KEGG   Bombus pascuorum (common carder bee): 132908618
Entry
132908618         CDS       T09597                                 
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1
  KO
K02999  DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1 [EC:2.7.7.6]
Organism
bpas  Bombus pascuorum (common carder bee)
Pathway
bpas03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bpas00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    132908618
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:bpas03021]
    132908618
Enzymes [BR:bpas01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     132908618
Transcription machinery [BR:bpas03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase I system
   RNA polymerase I
    Core subunits
     132908618
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_4 Znf_XAF1_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 132908618
NCBI-ProteinID: XP_060818747
LinkDB
Position
1:23552413..23558245
AA seq 1713 aa
MVQHKYLTTRLTPKHLDPKCLMFSMFTANDIRNLSVTKIRTPLSFNILGHPLKGGLYDPA
LGPLLESSDPCATCGYNVFKCPGHFGHIELPMPVVNPLFHRRLSMLIKLACRNCFSLQIP
SYVKLLLTAKLNLLQQGYLSDLEDLEQEVMFVVSCSNNPYEVDVQAVQNVIDNYTENLRN
RPRLNQSIVQYNEIQLNTKNINMQWHTYVENVIKQYTTSKVCANCKVHIPKITTLKNKIM
TTKISETPNTPRTVKSRGAVHKLESVIIMPDQSKDYLRKLWQNERDFLKVLIPCFGMVDI
EYPTDIFFFEVIPVLPPIVRPVNFVNGQMIEHPQSQVYKSIIQDCLVLRNIIQTIQDGDT
NQLTEEGKLVFEQIKGNTATEKLHNAWQNLQINVDHLMDRDMNRTADSANCQGLKQVIEK
KEGIIRMHMMGKRVNFAARSVITPDPNLNIDEIGIPEAFAMKLTYPTPVTPWNVVQLRQL
VLNGPNIHPGAVMVEHEDGSIQRISSTNTVQREAIAKRLLTTSDKANKFFKGIKVIHRHL
QNGDILLLNRQPTLHKPSIMAHKARILKGEKTLRLHYANCKAYNSDFDGDEMNAHYPQNE
LARSEGYNIANVSNQYLVPKDGTPLSGLIQDHMVSGVRLTVRGTFFSREDYMQLVYAALS
TIQDNIILLPPSIIKPVPLWSGKQIVSTVIINIIPSNQARINLTANAKISVKEWQVGKAR
RWKCGTEFLDPKTMSEAEVIIRNGELLCGVLDKTHYGATPFGLVHCIFELYGGICSTKLL
SAFGKLFQAALQRNGFTLGIEDILLLNKADKKRKEIISNCRKIGENIQRSMLELPDDVPM
DIVTSKIEESYWSDPKFRAQIDRKYKSALDVYTNDINKACLPAGLLKKFPDNNLQLMVQS
GAKGSTVNTMQISCLLGQIELEGKRPPLMISGKSLPSFLAYDPTPRAGGFIDGRFMTGVK
PQEFFFHCMAGREGLIDTAVKTSRSGYLQRCLIKHLEGLSINYDSTVRDSDGSMVQIYYG
EDGLDIPGSRFLRKEQLSFLIDNKNAILNEETVKNLKMDSDTDKILKVARKIKKWESKNG
SALQKRRISSFTRFSREDMNIKKSKYKEINKNNGRSKASLSLMRKWLRTSEEDKKWIYAE
CARCPDPIMSKYRQDIDFGVFSERLENLMDEYIASKPNNSIIKKKDLRDLLSVKVMKTVC
PPGEPVGLLAAQSIGEPSTQMTLNTFHFAGRGEMNVTLGIPRLREILMMASKNIKTPSME
IPFWKDLKNVTKRSNKLRLQLTKCVLSNVLDNINVSRKMELLPNRQLVYTMTINYLPHKS
YKSEFCIQPHEVLKKTEEIFFKEMFKEIKKIAKVTGALVYVEEEKKSMYENDALLDQAEP
DEGAESALKHANLGEMHESSDEEAAVEDADATLLRSISRHRENQEYEDPEEVEEIEDINE
REDDILVEHENERFKTNDQQQDEDDDDHDIEHEKSDYIVNETYSAQKKRDIKNMYTNVIE
YDYDENKFTWCKLTFWLPLKMLKVDLPTIIRNVANRVVLWEVPCVKRAFTFQNNNGETIL
KTDGINIVEMFKYDKSLNLNKLYSNDIYGISQTYGIEAANRVIIKEVRDVFKMYGITVDS
RHLSLIADYMTFDGSFQPLSRKGMEGSASPLQQMSFESSLNFLKNATLEGKRDNLVSPSS
RLMLGQPCKSGTGSCSLLVKIHKQPETTLSVGG
NT seq 5142 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtacaacataaatatcttacaacacgtctaactccaaaacatctagatccaaaatgt
ttaatgttttctatgtttactgcaaatgacataagaaatttaagtgttactaaaataagg
acaccattatcatttaatatcttgggacatccattaaaaggaggtttatatgacccagca
ttaggaccacttttagaaagttcggatccatgtgcaacatgtggatacaatgtattcaaa
tgtccaggtcattttggacatatagaattgcctatgccagtagtaaatccactgtttcat
agaagattatctatgctaatcaaattagcatgtcgtaactgtttctctttacaaattcca
tcttatgtaaaattgttacttactgcaaaattgaacttacttcaacaaggatatctcagt
gaccttgaagatttagaacaagaagtaatgtttgttgtttcatgttcaaataatccttat
gaagttgatgtgcaagctgttcaaaatgtaattgataattatactgaaaatcttcgcaat
agaccaagacttaatcagtctattgtacaatataatgaaattcaactaaataccaaaaat
attaatatgcaatggcatacatacgttgaaaatgttataaagcagtatacaacatcgaaa
gtctgtgcaaattgtaaagtacatataccaaaaattacaacattaaaaaataaaattatg
accactaaaatatctgagacacctaatactcctcggacagtaaaatcacgtggagcagta
cataagttagagtcagttataataatgccagatcaatctaaagattacctcagaaaactt
tggcaaaatgagagagatttcttaaaagtacttataccttgctttggaatggtagatatt
gaatatccaactgatatattcttctttgaagtaataccagttttaccacctatagttagg
ccagttaattttgtcaatggacaaatgatagaacatccacaatctcaagtttacaagagt
atcatccaagattgtcttgtacttcgaaatatcattcaaacaattcaagatggtgataca
aatcaactaacagaagagggaaagcttgtttttgaacaaataaaaggtaatacagcaact
gaaaaattacacaatgcttggcaaaatctgcaaataaatgtggatcatttaatggaccgt
gatatgaatagaactgcagattctgcaaattgccagggtttaaagcaagttatagagaaa
aaggaaggaattattagaatgcatatgatgggtaaaagagttaattttgctgctcgttct
gttattacaccagatcctaatttgaacatagatgaaattggcattcctgaagcttttgca
atgaaattaacatatccaacaccagttacaccttggaatgttgtacagttaagacaatta
gttttaaacggtcctaatattcatcctggtgcagtaatggttgaacacgaggatggaagt
atacaacgcatttctagcacaaatactgttcaaagagaagctattgcaaaacgtcttcta
acaacaagtgataaagcaaacaaattttttaaaggcattaaagttatacataggcattta
caaaatggagacattctgctgttaaaccgtcaaccaactttgcataagcctagtataatg
gctcataaagcacgtattttaaagggagaaaaaacattacgtttgcattatgctaattgt
aaagcttataattcagactttgatggtgatgagatgaatgctcattatccccaaaatgaa
ctagctagaagtgaaggctacaatatagccaatgtatctaatcaatatcttgtacctaaa
gatggtactcctttaagtggtctcattcaagatcatatggtttctggtgtgcgattaaca
gtaagagggacattcttttcacgtgaagattatatgcaactagtttatgctgctttatct
acaatacaagataatataattcttcttcctcccagtattataaaaccagtacccttatgg
tctggtaaacaaattgtatccactgttatcattaatattattccatcaaatcaagcacgc
atcaatttgacagcaaatgccaagattagtgtaaaagaatggcaagttggaaaagcacgg
cggtggaaatgtggtactgaatttttagatcctaaaacaatgtcagaagccgaagtaata
atacgaaatggagaattattatgtggtgtacttgataagacacattatggtgcaactcca
tttggtcttgtacattgtattttcgaattatatgggggaatatgctctacaaagttgtta
agtgcctttggtaaattatttcaagctgctttacaaagaaatggatttactcttggtatt
gaagatattttattattaaataaagcagataagaaacggaaagaaattatttctaactgt
agaaaaattggagaaaatatccagagatcaatgttagaattacctgatgatgtacctatg
gatattgttacatctaaaattgaagaatcttattggagtgaccctaaattccgtgctcaa
atcgatcgaaaatataaaagcgcattagatgtctatactaatgatataaataaagcttgt
ttaccagctggtcttttgaaaaaatttccagataataatctacaattgatggttcaatct
ggtgcaaaaggttctacagtgaatactatgcagatatcttgcttacttggacagattgag
ttggaaggaaaaaggccacctttaatgatcagtgggaaaagccttccaagtttccttgca
tacgaccctacaccaagagctggtggttttatcgatggtagatttatgacaggggtcaaa
cctcaagaattcttttttcactgtatggctggccgtgaaggtctcattgatactgctgta
aaaactagtagatcaggctatttacaaagatgtcttattaaacatcttgaaggattaagt
atcaattatgattcaacagtacgagactcagacggtagtatggtgcaaatttattatggc
gaagatgggcttgatataccaggttcacgatttttgaggaaggaacaattaagtttctta
atagacaataaaaatgcgattctcaatgaagaaacagtaaagaatttaaaaatggactca
gatacagataaaattttaaaagtagcgagaaaaattaaaaaatgggaaagtaaaaacgga
agtgcattacaaaagagaagaattagctcatttacaaggttttcaagggaagatatgaat
attaagaaatcgaaatacaaggaaattaataaaaataacgggaggagcaaagcatctctt
tcattgatgagaaagtggttaaggactagtgaagaagataaaaaatggatttatgccgaa
tgtgcaagatgtcctgatccaataatgtcaaaatatagacaagatatagattttggtgta
ttttctgaacgattagaaaatttaatggacgaatatatagctagtaaacctaacaattcg
attataaaaaagaaagatttaagagacctcttgtctgtgaaggtaatgaaaactgtttgc
ccgcctggtgaaccagtaggtttattagcagcacaatcaataggagagccatcaactcaa
atgactttaaatactttccactttgctggtcgtggagaaatgaacgttactttgggtata
cccagattacgtgaaatacttatgatggcatcgaaaaatattaaaacgcctagcatggag
ataccattctggaaggacttaaagaatgtaacaaaacgctcaaataaattaaggttacaa
ttaacaaaatgcgttttatccaatgttttagacaatattaatgtaagtaggaaaatggag
ctattgccaaatagacaattagtgtatactatgactattaattatcttcctcataaatcg
tataaatcggaattttgtattcaaccacatgaggtattgaaaaaaaccgaagaaatattt
tttaaggaaatgtttaaagaaattaaaaagattgctaaagtaacaggtgctttagtatat
gttgaagaggaaaagaaatctatgtatgagaatgatgctttattagatcaagcagaacct
gatgaaggagcagaatctgcattgaaacatgcaaatttaggagaaatgcacgaatcttca
gatgaagaagcagcagtagaagatgcggatgcaactttactacgatcaatttcgcgtcat
agagaaaatcaagaatatgaggatccagaagaagtagaagaaatagaagatataaatgaa
agagaagatgatattcttgtagagcatgaaaatgaaagatttaaaactaatgaccaacaa
caagatgaagacgatgatgatcatgacatagaacatgagaaatcagactatattgtaaat
gaaacttatagtgcacagaaaaagagggatattaagaatatgtatactaatgtaatagaa
tatgattatgatgagaataaattcacatggtgtaaattaacattttggttacctcttaaa
atgttaaaagtggatttaccaacgataattagaaatgttgcaaatagagttgttttatgg
gaggtaccttgcgtaaaacgtgcttttacatttcaaaataataatggagagacaattctt
aaaactgatggtatcaacatagtagaaatgttcaaatatgataaatctctaaatttaaac
aaattatattccaatgacatttatggtatttctcaaacatatggtattgaagctgctaac
agagttattataaaagaagtgagagatgtatttaagatgtatggaatcacagttgattct
agacatctatctttaattgcggattacatgacttttgatggtagttttcaacctctcagt
cgtaaaggaatggaaggttcagcatctccattgcaacaaatgagttttgaaagttctctt
aattttttgaaaaatgcgactttagaaggaaaacgagataatttagtatcgccttctagt
cgattaatgttaggtcaaccttgtaaatctggtactgggtcatgttcgttattggtaaaa
atacataaacaaccggaaactaccttgtcagtaggtggataa

DBGET integrated database retrieval system