Bombus pyrosoma: 122573212 Help Entry 122573212         CDS       T07776                                  Name (RefSeq) spatacsin isoform X1   KO K19026   spatacsin Organism bpyo  Bombus pyrosoma Brite KEGG Orthology (KO) [BR:bpyo00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03400 DNA repair and recombination proteins [BR:bpyo03400]     122573212 DNA repair and recombination proteins [BR:bpyo03400]  Eukaryotic type   DSBR (double strand breaks repair)    HR (homologous recombination)     Other HR factors      122573212 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Spatacsin_C Motif Other DBs NCBI-GeneID:  122573212 NCBI-ProteinID:  XP_043595230 LinkDB All DBs Position LG2:12236142..12243566 Genome browser AA seq 1799 aa AA seqDB search MAEKTTVGGIPIECLTGEPAIIWSGWRILGDRELVREASAKGTHINLAYKCLAYRRRCSI EDAQHYFNKEVETWIIELLKKHQIYRASHILNNMDKNPVEYIFKICVNCKDFTLRNYLSE YLISVAHFENEYIDSWNIIKSIVEFEQKYMVEDGLSSSLCIEDIIKLPEDIKQALCTELY FSITEQSLSKNITNIMLWDYLLSNNKIELMRFWIDIYYGSDTIEEVNEVNEEYKSLFHTL DIVPDMIEAIDSSDASTLIKDLAKNHLCRYGVFVEREQRDVKLLLARIYASAMTISEFNT ILSYKSCNINKTEFMKKIDKELCLAHCLSETSTQEDETKIIELYDVLTKMCENQEPLQDI LTEGIFKTIYYLSDDVTEYLKQNYLIVLVLIFSYQSRESAICNQDKDTVLKEITLKNIFT SKNPLQLCNYDISNEVLQNTLKQVTILESIIKKEPKNKVTMYELLDGYKNLNVKQLYKWR FNNEPMPHFSNDTLVKKYGYTEDLTYKYYLKEARPNMAIFSLKHSQGKLIGNVSSRRKYK AALYAHSLALRNLEKPEILHTCISFMEILGIDSENLRLHITVANYIYKQINIPIGNLLEN IIYKNENDLMTVMSYLESSFQTSCTENSINDSQEFVNVLKIWDVIVRFAAAHNFAFPISF LKFLASKNHWFEFVLVCHIFNYPLNQILENTEHFEDTILREHLLTCLSNIQLTKSQLAVC NEQKIKSRDVRQSLYYKIGVKQSGSPSYDSPVSADLASTYDSHNISEYTVNDNICSPNDD LWLIILKCHQSPDPPGALINSSRLTSKPFLIVLASCYEPSSIAAYCYSWMVISTTDKEIL SNYKECLEQQVWTANQVYNLLDQMVTYGYITIVSKAYKIFMPESLFNLFFDFLIECVIYG DLKSCQQKLLDFKAQCVDLKCNEAIDWNCSDATYLNNLYWIAIVTIKCLIATLAHGLRST HLQIKFLEILIKCNIYKNFPGFVPIFPFLLQVIKILQKTNVTLNFAAFTVSDNVYNFDTE IHRCINDLIRTEDYTSALKLSNVAGFNSSEIILAQCRSKFKYYIQKNEKIEDNFWNECAL NFKKYNISYEKAAEFFVEHAEKVTSHKERYEILKLAFETLKNIETEQQDIDVLETAMWKS CILAGPENVQLDDGPYIFNKLKTELLSGLNKLKFGYTLSNIQEKNAIESLINTLIDLGKL DTALRISTIFNYKHKDLQILMLCLSLAEGEISPNDLNIEQQSLLKEVNKNKQQKYNALKN RGLQRFSSVSSLITSISTEMNKLKHEDVHGIQMECLSILEKLLNILEHGVDICLRIVLCY KLAMQLEKSYQFLLMLNNPIEFLQEITESDNIKNKSEIINDIVIAYKINNDNVATFLAEN ITLNINRAVEGGYENNVCLWGYSLNTNFRVIMELCNDVSLLGWKLLKTANKLLGHSHGEK TSAFTLKTIAELLIRAHDCFTTSCNMEGIASVLCKCQIFANVLQNLKYWTLLVRLVTGVG RFTEMNYVFQILKENDQFEFLLGKGLNKVIGLETAILEFLKRHCPENKELFTLVALHFRL YHELAHMWKNEAKDIINTIISDATKDHMKLQSTVQHEKKFIKTENILKQLHLAVTNYTHA TEYYLQANKLNLANQCSDQVQLVALQLSLFNTVSYNQQVICILNLKPGDIDKVLCHNLSF SQAFIVIHAYNHHVDWANLIYSHCILNGEKKYLKDFIAVNKLTPGLVRNCVRRYRLEKSI THTMTDNMKILISELSDVECKYVLASQLGFKGIVETMLNNPMIGAYLKDTVWKKGYNAI NT seq 5400 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggcagaaaaaacaacagtgggaggcataccgattgaatgtttaactggagaacctgca attatttggtctggttggcgtatattaggggacagagaacttgttagagaagcctctgca aaaggcactcacattaatcttgcttataaatgtctagcttatagaagaagatgttctatc gaagatgctcagcattatttcaacaaagaagttgaaacttggattatagaacttctaaag aaacatcaaatttacagggcctcccatattttaaataatatggacaaaaatccagtggaa tatatattcaaaatttgtgtaaactgcaaggattttacattaagaaattatttatcagaa tatctaataagtgttgcacactttgaaaatgaatacatagattcatggaatataataaaa agtattgtagaatttgaacaaaaatatatggttgaagatggcttgagctcttctttatgt atagaggatattataaaattaccagaagatataaaacaagcattatgtactgaattatat ttttctataactgaacaatctctttcaaaaaatataactaatattatgctatgggattat ttactgtcaaataataaaattgaactaatgagattttggattgacatttactatggcagt gatacaatagaagaagtaaatgaagttaatgaagaatacaagtcgttgtttcatactttg gatatagtaccagatatgattgaagctattgattcttcagatgccagtactcttataaaa gatctagctaaaaatcatttatgtaggtatggcgtatttgtagagagagaacaacgtgat gtaaaattattactagcacgtatatatgccagtgcaatgacaatatcagaatttaataca atattatcatataaatcttgtaatattaataaaactgaatttatgaagaaaatcgacaaa gaattgtgtcttgcacattgcttgagtgaaacaagtactcaggaagatgaaaccaagatc attgaattgtatgatgtattgacaaaaatgtgtgaaaatcaagaaccgttacaagatata ttaacagaaggaatttttaaaacaatttactatctttctgacgatgtaaccgaatatttg aagcaaaattatttaatagttttagtattgatattttcataccagtctagagaaagtgca atatgcaatcaagataaagacacagtactaaaagaaattactctaaaaaatatatttaca agtaaaaatcctctgcaattatgcaactatgatatttcgaatgaagttcttcagaataca ttaaaacaagtgacaattcttgaatccattataaaaaaagaaccaaagaacaaagttaca atgtatgaattattagatggttacaaaaatttaaacgttaaacaattatataagtggcgt tttaataatgaaccaatgcctcatttttctaatgatactcttgttaaaaaatatggatat acagaagatttaacatataaatactatttgaaagaagcccgtcctaatatggctatattt agcttaaaacattcccaaggaaaactaattggaaatgtttcttccagaaggaaatataaa gcggctctgtacgcgcatagtcttgccttacgaaatttagagaaacctgaaattttacat acttgtatttctttcatggaaatattaggtattgattcagaaaatttaaggctgcatata accgtggcaaattatatttataaacagattaatattcctattggaaatttactagaaaat ataatatacaaaaatgaaaatgatttaatgactgtaatgtcttatcttgaaagtagtttt caaacaagttgcactgaaaattcaattaatgatagtcaagagttcgtaaatgtattaaaa atatgggatgttattgtacgatttgcagcagcacacaactttgctttcccaatcagcttt ttaaaatttttagcaagtaaaaatcactggtttgaatttgtattagtttgtcacatcttt aattatcccctgaaccagatattggaaaatacagaacattttgaagacacaattcttaga gaacatttattaacttgtttgagtaatattcaactcactaaatctcaattagctgtatgt aatgaacaaaagataaaatcacgagatgttagacaatcattatattacaaaattggagtt aaacaaagtggatcacccagttatgattcaccagtctcagcagatttagcaagcacttat gattctcataatataagtgaatatactgtaaatgataacatttgttctccaaatgatgat ttgtggttgattatattgaaatgtcaccaaagcccagatccacctggtgctttaatcaat tcatcccggttaacttcaaagcctttccttatagttttagcatcctgttatgagccatct tcaattgcagcatattgttattcatggatggtaatatctaccacagataaagaaattctt tctaattataaagaatgtttagaacaacaagtatggacagctaaccaagtttataactta ttggatcaaatggtaacatatggatatattactattgttagtaaagcttataaaattttt atgcctgaaagtctcttcaatttattttttgactttctcatagaatgtgtaatttatggt gatcttaaaagttgccaacaaaaattattggattttaaagcacaatgtgtagatctaaaa tgtaatgaagctatagattggaattgctcagatgccacatacttgaataatttatactgg attgcaattgttacaattaaatgccttattgcaacactcgctcatggtctaagaagtaca catctccaaataaaatttctcgaaattttgataaaatgtaacatttataagaattttcca ggtttcgttccaatctttccatttttgctacaagttataaaaattcttcaaaaaaccaat gtcacattaaattttgcggcatttacggtatcagacaatgtatataattttgatacagaa attcataggtgcattaatgatttaataagaactgaagattatactagtgcattaaaatta tcaaatgtagcgggatttaattcgtctgaaataatcttagctcagtgccgaagtaaattt aaatattatatacaaaaaaatgagaaaattgaagataatttttggaacgaatgtgcacta aattttaaaaaatacaacatttcatatgaaaaagcagcagaattttttgttgagcatgct gaaaaagttacttctcataaagaaagatatgaaatattaaaactagcttttgaaacctta aagaatattgaaacagagcaacaagatattgatgttcttgaaacagctatgtggaaatca tgtattttagcaggtcctgaaaatgtgcaattagatgatggaccttatatcttcaataaa ctaaaaacagaattgttatcaggactaaataaattgaaatttggctataccttaagtaac atacaagagaaaaatgcaattgaaagtttaattaatacattaattgacttaggtaaactg gatacagcattaagaataagtacaatttttaattacaaacataaggatttacaaattctg atgttatgtttgagtttagcagaaggtgaaatttcaccaaatgatttaaatattgaacaa caaagtcttctgaaagaagtaaataagaataagcaacaaaaatacaatgccttaaagaat cgtggtttacaaagattttcttcagtttcttcattgatcacttcaatcagtactgaaatg aataaactaaaacatgaagatgttcatggaatacaaatggagtgtttatcaattttagaa aaattacttaatatcctggaacatggagtagacatatgtcttcgcattgtattatgttat aaattagccatgcaactggagaaaagttatcagttcttgttaatgttaaacaatccaatt gaatttttacaagaaattacagaaagtgataatattaaaaataaatctgaaattattaat gatatagttattgcatacaaaataaacaatgataatgttgcaacatttttggctgaaaat attactctaaatattaaccgtgcagtagaaggtggatatgaaaataacgtttgcttgtgg ggatattccttaaatacaaattttcgtgttattatggaactatgcaatgatgtttcactc cttggttggaaactcttaaaaacggcaaataaattgcttggacattctcatggcgaaaaa acaagcgcatttactctgaagacgattgcagaattattaatacgtgctcatgattgtttt acaacttcctgcaatatggaagggatagcatcggtattatgtaaatgtcaaattttcgca aatgttttgcagaatcttaagtactggacattactagtacgtcttgtaacaggtgttggt cgtttcacagaaatgaattatgtatttcaaattttaaaagaaaatgatcagtttgaattt ttacttggaaaaggactaaataaggtaataggtctagaaacagcaattttggaattcctg aagcgtcattgtcctgaaaataaagaactttttactctggtagctttacattttcgacta tatcatgaactagcacatatgtggaaaaatgaagcgaaagatataattaatacaataata tcagatgctacaaaagatcatatgaaattgcaaagtactgttcaacatgaaaaaaaattc atcaaaactgaaaatattctgaaacagttacacttagctgttactaattatactcacgca acagaatactatttacaggctaataaattaaatcttgctaatcaatgttctgatcaagta caattagttgctctccaactttcactttttaatactgtgtcttataatcaacaagtaatc tgtatacttaatttaaaacctggagatattgataaagtattatgtcataacttaagcttc tctcaagcttttattgtcattcatgcatataatcatcacgtagattgggctaatctgatt tatagccattgtatattaaatggagaaaaaaaatatttgaaagattttatagcagtaaat aagctcacccctggtcttgtaagaaattgtgtacgcaggtacagactggaaaaaagcatt actcatactatgacagataacatgaaaatattaatttctgaattgtcagatgtggagtgt aaatatgtattagccagtcaattgggatttaaaggtattgtagaaacaatgctcaataat cctatgataggtgcatatctaaaagacactgtatggaaaaaaggatataatgctatttaa

DBGET integrated database retrieval system