Bombus pyrosoma: 122574210
Help
Entry
122574210 CDS
T07776
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC122574210 isoform X1
KO
K20190
Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein
Organism
bpyo
Bombus pyrosoma
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bpyo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
bpyo04131
]
122574210
Membrane trafficking [BR:
bpyo04131
]
Endosome - Lysosome transport
Others
BLOC-2 complex
122574210
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HPS3_N
HPS3_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122574210
NCBI-ProteinID:
XP_043597444
LinkDB
All DBs
Position
LG13:7858796..7864406
Genome browser
AA seq
1173 aa
AA seq
DB search
MVRVITVHNFLGQNITQIEEPTASCIANASGHEMLLLALSTHCVEVWELMMSDIKLHTVF
PTVDMINQMVHCTKEDYVVTLESKLSRDASINNHAGKTINNFVRIYVNWAMVKDQSQPMR
ARIAGRVTPSLNRPLNSLEMIELPLNVQPTLIACCQSTGNLLVASGNSAILHEFKIETQQ
VSKMKFIDFEARPWSLGFSFSPTHMEIVEDFISIMDKTNLCVFRLTNSMYEDIDQLSSLT
STNSSSIDKTSISTDSSLVENSNNMTNQDDNTILQGINSKCKSSSQDLHFIVSENNDSSG
TSTKFKGRRHRSSKTSIWSKLETGDFRKIKSNNNDTIINLDHLVYNERDELQRLIDQEVV
DGNSQPLTINLPSISLERAGPGHTLSPFVLNPSEIRIIIKTNSPDLGWSENYTIKNLLSL
KVMAVNNKLDGSSELFSCSLLKPLYMRKECNTSCLKKSILRSDKYTYLQGVSCFLCTLQE
GYLYHFSATSSNPTDATCLTTYPFTAPVNHVALEHTALHALTEAGLESYTLRLSHHVARM
SNDIENVRVTCPSVSEPVCLIGLRPFLGIQKLLHSKNYLILLAKAENSWTLYSLILPKLE
NLYYDVLNAARSHKSSSPSTYRHLLGEAHALIRLAKDAVYNCSDINEFDDIANKNGLKLK
NLYNQSCALLGDYYIRSEYDSDWDFCIPYYKMSGLKPSEVLSRKSSQDAPGLVTFLTDIL
FTMKSGPEADALFQGFNIVEMICKLKKPDLLKLIFSSPVLREYTTEKLIHLLLLYETDEL
VKLALALLYIQAEKQEQAEKVLEPVSALCVKKIVLEHWDLLFDMTAMKKRSPMIPTFSDF
AGTLMRQKNSTFAEILIQLIEEDGILSLHQIIQVFLEYLPSRVGRDGHNAAMTLQVFLEK
YLHNYFSTKLIIDSSVINKNQIRTDFALVEAFKLLVRSYLGKLTQTKVYKIENKENVQEN
YDNFIFTKFRPHYLNGMPPYAKDYQKVLNVSDLKDFADIDKTDSEKTIPTELFKLQSVLS
CDFIPNECLYEVKQFLETQEIDGSLSLKALCIQNTEEATTLLMDNCPQAVVQYAKDMYTK
DSEWKYLIELTQNKIAVSNSRQELQCLYTQIMKAILNYLPHTLSLKSLHRVLPKDDVITF
QKCSEMCNQIMHAEHVKSLIIETGQQLLSTLKL
NT seq
3522 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgcgtgtaatcacagtacataattttctggggcaaaatatcactcaaattgaggag
ccaactgcaagctgtatagcaaatgcatctggacatgaaatgctactcctagcattatca
actcattgcgtcgaagtttgggaattgatgatgtctgatattaaactacatactgttttt
ccaacagttgatatgattaatcaaatggtgcactgcactaaagaagattatgttgtaacg
ttagaatcaaaattatctagagatgcaagcattaataatcatgcagggaaaacgattaat
aattttgttagaatttatgttaactgggctatggtgaaagatcaaagtcaacctatgcgt
gctagaatagctgggcgtgttactccgagtttaaatcgaccattgaatagcttagaaatg
atagagttaccattaaatgtgcaacctacactcattgcttgttgccaaagtactggcaac
ctactagtggcttccggaaatagtgctattttacatgaatttaaaattgaaacacagcaa
gtatcaaagatgaagtttatagattttgaggctcgaccatggtccttgggcttttcattt
tctcctacacacatggaaattgttgaagatttcatatcaatcatggataaaacaaattta
tgtgtttttcgattgactaattcaatgtatgaagatattgatcaattgagttctctaact
tccacaaactcttcatctattgataaaacatctatatccactgattcctcccttgtggaa
aacagtaataatatgactaatcaagatgataacacaatattgcaaggaataaattcaaaa
tgtaaaagttctagtcaagatctgcactttattgtatcagaaaacaatgattctagtgga
acaagtacaaaatttaaaggtaggagacatagaagttccaaaacaagtatatggagtaaa
ctggagacaggagatttcagaaaaataaaatctaataataatgacactattataaatttg
gatcatttagtgtataatgaaagggatgaattacaaagattaattgatcaagaagttgta
gatggaaattcacaacccttgactataaatttaccatctataagtttggaaagagcagga
cctgggcatacattaagccctttcgtattaaacccatcagaaataaggattataattaaa
acgaattctcctgatttaggatggtcggaaaattatacaataaaaaatttattatctctt
aaagtaatggcagttaataataaacttgatggaagttctgaactgttcagctgctcttta
ttgaagccattatacatgagaaaggagtgtaatacttcttgtttaaaaaaatcaatcctc
agatcagataaatatacatatttgcagggcgtaagttgcttcttatgtacactgcaagaa
ggatatctttatcatttctctgctactagctcaaatcctacagatgcaacttgtttaact
acttatccatttactgcacctgttaatcatgtagctttggagcatactgctttgcatgca
ttgactgaagctggtcttgaatcttacacgctacgtttatctcatcatgttgctagaatg
tctaatgatatagaaaatgtaagagttacgtgccctagtgtctctgagcctgtttgttta
ataggattaaggccatttctggggatacagaaattattacatagcaaaaattatctaatt
ctcttagccaaagcagaaaactcttggactttatattctttaattttacctaaattggag
aatttgtactacgatgttttaaacgcagcgagaagtcataaatcttctagtcctagcaca
taccgacatttgttaggagaagctcatgctttgatacgtttagctaaagacgctgtgtat
aattgctcagacattaatgaatttgatgatatcgcaaataaaaatggattgaaattgaag
aacttgtataatcaatcatgcgcgctgcttggagactattatattcgttccgaatatgac
tcagattgggatttctgtataccctattataaaatgtcgggtttaaaaccttcagaagta
ttatctaggaaatcaagtcaagatgcaccgggactcgttacgtttttaactgatatactt
ttcacgatgaaaagtggtccggaagcagatgccctgttccaaggatttaatattgtagaa
atgatatgtaaattaaagaaaccagacttattgaaattgatcttcagtagtcccgtatta
cgagaatatactacagaaaaactaatacatcttttgttattatatgaaacggacgaatta
gtcaagttagctttggcactcttatacatacaagctgaaaaacaagaacaagcagagaaa
gtacttgaaccagtctcagcattatgtgtcaagaaaatagttttagaacattgggacctg
ttgtttgatatgacggcgatgaaaaagagaagtccaatgattcccacgttttcagatttt
gccggaacgttaatgcgtcagaaaaattcaacctttgctgaaattctaatacaattaatc
gaagaggatggaatcttatctcttcatcaaattatacaggtgtttttagaatatttacca
tcaagagtaggacgagatgggcataatgcagcgatgacattacaagtatttctcgaaaaa
tatcttcacaactactttagtacaaaattgattatagattcgtctgttataaataaaaat
caaatacgcacggatttcgctttggttgaagcttttaaactattagtacgatcatactta
ggcaagttgacacaaacaaaagtgtacaaaatagaaaataaagaaaacgtacaagaaaat
tatgataacttcatatttacgaagtttagacctcattatctaaacgggatgccaccgtat
gcgaaggattatcaaaaagttttgaatgtgagcgatctaaaagatttcgctgatatcgat
aagactgactctgaaaaaactataccaacggaattgtttaaattacagtctgtattatct
tgtgattttataccaaatgagtgtttatatgaagttaagcaatttcttgaaacacaagag
attgatggcagtttatctttaaaagcgttgtgcattcaaaatactgaagaagcaacaaca
cttttaatggataattgtcctcaagctgttgtgcaatatgcaaaggacatgtatactaaa
gattctgaatggaagtatttaattgagttgacgcaaaataagattgctgtatcgaactct
cgacaagaattgcaatgtttatacacgcaaattatgaaagcaattttgaattatctacca
catacgttgtccttaaaaagtttacatcgtgttcttccaaaagatgatgtaataacattt
caaaaatgcagtgaaatgtgtaatcaaattatgcacgccgaacatgttaaatctttaata
atagaaactggacaacaacttttatctactttaaaattgtga
DBGET
integrated database retrieval system