Candidatus Borrelia mahuryensis: F0310_04120
Help
Entry
F0310_04120 CDS
T10492
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
borr Candidatus Borrelia mahuryensis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Helicase_C
DEAD
OB_NTP_bind
WHD_HA2
AAA_22
AAA_19
Cas3-like_C_2
NAT10_TcmA_helicase
nSTAND_NTPase5
Flavi_DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QMU99567
LinkDB
All DBs
Position
complement(880919..883408)
Genome browser
AA seq
829 aa
AA seq
DB search
MNDFELPIYKYKDELILLLKSNNVLIVESPTGSGKTTQIPRIIYEAGFAKLGKIGVTQPR
RIATVSIAEYIAKHIGVNLGEEVGYKIRFQEIISSKTKIKLMTDGVLLQELKKDTLLYEY
DVIIIDEAHERSLNIDFILGLIKDILKKRDDFKVIISSATINTQIFSKYFNNAPILNIET
ITYPVQIIYNPPLINTPKGMILKIKEIISSIIKSKQEGDILIFLSGEKEIKETIKEINNL
NLRKDLIILPLYSRMAKEAQEQIFMPTPKNKRKIIVSTNIAETSITIENIKIVIDSGKVK
TNRFQMKTHTYSLQEVPISKASATQRAGRAGRLSKGTCYRLYRRDEYQLREDYQKEEIYR
TDLSEVILRMADIGIKNFTKFDFISKPSIKSIQTASEILKSLDAINDKNELTEIGKYMII
FPLIPIHSRALVEAMINYQQAIYPTTIGLSFLSTSGVFLLPQNEEIEARQAHLKYKNPLG
DLMGFIKIFEDYKKALNKEEFAKENYLDLQGLEEIINIQKQLENIVSRLNIPVINKPEID
KEGYLKSIMRGMRDYICFKTSKNKYKTIKAQNIVIHPGSLINIDSVKYFVAGEIIETTKI
YARSIGVLKKEWINEIEFEENKIKKHIKENKILNKDNKSTFKKTKKPLLENEITIGEKKF
NFKNENNIQFIDLTLTEAKKLILKRLTSKENQATKKINVKLIHKDLVIFKSKKLIEIIRI
VSNMGLDWTLIEKYENNNININEVNKVKNILECTMNFVQHPNKKSVLFLSLKSDYSDNFW
LKPQKSFIIAIEESMNSIKSLIDNQKYINKLSAIKPTINKVYKKLNIFF
NT seq
2490 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacgatttcgagcttcctatttataaatacaaagatgaactaattctactattaaag
tcaaataatgttttaatagtagaaagtccaacaggaagtgggaaaaccacacaaatacca
agaataatatatgaagcaggctttgcaaagcttggtaaaattggggtaacacaaccaaga
agaatagccactgtatcaatagcagaatacattgccaaacacattggagtaaatcttgga
gaggaagtaggctataaaataagatttcaagagatcataagctctaaaaccaaaattaaa
ttaatgactgatggtgtactcttacaagaactcaaaaaagacacacttctttatgaatat
gatgtaattataatagatgaggcacatgaaagaagtttaaacatagattttatactaggc
cttattaaggatattttaaaaaaaagagatgattttaaagttataatttcatctgcaaca
ataaatacacaaatattttcaaaatattttaacaacgcaccaatacttaatatagaaaca
atcacttaccctgtacaaataatatataatcctcccttaattaatacaccaaagggcatg
atactcaaaataaaagaaataattagtagcataattaaaagtaaacaagaaggtgatatc
cttatattcctatctggagaaaaggaaataaaagaaacaataaaagaaattaataattta
aatttaaggaaagatttaattattttgcctctatatagtcgaatggcaaaagaagcacaa
gaacaaatatttatgccaacacctaagaataaaagaaaaataatagtatcaacaaacatt
gcagaaacttcaattacaattgaaaacattaaaatagtaattgatagcggaaaagtaaaa
acaaatagattccagatgaaaacgcatacttactcattgcaagaggtgccaatctcaaaa
gcatctgcaactcagagagcaggaagagcaggaagactttcaaagggcacatgttacaga
ttatatagaagagatgaatatcaactaagagaggattatcaaaaagaagaaatatacagg
acagatctatctgaagtaatattaagaatggcagatattggaattaaaaatttcacaaag
tttgactttatctcaaagccttccattaaatctattcaaacagcaagtgaaatactaaag
tctttagatgcaataaatgacaaaaacgaacttacagaaattgggaaatacatgatcata
tttcctttaataccaatacactcaagggctttggttgaagcaatgattaactaccaacag
gcaatatacccaactacaattggactgtctttcctctctacgagtggagtttttttgcta
cctcaaaacgaagaaatagaagctagacaagctcatttaaaatataaaaacccattagga
gatttaatgggttttattaaaatatttgaagactacaaaaaagctttaaacaaagaagaa
tttgctaaagaaaattatttagacttacaaggacttgaagagattattaatatacaaaaa
caacttgaaaatattgtaagtagactcaacattccagtaataaataaacctgaaattgat
aaggaaggttatttaaaatctataatgagaggcatgagagactacatttgctttaaaact
tcaaaaaataaatataaaaccataaaagcacaaaatatagtaatacaccctggatcactt
attaatatagattctgtgaaatattttgttgcaggtgaaataatagagacaactaaaata
tatgccaggtcaattggagtactcaaaaaagaatggatcaatgaaattgaatttgaagaa
aataaaataaaaaaacatataaaagaaaataaaattttaaataaagataacaaatctaca
tttaaaaaaacaaaaaaacctttactagaaaatgaaatcactattggtgaaaagaaattc
aattttaaaaatgaaaacaacattcaatttatagatcttaccttaacagaagctaaaaaa
ttaattttaaagagattaacaagtaaagaaaatcaagcaactaaaaaaattaacgtaaaa
ttaatacataaagatttagtaatatttaaaagtaaaaaattaatagaaataatacgaata
gtatctaatatgggactagattggacacttatagaaaagtatgaaaacaataatatcaat
attaatgaagttaataaggttaaaaacatcttagaatgcactatgaatttcgtccaacat
ccaaataaaaaatctgtactctttttatcgctcaaaagtgattattctgataacttttgg
ttgaaacctcaaaagagctttataatagcaatcgaagaatcaatgaacagcataaaaagt
ctaattgacaaccaaaaatatattaataaactttctgcaataaaacccacaataaataaa
gtttataaaaaattaaacattttcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system