Borrelia puertoricensis: bpuSUM_000806
Help
Entry
bpuSUM_000806 CDS
T08229
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB domain-containing protein
Organism
bpur
Borrelia puertoricensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPA18248
LinkDB
All DBs
Position
842397..846785
Genome browser
AA seq
1462 aa
AA seq
DB search
MNLFFIRNKIALSFIFSMIVFVSILVIFIVFIQAQVYSAKFFIMSYLESKTGFKIKYDKI
APYFLSSIKIDNLELSLNDKDTILMNTVKVNLDLFKLLLGDKNIILDVFVRGSTLNFDLN
DFKFLNPQSSHSHTLKLDDDSTSHAMFGKMFNLFDSLHVHLEDINMNFRLISDKFLKFQI
KSFALKTIDDDFLFSFIVDFSSIAVLNPDVSHENILDSTFYFEGKFKKELEDGYINFSFL
KLHTSYFDLLEQGFQINYSKGNIEIFNILRENLDFDLRYDFNKKFLRLDVLFFDVNLVNW
ISFNKNLSDYKDYLDTNLNGQLAFSYDFKDKDLRYAFLLNSSSNANMVNKEIQGLKVQIK
GNESVVDVQNAFVKLKRGFIGYKGYYSLKDLVPIGRLDFRSAKIFNFKDINGHLNFSKIN
QNFCVRSDDFRIGRLKIRDLNMKTSFAQDRIYVNYLLSFVNNNSKISLKGDFSKENFNLN
LGVKEFPMLFLKDVIPETFITKVIPEHFLSGKYLNLTSDFDLNTVDYTKSKLNSLNCTVL
SKLDNFNLILNASGEKNIYKVKYFNYSNGDYNVSSNFLIQLFDDSFKINTEFNYLNRNYP
LYFELNFKNRYANLKLSPRSRVSLTYSDSSIVYFFDINDFCLYNGDSEILFNVNSLGNYQ
RMNDDLNVKITKFKLDKIAGNPAYNFNFSFEGLYKDKQFSLSSIRFVNGVSNLQGQGHFN
LNDKLSGNLNLFSHMNSERYFFGVDSNEDGSYFVGRFQGFNFSNLKFFSVLNGNINGNFI
LSFKDSDLFNYSLNAYLETNDLLLVGVPTHCSLNLGLVDNNLNIYNINASQNKRKILTGN
FRYDIKNSIGISNLNVNGKLFSSRVNASFQRFENKAEEEFGILKSETDGEIALRDLRYKD
KDLSDLTIEFKNNSERFIMSSIEYDFISCLYEYNYGNFDIRLNDYLPFSFVASGNISGNK
ITGNIQDIKFDSKLITKDLLGSKTFFNIKEHFVLHDLNVIGMLDVDGDLYNPNLNGEFEV
VHGLISSEYLKMSRQYGKSRILELINVPVIVKDNNVIIENKFNLDYYSDVNVAAHLNLNF
LSDSIVDYYKIDIGVSGSSGVPIKFDKVTINFVGHASGDFFIEGNSEEIMFRGDLNVSNA
WIYLLENSIVDLLIDPYKRSKKVRAFDVSSKGLDVVTDLKINFDSNVAFHWPDNKISFLN
AIIARGNTLEVKSDTKTDDFILKGDLNVASGSFNYHNKQFVFRGGAYISFNENKSKFDPW
VKAEATNMIKDGNENLLITMSIDGPLSLWNFSFSSYPVRTEQEIKYLLSSAIIGGEHGLQ
SAGTNTAEMALGLASDILVDLIVQPIEDYIRSVLKLDLLSIKTDILRNAIGILGSTTTFA
GVLDKTNVKVGKYIIDGVFAKAGFGFLKEEVTPLSQNLNFSINFGLELDSPFFFVDYIFD
YNFMKHGHGIGNQISIFWKFKY
NT seq
4389 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttgttttttataagaaataagattgctctatcttttattttttcaatgatagtc
tttgtatcaattcttgttatctttattgtatttattcaagcccaagtttattctgctaaa
ttttttattatgagttaccttgaatcgaaaacaggctttaaaatcaagtatgataaaatt
gccccttattttttatcttcaataaaaatagataatctggagttgagcttaaatgataaa
gatacaatattgatgaatactgttaaagtcaatttggatttgtttaaactgctattagga
gataaaaacattattttagatgtttttgtaaggggaagtactttgaattttgatttaaat
gattttaaatttcttaaccctcagagttcacattctcatacattaaaattagatgatgat
agtactagtcatgcaatgtttggtaaaatgtttaatttatttgatagtcttcatgtgcat
ttagaagatattaatatgaattttagactaatttctgataagtttcttaaatttcaaatt
aagagttttgcattaaagactattgatgatgattttttatttagttttattgttgatttt
agttctattgcagttttaaatcctgatgttagtcatgaaaatattcttgattcgactttt
tattttgaaggtaagtttaaaaaagagcttgaagatggatatattaactttagtttttta
aaattacatacaagttattttgatttgcttgagcaaggctttcaaataaattattctaag
ggaaatattgaaatttttaatattctcagagagaatttggattttgatttaagatatgat
tttaataaaaaatttttaagattagatgttttgttctttgatgtaaatcttgtaaattgg
ataagctttaataaaaacttgagtgattataaagattaccttgatacaaatttaaatggt
caactagcattttcttatgattttaaagataaagatttacggtatgcatttttattaaat
tcatcttcaaatgctaatatggtaaataaagagattcagggattaaaagtccaaattaaa
gggaatgaatcagttgtagatgttcaaaatgcttttgtaaaacttaagagaggatttatt
ggttataagggctattattctttaaaagatttagtaccaataggaaggcttgattttagg
tctgcaaagatttttaattttaaggatattaatgggcatttaaattttagtaaaataaat
caaaatttttgcgtaagatctgatgattttaggattggcaggcttaaaattcgagatttg
aatatgaaaacgagttttgctcaggatcgtatctatgttaattatttattaagttttgtt
aacaataattctaaaatttcattaaagggtgattttagtaaggaaaattttaatcttaat
ttaggtgttaaagagtttcctatgctttttttgaaggatgttattccagaaacttttatt
actaaagttattccggaacattttttgtcgggtaagtatttaaatttgacttcagatttt
gatttaaatactgttgattatactaaaagtaagttgaatagtcttaattgtactgtctta
tcaaaattagataattttaatttaattcttaatgcaagtggagagaagaatatttataag
gtaaaatactttaattatagtaatggggattataatgtaagttctaattttttgatacag
ttgtttgatgatagttttaagataaatactgagtttaattatttaaatagaaattatcct
ttgtattttgagttgaattttaaaaataggtatgccaacttgaaattgtcacctaggtcg
cgagtcagtttaacttattctgattcatctatagtttatttttttgatattaatgatttt
tgtctttataatggagattctgaaattttgttcaatgttaattctttaggaaattaccaa
agaatgaatgatgatttaaatgtcaaaattaccaagtttaaattagataagattgctggt
aatcctgcttataattttaattttagttttgagggtttatataaagataaacaatttagt
ctttcaagtattagatttgtaaatggtgtttcaaatttacaagggcaaggacattttaat
ttaaatgataaacttagtggtaatttgaacttgttttcgcatatgaattcagagcgttat
ttttttggtgttgattctaatgaagatggcagttattttgttggtagatttcagggattc
aatttcagtaatttaaaattcttttctgtcttaaatggaaatattaatggtaactttata
cttagttttaaagatagtgatttatttaattattctcttaatgcttatcttgaaacaaat
gacctgttgttagtaggtgttcctacacattgctctttgaatttgggattggttgataat
aatcttaatatttataatataaatgcgagtcagaataaaagaaaaattctaacaggtaat
tttagatatgatattaagaattctattggaatttctaatttgaatgttaatggcaagctt
ttttcttcaagggtaaatgcaagctttcaaagatttgaaaataaagcagaagaagaattt
ggtattttaaagagtgaaactgatggagagattgctttaagagatttgagatataaagat
aaagatctttctgatcttacaattgaatttaaaaataactctgaaagatttatcatgtca
tcaattgaatatgattttattagttgtttatatgaatataattatggtaattttgatatt
aggttaaatgattatttgccttttagttttgttgcatcaggtaacatttctgggaataaa
attactggtaatattcaagacattaaatttgattcaaagttaattacaaaagatttattg
ggttcaaaaactttttttaatattaaagagcattttgttctgcatgatcttaatgtgatt
ggaatgttggatgttgatggtgatttatataatccaaatcttaatggagagtttgaagta
gtacatggtttaataagtagtgaatatttaaaaatgtctagacaatatggaaagagtaga
attttagaattaattaatgtaccagttattgttaaagataataatgtgattattgagaac
aaatttaatttagactattattctgatgtcaatgtcgctgcacatttgaatctgaacttt
ttaagtgatagtattgttgattattataagatagatattggtgtttctggtagttctgga
gtacctattaaatttgataaagtaactataaattttgttggacatgcttcaggtgatttt
tttattgaaggtaattctgaagagattatgtttagaggggatctaaatgtttcaaatgct
tggatttatttacttgaaaattcgattgtcgatctattaatagatccttataagagatca
aaaaaagttagagcatttgatgttagctctaaggggttagatgttgttacagatcttaaa
attaattttgatagtaatgttgcttttcattggccagataataaaatttccttcttgaat
gctattattgcaagagggaatacgcttgaggttaaatctgatactaaaacggatgatttt
atccttaagggagatttaaatgttgcaagtggttctttcaattatcataataaacaattt
gttttcaggggaggggcatatatatcttttaatgaaaataagagcaaatttgatccgtgg
gtaaaggcagaggctacaaatatgattaaagatggtaatgaaaatttgttaataacaatg
agcatagatggtcctttgagtttgtggaattttagtttttcatcttatcctgtgcgaact
gagcaagagatcaaatatcttttatcaagtgcaataattgggggtgaacatggactacaa
tcagcaggaacaaatacagctgagatggcacttgggttagctagtgatattcttgttgat
ctgatagtacaacctattgaagattatatacgttctgtattaaaattagacctattgagt
ataaaaacagatatattaaggaacgctattggtatcttgggtagtacaacaacttttgca
ggtgttcttgataaaacaaatgttaaagtgggtaaatatattattgatggtgtttttgct
aaggcgggatttggatttttaaaagaagaagtaacaccattatctcagaatttaaatttt
agtattaattttggtcttgaacttgattcaccgtttttctttgttgattatatttttgat
tataattttatgaaacatggtcacggaataggaaatcaaatatctattttttggaaattt
aaatactga
DBGET
integrated database retrieval system