Brasilonema octagenarum: DP113_28055
Help
Entry
DP113_28055 CDS
T10103
Name
(GenBank) hybrid sensor histidine kinase/response regulator
Organism
box Brasilonema octagenarum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_3
PAS
PAS_9
PAS_4
HATPase_c
Response_reg
GAF
PAS_8
HisKA
GAF_2
PAS_11
PigL_N
HPTransfase
PAS_7
DUF3509
Diguanyl_cycl_sensor
FcoT
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDL17589
LinkDB
All DBs
Position
6669539..6672469
Genome browser
AA seq
976 aa
AA seq
DB search
MKDEEKTIEELIEELSALRQKLSQLEQVAVQQQQAQEELQQQRECSRRQVQKEQALNRVI
QSIRNSLELERIFSTAAYEITQLVSADRVEIVQYIPEQQLWLNVGDYRRTPDLPSALGVE
IPDADNEVAAQLKRLEVVIIEDASTCSDQVNRSLAETYRGAWLLVPVHFGSTIWGSVSLI
RNNHSLSWQQEEVELTCAVADQLAIAIHQSTLLLQLQTELSEPKKAIIALQESEERFRTM
ADIAPVMIWMVGTDKLCNYFNRVWLEFTGRTLEQELGYGWAELLHPDDLQLCLEIYTTAF
DARRSFTMEHRFRRFDGEYRWFLNTGTPRFHSDGSFAGYIGSSIDITEQKQMLEALQDSE
ARLRLTLDAAHMVIWDWNILTNNIVYDNSMLPLCGLSLGLNEHTFEAFLDAVYFEDRDRV
VAAITDAIENKKEHEVEFRFVSLDRALRWIGDKGQVYYDQTGKPVRMVGVGIDITQRKEA
EHKIREQAAWLDVATDAIIVRNLENKIVFWNKSAERLYGWKAKDVLGKNANDILYKKISS
QLKEALSQVNLTGEWYGELSQIRKDGKELIVETRWTLVRDEHGNPKSILSVKTDITEKKR
LQTQFLRAQRLESLGTLASGIAHDLNNTLAPMLMSAQLLRMRISDERNQQLLQTLETNAQ
RGAAMVKQVLSFARGVEGKRTILQIKHLISEIEQFAKQTFPKSIEFCTDIAPNLWTISGD
ATQLHQVLMNLVINARDAMPKGGVLSIYGENFFVDENYARMNLDATVGPHIVITVKDTGM
GMLPEVLDRIFEPFFTTKEVGKGSGLGLSTVLGIIKSHNGFISVSSKIGKGTQFKVFLKA
VLENQTFSEESFELPMGNGELILVVDDEAEIREITKITLENYNYKILTACDGIEALALYA
QNPENIKVVFVDMMMPDMDGLTTIRALLRINPCIKIMAASGLTDNNKLIENLDVEIFLSK
PYNVKQLLQALHQILN
NT seq
2931 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagacgaggaaaagacaatagaggagttgattgaagagttaagtgcactgcgccaa
aagctttctcaattagaacaagtagcagttcaacaacagcaggctcaagaagagctgcaa
caacaacgcgaatgttctcgacgccaagttcaaaaagagcaagctctgaatcgagtgatt
caaagtattcgtaattctctggagttagaaagaattttttccacagcggcttatgagatt
actcagcttgtgagcgctgatcgagttgaaattgtgcaatacatacctgaacagcaacta
tggctgaatgttggtgattatcgtcgaactccagatttaccaagtgctttgggggtggaa
attcccgatgctgataatgaagttgccgcccaactcaagcgattagaagttgttataatt
gaggatgccagtacttgttcagatcaagtcaaccgcagcttggccgaaacttatcgggga
gcatggttgctggtaccggtgcactttggctctactatttggggtagtgttagcctaatc
agaaataatcactctttatcttggcagcaggaagaagtggaattaacttgtgctgtggct
gatcaattggcgatcgccattcaccaatccaccctcttattacagctacaaaccgaactg
agcgaacctaaaaaggcgattatagcgcttcaagaaagcgaagaacgatttcgcacgatg
gcagacatagcccctgtgatgatatggatggttggcactgacaagctttgtaattatttt
aatagggtttggttggaatttactggacgcacactggaacaagaactaggttacggttgg
gcagaacttctccatcccgacgatttacaactttgcttagagatttacacaaccgcattt
gatgctcgccgaagcttcactatggaacatcgcttcaggcgttttgatggtgagtatcgt
tggttcttaaatacaggtaccccaaggtttcattcagacggtagttttgctggttacatt
ggttccagcatcgatatcacagagcaaaagcagatgcttgaagcattgcaagacagcgaa
gcacgattgaggttaactctagacgcagctcacatggtgatttgggactggaacattttg
accaataatattgtgtatgataactcaatgctacccctgtgtggtctttcgttaggttta
aatgagcatacatttgaagcttttctcgatgctgtttattttgaagatcgcgatcgcgtc
gttgctgccataacagatgctattgaaaataagaaagagcatgaagttgaatttcgattc
gtatcacttgatcgtgcgttgcgttggataggagataaagggcaagtctactatgatcaa
actgggaaaccagtacgtatggttggtgtaggaatagacatcactcagcgtaaagaagcg
gaacacaaaatccgcgaacaagcggcttggcttgatgttgcgacagatgccattatagtc
agaaatttagaaaacaaaatagtcttttggaacaaaagtgctgaacgactttacggttgg
aaagcaaaagatgttttgggtaaaaatgctaatgatattttgtataaaaaaatttcgtcc
caactaaaagaggctttgtctcaagttaacttgacaggcgagtggtatggtgaattgagc
cagatccgaaaagatggcaaggaactcattgttgaaactcgctggacactcgtgcgtgat
gaacacggaaacccaaaatcaattttgagcgtaaaaactgacattacagaaaagaaaaga
cttcagacacagtttcttcgtgctcaacgactggaaagtctcggtacgcttgcgagcggt
attgctcacgatcttaataatacactagctcccatgctgatgtccgctcagcttttgcgc
atgagaatttccgatgagcggaaccagcagctcctccagacattagaaacgaacgctcaa
cgtggtgcagctatggttaagcaagtgctatcgtttgcacgcggtgtcgaaggtaagcgc
acaattttacaaatcaagcatttgatatcggaaattgagcagtttgctaagcagacattt
cctaaatctatagaattttgtactgatatcgcaccaaatctttggactatttctggagat
gcaacacaactgcatcaggtactgatgaatctagttattaacgctcgcgatgcgatgcca
aaaggtggagttttgagtatttatggcgaaaatttctttgttgacgaaaactatgcccgc
atgaatcttgatgcaactgttggacctcacattgtcattaccgttaaggatactggaatg
ggtatgcttccagaagtcttggatagaatttttgagcctttctttacaactaaagaggtt
ggaaaaggttcaggattaggtctttcaacagtacttggtattataaaaagccataacggt
tttatcagtgtttctagcaaaattggtaaaggaacacaatttaaagtcttcttaaaagca
gttttagaaaaccaaacgttctcagaagagtcttttgaattgcctatgggaaatggagaa
ttgattttggtagttgatgatgaagctgaaattcgagagattaccaaaatcacgctggag
aactacaactataaaattttaaccgcttgtgatggcattgaagcacttgcattatatgct
caaaatccagaaaacattaaagtcgtatttgtagatatgatgatgccagatatggatggt
ttaaccaccattcgtgctttactaagaataaatccatgcatcaaaattatggctgcaagt
ggacttacagacaataataaattgatagagaaccttgatgttgaaatatttttgtctaag
ccttacaatgtaaaacaattgttacaagcattgcaccaaatcttaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system