KEGG   Basilea psittacipulmonis: IX83_05160
Entry
IX83_05160        CDS       T03226                                 
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase
  KO
K03578  ATP-dependent RNA helicase HrpA [EC:5.6.2.6]
Organism
bpsi  Basilea psittacipulmonis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bpsi00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:bpsi03019]
    IX83_05160
Enzymes [BR:bpsi01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.6  RNA 3'-5' helicase
     IX83_05160
Messenger RNA biogenesis [BR:bpsi03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   Other RNA degradation factors
    Others
     IX83_05160
SSDB
Motif
Pfam: DUF3418 OB_NTP_bind Helicase_C DEAD HA2_C AAA_22 nSTAND3 WHD_HA2 AAA_19 SRP54 ResIII ABC_tran SLFN-g3_helicase NACHT NTPase_1 AAA_16 AAA_30 nSTAND_NTPase5
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIL32780
UniProt: A0A077DD70
LinkDB
Position
complement(1157937..1161719)
AA seq 1260 aa
MFRKNKSNMMLPTIEYDDNLPVVGMLDEIRIAIETHQVVVICGETGSGKTTQIPKLCLQI
GRGAKGKIIGHTQPRRLAATSVAKRLAAELKSELGQWVGYQIRFHEKRSEQTKIKLMTDG
ILLAELQNDPLLKRYDTIIIDEAHERSLNIDFLLGFLKPLLKKRRDLKLIVTSATIDAQR
FAQHFEENNKKVPIIEVSGRLYPVEIRYRPVNFGTDTTASETDEERDLMDAIVDAVDECI
HHGTGDILIFLPGEREIREAAQALQKHHLSGALILPLYARLSQQEQERIFKVDSQLRRII
LATNVAETSLTVPGIRFVIDSGLARVKRYSLKNKVEQLEIEPISKASAKQRSGRCGRLAE
GVCIRLYDEEDYEKRPEFTDPEILRSSLASVILQMKALRIHDVESFPFIQMPSRRAFSDG
MAQLRELNALNDKNQLTPIGKVLSSLPLDPRVGRMILAAKENQSLKEVLVIASALTIQDP
RERPLEQRDLAQQLHAKFQDDQSEFMSYLKLWDWYHDAVKHKDSQRKLQQKLKDNFLSSL
RLREWHDVHSQILTLIKERGWRVNELAATYEQIHTSLMAGLLGNLGLKILTEEVPQQASY
QGARGIKFTIHPSSTLRKKAGKWIMASELVETSKLYARCIANIDPKWIEGVGEHLLQKHY
SDPQWYAKQGQVLVNERATLYGLPIYTGRKRQPVDIEQAHEIFIRDALMTGDIQTNLPFL
KHNQKIIDEVERLEHRSRRQDILVDDALILNFYKEKIPSHIHKTVALERWYKQLNEEQKK
TLLLSKEDLMRHDAQGITSETFPKKLNLGELKLSLSYHFEPGSPKDGVTATVPVYALNQL
SDKPCTWLVPGMLKEKVLALLKSLPQKLRKSCVPLPDYAENFYHQYFDQQDLKMDKSLVQ
ALCDDIYEKKRIHVTVHDFQESSLPPHCFMNFKIVDEHGRMLSAGRHLDMLKATHGHLAR
ESLQQLVHKQSDLDKIKKDRIVTWDFGAMPEILEIQKNHQTLMGYAALVDHGDHCQMDVF
DEQAQAMIAHQKGLLRLYKLALKDQIKGLLKQIPQQDKLGMLYLSFGTLDDLKEDILDAA
LKHLGWGESLPHDEESFQLKIMEIKQRLGLFIQEVAKLTLTILNDYAMVQKNISSIKAFT
QAQEDISENLKLLVFKGFLSSTPFEQIKHLPRYLQATLRRIDKIKQDPARDQKLMSELKP
LWQMYGRKKQMLKGRVDDHLETFFFMLQELRVMLFAQELKTPMPVSVKRLYKMWESLGLA
NT seq 3783 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgtttagaaaaaataaatcaaatatgatgttaccaacgatagaatatgacgataatttg
cctgtagtagggatgcttgatgaaattagaatagcgattgaaactcatcaagtggtcgtt
atttgcggtgaaacaggttctggaaaaacgacacaaattcctaagctatgtctgcaaatc
ggtagaggggcaaaaggaaagataattggccatacgcaaccaagacggctagcagcgact
tcagtggcgaaacggttggctgcagaattgaagtctgaattaggtcaatgggtcggctat
caaatacggtttcatgaaaaacgcagtgaacagaccaaaataaagctgatgacagatggc
atattattggctgaattgcaaaatgatccgctgttaaaacgttatgacaccattattatc
gatgaagctcatgaacgcagtttaaatattgatttcttattaggatttctgaaaccttta
ttaaagaaacgtcgtgatcttaaattaattgtgacctctgctacgattgatgcacaacgc
tttgcccagcactttgaggaaaataataaaaaagtgccgattattgaggtatcgggtcgt
ttatatcctgtcgaaattcgctatcgtcctgttaattttggaaccgataccactgcaagc
gaaacagatgaagaacgtgatttgatggatgctattgtggatgcggtggatgagtgtatt
catcatggaacaggtgatattttgatttttttgccaggtgaacgtgaaattcgagaagct
gctcaagccttgcaaaaacatcatttatctggtgccttgattctacctttgtatgccaga
ttatcccaacaagaacaggaacgtatttttaaagtggatagtcagttacgtagaattatt
ttggcaactaacgtggcagaaacttctttgactgtgccaggtattcgttttgtgatagat
agtggtttagctcgagtcaaacgatattctttgaaaaataaggttgaacagcttgagatt
gagccgattagtaaagcatcggctaaacaaagaagtggacgttgtggacgactggctgaa
ggggtgtgcattcgactttatgatgaagaggattatgagaaacgccctgaatttacagat
ccagagattttgcgaagttcgttagcttccgttatcttacaaatgaaagcactcaggatt
cacgatgtcgaaagttttccttttatacaaatgcccagtcgtcgagctttttcagatggt
atggctcagcttcgtgaattaaatgccttaaatgataagaatcaattaacccctattggt
aaggttttatccagtttaccgctggacccaagagtgggaagaatgatcttggcggctaag
gaaaatcaaagtctgaaagaagttttggtgattgcgtcggcattaacgattcaagatccg
cgtgaacgtcctctagaacagagagatttggcacaacagctacacgctaaatttcaagat
gatcaatctgaatttatgagttatttaaaactctgggattggtatcatgatgcggttaaa
cacaaggattctcaacgtaaattacaacaaaaattaaaagacaattttttatcttcttta
agattaagagagtggcatgatgtacattcgcagattttgactttgattaaagaacgagga
tggcgtgttaatgagcttgcagccacctatgaacagattcataccagtttaatggctggc
ttattaggtaatttgggtttgaaaatactgacggaagaggttcctcaacaagcctcttat
caaggtgccagaggtatcaaattcacgatacatccctcatcaacgttaagaaaaaaagca
ggtaagtggattatggcttctgagttagtggagacgagtaaattgtatgcccgttgtatc
gctaatattgatcctaagtggatagagggagttggcgaacacttgttacaaaaacactat
tccgatccacaatggtatgctaaacaaggtcaggtgctggttaatgaacgagccactttg
tatggattacctatttatacaggcagaaaaagacaacccgtcgatattgaacaggctcat
gaaatctttatacgcgacgcattgatgacgggagatatacaaacaaacttgccgttttta
aaacataatcagaaaattatcgatgaagttgagcgtttggaacatcgctctcgcagacag
gatattttggtggatgatgccttaattttgaatttttataaggaaaaaattccctcacat
atccataaaacagttgcgttagaaagatggtataaacagttaaatgaggaacaaaagaaa
acattattgctgagtaaagaagatttgatgcgtcatgacgcacaagggattaccagtgaa
acatttcccaaaaaattaaatttaggcgaactcaaactctcgttaagttatcattttgag
ccgggctctcccaaagatggtgtcacggctaccgttcctgtttatgccttaaatcaacta
tcggataaaccttgtacttggttagtaccggggatgctaaaagaaaaagtattggcctta
ttaaaatcattgccccagaaattaagaaagtcttgtgtaccgctacccgattacgcggaa
aatttttatcatcagtattttgatcagcaagatttaaaaatggataaatcattggtgcaa
gcattatgtgatgatatttacgagaagaaacgaattcacgtcactgtgcatgatttccaa
gaatcaagcttgccacctcattgttttatgaattttaaaattgttgatgaacacggacgc
atgctatcggctggaagacatctggatatgttaaaagcgactcatggtcatttggcacgt
gaaagtctgcaacagcttgttcataaacagtctgacttggataagattaaaaaagatcgt
attgtgacatgggattttggggcgatgccagagatcttagaaatccagaaaaatcaccaa
accctaatgggttatgcagccttggtcgatcatggtgatcattgtcaaatggatgtgttt
gatgaacaagcacaggcaatgatcgcacatcaaaaaggcttgctaagattgtataaactt
gctttaaaagatcaaatcaaagggttattaaaacaaatccctcaacaagacaaattaggt
atgttgtatttgtcttttgggactttggatgacttaaaagaagatattttagatgccgca
ttaaaacatttaggatggggagaatccttgcctcatgatgaagaaagttttcaattaaaa
atcatggaaatcaaacagcgtttggggctgttcattcaagaagtcgcaaaattaaccttg
acgatcttaaatgattatgcgatggttcaaaaaaatatatcttccattaaagcctttact
caggcacaagaagatataagtgaaaatttgaaattgctggtgtttaaaggctttttatcc
agtacaccatttgagcaaataaaacatctcccgcgttatttgcaagctacgctaagacgt
atcgacaaaatcaaacaagatcccgcaagagaccaaaaactaatgtcagaattaaaacct
ttatggcaaatgtatggacgtaaaaaacaaatgctcaaaggtagggtagatgaccatcta
gagacttttttctttatgttgcaagagttaagagtgatgttgtttgcacaagagttaaaa
acgccgatgccagtgtcggtaaaacgtttatacaaaatgtgggagagtctcggtttagct
taa

DBGET integrated database retrieval system