaaatagaagaaccctttttgaaaatcttgacagattaatagatgttataacacaa
gataagaatgataaaaggtttggtcaaaatagtttgtttgctacttttgaagcacaagat
gttgcttataaaagttttagttatgatatatttgaagaatattcttatcttgaacttttg
ggatttgaaaaagaacttttaggtttctatgtatctggacatcctcttgatccttataaa
acagaaatagagtattttacagatttaaacattttagaagatttggctattaaaaaggat
agtattgttaaatttgctggtattttaaattcgataaaggttattcatactaagaaaaat
aatgctagaatggcatttgctgttattgagaatttcaaaggtacaatggacattgtagtg
tttactgaaaattatgaaaaatataaacatttatttattgagggagatgtgattggtgtt
ataggtaagcttacatttaatagggataaattttcaataattgctgaaaagattttaagt
attaatgagatttcttttaataagattaataatctttatattaaactttttagtgaaaga
ttaaatgattcgcatcttctttattctttaaaggataaaattttgaatcttgaagataat
actggattttcaaatgtttatctttatttaaaaaatgatgataaaagttttaagctaaaa
atgaatttaactttaaattttaaacctgatgaatttaagcttaatgcattaaggtctagt
gaaatagtagaagatgtttggtgtgattag
DBGET
integrated database retrieval system