Bombus pascuorum (common carder bee): 132913974
Help
Entry
132913974 CDS
T09597
Name
(RefSeq) nicastrin isoform X1
KO
K06171
nicastrin
Organism
bpas
Bombus pascuorum (common carder bee)
Pathway
bpas04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bpas00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
132913974
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ncstrn_small
Nicastrin
Peptidase_M28
DUF411
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
132913974
NCBI-ProteinID:
XP_060828672
LinkDB
All DBs
Position
1:5653251..5657885
Genome browser
AA seq
644 aa
AA seq
DB search
MAKCLGCGYLLIFLIVNLVAAERIKDMIYMNFEGVAACFRRHNGTHQFGCSSSRSGSVGV
IHLVEDENDIRWLEHNANGGDYTVILTFSMFTRDILLRLRNTHNINGVLLTKNTTQPHPE
YYSPEDTCPNRYAGYKKCQDLEWNPYGSSLLMEDWPFPMFYTENQTLIEAVKSCFLKHNA
PDMENQYYRPLCALEMKSFMFAAINSESCIKRSDFKLNFNPTQFCDPLGDRNIYWPLAPI
NRDKNSIILVTARLDASSLFDGISPGAGNVVTGLVTLLATAYYLNILAKDAVVKNTNVVF
SLLNGESFDYIGSSRFIYDLKEGNFNALGGVNLKFDDIKTVIEFGQLTKGKLFLHSNNAQ
NDETIKKIQIALNTTVLEGSVPPTSIQSFLKEKPDLTAVVISDHGRQFKNKYYNGILDDA
ESLNFNRSDINGLATALAKIAVHVAEILYKDVSGTESLDDYDSFQSVEHHILEMLKCYLE
SAKCPLFHAASSPNAKLINQVLSLYVGVHRVPNIATTLTGQLLAYLTREEVANMTETTCY
ENHLIWMAGDNNSGLCINSSVNYSTAMSPAFIIDGYDMKSGMYSTWTESIWQTLSVRMFL
KPSAATEQLTMILGSSVAGISFILVWFINSRADILFNSRRAINC
NT seq
1935 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaaatgtttaggttgtggatacttactaatatttcttatcgtaaatctagtggct
gcagaacgaataaaagatatgatttatatgaattttgaaggagttgctgcctgtttccgt
agacacaatggaacacatcagtttggatgttcttcaagtaggtcaggaagtgttggtgtt
attcacttagtggaagatgaaaatgatatcagatggcttgaacacaatgctaatggtgga
gattatactgtaattcttacattttctatgttcaccagagacatattacttcgtttaaga
aatacacataatataaatggagttttattgactaaaaataccactcaaccacatcctgaa
tattattctcctgaagatacttgtcccaatagatatgcagggtataaaaagtgccaggat
ttagagtggaatccttatggatcctcattactcatggaagattggccttttcccatgttt
tatacagagaatcaaacactgatagaagctgtaaaatcttgttttttaaaacataatgca
cctgatatggaaaatcaatactacagaccactgtgtgcactagaaatgaagtcattcatg
tttgctgcaattaactctgaatcttgcattaaacgtagtgattttaaattgaacttcaat
cctacacaattttgtgatcctttgggagataggaatatatattggcctttagctcccata
aatagagataaaaactccataatattggtaacagctagattagatgcatcttctttgttt
gatggaatatcacccggagcaggtaatgtggtcacaggattagtaacattacttgctaca
gcttattatttaaatatattagctaaggatgctgtagtgaaaaacactaatgtagttttc
tctttattaaacggagaatcttttgactacataggatctagtagattcatttatgatttg
aaagaaggtaatttcaatgcattgggtggagtaaatttaaagtttgatgacattaaaact
gtgatcgaatttggtcaactgactaaaggaaaattatttcttcattctaataatgcgcaa
aatgacgaaacaataaaaaagatacaaatagcgttgaatactacggttttggaaggtagc
gttccgcctacatctatacagagtttcttaaaagaaaaaccagatttaactgctgttgtt
ataagtgaccacggtcgacaatttaaaaacaaatattacaatgggattttggatgacgca
gaaagtcttaacttcaataggagcgatataaatgggctcgcaactgctctagcaaagata
gcagttcatgtcgctgaaatcctttacaaagacgtatccggtaccgagtctctcgacgat
tatgattctttccaatctgttgaacatcacattttggaaatgttgaaatgttatttagaa
agtgcaaaatgccctttgtttcatgctgcttcgtctccaaacgctaaattaattaatcaa
gttttatcgctatacgttggtgtacatagggtaccaaatattgccacaacactaactggt
caacttcttgcatatctgactagagaggaagttgcaaatatgacagaaacaacatgttat
gaaaaccaccttatttggatggctggtgataataattcaggtttatgtataaattccagt
gtaaattatagtacagctatgagtccagcatttattattgatgggtatgacatgaaatct
ggaatgtattcaacttggacagaatctatatggcaaacattaagtgtaagaatgttcctg
aaaccttcagcagctacagaacaactcactatgattttaggaagttcagtagctggtata
tcatttatactcgtatggttcattaattctagagcggatatattgtttaattcaagaaga
gcaataaactgctag
DBGET
integrated database retrieval system
