Borrelia puertoricensis: bpuSUM_000843
Help
Entry
bpuSUM_000843 CDS
T08229
Name
(GenBank) SMC family ATPase
KO
K03546
DNA repair protein SbcC/Rad50
Organism
bpur
Borrelia puertoricensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bpur00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bpur03400
]
bpuSUM_000843
DNA repair and recombination proteins [BR:
bpur03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
bpuSUM_000843
Archaeal homologous recombinant proteins
bpuSUM_000843
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_23
SMC_N
SbcC_Walker_B
AAA_29
nSTAND3
ABC_tran
T2SSE
Zeta_toxin
AAA_16
AAA_22
DUF6985
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPA18281
LinkDB
All DBs
Position
889200..892049
Genome browser
AA seq
949 aa
AA seq
DB search
MRINKLVFKNIASYKGEYEINFDVSVLKKSGIFLISGNTGAGKSTILDCITLALYARVYR
LDKNISDSISKGFDSAYVKLTFTVSGKIYESFIELNTRQKETPKNMVLTCFSDGNLIDNK
DDVLSYIKSLCRLDFEQFCQTVILPQGNFQEFLTSKPKNKIAIIDNIFNLKKYDDIEIFL
KKELELTKFNKERLVFLDTEERNRLSINKKKINELTESLNLIDVGVVRENLDNIYKLIVI
CEKIIKFNQNYLDIQHRIDNLGLELSSKVVFGKKLNHEYFLQKKIKLELDEKLKFYNSND
FLDLKIFVQRQSELLNDKDRFSLELLSIQRNLEEFKYLNLDNFNFDYVKELYYENVILCE
MNFDEEAYDRLLVKERQLEAQRKKLSVEQKRKNVEIKSINSEKISFDFDKYVYYKALKLL
KGFYEELILRYKNGLDLLLQSNDSGLSQPIEINIKIDLYRNFLEHLNSNRQSVEKDIDEL
KHHEDAYKVYQGKEKLKINSLNELLKLNSKLQILQSELDILKIAILHNRENKIKWEGCVL
NFKKNNAEILKRIGQNLFRKYIDYSNKDKILIFESKLKEVTALKLMFNDLNSKISLKEVE
IKENLGKIKNLLSSVNLKISLIEPALIEREFEKVLRFKRDIENDHVKLSLCLDNISNEKL
KLESQIEIMKQTILGFKMELKDELAEFTSSFVDFKRSIEGVFCTKDPIFSLDSLNPSKNS
LEHFMRLKSNFISQIEILSKDISKYEANFSSLQVLKAELNAHEINLENIKSELSSVNERN
DKLEILKKVVTISPSLKYYVQSFLIDEILSISNKKYLNIILPDFELEINTNSKDFNFLVK
SKKDGNMTRSVKTLSGGEKFLVSLSLSLALSDMIRDSDLKIEAFFLDEGFGSLDEDTLKM
VIPKISDLQRVDGRQIGIISHVSYLKEEIKTQIVISKISTGSKITIESL
NT seq
2850 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggataaataagttagtatttaaaaatattgcttcttataaaggtgaatatgagatc
aatttcgatgtttctgttttaaaaaagtcgggaatttttttaatttctggaaatactgga
gctggaaaaagtacaattttggattgtattacccttgctctttatgcacgagtttataga
cttgataaaaatatttcagattcaatttcgaaaggttttgatagtgcttatgttaaactt
actttcactgtttctggaaaaatttatgagtcatttattgaacttaatacaagacaaaag
gaaacaccaaaaaatatggtacttacttgttttagtgatgggaatttgattgataataaa
gatgatgttttatcttatataaagagtctttgtaggttagattttgaacagttttgtcaa
actgttattttgcctcaaggtaattttcaggagtttttaacttcaaagccaaaaaataaa
atagcaataattgacaatatttttaatttaaaaaagtatgatgatatagaaattttttta
aagaaagaattagaacttacaaaattcaataaagaaagattagtatttttagatacggaa
gagagaaatagactgagcattaataaaaaaaaaataaatgaattgactgaatctttgaat
ttaattgatgtaggagttgtaagagaaaatcttgacaatatttataagttgatagttatt
tgtgaaaaaataataaagttcaatcaaaattatttagatattcaacataggatagataat
ttaggattggaattatcttcgaaagttgtgttcggaaagaagttaaatcatgagtatttt
ttgcagaaaaagattaaattagaattagatgaaaagcttaagttttataattctaatgat
tttttggatttaaaaatttttgttcaaaggcaaagcgaactattaaatgataaagatcgg
ttttcgttagagcttttaagtattcaaaggaacttagaggaatttaaatatttgaattta
gacaattttaattttgattatgtaaaggaattatattatgagaatgttattttatgtgag
atgaattttgatgaagaggcttatgatagattgcttgtaaaagagaggcaattggaagct
caaagaaaaaaattatcagtagaacaaaagagaaaaaacgtcgaaattaaaagtattaat
tcagaaaaaatatcatttgattttgataagtatgtttattataaggcattaaagttattg
aagggtttttatgaagaattaatattgaggtataaaaatggattagacttattgttacag
tcaaatgatagtggtttatcacaacctattgagataaatattaaaattgatttatataga
aattttttagaacatcttaatagcaatagacagtctgttgagaaagatatagatgagctt
aaacatcatgaagatgcatataaagtatatcaaggaaaagaaaaattaaaaatcaatagt
ttaaatgagctcttaaaattgaattcaaagcttcaaattttgcaatctgagttagatatt
cttaaaattgctatcttgcataatagagaaaataaaattaaatgggagggttgtgtctta
aattttaagaaaaataatgcagaaattttaaaaagaattggtcaaaatttatttcgaaag
tatatagattattctaataaggataagattttgatttttgaaagtaaacttaaggaagtt
acagctttaaaattaatgttcaatgatttaaattctaaaatttctttaaaggaagtagaa
attaaagaaaatttaggtaagataaaaaatttattatctagtgttaatttaaagataagt
ctaattgagcctgctttaattgagagagagtttgaaaaagttttaaggtttaaaagagac
atagaaaatgatcatgttaaattgagtttgtgtcttgataatataagtaatgaaaaactt
aaacttgagagtcaaattgagattatgaaacaaaccatattaggttttaaaatggagctt
aaagatgaacttgctgagtttacttctagttttgttgattttaaaagatcaattgaaggt
gttttttgtactaaggatcctattttttcacttgattctttaaaccctagtaagaatagt
ttagagcattttatgaggttgaaatccaattttatatctcagatcgagattctctctaag
gatattagtaagtatgaggcaaatttttcaagcttgcaggttcttaaagcagaacttaat
gcacatgagattaatttagagaatattaagagtgaattaagtagtgtaaatgagcgtaat
gataaattggaaattttaaaaaaagttgttactatttctcctagtttaaagtattatgtt
cagagttttttgattgatgagattttaagtatatcaaataaaaagtatttaaatattatt
ctgcctgattttgagcttgaaattaatacaaatagtaaagattttaatttcttagttaaa
agcaaaaaagatggaaatatgactcgtagtgttaaaacactatctggtggtgagaaattt
cttgtatctttatcactttctctagctctctcagacatgataagagatagtgatcttaaa
atagaagcattttttcttgatgagggatttgggagtcttgatgaggatactttaaaaatg
gttattccaaagatttctgatttgcagcgtgttgatgggcgtcaaattggtataatatct
catgtttcttatttgaaggaagagattaagacccagatagttataagtaaaatttcaaca
ggttctaaaattactatagagagtttataa
DBGET
integrated database retrieval system
