Brassica rapa (field mustard): 103857488
Help
Entry
103857488 CDS
T03449
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
brp
Brassica rapa (field mustard)
Pathway
brp03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
brp00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
103857488
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
brp03019
]
103857488
Messenger RNA biogenesis [BR:
brp03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
103857488
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
OB_RNB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103857488
NCBI-ProteinID:
XP_009132928
UniProt:
M4E2D8
LinkDB
All DBs
Position
A03:8251680..8253602
Genome browser
AA seq
408 aa
AA seq
DB search
MESDQGKLFIGGISWDTDENLLKEYFANYGEVLQVTVMREKATGRPRGFGFVAFSDPAVI
DRVLQEKHHIDNRDVDVKRAMSREEQSPGGRPGGFNASRSFDSGASVRTKKIFVGGLPPA
LTSDEFRAYFETYGPVSDAVIMIDQATQRPRGFGFVSFDSEDSVDLVLHKTFHDMNGKQV
EVKRALPKDANPGIAGGGRGGSGGFPGYGGGSGGSCYEGGRVDSSSRYMPPQNVGSGYPP
YGASGYGTGYGYGSNGVGYGGFGGYGNPAGAPYGNPAGVPGAGFGSGPRSSWGGQAPTGY
SNVGYGNAAAPWVGGSGPGSAVMSQGGGASAGYGSSQGYGYGGNDASYGAPSGYGAVGGR
PGSMPNSHGGGYADGSDGSGGYGNLNHQGNGQAGYGGGYGNVRQAQQQ
NT seq
1227 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatcagatcaggggaagctgtttatcggcgggatttcatgggacactgacgagaat
ctcctgaaggagtacttcgccaattacggcgaggttttgcaggtgacggtgatgcgagag
aaagctacaggtcgtcctcgaggattcggattcgtcgcattctccgatccagctgtcatt
gatagggttcttcaggagaagcaccatatcgataatagagatgttgatgtgaagagagca
atgtctagagaagagcagagtcctggtgggagaccagggggttttaatgcttctaggagt
tttgatagcggcgctagcgttcgtaccaagaagatatttgtcggaggtttgcctcccgct
ttaacatcagacgagtttcgggcctacttcgagacttacggccctgttagcgatgcggtc
attatgattgaccaggcaacacagcgtcctagagggtttggttttgtttcatttgactcg
gaggattctgttgaccttgttttgcacaagactttccacgatatgaatggtaaacaagta
gaggtcaaaagagctcttcctaaagatgctaatcctggaatagctgggggtggtcgcggt
ggctctggaggtttccccggatatggtggtggttctggtggaagttgctatgagggtggt
cgtgttgattcgagtagtagatacatgccgcctcaaaacgttggaagtggttaccctcct
tatggtgcttctgggtatggtactggttatggttatggcagcaacggtgttggttacggc
ggttttggagggtacgggaatccagctggtgcgccatacgggaatccagctggtgtccct
ggagctgggtttggaagtggtccaagaagttcatggggaggacaagctccaacgggttac
agtaatgtgggatatggaaatgctgctgctccgtgggttggtggttcgggtcccggttca
gcagtgatgagtcaaggaggaggtgcgtctgcaggttatggcagtagtcaaggttatggc
tatggtggaaatgatgcgtcttatggggctccatctggttatggtgcagttggtggacgg
cctggaagtatgcctaacagccatggcggtggctatgccgatggttcagatggctctgga
ggctatgggaatctgaatcaccaagggaatgggcaagctggttatggtggaggttatgga
aatgttaggcaagctcagcaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
