Butyrate-producing bacterium SS3/4: CK3_15330
Help
Entry
CK3_15330 CDS
T02611
Name
(GenBank) Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits
Organism
bprs
Butyrate-producing bacterium SS3/4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_11
AAA_12
Pkinase
AAA_19
AAA_30
PK_Tyr_Ser-Thr
Viral_helicase1
ABC1
UvrD-helicase
AAA
SLFN-g3_helicase
NB-ARC
Kinase-like
AAA_18
AAA_22
AAA_16
ResIII
nSTAND3
APH
RNA_helicase
Rad17
Choline_kinase
DEAD
AAA_14
AAA_17
AAA_5
NACHT
cobW
AAA_7
RuvB_N
TadZ-like_ARD
AAA_28
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBL41216
UniProt:
D7GTS4
LinkDB
All DBs
Position
complement(1532765..1535683)
Genome browser
AA seq
972 aa
AA seq
DB search
MLNAEFNGKNDWGLILLDYVDGTNLEELDLSNFSQIEKYELCLKILKAIEEAHNNNVLHR
DIKPSNIMYNIDTGEVKIIDFGTSKIKSIVEQETTLPFYSPNFSAPEVVKGNSTTEASDI
YSLGAVIFYILFSMLPNGTEMICRSLQDLEVPENLVTVIAKMVAEEPRDRFQEVGTVIDA
FEEILGDNASQKDTYLCSIDVDKLRYLKNISLIEANTNMTIFTKSFLKSQFKECSAFYNH
NMDVYVFSGKKIAVECIYNEKDELFVVSKIMPLSVDRRISNQKRGFIIDGIVKFIESGRG
NYSNKRLDNDNEKLIVQFKNNINSKSALQKQDELFEELFGKWQDGLDESMKNEKERVGKV
VYSSFSILDQQLILTVEEYKNNDIDGLENDKKYIIEDVDSRGNSFYFDIGTYHGISYEDD
ETLLIIDLDKKVQMGKVRPLLRKHCSVMEDFRANISAYKRQHYAIRALHDDNYSSKNLKD
ILLNLDEPTYTPFLQNIKFSKDTLNVSQREAIRKALYSDSISLIQGPPGTGKTTVIKEIV
RRILMQINKFDDTSRILVVSQSHTAVDNIIEGLVDIDEGKLDIIRIGRAENISPKVEETC
TMNAIRKKMFTEIKEKSDTYIEHQNLLYANITEQKALDRWERIKDIQKDWINRCSNLETL
DYQVVKSATIIAGTCVGFLSNDFVKELDFDYVIIDEAAKATTPELLVSIIKSKKIILVGD
QNQLPAYADQDLSPIIAKLTKEPKYRLFDLLFNVLPDTHKQILTVQYRMRRNIGNLISQV
FYEGKIATEVDDKNRMHPIKKFAGKSIIWVDTSIMDKKDESRLKGGSYCNYAENNLIKKL
LENFKREGVLSQLDIGIITGYRGQKDLIRKSVNNSGYDRIAKGIDINTLDAFQGRENDVI
IYSTVRTKNSIGFQKEKERVNVAFSRAKNLLIICGDMDFFYRFDDPDNKFIEIIDYICEH
EDECLIIPGGEI
NT seq
2919 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaatgcagaatttaatggtaaaaacgactggggattaattttactagattatgtt
gatggaacaaatcttgaagaattagatctgagtaacttttcgcaaatagaaaagtatgag
ctttgcttaaaaattttaaaggcgattgaagaggcacataataacaatgttttgcatcgc
gatataaagccgtccaatattatgtataatattgacacgggagaagtgaagattattgat
tttggaacgagtaagattaaatctatagtagagcaagagacaactttgcctttttattct
cctaatttctcggcaccggaagtagttaaggggaatagtacaacggaagctagcgatatt
tattccttaggtgcagtaattttctatattttgtttagtatgttgccaaacgggacagag
atgatttgcagaagtttgcaagatttagaagttccggaaaatttagtaacagtaattgct
aagatggtggcggaagaaccgagagatagatttcaagaggttggaacagttattgatgct
tttgaggaaattcttggagataatgcttctcaaaaggatacatatttatgtagtatcgat
gttgataagctgagatacttaaaaaatatttcgctaattgaagccaatactaatatgact
atttttacaaaatcatttttaaagagtcagtttaaggagtgttctgctttttataatcat
aatatggatgtttatgttttttctggaaagaaaatagcagttgaatgtatctataatgaa
aaagacgaattatttgtggttagtaaaattatgccactatccgttgatagaagaattagt
aatcaaaaaagaggttttattatcgatggtatagttaaatttatagaaagcggaagagga
aattatagtaataaaaggttagataacgataatgaaaagctaatcgtacaatttaaaaat
aatataaatagcaaaagtgcgttacaaaaacaagatgagctatttgaagaattgtttgga
aaatggcaggatggattagatgaatccatgaaaaatgagaaggaacgagtaggaaaggtt
gtttattcttcgtttagcatattagatcagcaattaattttaactgttgaagaatataaa
aataatgatattgatggtttagaaaatgataaaaaatatattattgaagatgtagatagc
agaggcaattcgttctattttgacataggcacttatcatggaataagctatgaagatgat
gaaacattacttattatcgatttggacaagaaagtgcaaatggggaaagtgcgcccatta
cttagaaaacattgttcagtgatggaagattttagagcaaacataagcgcatataaaagg
caacattatgcgattcgtgcattgcatgatgataattactcgtctaaaaacttaaaagat
attttgcttaatttagatgaaccaacctataccccgtttttacagaatattaaatttagt
aaagatacattaaatgtgtctcagagagaagcaataagaaaagcgctgtattcagatagc
attagtttaatacaaggacctccaggaaccggaaaaacaacagttataaaagagattgtg
cgacgaattttaatgcagataaataaatttgatgatacgtctagaattttagttgtatct
caatcacatacggcagtagacaatattattgagggattagtcgatatagatgaagggaaa
ttggatattatccgaatcggccgtgcggagaatatatcaccaaaggttgaagaaacctgt
actatgaatgctatcagaaaaaagatgtttacagaaatcaaagagaaatctgatacatat
attgaacatcagaatttgttgtatgctaatattactgagcaaaaagcattagatagatgg
gaaagaatcaaagatattcaaaaggattggattaatagatgcagtaatttagaaacatta
gattatcaggtagtaaaaagtgcaaccattattgccggaacttgtgtaggttttttgtca
aacgattttgttaaggagttagattttgattatgtaattattgatgaagcggcgaaagcg
acaactccagaactgttggtttcaattataaagtccaaaaaaattatattggtaggtgat
cagaatcaactgccagcgtatgctgatcaagacctatctccaataatagctaagttgaca
aaagaaccaaagtacaggttatttgatttattattcaatgtgttgccagatacacataaa
cagattttgactgtgcaatatcgaatgagaaggaatattggaaatctgattagccaagtc
ttttatgaaggtaaaattgcaacagaagttgatgataagaatcggatgcacccaattaaa
aaatttgcaggaaaatctattatttgggttgatacttcaataatggataaaaaagatgag
agcaggcttaaaggtgggtcttattgcaactatgcagagaataatttgataaaaaaatta
ttggaaaactttaagagagaaggagtgctttcacagttagatattggtataattacggga
tatcgcggtcaaaaagatttaattagaaaatctgtaaataatagtggatatgatagaatt
gcgaagggaattgatataaatacacttgacgcattccagggcagggaaaatgacgttatc
atatatagcacagtcagaactaaaaactcaattggatttcaaaaagaaaaagaaagagtt
aatgtagctttttctcgtgcaaaaaatttgcttattatttgtggagatatggactttttc
tatagatttgacgatccagataataagtttattgagattattgattatatttgtgaacat
gaggacgagtgccttattataccgggaggtgaaatataa
DBGET
integrated database retrieval system