Bacillus shivajii: LGQ02_21115
Help
Entry
LGQ02_21115 CDS
T07881
Name
(GenBank) EAL domain-containing protein
Organism
bshi
Bacillus shivajii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
PAS
PAS_4
PAS_3
PAS_8
PAS_11
Diguanyl_cycl_sensor
Cache_WalK
PAS_10
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UCZ53235
LinkDB
All DBs
Position
complement(4418114..4420609)
Genome browser
AA seq
831 aa
AA seq
DB search
METDIPKKFQLYELVLQNMEEWIIICDKEGKIIYYNHSEKLFKQAPDSHINFDNIYNYYD
LFEVDGITRIKRDSIPLYEALRGKVVRQKQVVVRTKDGKSVYLMVNGHPIKDDNNEIIGA
IIVANDVTKENETKKALIETEEKYRLVTDNTNDLLYILNDHGKVTYSSLSNREIVGYLPE
EMEGKSALSFIHNDDHYSVKEAITEAISSLKPVKRELRLINKNNHALYVEAKGVPVFNKE
QGNVDIVVVARDITERKKVEKHLIESEERYRSLVDLSPLTVFVHVHGEIKYINKTGVDLL
GEDSAEDIIGKQVYDFAFSEDIPILLDRIDTVYHLGETSTPVELEISTAKGDIKTIEAMS
SLIRFKGKKAIQTILVDITDRKKAQDQVTHMAYHDTLTDLPNRRHFTMTLADYLKESKLK
GTKHALLMLDVDNFKMINDIYGHSFGDELLLNLGERLKECLLENMVLFRISGDEFAILLS
HISGEVEVLDVANNLVNLFNETIEINNVECSVSTSVGITFLPKDGNDPDTLLKNGDMALY
WAKKKGKNVIEVYSEQLQNQFLEKKRMELALKQALEKNEFELFYQPIFDLTSGEITATEA
LLRWEHPTKGSVSPADFIPIAEETGLIFPIGEWVLREACQQLNKWNNNEVGNICMKVNLS
AKQFYQTNFVKNLQRIIKETKINPTCLELEVTESIMMQQTEQAIASLEELSKLGVKLAID
DFGTGFSSLGYLKRFPIDTLKIDRTFVWDIHKDKKTEAIVQTIIHLAKALELDIVAEGVE
TKQQLQFLSEEKCEYIQGYLLSKPISSEEFNNTYLDLKKKARKVLQAETKS
NT seq
2496 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaacggatatacctaaaaagtttcaactatatgaacttgtgttacaaaacatggaa
gagtggattattatatgtgacaaagaaggtaaaattatttattataaccattcagaaaaa
ctgtttaaacaagctccagatagtcacattaattttgataatatctataattattatgat
ctatttgaagtagatggtataacacgaattaaaagagattctattccattgtatgaagcg
ctacgtgggaaggtcgtacgtcaaaagcaagtagtagtgagaacgaaggacggaaaatcg
gtgtacttaatggtcaatggacaccctattaaagacgataataatgaaattataggtgct
attattgttgctaatgatgtaacaaaggaaaatgaaacaaaaaaagcattaattgaaacc
gaagagaagtaccgattagtaactgataatacaaacgatttattatatatactgaatgac
cacggcaaagtcacttactcttcattatctaaccgagaaatagttggttatttgccagag
gaaatggaggggaagtctgctctgtcatttatacataatgacgatcattattcagtgaaa
gaagcgattactgaggcaatatcaagtttgaagccggtaaaaagggaactacggctaata
aataaaaataaccatgcattatatgtagaagcaaaaggtgttcctgtttttaacaaagaa
caaggaaatgttgatattgtcgttgtagcgcgagacattactgaacggaaaaaggtagaa
aaacatttaattgaaagtgaagaacgttatcgaagcttagtagacttatcaccattaaca
gtttttgtacatgtccatggggaaattaaatatatcaataagacaggagtcgatttgtta
ggggaggattcagcagaggatattattgggaaacaagtttatgactttgcattttctgaa
gatattcctatattactcgatagaatcgatacggtctatcatcttggggaaacatcaaca
ccggtggagcttgaaattagtactgcaaagggagatataaagacaattgaagcgatgtcg
tcattaattcgttttaaaggaaaaaaagctattcaaacgattttagttgacattaccgat
cgcaagaaagctcaagatcaagtgacacatatggcttaccacgatacattaacagatttg
ccaaatcgtaggcactttactatgacattagctgactatttaaaggaatcaaagttaaag
ggaacgaaacatgctttactcatgttagacgtcgataactttaaaatgattaatgatatt
tatggtcactcatttggtgatgaattgttattaaatttgggtgaaagattaaaagagtgt
cttttagaaaacatggtattattccgtatttctggagacgaatttgcaatactactttct
catatttctggtgaagtagaagtacttgatgttgcaaataaccttgttaacctctttaac
gaaacaatcgaaataaataacgtagaatgttctgtttcgacaagtgtaggcatcacgttt
ctcccaaaagatggcaacgatccagatacattattgaagaatggagacatggcattatac
tgggcgaagaaaaaaggaaagaatgttattgaagtatactctgaacaattacaaaatcag
tttcttgagaaaaagcgtatggaattggcgctaaagcaagcattagagaaaaatgaattc
gaattgttttatcaacctatatttgatttaacatccggtgaaattacagctactgaagcg
ttattaagatgggaacatccgacaaaagggagtgtttcaccggcagattttatcccgatt
gctgaagagacaggcttaatctttcctattggtgaatgggtgttacgtgaagcatgtcaa
caattaaataagtggaataacaatgaagtcggcaatatatgtatgaaagtgaatttatct
gcaaaacagttttaccaaacgaattttgtgaaaaatttacaaaggataattaaagaaaca
aagattaatccaacatgtttagaattagaagtcacagaaagtattatgatgcaacaaaca
gaacaagcaattgcatctttagaagaactaagcaagttaggggtaaagctagcaattgat
gattttggaaccggtttttcatcattaggttatttgaaaaggttcccaattgatactcta
aaaatagatcgtacatttgtatgggatattcacaaagataaaaaaacagaggcaattgtg
caaacaataatccacttagcaaaagctttagagctagatattgtcgctgaaggtgttgaa
acaaaacagcagctccaatttttatctgaagaaaaatgtgagtatatacaagggtattta
ttaagtaaaccgatatcaagtgaagaatttaataacacctacctggatttaaagaaaaaa
gcccgtaaagttcttcaagcagaaacaaagtcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
