Bacillus pumilus SAFR-032: BPUM_1804
Help
Entry
BPUM_1804 CDS
T00599
Name
(GenBank) collagen triple helix repeat protein
Organism
bpu
Bacillus pumilus SAFR-032
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
CBM_5_12
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABV62475
UniProt:
A8FE08
LinkDB
All DBs
Position
1851328..1856925
Genome browser
AA seq
1865 aa
AA seq
DB search
MGNLYNQFDHKCPFCGKYHEEPHYKRSRHDRPQRRDCPYIKQEHSKQNRPQGDPSCAKGE
KQPKIIQRVGRRGPAGPAGPTGPTGPAGGLIGALPFNPSQSQDYEAGQVVTFNGSTYIAN
VDAPSGIPGLSPDYTLLAASGETGPTGPTGIGLSGIEAYDPARASTYSIGQVVTYEGGTY
IVDSAPPLGTPDTSPDYTLLAAPGVSGSTGVTGITGATGSTGATGSTGSTGPTGPTGATG
ITGSTGPTGVTGITGSTGSTGVTGSTGPTGSTGITGSTGSTGATGITGSTGSTGATGITG
PTGPTGVTGITGATGTTGATGITGVTGSTGVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGSTGITG
VTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGITGSTGPTGATG
ITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGSTGPTGATG
ITGITGSTGPTGATGITGSTGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTG
STGITGSTGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTG
ATGITGATGPTGATGITGATGTTGATGITGATGITGSIGPTGATGITGATGPTGATGITG
ATGPTGATGITGATGSTGATGITGSTGSTGATGITGATGPTGVTGITGSTGPTGVTGITG
TTGSTGSTGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITG
ATGSTGVTGITGSTGTTGATGITGATGPTGVTGITGSTGTTGATGITGATGPTGVTGITG
TTGSTGSTGITGVTGPTGATGITGSTGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITG
ATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGTTGATGITGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITG
ATGPTGATGITGATGTTGATGITGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG
ATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGATGPTGVTGITGTTGSTGSTGITGVTGPTGATGITG
STGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITG
ATGPTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITG
ATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGSTGPTGPTGSTGITGATGPTGATGITG
ATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITGTTGSTGSTGITG
ATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGATGPTGATGITGSTGPTGVTGITG
ATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITGSTGPTGATGITGATGITG
STGPTGATGITGATGPTGATGITGATGSTGATGITGATGSTGATGITGATGITGSTGPTG
ATGITGSTGPTGATGITGSTGSTGATGTTGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGSTGPTG
ATGITGATGPTGVTGITGATGPTGATGITGATGPTGVTGITGATGITGSTGPTGATGITG
ATGPTGVTGITGATGITGATGPTGVTGITGATGITGATGSTGATGITGSTGPTGATGITG
ATGATGATGSTGPTGPTGATGSTGATGPTGATGITGSTGPTGATGTGGFTDTALYAANSS
GPTIVTVAGGTNIPLPNFQNITGFTANGTSTVFTVLQTGKYYITYQVNTTTALLISTRLL
LNGATTISGSVQSPVISTSFINNTVIVNLTAGSTISLQFFGAVVTAILVGGGGAAGATLT
IIRLS
NT seq
5598 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggcaatttgtacaatcaattcgatcacaaatgtcccttttgcggtaaatatcatgag
gagcctcattacaaaagatcacgtcatgaccgtcctcaaagaagagactgtccgtatatc
aaacaagaacattcaaaacaaaacagacctcaaggagatccctcctgtgcaaaaggagaa
aaacaaccaaaaataattcaaagggttggacgaagaggcccagcaggtcccgctgggcct
accggaccaaccggacctgctggcggattaatcggcgccctcccttttaacccctcacaa
tcacaagattacgaggcgggtcaagtcgtcacgtttaatggcagtacttatattgccaat
gtagatgctccctcaggaatacctggactttcccccgattatacccttttggcagcttct
ggggaaactggtccgactggtcctacagggataggattaagtggtattgaagcatatgat
ccagcaagagcatcaacatattcaatcggtcaagtggtcacttatgaaggtggtacgtat
attgtggactctgctccacctttaggtacgccagatacgtccccggattatacgcttttg
gcagcacctggtgtttcaggttctactggagttacaggaatcactggtgcaactggttct
actggtgcaactggttccacaggtagcactggaccaactggtccgactggagcgactggt
atcactggttcaactggacctactggcgtcacgggaatcactggttcaactggatctact
ggtgtgacaggcagcactggtcctactggttctacaggaatcactggttcaactggatct
actggtgccacaggtatcacaggttcaaccggatctactggggctacgggaatcactgga
ccaactggtcctactggtgtgacaggaatcactggggctaccggaactactggtgcgact
ggtatcactggggttaccggatctactggcgtcacaggtatcactggtgctactggtcct
acgggcgtcacaggtatcactggtactaccggatctactggcagcacaggtatcactggt
gttaccggacctactggtgcaacaggtatcactggttcaactggatctacgggtgccacg
ggtagcactggaccaactggtccgactggttctacaggaatcactggtgctaccggtccg
actggagccacaggtatcacaggtatcacaggttcaaccggacctactggggccacaggt
atcacaggttcaaccggacctactggtgcaacaggaatcactggtgctaccggacctacg
ggcgtcacaggtatcactggtgctactggtcctacgggcgtcacaggtatcactggtact
accggatctactggcagcacaggtatcactggttcaaccggacctactggtgcaacaggt
atcacaggtatcacaggttcaaccggacctactggggccacaggtatcacaggttcaacc
ggacctactggtgcaacaggaatcactggtgctaccggacctacgggcgtcacaggtatc
actggtgctactggtcctacgggcgtcacaggaatcactggtactaccggatctactggc
agcacaggtatcactggttcaaccggacctactggtgcaacaggtatcactggtgcaact
ggatctacgggtgccacgggtagcactggaccaactggacctactggtgcaacaggaatc
actggtgctaccggtccgactggagccacaggtatcactggttcaaccggacctactggg
gccacaggtatcactggtgctaccggaccgactggtgcaacaggtatcactggtgcaacc
ggaactactggtgcaacaggtatcactggtgcaactggtatcacaggttcaatcggaccg
actggagccacgggaatcactggtgctaccggtccgactggagccacaggtatcacagga
gctaccggacctactggagccacaggaatcactggtgcaactggatctacgggtgcaacg
ggtatcacaggttcaaccggatctacgggtgccacaggaattactggtgctactggacct
acgggcgtcacaggtatcacaggttcaaccggacctacgggcgtcacaggtatcactggt
actaccggatctactggcagcacaggaatcactggtgttaccggacctactggtgcaaca
ggtatcactggttcaactggatctacgggtgccacgggtagcactggaccaactggtccg
actggttctacaggaatcactggtgctaccggacctactggagccacaggaatcactggt
gcaactggatctacgggcgtcacaggtatcacaggttcaaccggaactactggggccaca
ggtatcactggtgctaccggacctacgggcgtcacaggtatcacaggttcaaccggaact
actggggccacaggtatcactggtgctaccggacctacgggcgtcacaggtatcactggt
actaccggatctactggcagcacaggaatcactggtgttaccggacctactggtgcaaca
ggtatcactggttcaactggatctacgggtgccacgggtagcactggaccaactggtccg
actggttctacaggaatcactggtgctaccggacctactggtgcaacaggtatcactggt
gcaactggacctactggcgtcacaggtatcactggtgctaccggaccgactggtgcaaca
ggtatcactggtgcaaccggaactactggtgcaacaggtatcactggaccaactggtccg
actggttctacaggaatcactggtgctaccggacctactggagccacgggaatcactggt
gctaccggaccgactggtgcaacaggtatcactggtgcaaccggaactactggtgcaaca
ggtatcactggaccaactggtccgactggttctacaggaatcactggtgctaccggacct
actggagccacgggaatcactggtgctaccggtccgactggtgcaacaggaatcactggt
gctaccggacctacgggcgtcacaggtatcactggtgcaactggtcctacgggcgtcaca
ggtatcactggtgcaactggtcctacgggcgtcacaggtatcactggtactaccggatct
actggcagcacaggaatcactggtgttaccggacctactggtgcaacaggtatcactggt
tcaactggatctacgggtgccacgggtagcactggaccaactggtccgactggttctaca
ggaatcactggtgctaccggacctactggagccacgggaatcactggtgctaccggaccg
actggtgcaacaggtatcactggtgcaaccggacctactggcgtcacaggtatcactggt
gctaccggaccgactggtgcaacaggtatcactggtgcaactggatctacgggtgccacg
ggtagcactggaccaactggtccgactggttctacaggaatcactggtgctaccggacct
actggagccacgggaatcactggtgctaccggtccgactggagccacaggtatcacagga
gctaccggacctactggagccacaggaatcactggtgcaactggatctacgggtgccacg
ggaatcactggtgctaccggatctacgggtgcgacgggtagcactggaccaactggtccg
actggttctacaggaatcactggtgctaccggacctactggagccacgggaatcactggt
gctaccggacctactggcgtcacaggtatcacaggagctaccggacctactggtgcaaca
ggtatcactggtgctaccggacctactggtgccacaggtatcactggttcaactggtcct
acgggcgtcacaggtatcactggtactaccggatctactggcagcacaggaatcacaggt
gctaccggacctactggagccacgggaatcactggtgctaccggtccgactggagccaca
ggtatcacaggtgctaccggacctactggagccacaggaatcactggtgcaacaggacct
actggtgcaacaggtatcacaggttcaaccggacctactggcgtcacaggtatcactggt
gctaccggatctacgggtgccacaggaattactggtgctaccggatctacgggtgccacg
gggatcactggtgcaactggatctactggagcgactggtatcactggtgccacaggaatt
actggttcaaccggacctactggtgccacaggaattactggtgccacaggaattactggt
tcaaccggacctactggggctacggggatcactggtgcaactggacctactggagccacg
gggatcactggtgcaactggatctactggagcgactggtatcactggggcaactggatct
actggagcgactggtatcactggtgccacaggaattactggttcaaccggacctactggt
gccacaggaattactggttcaaccggacctactggcgctacaggaatcactggttcaacc
ggatctactggtgccacggggaccactggtgcaactggaccaactggtgccacaggaatc
actggtgctaccggtccgactggtgttacaggaattactggttcaaccggacctactggg
gccacggggatcactggtgcaactggtccgactggcgtcacaggaatcactggtgcaact
ggaccaactggtgccacaggaatcactggtgcaaccggtccgactggtgttacaggaatc
actggtgccacaggaattactggttcaaccggacctactggtgccacggggatcactggt
gcaactggtccgactggcgtcacaggaatcactggtgccacaggaatcactggtgctacc
ggtccgactggtgttacaggaatcactggggccacaggaattactggtgctaccggatct
acgggtgccacgggaatcacaggttcaaccggacctactggcgctacaggaatcactggt
gcaactggagctactggtgccacaggtagcactggaccaactggtccgactggtgccacc
ggatctactggggccactgggcctacaggggctaccggaatcactggttcaaccggacct
acgggagctactggaacaggtggttttacagatactgcactttatgctgctaatagttct
ggacctaccattgttactgtagccggtggaacgaatattcctctgccaaactttcaaaac
attactggttttacggcaaacggcacaagtactgtttttaccgttctgcaaactggtaaa
tattatattacgtatcaagtcaacaccactacagctcttttgattagtacacgtttgctt
ttaaatggagcaactactatttctggttctgttcaatcacctgttatctcaacttcattt
atcaacaacactgttattgttaatttaacagctggaagcaccatttcactgcagtttttt
ggggcagttgtcacagctattttagttggaggaggcggtgctgcaggtgctaccttgacc
atcattcggcttagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
