Heyndrickxia oleronia: I5818_19730
Help
Entry
I5818_19730 CDS
T07202
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein
KO
K24708
ATP-binding cassette, subfamily B, putative efflux pump [EC:7.6.2.-]
Organism
bou
Heyndrickxia oleronia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bou00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bou02000
]
I5818_19730
Transporters [BR:
bou02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
I5818_19730
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
RsgA_GTPase
ABC_ATPase
nSTAND1
AAA_16
HUTI_composite_bact
AAA_29
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQZ03918
LinkDB
All DBs
Position
complement(3947993..3949741)
Genome browser
AA seq
582 aa
AA seq
DB search
MSSTKRYMKFVKPYTGQIIGTLIIGLIKFAIPLLIPVIIQYVIDDIVTNQHLSVDEKTSK
LLITMSIMLGVFVVLRPPIEFYRQYFAQWTSSKILYDIRDRLFTHLQKLSFKFYSNTRAG
EVISRVINDVEQTKDFVITGLMNVWLDAATIIIAVSIMFTMDVPLTIVSLIVFPLYAISV
KYFFGNLRKFTRVRSQALAEVQGYLHERVQGMPVIKSFAIEDTEQERFRVHNSNFLDKAL
QHTRWTAKAFSVVNTLTDIAPLIVIGFAGYQAIHGNLSIGTMAAFIAYIDRLYSPLRRLV
NSGTTLTQSIASMDRVFELMDEKYDIDDAPDAIECKNVKGDISFEHVNFAYNEKELSVLK
DIQLHVRAGETIALVGMSGGGKSSLVSLIPRFYDVTSGKILLDGTDIRDFKVRSLRDKIG
MVLQDNILFSESVRLNILLGKPDATEEEIIQAAKAANAHEFIMNLPEGYDTKVGERGVKL
SGGQKQRIAIARVFLKNPPILILDEATSALDLESEHLIQEALEKLAKDRTTFIVAHRLST
ITHADRIVLIEHGEIVEIGPHEELMEKQGHYFNLFQVQQLDS
NT seq
1749 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtagtacaaagagatatatgaagtttgttaagccgtatacgggtcagattattggg
acgttgattattggtttgataaagtttgcgattccgctgcttattcccgttattattcag
tatgtgattgatgatattgtgacgaatcagcatttgtcagttgatgagaaaacgtcgaag
cttttgatcacgatgtcgattatgttaggtgtgtttgtggttttacggccgccgattgaa
ttttacagacagtattttgctcaatggacatcaagcaagattttatatgatatccgggat
cgcttatttacgcatttacagaaattgagctttaaattttactctaatacgcgtgcgggg
gaagttatctccagagtgatcaatgatgttgagcagacaaaggactttgttattaccggc
ttaatgaatgtatggctggatgcggcgacgatcatcattgcggtttcgataatgtttaca
atggatgttccgttaaccattgtttcgctcattgtgtttccactgtatgcgatatcggtt
aaatatttcttcggcaatttacgcaaatttacaagggttcgctcccaagcgcttgctgaa
gtgcaagggtatttacatgagcgggtgcagggaatgcctgttattaaaagctttgctatt
gaagataccgagcaggaacgctttcgcgtacataattcgaattttctcgataaagccttg
cagcatacgcgatggacagcgaaggcattttctgttgttaacacattgacagatattgct
ccattaattgtcattggttttgcaggatatcaagcgatccatgggaatttatcgattggg
acaatggcagcattcattgcatatatcgatcgtttatatagcccactacgtcgattagtg
aactctggtacgacattaacgcaatctattgcctcaatggaccgcgtctttgaattaatg
gatgaaaaatatgatatcgatgatgcgccagatgcgattgaatgcaaaaatgttaaaggt
gatatttcatttgagcatgtaaactttgcttataatgaaaaggaattatctgtccttaag
gatatccaattacatgttcgtgccggtgaaacgatcgcgttagtcgggatgagtggtgga
ggtaaatcttcattagtcagtttgattccccgtttctatgacgtaacgagtgggaaaatc
cttttagatggcactgatattcgcgattttaaagtaagaagccttcgcgataaaattggg
atggtcttacaggataatattttatttagtgaatcggttcggttaaatattttactaggt
aagccagatgcaacagaggaagagatcatacaggcagcgaaagcagcaaatgcccatgag
tttatcatgaatcttccagaaggatatgacacaaaggttggggaaagaggagtgaagctt
tccggtggtcagaagcagcggattgcgattgctcgtgtatttttgaaaaaccctcctata
ttaattttggatgaagcaacatctgcactggatttagaaagtgaacatttaattcaggag
gcattggaaaagctggctaaggatcggacgacatttattgttgcccatcgactgtccact
attacccatgccgatcgtattgtcctcattgagcatggggaaattgttgagattggtcca
catgaagaattaatggaaaaacaagggcattattttaacctattccaggtacaacaatta
gattcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
