Brasilonema octagenarum: DP113_05660
Help
Entry
DP113_05660 CDS
T10103
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
box Brasilonema octagenarum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDL13823
LinkDB
All DBs
Position
1320679..1325571
Genome browser
AA seq
1630 aa
AA seq
DB search
MSVVSIRLYWWQSLGILIGSIIALYTNSARAQITPDGTLPNNSNVRLEGNTRIIEGGTAR
GANLFHSFREFSVPTGSEALFNNALNIQNILTRVTGKSISNIDGLIRSLGTANLFLLNPN
GIIFGPNARLDIGGSFSATTASSFKFPDGSTFSATNPQAPPLLTVNITPGLQYGASQPGA
TITNTGNLAPQQDLTLVADKLDLQGQLKAGRDLTLQAQDTVKVRDSVTTPFLATAGGNLT
IGGNQGIDILALNHPTQTPFVSGGNLSLISDGIISLDAHFSSGGSFSLKSVSGGLANFVS
KYDPIISSNGNVDVAANYTGASLLVESKGNIRFAGDINITGPDTSVLPTGQDTATLSNST
ALIMRSGQNTLAYGGINSGSVPGFSSGTVPEGITLGGDVSLQQSNGAGGLVSLTTASGDV
STKGIITNGGAIDINSARAITTTGILNSSSYSSVDSVGNGGAIALTANGNITTGGIISEA
GGTGNGGNITLTSNAGAIDTTKGSITSQIRDYSNGTGRGGAIAFTAQGDIQTATVNASSE
TGDGGNIQLTSNNGAINTTKGDLATDSRSGNAGTVFLSANNITTGGIISEAGGTGNGGNI
TLTSNAGAIDTTKGSITSQIRDYSNGTGRGGAIAFRATGDIQTATVNASAEKGNGGSIQL
ISNNGTINTTAGDLATDSRSGDAGAIFLSAFNNITTGWIISETEDTGNGGNITLTSNAGA
IDTTKGTITSQIRNNSGGTGNGGAIVFTAKGDIRTAELDTSAEKGDSSRIQLTSTNGEID
TTKGTLYTDSRSGNTANIQLQASNNIRTGNIISTIRSSDKLARGGDITLISKNGEVRVDG
EISTNTYGSSKGGDINITTGSLSLTDRAILSARTFGQGNAGSVFVKATDSVSLVNALILS
TVESGAVGNGGKVEINAASLSLKDGAQILTLVREAFNDKPAGRGNAGNVNVDVTGAVKIE
GIRDGKYPSAISSSVGAGATGNRGNINISAGSLSLTDNAELSASLQPLATDKGVGGNINI
TTNSVSLDNQGAIYAQAEFNAVGNAGNITIKTGSFSAATTSQIAVNSRATGNSGNIKIQA
GEFSMTSNAALRADLDIGGVSREGGNIDLIVDGTILLIGGKTEIAPTGESTRITLGVLPG
GKGPGGNLAIKANSLVLKDGALIKASTQGEGAAGNININTNVVDISGSSPISGLSSGLFT
NTDNSSNAGNIIINTETFRIADSAGLSARTRGNGRGGDITVNAKYFEAMSGGQLVTTTTG
NGQAGNILISAKDRITISGIDQKYNTRVAQVQANEERIRTDPEGASFRLSLIANNFTETG
AASGLFTNSFKGSTGKGGDINITSGSLTIRDNAEVTGNSQGSGNAGAIKATSNSILLDNK
ATFSANTTGGGGDISLNSPLLLLRRGSSITTNASGDNISGGNITIDAKNGFIVAVPNENS
DIRADSANFRGGNVTIKNTAGIFGIQSRKEPSPQSDITAKGATPDLSGNVQINRPNIDPT
SGLIELPSNLVDVSQQISTACTPGSRQSQSSFVSTGRGGLPISLTEPLQDSSTLSAWVRL
KPKPANSARTTPSPQPTAVSNSTKVAAATTQIVEATGWVVDRNGNIELVAQSAQVTPHSP
WQTPASCPSR
NT seq
4893 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgtggtatctatacgtttgtactggtggcaaagtctaggaattttgattgggagc
ataatagccttatatacaaatagcgctcgcgctcaaattacgccagatgggactctgcca
aataattccaacgtgagattagagggcaacactagaattattgaaggtggaaccgcaaga
ggtgctaatctgttccacagttttcgggagttttctgttcccactggctcagaggctttg
ttcaataatgcactcaatattcagaatatcctgacacgagtaacaggtaagtcaatttct
aatattgatggcttaattcgcagcttaggcactgcaaacttattcctgcttaatcccaat
ggtattatttttggaccaaatgcccggttagatattggtggctcgttttctgcaactaca
gcaagcagttttaagtttcctgatggcagtactttcagtgccactaatccccaagcaccg
ccattactaacggtaaatattacaccagggttgcagtatggagcaagtcagccaggggcg
actattaccaataccggaaatttagcaccccagcaagacttgacactagtagctgacaaa
cttgatttgcagggacagctaaaagcaggaagagatttaacactgcaagcacaggatact
gtaaaagtacgggacagtgtgacgactccgtttttagctactgcgggcggtaatctcaca
attgggggaaatcaaggaattgatattttagcactgaatcacccaacacaaacaccattt
gtgagtgggggcaatttaagcttaatcagtgatggaattatttctcttgatgctcatttt
agtagtggtgggagtttttcgctcaagagtgtatcggggggactggctaactttgttagc
aaatatgaccccataatcagtagcaatggcaatgtggatgttgcagctaactatacaggc
gcatcgttgttagtcgaaagcaagggtaatattcgctttgcaggtgatataaatattact
ggaccggatacgagtgttttacctacaggacaagatactgcaactttaagcaacagtacg
gcgttaattatgcgttctgggcagaatactctagcttatgggggtatcaattctggttca
gtacctgggttttcgagtggaactgtgccagagggaattactttaggtggagatgtttct
ttacagcagtctaatggggctggggggttagttagcttaacgacagcatctggagatgtt
agtactaaagggattatcactaatggtggggcgattgatattaacagtgctagagcaatt
actaccacaggtattttaaactcttcttcatactcttctgtggacagtgtgggaaatggt
ggcgcgatcgccttaactgccaatggcaacattaccacgggtggcatcatctcagaagca
gggggtactggcaacggtggaaacatcaccctgactagtaacgccggagctattgataca
accaaaggaagtatcacatcccaaattcgcgattattcaaatggaacagggcgtggaggt
gcgatcgcatttacagcccaaggagatattcaaaccgctacagttaatgctagttctgaa
acaggagatggtggcaacattcaactcacgagtaacaatggagcgattaacacgacaaaa
ggagatttggctactgattctcgaagtggaaatgctggtacggttttcctctctgccaac
aatattacaacgggtggcatcatctcagaagcagggggtactggcaatggcgggaacatc
accctcaccagtaacgccggagctattgatacaaccaaaggaagtatcacatcccaaatt
cgcgattattcaaatggaacagggcgtggaggtgcgatcgcattcagagccactggagat
attcaaaccgctacagttaatgctagtgccgaaaaaggaaatggtggaagtatccaactc
attagtaacaatgggacaattaatactaccgcaggagatttagctactgattctcgaagt
ggggatgctggcgcgattttcctctctgcctttaacaatattacaacgggttggatcatc
tcagaaacagaagatactggcaacggtgggaacatcaccctcaccagtaacgccggagct
attgatacaaccaaaggaactatcacatcccaaattcgtaataactcaggtggaactggc
aatggaggagcgattgttttcacagccaaaggtgatattagaaccgctgaattagatact
agtgccgaaaaaggagatagtagcaggattcaactcaccagcactaatggagaaattgat
acaacaaaaggaactttatacactgattctcgaagtgggaatacggctaatattcagctt
caagcctcgaacaacattaggacaggtaatattatctcaactattagatcctctgacaaa
ctagctcgtggtggagatattaccctgattagtaaaaatggagaagtccgagttgacggc
gaaattagtaccaatacttatggttcaagtaaaggaggggacattaatatcaccactggc
tcactctccttaactgatcgcgccatactaagtgctagaacattcggacaaggaaatgca
ggcagtgtgtttgtaaaagcaaccgactctgtgtctcttgtcaacgcattgatcttaagc
accgtggaatcaggagcagttggtaatggaggcaaagtcgaaatcaacgcagcttcatta
tccctaaaagatggcgcccaaatcttaaccttagtgcgtgaagcatttaatgataaacca
gcaggaagaggaaatgcaggaaatgtcaacgttgatgtcacaggcgcggtgaagattgaa
ggtattagggatggaaaatatcccagtgcaatttccagcagtgtgggtgcgggggcgact
ggtaataggggaaacattaatatctccgcaggctcgttgtctttaactgataacgctgaa
ctgtctgccagcttgcaaccactagcaacggacaaaggggttgggggtaatattaatatc
acaaccaactcagtctctcttgataatcagggcgccatatatgcccaagctgaatttaat
gcggtaggcaacgcaggcaacatcacaattaaaactgggtcgttttctgcggcaacaact
agtcaaatagcagtaaacagtagagctacgggtaattcgggcaacatcaaaattcaagca
ggagagttctcgatgacgagtaatgctgctttgagagcggatttagacataggcggagta
tcacgagagggaggaaacattgatttaatagtcgatggtactatcttactgattggaggc
aaaactgagattgctccgactggagaatcgaccagaattacattaggagtgttgccaggg
gggaaaggtcctggtggaaaccttgcaattaaagctaattctctagtgctaaaagacggt
gccttaattaaagccagtactcaaggagaaggtgctgcaggaaatattaatatcaatact
aatgttgttgatatttcaggcagtagtcccattagtggtttatctagcggattatttacc
aacaccgataattcttccaatgctggcaacatcattattaacactgagacattccgaatt
gcagactcagccggtttgagcgctcgcacccgtgggaatgggcggggtggcgatattaca
gtgaatgccaaatattttgaggcaatgagcggtggacaattagttactacaacaactggt
aacggacaagcaggtaatattttgattagtgcaaaagaccggataactatatctggtatt
gaccagaaatacaacactcgcgttgcccaagttcaggcaaatgaagaacgtatccgcacg
gatccagagggtgcttccttccgattatcattgatcgccaacaattttacagaaacagga
gctgccagtggtctatttactaactccttcaaaggctccacaggtaagggaggagacatt
aacatcactagtgggtcattgactatccgggataatgctgaagtaactgggaacagtcaa
ggatcaggtaatgcaggcgccataaaagctacatctaattctatccttttagataacaag
gcaacttttagcgctaacaccacaggcggtgggggagatatctctctcaactcaccttta
ttattattacgtcgaggtagcagtatcacaaccaacgctagtggagacaatatctctggg
gggaacataactatcgatgctaaaaatggctttatcgttgctgttcccaatgaaaatagc
gacatcagagcagattccgctaacttccgtggcggaaatgtcaccataaagaatactgct
ggtatatttggtatccagtccaggaaagaaccttctccacaaagtgatattactgcaaaa
ggagcaacgccagatttaagcggcaatgtgcaaattaacagacctaatatcgaccccact
agcggcttaatcgaactccctagtaatctagttgatgtctcccaacaaatttccaccgcc
tgcactcccggaagtcggcaaagccaaagttcttttgtatcaacagggcgcggcgggtta
cccataagtctgactgaaccattacaagattcaagtactctgtctgcgtgggtgagatta
aaaccaaaaccagcaaactcagctagaacaacaccttcgccacaaccaactgcagtctca
aacagtactaaagttgcagcggcgacgactcaaattgtggaagctactggttgggtggtt
gatcgcaatgggaatatagaactcgtggcgcaatctgcccaagtcacgcctcacagccct
tggcaaacacctgcttcttgtccatctcgctaa
DBGET
integrated database retrieval system
