Buttiauxella selenatireducens: RHD99_19115
Help
Entry
RHD99_19115 CDS
T09954
Name
(GenBank) YadA-like family protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
bsel
Buttiauxella selenatireducens
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bsel00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bsel02000
]
RHD99_19115
Transporters [BR:
bsel02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
RHD99_19115
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_head
YadA_anchor
ESPR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMY73538
LinkDB
All DBs
Position
complement(4154661..4159775)
Genome browser
AA seq
1704 aa
AA seq
DB search
MNKIYRLVWNSAQRAWVVAGEFAAAKGKGKTSPRRLASTAAGMVGAVALSMVSMEDARAY
VAGGGINTSDTESVAIGMGATTGNVGKITNTWGTPPRGNSAAVTTTGTDNVSNIALGENA
SSDTAGIALGNYAIASTGGGISSSAMAIGNYAKSTGTASTAIGLASLSTGQDAIALGTVS
GAYSRAAVAVGPGSSATGVGSTALGSAAIANGTASLALGDSAQANVAGGVALGYQSNATR
AAGSAGYLPAGISAASLAAINATTASRAAVDIGSRQITSVAAGTADSDGVNVAQLKGVAE
LADAGWNVADSSGTKANIGPNGKVTFTGDSNVTVAAGGADDAGTLNVALNKNLDLTNAGS
VTIGNSLLNNSGLTLTGGPKVLVSGIDAGTKQITNVAAGVADTDAVNVSQLRGVSASHYY
SVNDGGVSGANYLNDGATGSKALAAGISASATGADSVALGSYSVANTAEGIAGYMPVGTS
AAQLAAISATTSTLGAVSVGDAASGKFRQINGVAAGTVDSDAVNVAQLKGVAELADAGWN
VADSSGTKANIGPNGKVTFTGDSNVTVAAGGADDAGTLNVALNKNLDLTSAGSLTIGNSL
LNDNGLTLANGPKVLVSGIDAGTKQITNVAAGVADTDAVNVSQLRGVSASHYYSVNDGGV
SGANYLNDGATGSKALAAGISASATGADSVALGSYSVANTAEGIAGYMPVGTSAAQLAAI
SATTSTLGAVSVGDAASGKFRQINGVAAGTVDSDAVNVAQLKGVAELADAGWNVADSSGT
KANIGPNGKVTFTGDSNVTVAAGGADDAGTLNVALNKNLDLTNAGSVTIGNSLLNNSGLT
LTGGPKVLVSGIDAGSKKITNVLAGEDDSDAVNVSQLKSSTKYFKARSEEADAQAIGVDS
IAVGPQAIARADNSVAMGNGAIANYSGDIALGAGSVTGPTTGSGGGYAIDDVFIPFAGAN
PTSQVSVGSKGNERLITNVAAGSLSFTSTDAVNGSQLYAITKGIEDQGDILNERTVKYDW
NDLNGDGQIDLGEVNYSKATLSGTVSNDGGITGGTKITNLAQGEVSNTSTDAINGSQLFK
IAGDTTNNYTTINGAGIRYVRTNEAGLDELDAFATGKGSTAVGYNAQSKGVNSLALGNNA
VATANNSVALGAGSQANGSTLANAAYLTGTTATGEVNVGGRRITGVSDGAMDDDAVTVAQ
LKKVSTTAVDVSERALKYDWNDINGNGQLDPGEVDYSKATLSGAVSSDGGITGGTKITNL
AQGAVNASSTDAINGSQLFKIAGDTTNNYTTINGAGIRYVRTNEGVLGEADAYAQGQGST
AVGYKATSTGAGSIAVGQNSLASATNAIAIGKDAVASDANSVALGNGSKTSATVATTSMT
IDGKTYAVAGKAPVGTVSVGDVGQERTITNVAAGRVTASSTDAVNGSQLYATNTAIENIN
TTIETIDEGAVKYDRNSDGTVNHNHITLAGGPTTISNLADGVEDSDAVNYSQLKNVENNV
TNIANGTDGMFQVNNTSNNPKPKPTGKDSTAGGAGAVASGDNSTAIGANSRAKHNNSVAL
GNNSVTDRDNSVSMGYAGGERQVTNVAAGTQGTDAVNVNQLKSGISSANQYTDNKFNSLK
NMVDDQDDKLSAGIAGAMAMAGLPQAYQPGASMVAMAGSTYQDQSAVALGVSVISDNGKW
VTKLSGSTNTQGDLGGAVGVGYQW
NT seq
5115 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaagatttatcgtctggtatggaattcggcgcaacgcgcctgggttgttgcaggt
gaatttgctgcggcaaaagggaaaggtaaaaccagtccgcgtcgtcttgcatcaacggca
gcaggtatggttggtgcagtggcattgtctatggtgtctatggaagatgcccgggcttat
gtggcgggtggtggaattaacacatctgatactgaatctgtggcaattggtatgggagcg
accacgggtaatgtagggaaaattactaacacctggggtacaccgccgcgtgggaatagt
gcagcagttactacaacaggaactgataatgtgtctaacattgctcttggtgaaaatgct
tcgagtgatacggcaggtatcgcactaggtaattacgctattgcttcgactggtggtggt
atttcaagtagtgcgatggctatcggtaactatgccaagtccactggtactgcttccaca
gccattggactagcatctttgtctactggacaagatgcaatcgctctcggtaccgtttca
ggtgcttattctcgagctgctgttgcagtgggtcccggctcatccgcaacaggagtagga
agcaccgcacttggttctgcagcaatagctaatggcaccgcgtcccttgccctcggtgac
tctgcacaagcaaatgttgccggtggtgttgcacttggttatcagtcaaatgccacgcgt
gcggcgggttctgctggctacctgcccgctggcatctctgctgcatctttggcggctatt
aatgctacgacagcttctcgtgcagctgtcgatattggcagccgccagatcaccagcgta
gctgcaggtacagcagacagtgatggggtcaacgttgcacaactgaaaggcgttgcagaa
ttggctgatgctggctggaacgtggctgacagttctggtaccaaagccaacatcggtcca
aacggcaaagtgaccttcaccggcgacagcaatgtgaccgttgccgcgggtggtgcagat
gatgcgggtacgctgaatgtggcactcaacaaaaacctggacctgactaacgcaggtagc
gtgacgattggtaacagcctgctgaacaatagcggtctgaccctcaccggtggcccgaaa
gttctggtatccggtatcgatgctggcactaaacaaatcaccaatgtggcagcgggtgtt
gctgacacagatgcggtgaacgtttcccagcttagaggggtctctgcctctcattactac
agcgtgaatgacggtggcgtaagtggggctaactaccttaatgatggcgctacgggaagt
aaggcactggctgcaggtattagtgcttctgcaacaggtgcggattccgtcgcgcttggt
agctattccgtggccaacacagcagagggtatcgcgggctatatgcctgttggcaccagt
gctgcgcaactggctgctatttcggcaaccaccagtacgctgggtgcagtaagcgtcggc
gatgccgctagcggtaaattccgccaaatcaatggcgtggctgcaggcacagtggatagc
gatgcagtgaacgttgcacaactgaaaggtgtggcagaactggccgatgctggctggaac
gtggctgacagttctggtaccaaagccaacattggcccgaacggcaaagtgacctttacg
ggtgacagcaatgtgaccgttgctgccggtggtgcagatgatgcgggtacgctgaatgtg
gcactcaacaaaaatctggacctgactagcgcaggtagcctgacgattggtaacagcctg
ctgaacgataacggtctgaccctcgccaatggcccgaaagttctggtatccggtatcgat
gctggcactaaacaaatcaccaatgtggcagcgggtgttgctgacacagatgcggtgaac
gtttcccagcttagaggggtctctgcctctcattactacagcgtgaatgacggtggcgta
agtggggctaactaccttaatgatggcgctacgggaagtaaggcactggctgcaggtatt
agtgcttctgcaacaggtgcggattccgtcgcgcttggtagctattccgtggccaacaca
gcagagggtatcgcgggctatatgcctgttggcaccagtgctgcgcaactggctgctatt
tcggcaaccaccagtacgctgggtgcagtaagcgtcggtgatgccgctagcggtaaattc
cgccaaatcaatggcgtggctgcaggcacagtggatagcgatgcagtgaacgttgcacaa
ctgaaaggtgtggcagaactggccgatgctggctggaacgtggctgacagttctggtacc
aaagccaacatcggtccaaacggcaaagtgacctttacgggcgacagtaatgtgaccgtt
gccgccggtggtgcagatgatgcgggcacgctgaatgtggcactcaacaaaaacctggac
ctgactaacgcaggtagcgtgacgattggtaacagcctgctgaacaatagcggtctgacc
ctcaccggtggcccgaaagttctggtgtccggcattgatgccggcagcaaaaaaatcacc
aatgtgttagctggtgaagacgacagcgatgcggtgaacgtttcgcaactgaaaagtagc
actaagtacttcaaagccaggtcagaggaggcggatgctcaggccattggcgtagacagc
attgccgttgggcctcaggcgattgctcgtgcagacaactctgttgctatgggtaatggt
gctatcgctaactactctggtgatattgcgctgggtgcaggttctgtaactggtcccact
acaggttccggtggtggctacgcaattgatgatgtgtttattccatttgcaggtgccaat
ccgaccagccaggtcagcgtgggcagcaaaggtaatgagcgccttattactaatgtggct
gcaggtagcctgagtttcaccagtactgatgctgtcaacggttcccaactatatgccatc
acaaaagggattgaggaccaaggggatatactgaatgaacgtacagtaaaatatgactgg
aacgacctcaatggtgacggccagattgacctgggtgaagtcaattacagtaaagcaact
ctgtcaggcactgtttccaacgatggcggtataaccggcgggacgaaaatcaccaatctg
gctcagggtgaagtttctaataccagtactgatgccatcaacggcagccagttgtttaaa
attgcgggtgatacgactaacaattacaccaccattaatggtgcaggtattcgttatgtt
cgtaccaacgaagcgggccttgatgaattagatgcttttgcaactggcaagggcagcacc
gcggtgggttacaacgctcagtctaaaggcgtaaacagcctggctttgggtaacaatgcc
gtagcaacagcgaataacagcgtggcgctgggtgcaggttctcaagctaacggttctaca
ctggcgaatgctgcctacctgacaggcacgacagcaacaggggaagtgaacgtcggtggc
cgtcgtattaccggtgtatctgatggtgctatggatgacgatgctgtgacagtagcccag
ttgaagaaggtatccactactgcagttgacgtcagcgaacgtgctctgaagtatgactgg
aacgacatcaacggtaacggtcagcttgacccgggtgaagtggattacagcaaagccact
ctgtcaggtgctgtttccagcgatggcggtataaccggcggaacgaaaatcaccaacctg
gctcagggagcggtgaatgcgagcagtacggatgctatcaacggaagccagttgtttaaa
attgcgggtgatacgactaacaattacaccaccattaatggtgcaggtattcgttatgtt
cgtaccaacgaaggtgtgcttggtgaggctgatgcttatgctcagggtcagggaagtacg
gccgtgggttataaggcaacttctacaggtgcaggcagtattgcggtaggtcagaattct
ctggcaagcgcaacaaatgcaatcgcgattggtaaagatgccgttgcatctgacgctaac
agcgttgctttgggtaatggatctaaaacatccgctactgtggcaaccaccagtatgacg
atcgatggcaaaacttatgctgtagcgggtaaagcacctgtaggtaccgtgagtgtgggt
gatgtcggtcaggagcgcaccatcactaatgtggctgcaggcagagtgacggcaagcagc
accgatgcagtcaacggttcccaactgtatgcaactaatacggctattgaaaatatcaat
actacaatcgaaaccattgatgaaggggcggtgaaatatgaccgcaattcggatggtacg
gttaatcataatcacattacgctggctggaggcccaaccaccatttccaatctggctgat
ggggttgaagattctgatgcggttaactactcgcagctgaaaaacgttgaaaacaatgta
accaatattgccaacggtacggacggtatgttccaggtgaacaacaccagcaataatccg
aaaccaaaaccaaccggtaaggattcaactgcgggtggtgcgggcgccgttgctagtggt
gataacagcaccgctatcggggctaactctcgtgcaaaacataataattctgttgcactg
ggtaataactctgtaaccgaccgcgataacagcgtctctatgggttatgccggtggggaa
cgtcaggtgactaacgtcgcggccggtactcaaggtactgatgctgtgaacgtgaatcag
ctgaagagtggtatcagcagcgcgaaccagtacaccgacaacaagtttaactctctgaaa
aatatggttgacgatcaggatgacaaactgagcgcgggtattgcaggggcgatggcgatg
gccggtctgccgcaggcttaccagccaggtgcaagcatggtcgcaatggcgggttccacc
taccaggatcagtctgccgtcgcattgggcgtatctgtcatttccgataacgggaaatgg
gtaacgaaactttctggctccacgaacacacagggtgacctgggtggagcagtcggtgtt
ggctaccagtggtaa
DBGET
integrated database retrieval system