Bdellovibrio reynosensis: MNR06_01555
Help
Entry
MNR06_01555 CDS
T08711
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB domain-containing protein
Organism
brey
Bdellovibrio reynosensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOF01638
LinkDB
All DBs
Position
complement(337246..341211)
Genome browser
AA seq
1321 aa
AA seq
DB search
MKRAFWILITPIAGFLVLYLLGTKIVGPKLESWTLQQVQSYSDQELPVSIRAEKLQLKLF
KPSLIVEDIEISAKGDLARSVQKVHIKGLRVFLDFFQLLVGKVKLSAVVVESPEVVLDID
PFLEDDTPPKELPIDMIFDQLAKLPLQRVFLQNLSLKVSSKKLKFTTEIQSGDLLLNNMA
KNITAKINLPALTASYDGISNLEGSLDSHLYLTRQSLRIIQLGLRLDSSEIYARGELTRI
KQVTIKPSGVLDISGKVNLQDVYQEIKKIRPGLKIPTLAGQVNLDVETRFDGLKNLRGKA
DLTTRAVVVDKFELGDARIQGDYQDNVVTLSELRAHHPAGEAVLTKSQITLDGNFPFTTK
LHFDWELQKLFESLDLAGIPVGMDLKADVPCEGQIYPSIQVTCSNVDLQAENLWVKSGMA
KTDNYILELVSMGAKGQFKVTPQSIAYAAKVNVGNSSGTSDGTIDFAQGFKINFKTDKLD
MKDIKNLSNLKIEGSASIDGSTSGDSQAAIFDMKMNARDFTFEGFYLGNLISTLHYRDGN
LAFEDVAGAVNKTQYLGDLTVRFNSKTLEGDFSAPTADLNDIALIFSKIYELPVSVQGLG
SAKAKVSGPLDFWKMNYQLQSAFKKVFIGPESFDQLQFNVSAVNGNMNTDKVQLSRGLST
LTLQGGISSEKVMNLYADGKNWKLEESDTITKVNSNISGNLNFAAELKDNVTTPQILAKG
AITDTYFEEQEIPNSNFIFKINREFLNTQVSLFGDKVQSEFQYPFEKGRAPLLIKLNTND
WNFSSLLGLIGGINLANEYNSSLTTNVDLRSESGELFKSSGKVTVQNLSLKRGTMSFANK
APIEITANNGALTIRNFNLEGPHNSLQVRGENFTADDLNVAVNLEADMRLLQIFLPFLED
LGGPINLSTTVSGKITKPAILGNFNANNAFIKIKGFPHPIERLSTEVVFSQSRIIINGIK
AQIAGGTLTGDGGVQINGIKDLPTSIRLRMENVTFNVPDKIRTSGNADMLFSGRWFPFTL
SGTYHVASALVEKEFTEDGGSVAGVKQSVYLPKVIREGRFEPVVLDLQIILDRNIIVKNS
LLDGSVTGNIQVKGPPSNPILLGRINMDRKSKLIFKDKIFEVQNGVVEFNDPNEINPNLY
ISAQSRIDEYDITLIAQGPAKNVGIRLTSIPPLPEQDIISLIALGVTSSTKEQNLTSRQQ
AEQLGVEIGGAVLAKPISKQLESTLGLNLQVTSEYDSTRNISVPKITLSRRLSERVKVSG
SRPVGDNQSYDLKLEYLINNNITAVGSFENRGIEENSTLQTVQPASQSIFGLDLEFKREF
K
NT seq
3966 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaacgcgcgttctggatcttaatcacgccgattgcaggattcttagttctttatttg
ttaggcacaaaaattgtcggcccgaaactagaatcgtggactttacaacaagtccaaagc
tattccgatcaagaattacccgtcagtattcgcgccgaaaaacttcagcttaaattattt
aagccttcccttattgttgaagatattgaaatcagcgctaaaggggatcttgctagatcg
gtccaaaaagttcacatcaaaggactgcgtgtctttttagatttttttcaactattagtg
ggtaaagtaaaactttctgcggtggtggttgaaagcccggaagtggttttagatatcgat
ccgtttttagaagacgatacgccacctaaagaactcccgattgatatgatctttgaccag
ttggcaaagcttccgctgcaaagagtgtttttgcagaacttaagtttaaaggtcagttca
aagaaattaaaattcaccacggaaattcaaagtggtgatttgcttctaaataacatggct
aagaacatcacggcgaaaatcaaccttccggctttgacagccagctatgatggcataagc
aaccttgaaggatctttagattcgcacctgtatttaactcgccaatctttacgcatcatc
cagctaggactgcgtttagattcatcagaaatttatgcccgcggtgaattgactcgtatt
aaacaagtgacgatcaaaccatcaggggttcttgatatctctggaaaagttaatttgcag
gatgtgtatcaggaaattaaaaaaatccgtcctggcttgaaaattcctactttagcgggc
caagtaaatttggacgttgaaactcgctttgacggattaaaaaatctgcgcggcaaagca
gacctcacgacccgtgccgtggtggttgataagtttgaattgggtgacgcccgcattcaa
ggtgattatcaagataacgtcgtcactttatctgaactaagagcccaccatccagctggt
gaagcggtccttactaaatcgcaaatcactttggatggtaattttccattcacaacgaaa
ttgcactttgactgggaactgcaaaaactttttgaatctttagacctagctggcatcccc
gtgggcatggatttaaaagccgatgttccttgtgaaggccaaatttatccaagcatccaa
gtcacttgttcaaatgtagatctgcaagcagaaaatctgtgggttaaatcaggaatggct
aagacagataattacattcttgaacttgtcagtatgggtgctaagggtcaatttaaagtg
actccgcaaagtattgcctatgccgctaaagtgaacgtaggcaacagctccggaactagc
gacggaaccatcgatttcgctcaaggttttaaaatcaacttcaaaaccgataaactagat
atgaaagatatcaaaaatctttcaaatcttaaaattgaaggctcagcgagtattgatggt
tcaacatcaggggattcccaagcggcgatttttgatatgaagatgaacgccagggatttt
acatttgaaggtttctatttaggaaacttgatttcaaccctgcattatcgagatggcaac
ctagcttttgaagatgtcgcgggagctgttaataaaacccagtaccttggtgacctcacc
gtccgatttaacagtaagaccttggaaggtgacttctctgcacctacggcagacttaaat
gatatcgctttgattttctctaaaatttatgaactgcctgtttctgttcaaggccttggc
tctgcaaaagcaaaagttagtggccccctggatttctggaaaatgaactatcaactgcaa
tcggctttcaaaaaggtatttatcggacctgaaagctttgatcaactgcagttcaacgtt
tcagccgtaaatggcaatatgaacactgataaagttcaattaagccgtggattatcgact
ttgaccttgcaaggtggaatcagctctgaaaaagtcatgaatctttatgctgatggaaag
aactggaaactggaagaatccgacaccatcaccaaggtcaattcaaacatcagcggcaac
ttgaactttgcagccgaactgaaagacaatgtaacaacaccccaaatcttagccaaaggg
gccatcaccgacacttactttgaagaacaagaaatccctaattcgaattttatcttcaaa
atcaatcgcgagtttttaaacactcaagtcagtcttttcggcgacaaagtgcaatccgaa
tttcaatatcctttcgaaaaaggtcgcgccccacttttaattaaacttaataccaacgat
tggaacttctcttcactattgggccttatcgggggcattaacttagccaatgaatataac
tcgtcactgactacgaatgtggatctaagatcagagtctggggaattgtttaaatcttcc
ggcaaagtgacagtacaaaatctttcgctgaaacgcggaacaatgagctttgccaataaa
gcacctattgaaataaccgcaaataatggtgctttaacgattcgaaattttaatttggaa
ggcccccataatagcctgcaggttcgcggtgaaaattttacggccgatgacttaaacgtg
gctgtgaatttagaagccgatatgcgcttattgcagatttttttacccttccttgaagat
ctgggcgggccgattaatctttccaccacagtttcaggaaagatcactaagcccgcgatt
cttggaaacttcaatgccaataatgcctttattaaaatcaaaggcttccctcaccccatt
gaacgcctttcaactgaagtcgtattttcgcaaagtcgtatcattatcaatggtattaaa
gcgcaaattgctggcggtacgttgactggcgatggtggtgtgcaaatcaatggcattaaa
gatctgccgacgtccatccgtttaagaatggaaaacgtgaccttcaatgttcctgacaaa
atcagaaccagcggaaacgcagatatgttgttttcaggccgctggttcccgttcaccctt
tcgggaacttaccatgtagctagtgctttggttgaaaaagaatttaccgaagatggcgga
tctgttgcgggggttaaacaaagcgtttatttgccaaaagtaattcgtgaaggccgcttt
gaacctgtcgtgctagatttgcaaattatcttagatagaaacatcattgttaagaattct
ttgttagatggttctgtcactgggaatattcaagtgaaaggccccccatcgaatccgatt
cttttaggccgtatcaacatggatagaaagtccaagttgatctttaaagataaaatcttt
gaagtgcaaaacggtgtggttgaattcaacgaccctaacgagatcaatccaaacctatat
atttccgcccaatcacgcattgatgaatacgatatcactttgattgcccaagggcctgca
aagaacgtggggattcgtttaaccagtatcccgccgttaccagaacaagatattatttca
ttgattgccttgggtgtgacctcttccaccaaagaacaaaacctaacgtcccgtcaacaa
gcagaacaattgggtgtggaaatcggcggcgcggttttagcaaaaccaatcagcaaacag
ttagaaagcaccttaggtttaaatctgcaagtcacctcagagtacgattcaacccgcaat
atctccgttcctaaaatcactttgagccgtcgactttcagaacgcgtcaaagtgtcaggc
agccgtccggtgggtgataatcagtcctatgatttaaaattagaatacctgatcaataat
aacatcacggctgtaggttcttttgaaaaccgcggcattgaagaaaattcgaccctacaa
accgttcaacctgcttcgcaaagcatctttggtttggatctagagtttaaaagggagttc
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system