Brassica rapa (field mustard): 103867535
Help
Entry
103867535 CDS
T03449
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
brp
Brassica rapa (field mustard)
Pathway
brp03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
brp00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
103867535
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
brp03019
]
103867535
Messenger RNA biogenesis [BR:
brp03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
103867535
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
OB_RNB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103867535
NCBI-ProteinID:
XP_033147665
LinkDB
All DBs
Position
A05:complement(6106971..6108701)
Genome browser
AA seq
399 aa
AA seq
DB search
MESDQGKLFIGGISWETDENILREYFSNFGEVLQVTVMRDKATGRPRGFGFVAFSDPAVI
DRVLQDKHHIDNRDVDVKRAMSRDEQSPAGRQGGFNGNRSFDSGANVRTKKIFVGGLPPA
LTSDEFRAYFETYGPVSDAVIMIDQATQRPRGFGFVSFDSEDSVDLVLHKSYHDLSGKQV
EVKRALPKDANPGVAGGGSRGGGGFPGYGGSGGSGYEGRVDSSRYMPPQNAGSGGYPPYG
GASGYGTGYGYGSSGAGYGGFGGGGYGNPSGAPYGNPGGPGAGFGSGPRPSWEGQAPSGY
GNNVGYGNAAAAPWGGSGPGSVGIGQGGAAAGYGSQGYGYGGNDSSYGTQSGYGAVGGRP
NSHGGGYADVSDGSGGYGNHQVNGQAGYGGGYGRQAQQQ
NT seq
1200 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatcagatcagggaaagctctttatcggcgggatttcatgggaaaccgacgagaat
attctgagagaatacttcagcaatttcggagaggttttgcaggttacggtgatgcgagac
aaagctacaggtcgtcccagaggattcggattcgtcgcattctccgatcccgccgttatt
gatagagttctccaggacaagcaccatatcgataatagagatgttgatgtgaagagagca
atgtctagagacgagcagtctcctgcagggagacaagggggttttaatggtaataggagt
tttgatagtggagctaacgtgaggactaagaagatattcgtgggaggtttgcctcctgct
ttaacgtcagatgagtttagggcttacttcgagacttacggccctgtgagcgatgcggtt
attatgattgaccaggccacgcagcgtcctagagggtttgggtttgtttcgtttgactct
gaagattcggttgaccttgttttgcacaagagttaccacgatttgagcggtaaacaagtg
gaagttaagagagctcttcctaaagatgctaatcctggagtggccggaggtggtagtcgc
ggcggtggtggtttcccgggatatggtggttctggtggaagtggctacgagggtcgtgtt
gattccagtagatatatgccgcctcaaaacgctggaagtggtggttatcctccttatggg
ggtgcttctgggtatggtactggttatggttatggaagcagcggtgcaggttatgggggt
tttggaggaggagggtatgggaatccatctggtgcgccttatgggaatcctggtggccct
ggagctgggtttggaagtggtccgagaccgtcatgggaaggtcaagcaccatcgggttac
ggtaacaacgtgggatatggaaatgctgctgctgctccttggggtggttctggtcctggt
tcagtagggattggtcaaggaggtgcagctgcggggtatggcagtcagggttatggctat
ggtggaaatgattcctcttatggaacacaatctggttatggtgcagtcggtgggcggcct
aacagccatggcggtggctatgctgatgtgtcagatggctctggagggtatggaaaccac
caagtgaacgggcaagctggatatggcggaggttatggtagacaagctcaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
