Borrelia puertoricensis: bpuSUM_001495
Help
Entry
bpuSUM_001495 CDS
T08229
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
bpur
Borrelia puertoricensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
PFam54_60
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPA18957
LinkDB
All DBs
Position
lp110:complement(39239..40090)
Genome browser
AA seq
283 aa
AA seq
DB search
MRKKFKDMCGMYVLIVLLFMIMGCTGSVGPQGPQGPQGVAGKNGKDGVQGPQGPRGLEGR
VGVPGLPGLPGLDGASSSELIRTKCMNFSNLYSANKDQFDSNLVNIPFNHMIGTESTFVG
FDDPVVQDNLYAGMDYNQGYATALKSVIDKLLLSPSKPDMIGAAKRLLNVIRDIGAYVGD
VVDRNRANVILSSHTLGRVIATKRQYFLLDLIFLLDTMFLLRFSLIKDIHSILTSVKDLQ
DVERIKDALSPIISLGSSINVRVYGQTGSSLEGLKAEIERQVQ
NT seq
852 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaaaagtttaaggatatgtgtggtatgtatgttttgattgttttactatttatg
atcatgggatgtactggttcagtgggcccacagggtccacaaggtccacaaggagttgca
ggcaaaaatggtaaggatggggttcaaggtccacaagggccaagaggattagagggccgt
gtgggtgtgccaggtctgccaggtctgccaggtctggacggagctagtagttctgaattg
ataaggacaaaatgcatgaattttagcaatttatattctgctaataaagatcaatttgat
tctaacttagttaatattccatttaatcatatgattggtactgagagtacatttgttggt
tttgacgatcctgttgtacaggataatctttatgctggtatggattataatcaaggttat
gctacagccttaaaatctgtaatagataaattattactttctccttctaagcctgatatg
attggagctgctaaaaggcttctgaatgttataagggatattggagcttatgttggtgat
gttgtagatcggaatagagcaaatgtaattttgagtagccatactctaggtagagttatt
gcaaccaaaaggcaatattttcttcttgatcttatttttttgctagatacaatgtttctt
ttgaggtttagcttaataaaggatattcactcaatattaacttcagtaaaagatttgcaa
gatgttgaaagaattaaagatgctttatcgccaattattagtttaggctcaagtattaat
gtaagagtttatgggcagactggaagtagcttagaaggtttaaaagctgagattgagaga
caggttcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system