Borrelia puertoricensis: bpuSUM_000582
Help
Entry
bpuSUM_000582 CDS
T08229
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
bpur
Borrelia puertoricensis
Pathway
bpur03030
DNA replication
bpur03430
Mismatch repair
bpur03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bpur00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
bpuSUM_000582 (dnaE)
03430 Mismatch repair
bpuSUM_000582 (dnaE)
03440 Homologous recombination
bpuSUM_000582 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
bpur03032
]
bpuSUM_000582 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bpur03400
]
bpuSUM_000582 (dnaE)
Enzymes [BR:
bpur01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
bpuSUM_000582 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
bpur03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
bpuSUM_000582 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
bpur03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
bpuSUM_000582 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPA18054
LinkDB
All DBs
Position
600882..604325
Genome browser
AA seq
1147 aa
AA seq
DB search
MGLQVKFVHLHVHSDYSLLDGAAKITDIVTKAKKCNMSHIALTDHGNLFGAMKFYREAKG
AGIKPIIGMEAYMSSTSKHIKKNDEFGRPYYHLIFLAKNELGYKNLLKLTSISYLDGFYY
RPRIDKEDIEKYSEGLICTSACIGGIIPQLILANKFDDAKNEILWFKSVFGDDFYLELQR
HGIKQQDIVNEKLIAYSIELNVSLTVSNDSHYVNKEDATAQDIIVCIGTGAKRSDPNRLK
METNEFYLKTQEEMCKLFRDLPGALANTLKIAEKCDEFEIKFPGPIFPEYQVPSEFDTLS
QYLEHLTLEGLKFRYANVTDSIKERAFYELSTIIKMGFEAYFLIVWDFIKFAHDNDIPVG
PGRGSGAGSIVAYALRITDIDPLKYNLLFERFLNPERVSMPDFDIDFCFEGRDEVIKYVT
RKYGEDKVAQIITFGTLKPKAVFKDVGRVLDIPFAESNELTKLIPDGPKVSLREVFKDKA
LKAYLNKGAVYNELMEAALVLEGMNRYVSTHAAGIVISRTPLTDYVPLYKDYKQNTVSTQ
YTMDLLEDCGLVKMDFLGLKTLTLIKNAENLIRITNPNFSIANISDSDVKTFKMLSEGRS
ASVFQFESEGMQQVLKEAKPDSIEDLIALNALYRPGPMQFIPQFISAKTGTKRIRYPHPD
LKEVLKPTYGVIVYQEQVMEVARIIGGFSLGKADILRRAMGKKKEDEMNKMKVDFIKGAL
SKGYDEVLANDIFELLKPFAGYGFNKSHAAAYSLIAYQTAYLKANYPENFMAANLTNEIN
NTEKLSYYIEEAKSMGINVLKPDINQSFKEFSVVGLNISYGLNGIKNIGGMIVDLIITER
QKNGEYKSFEDFVRRVDDKVINKKFLEAAIKSGLFDSLGQNRKTLFENLDKLINFVIKDR
NDKKLGQNSLFGSQDAIQQSFNYHIFEEYSYPELLRFERELLGFYVSGHPLDHYKPELEH
FTNFNVLEDLAVKKDTTVKFAGSLNAVRVIRTKRNNARMAFGVIEDFKGEMDIIVFAENY
EKYNHLLIEGDVIGVIGKLRFERDKFSIIVDKVLSIEEISVNNVNKINNLHIKFSDERLG
DSHLLYSLKDEIFNLEDNTGFSHVYLYLKNDDKSLKLKMDLTLNFKPDEFKLNELRCHKI
VEDVWFD
NT seq
3444 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtttacaagttaagtttgttcatttacatgtacattcagattattctcttttagat
ggagcggccaagattacagatattgtgacaaaggctaaaaaatgtaatatgtcccatatt
gcattaacagatcatggcaatctttttggtgctatgaagttttatagagaagcaaaaggg
gcaggaataaaacccatcattggtatggaagcttacatgtcaagtacctcaaagcatata
aaaaagaatgatgaatttggaagaccttattatcatttaatttttcttgcaaagaatgaa
ttaggctataaaaatttattgaaattgacaagtatttcttatcttgatggattttattat
cgtccaaggattgataaggaagatattgaaaaatattcagaaggacttatttgtacgtct
gcatgtattggtgggatcattcctcaattaattcttgcaaataaatttgatgatgcaaag
aatgaaattctttggtttaagagtgtctttggtgatgatttttatcttgaacttcagcgt
catgggattaaacaacaggatatagttaatgaaaaattaattgcttattctatagagctt
aatgtttcactaactgtgtctaatgattctcactatgtgaataaagaagatgcaacagct
caagatattattgtctgcattggaacgggtgctaagagaagtgatcctaatagacttaaa
atggagactaatgagttttatcttaaaactcaagaggagatgtgtaaactctttagggat
ttgccaggggctttagcaaatactttaaaaattgctgaaaaatgtgatgaatttgagatt
aaatttccaggccctatttttcctgaatatcaagtacctagtgagtttgatactcttagt
caatatttagagcatttaacacttgaaggtttgaagtttagatatgcaaatgtaactgat
agcattaaagagcgtgctttttatgagctctcaacaattatcaagatgggatttgaggcg
tattttttaattgtttgggattttataaaatttgcacatgataatgatattcctgttggt
cctgggcgtggctctggagctggttctattgttgcatatgctcttagaattactgatatt
gatcctttgaaatataatctactttttgagagatttttaaatcctgaacgtgtatctatg
cctgattttgatattgatttttgctttgaaggtagagatgaagttataaagtatgttaca
agaaaatatggtgaggataaggttgcacagataattacttttggaactttaaaacctaag
gctgtatttaaagatgtgggcagagtgctagatattccttttgcagagtctaatgaatta
actaagcttattcccgatggtccaaaagtttccttaagagaagttttcaaagataaagct
ttaaaggcatatttaaataagggagctgtttataatgagttgatggaagcggcgcttgtt
cttgaaggcatgaatcgatatgtctcaactcatgcggcaggtattgtgatttctagaact
cctttaacagattatgttccactttataaggattataagcaaaacacagtttctacacaa
tataccatggacttgttagaggattgtggtcttgtaaagatggattttcttggacttaag
acattgactttaataaagaatgcagaaaatcttattaggattactaatcctaattttagc
attgctaatatttctgatagtgatgttaagactttcaaaatgctttctgagggacgtagt
gcatctgtttttcaatttgaatctgaaggtatgcagcaagttttaaaagaagcaaaacct
gacagtattgaagatttgattgctttaaatgcactttatcgaccaggtcctatgcagttt
atacctcaatttatttcggctaagacaggaactaagcggattagatatcctcatccggat
ttaaaagaagttttaaagccaacttatggagttattgtttatcaagaacaggtaatggaa
gttgcaaggattattggtggattttctcttgggaaagcagatattttaagacgtgcaatg
ggaaagaagaaagaagatgagatgaataaaatgaaggttgactttataaaaggtgctctt
agtaagggttatgatgaagttcttgcaaatgatatatttgagcttttaaaaccctttgct
ggttatggctttaataaatctcatgcagctgcgtattctttaatagcttatcaaacagca
tatcttaaggccaattatcctgagaattttatggctgccaacttgacaaatgagattaat
aatactgaaaagctgtcttattatattgaagaagcgaaatcgatggggatcaatgtttta
aaacccgatataaatcagtcttttaaagaatttagtgtagtgggattgaatatttcttat
ggtcttaatgggattaagaatatcggggggatgatagttgatcttataattactgaaagg
caaaaaaatggggaatataaatcttttgaagactttgttagaagagtggatgataaggtt
ataaataaaaaatttcttgaggccgcaataaagtctggactttttgacagtcttggtcaa
aatagaaaaacactttttgaaaatcttgataaattaataaattttgtaataaaagatagg
aatgataaaaaacttggccagaatagtttatttggctctcaagacgctattcagcagagt
tttaattatcatatatttgaggaatattcttatcctgaacttttaagatttgagagagag
cttttaggtttttatgtatctgggcatcctcttgaccattataaacctgaactagaacac
tttacaaactttaatgttttagaggatcttgctgttaaaaaagatactactgttaaattt
gctggcagtctgaatgcggtaagggttattcgtactaagagaaataatgctaggatggcc
tttggagttattgaagattttaaaggtgagatggacattatagtttttgctgaaaattat
gaaaaatataatcatttattaattgaaggtgatgtgattggtgttataggtaagcttaga
tttgaaagagataaattttcaataattgttgacaaagttttaagtattgaagaaatttct
gtaaataatgtgaataagattaataatcttcatattaaattttctgatgaaagactgggt
gattctcatcttctttattctctaaaggatgaaatctttaatcttgaggataatactggg
ttttcacatgtttatctttatttaaaaaatgatgataaaagcttgaaacttaaaatggat
ttgaccttaaattttaagcctgatgagtttaaacttaatgagttaagatgtcataaaata
gtggaggatgtttggtttgattag
DBGET
integrated database retrieval system
