Bombus pyrosoma: 122577111
Help
Entry
122577111 CDS
T07776
Name
(RefSeq) putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12 isoform X1
KO
K18409
ATP-dependent RNA helicase TDRD12 [EC:
5.6.2.5
]
Organism
bpyo
Bombus pyrosoma
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bpyo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
bpyo03036
]
122577111
Enzymes [BR:
bpyo01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.5 RNA 5'-3' helicase
122577111
Chromosome and associated proteins [BR:
bpyo03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
piRNA pathway
122577111
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
TUDOR
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122577111
NCBI-ProteinID:
XP_043604132
LinkDB
All DBs
Position
LG17:complement(279593..289524)
Genome browser
AA seq
1006 aa
AA seq
DB search
MDCVKCLLQKGAMLPSTATVIKITNILTPYIVRIYEVKDYNEKLNSINKKLLKEEKTFHS
IEKDIEPKIGDTVIVYNRLDITTDCPGWLCRGYISSIENLKDTYNIFLPDYGISIKSQRE
DFIVCSTGAILEEYLTFTVGLYNILPADVKHNLSVQNETLTILEEWSTSAIEYTKELISA
SDIIYFDHIVSDQYGKYYGEFYLNIKNKIICLSEALVLHQYAIYLNKKLLQFIEYSMNSE
KLNKEIINDETTFYLNVSQVLDRAGERTKQKESFLKRAKFKRDNYLHHELQRDEEKVLIY
GMDKYEWLSSTLDVKFPVEIHKAWKSLIQSCKPRKIQSYIWPAIKKGLDTVAIGTAKCGK
TIGYTFAICGLLATNSSLPRGINPSALILCSSSSEVLEVHFLCTKFLEDYKAIKSVAAIN
GKSERSLVAEMFNGCQILISTPRFLIRFMNKNKKLVNFKNLRYLILDDGDIILDKYFDSI
SQLFRRHNIICNRELKSKTFQIIITATYWTLHLKKIASILMENPCIYIASFMEAAIFKSI
RLNFYVINSREKHERLLDHFTTDSLGNEYSTSRTIVICTNNNEAKELNNFLEKHKETLLA
HGNMNYVHLQRIKQYWNVCTSGSYPILICTDDILPDIDITNVTWLIHYSIPLHSKTQFNF
RFSTLLENLQMENSTGKVTIIMDENNDRQFLHIIKIMQRTNYVIPEKILESVKFITATLE
QKKENYPICDSIKSWGFCNKQISCALRHKIISKVDAPITDIQINDKVKFRVVSIHDATHV
SARIISYIKFNTLKEVEFSTIEYLRINTRIQEFYSCVENRKKCETLDVGCICGLEEPVDA
FKRIQILHIERENKTEIPKYVNVRCIDNGVILKKVDVYRLLHMPQELIEYSMQVVEVFLV
GIAPHDEEYVWNNCAIDAVYQWFKENVDDRSYVIGTVNLHLGNTIWVNTLNVGTKLIGYK
DLIGSCLRTELLEKDHAVEDDKHLNRMYQLCRDAGFLNINGYDLNL
NT seq
3021 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggactgtgtcaaatgtctcttacaaaaaggtgctatgttaccatctactgcaacagta
attaaaattacaaatattttaactccgtatattgtaagaatttatgaagtgaaggactat
aacgaaaagttaaattctattaataagaaattgttaaaagaagagaaaacgtttcacagt
attgaaaaagatatagaaccaaaaataggagatacagttatagtatataatagattagat
attacaaccgattgtcctggatggttatgcagaggatatattagtagtattgaaaatctg
aaagatacatataatatttttttacctgattatggaatttctattaaatcacaaagagag
gacttcattgtgtgttcaactggtgcaattttggaagaatatttaaccttcacagttggt
ttatataatattttacctgcggatgtaaaacataacttatctgtacagaatgagactcta
acaattttagaggaatggagtacatctgcaatcgaatacacaaaggaattaataagtgca
tctgatataatctattttgatcatatagtatctgatcagtatggaaaatattatggtgaa
ttttatcttaatataaaaaacaaaataatatgtttaagtgaagctttagttctacatcaa
tatgctatttatttaaataaaaaattgttgcagtttatagaatattctatgaatagtgaa
aaattaaataaagaaataatcaatgatgaaactacattttatttaaatgtttcacaagtg
ttggatagagctggtgaaagaacaaagcaaaaggaaagttttctaaaaagagcgaaattt
aaaagagacaattatttacaccatgaacttcaaagagatgaagaaaaagtattaatttat
ggaatggataaatatgaatggttaagttctacattagatgtaaaattccctgtagaaata
cacaaggcttggaaatcattgatacagtcatgtaagccaaggaaaatacagtcatatata
tggcctgccataaaaaaaggtttagacacggtagcaattggaacagcaaaatgtggtaaa
actattggatatacatttgctatttgtggacttttggctacaaattccagtcttcctcga
ggaataaatccatctgcattgatactatgttcttcctcatctgaggtactagaagttcat
tttttatgcacaaaattcctagaagactataaagcgataaaatctgttgctgcaattaat
ggtaaatcagaaagatcattagtggctgaaatgtttaatggatgtcagatactaatctct
acaccaagatttttaatacgcttcatgaataaaaacaaaaagttagtgaattttaaaaat
cttcgatatttaattttggatgatggtgatattatcttggataaatattttgattctata
agtcaattatttagacgacacaatattatttgtaacagagaattaaaaagtaagacattt
caaattataataactgcaacatactggacactgcatttaaaaaaaattgcctctattcta
atggaaaatccatgcatatatatagcatcttttatggaagctgcaattttcaaatccata
cgtttaaacttttatgtaataaattcaagggaaaaacatgaaaggcttttagatcatttt
acaacagattcattaggtaatgaatattctacctcacgaactatagtaatttgtacaaat
aataacgaagctaaagagttaaataacttcttagaaaaacataaagagactcttttagct
catggaaatatgaactatgttcacttacaacgtattaagcaatattggaatgtttgtaca
agtggttcttatccaattttaatatgtacagatgatatattaccagatatagatattaca
aacgtaacttggttgatacattattcaattcctttgcattcaaagacacaatttaatttt
cggttctctacacttctagaaaatttacaaatggaaaatagcactggaaaagtaactata
ataatggatgaaaataatgatagacagtttttacatataataaaaataatgcaacgtacg
aattatgtcattcctgaaaagatattagaaagtgttaagtttataacagctactttagaa
cagaaaaaggaaaattatcctatttgtgacagtataaaatcttggggattttgtaacaaa
caaatttcttgtgcattgagacataaaataatttcaaaagttgatgctccaattacggac
attcaaataaacgacaaggtaaagttcagagtagtgagcatacatgatgctacacatgtt
tctgcaaggattatatcatatatcaaatttaatacattaaaagaagtagaattttctact
attgaatatctgcgaattaacacaagaattcaagagttctattcttgtgtggaaaacaga
aagaaatgtgagactcttgatgtgggatgtatatgtggcttggaagaaccagtagatgct
tttaagaggatacaaattttacatattgaaagagaaaataaaacagaaattccaaagtat
gtaaatgtaagatgtattgacaatggggtaattttgaagaaagtagatgtatatagattg
ttacatatgccacaagaacttatagaatattctatgcaagtagtagaggtatttttagtt
ggtatagctccgcatgatgaagaatatgtttggaataattgtgcaattgatgctgtgtac
cagtggtttaaagaaaatgttgatgataggtcctatgtgattggaacggtaaatttacat
ctgggaaatacaatatgggtaaatactttgaatgttggaacaaaattaattggatataaa
gatttaattggttcatgtttaagaacagaattattagaaaaagatcacgctgttgaagat
gacaaacatttaaatcggatgtatcaactttgtagagatgctgggttcttgaacataaat
ggatatgatttaaatctttaa
DBGET
integrated database retrieval system