Bacillus pacificus: LMD38_15180
Help
Entry
LMD38_15180 CDS
T07947
Name
(GenBank) collagen-like repeat preface domain-containing protein
Organism
bpac
Bacillus pacificus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
YNCE
Lactonase
Vgb_lyase
Beta-prop_EML_2
choice_anch_I
Cytochrom_D1
Arylesterase
NHL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UEP92724
LinkDB
All DBs
Position
2895012..2896949
Genome browser
AA seq
645 aa
AA seq
DB search
MKHNQNSNDPCEKFQFPCFISISSCNQTNCCTPVFFSFSQQQELLSLINQLNQAIFSFFT
TPNPTTIQILQSSLQALNDLLIAVQPNTPNKNLVIRTINQLINSLPTASLTQISALFQFL
FQNLSSLISCSNISDPLLQQIFNLILQGILNSSLLSNIGTPGPTGATGPRGFRGPRGFPG
PRGIQGSQGIQGPEGPEGPQGVPGIQGSEGPAGPQGAQGSQGIQGPEGPAGPQGPQGVQG
IQGPPGPPGPTGSGTGMGIPGPPGPTGPQGIQGIQGPEGPAGLTGPQGIQGIQGLEGPGG
PTGPQGVQGIQGPTGPQGAQGIQGPEGPPGPTGECECPTGPACNFLVYVTNAGVIDDPTD
DTVSVINTGTNTVVATITVDNAPLEVTVSPNGTRAYVTNIFSDIVSVIDTSTNSVIATIP
VGSDPIGVAVSPNNTTVYVGNHGNNTVSVINAATNTVIDTIPVGNAPQGITVSPNGAFAY
VANELSNNISVINTATNTVSATIPVGIRPRIIVFTLDGTRAYVTNQNSNTVSVINTATNA
VINTINVGTEPVGIDITPGGNLIYVVNKVSNNVSVINVATNTVIDTISVGLSPDQVTIIP
DGTLAYVTNQASNTVSVIDIATNTVITNVPVGVAPTGIATGTICE
NT seq
1938 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcataatcaaaactcaaacgatccgtgcgaaaagtttcaattcccctgttttatt
tctatttcctcttgtaatcaaactaattgttgtacacctgtttttttctcattttctcag
caacaagaattattgtccctaattaaccaattaaaccaagctatcttttcttttttcaca
acaccaaatccaacaactatacaaatactccaatcatcattacaagcgttaaatgattta
ttaattgcagtacaaccaaatactccaaataaaaatttagttatacgaactataaatcaa
ttaatcaattccttacctaccgcatctcttactcaaatttcagcattattccaatttcta
ttccaaaacttatcttcacttattagctgttcaaatatatcggacccattattgcagcaa
atattcaacttaattttacaaggaatcttgaatagttcgttattaagtaacatcggaaca
ccaggtccgactggagccactggacctagaggatttcgtggacctagaggattccctgga
cctagaggtatccagggttctcaaggaattcaggggcctgaaggaccggaaggacctcaa
ggtgtgccagggatccagggatcggaaggaccagcagggcctcaaggagctcagggttct
caaggaattcaaggaccggaaggaccggcagggcctcaaggacctcaaggcgtacaaggg
attcaaggaccaccaggaccaccggggccgactggttcagggaccggaatgggaatacca
ggaccaccgggacctactggacctcagggtatacaagggattcaaggaccggagggaccg
gcagggctcactggacctcagggtatacaaggaattcaagggcttgaaggaccaggagga
cccactggacctcagggtgtgcaaggaattcaaggacccactggacctcaaggtgcgcaa
ggaattcaagggccagaagggccaccaggacctactggggaatgtgaatgtccaactgga
cctgcatgtaatttccttgtttatgttacaaacgcaggagtcatagatgatcctaccgat
gatacagtatctgtaatcaacaccggaacaaatacagttgtagctacaattactgtagat
aatgcacctctcgaagtaacagtttcaccaaatggaactcgcgcttatgttactaatatt
ttttctgatattgtctctgttattgatacctctacaaattccgttatcgctaccattcct
gttggaagcgacccgattggtgtagctgtttctccaaataacacaactgtttatgttgga
aatcacggtaataatacggtttctgttattaatgctgctactaacactgtcattgataca
attcctgttggtaacgctccgcaaggaatcactgtttctccaaatggagcctttgcatat
gttgcaaatgaattaagcaacaatatttctgttattaatactgctacgaataccgttagc
gctacgattcctgttggtattcgtcctagaataatcgtcttcacactagatggtactcgt
gcttatgtaacaaatcaaaacagcaatactgtttctgttattaacaccgctaccaatgca
gttattaatacaattaacgtaggtacagaacctgttggtatagatattacaccgggtgga
aatcttatttacgttgtaaataaagtgagcaataatgtatcagttataaatgtagcaaca
aatactgtgattgatacaatttctgttggcttatcccctgatcaagtaaccatcatacct
gatggcactcttgcatatgttacaaatcaagctagtaatactgtttccgttattgatatt
gctacgaatactgttatcactaatgtcccagtaggtgtcgctccaactggtatagcaacc
ggaactatttgtgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
