Bacteroides pectinophilus: NQ488_06120
Help
Entry
NQ488_06120 CDS
T09080
Name
(GenBank) alpha-amylase family glycosyl hydrolase
Organism
bpen
Bacteroides pectinophilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Malt_amylase_C
DUF5696
GHL6
Glyco_hydro_70
Alpha-amylase_C
Radical_SAM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWN96871
LinkDB
All DBs
Position
1307903..1309231
Genome browser
AA seq
442 aa
AA seq
DB search
MWFDESVFYQIYPLGFCDVLVSNDGQHASPVGEHARIKKVVDWIPHIKKLGADAIYFSPV
FESDYHGYDTRDYTKIDNRLGSNEDFANVVRTLHENGIKVVIDGVFNHVGRGFFAFQDVL
ANRENSGYKDWFFVNFGGNNDYNDRLWYEGWEGYYNLVKLNLRNNDVVEYLLSCVKQWIE
EFDIDGIRLDVAYCLDHGFMRRLRAHVDSLKPEFFLLGEMLHGDYNTIVNDGMLNSATNY
ECYKGLYSSFNSMNMFEICHSLQRQFGSEQWCLYRGKHLFTFVDNHDVNRIASTLGDANH
IPLIYALAMGMPGIPCVYYGSEWGAEGVKSNGSDNDIRKSYDGPVENELFDKISAMAHAH
HTSRALCYGDFNQVVLTNRQCIFARDCGDEKVLVAVNADSQPFYANFNAGTDKAADLISG
QECCIAGGFELPPYSAYYWRVN
NT seq
1329 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggtttgatgaatcggttttctatcagatatatccgctgggattctgtgatgtgctt
gtcagtaatgacggtcagcatgcaagccctgtcggggagcatgcaagaataaaaaaggtt
gttgactggataccgcacataaagaagcttggagctgatgcgatatacttttcccctgtg
tttgaaagtgattaccacggatatgatacgagagactacactaagattgataacaggctt
ggaagcaatgaggattttgccaatgtggtaagaacacttcatgagaatggaataaaggtt
gttattgacggagtgttcaaccatgtcggaagaggcttctttgcgtttcaggatgtgctt
gccaacagagagaattccggatataaggactggttttttgttaactttggcggtaataat
gattataatgacagactctggtatgaaggatgggaaggctattataatcttgtgaagctt
aatcttcgcaacaatgacgttgttgaatatctgctgtcatgcgttaagcagtggattgaa
gaatttgacatagacggaataaggcttgatgtcgcatattgtcttgatcatggctttatg
agaagattaagagcacatgttgacagccttaagccggagttcttccttctcggtgagatg
cttcatggcgattataatacgatagttaatgacggaatgcttaacagcgcaactaattat
gagtgttacaaggggctttactcaagcttcaactcaatgaatatgttcgagatatgccac
agcctccagaggcagtttggcagtgagcagtggtgcctgtacagaggtaagcatctgttt
acatttgtagataaccacgatgtcaacaggattgcaagcacactcggagatgccaatcat
atcccgcttatatatgcactggcaatgggaatgccgggtataccatgtgtgtattacgga
agtgaatggggcgcagaaggcgttaagtccaacggaagcgataatgatatcaggaagtca
tatgacggtcctgttgagaatgaattgtttgataagataagtgccatggcacatgcgcat
cacacaagcagggcactctgctatggtgattttaatcaggttgtgcttacaaacagacag
tgtatattcgcaagagactgtggtgatgagaaggtacttgtggctgttaatgcagattca
cagcctttttatgctaattttaacgcgggaacagacaaggcagctgaccttatcagcggt
caggaatgttgtattgcaggaggctttgaacttcctccgtattctgcttattattggaga
gttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system