Basfia succiniciproducens: A4G13_03335
Help
Entry
A4G13_03335 CDS
T06488
Name
(GenBank) poly-beta-1,6 N-acetyl-D-glucosamine export porin PgaA
KO
K11935
biofilm PGA synthesis protein PgaA
Organism
bsun
Basfia succiniciproducens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PgaA_barrel
TPR_19
TPR_14
HR1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIM68491
LinkDB
All DBs
Position
complement(739496..741901)
Genome browser
AA seq
801 aa
AA seq
DB search
MNKVSLLTLLIGGALAVQYANGSPIDERRENIIKYSRLGDGQLVEGTKQLIDLYNKTKDK
KVRDDLITLLVRQNRDAEALSISETYKLTDFSSNELEYLARAARNERQFSKSLAFYNQLN
NLDTKNPNGLLGLALVSTDMAKFEQSKLYLSRYKHRFGTDEQYNQANAYFLDSSEPLITR
FHRWNSELDTNPNDIELVKKLYRLAAQLNISPVQEQLIAKYPEVFTDNDKSWLLHDQAVR
ISKNSPNKQQLNTAYSMLDKVYIKVPEDNSLKQQSLQDMVVVGSKLKNDDSNRAKNSYEL
LTESNQPIPNYVKEAYADYLVASGSPFAALSLYKEVEQSHLAEGGEVPFTLGIKIVQALN
DAAKYPEARDYLENNIGEPGLMVLDFTRSRKIENPDYGNYFSTKVSSLVAQGDLSSAMQL
IDERLSVTPGDGWIMLTKAELEAARARTDDAADWVHKAQAFLPEDTAWAEVAQANLALSV
NDWRTASRLVNTWTTEEKDNANWFMEQYDQAKSARLVASSGISHRTSPAGENESNQEYYL
YSPKTDDGHDVYIHYLTTKSPDDGLPFEQQRVGAGVEANFYPFMVNAEAGKGIKLNDKAY
FAATIQYQLNQHWQFSLNGGLNSANTPIKAIYQDTYAKDLGFSVNYKYSDRFEAGAGITA
MKFDDENLRKNLSFWSNFNLFKHNRWNLNGSLYGSYERNKAIPGAYYYNPLKSRSLEDNF
DLSYYQPFDHSITLTHHFKAGGGYYWQDSFASSKTWSVAYGQEWRLGKKLNISYDVGRKR
SIYDGSPEFNNFINLTLSVSF
NT seq
2406 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaggttagtttactgacacttcttattggaggcgctttagccgttcaatatgcg
aacggttctcctattgatgagcggcgggaaaatattattaaatattcccgattgggtgat
ggtcagttagttgaaggaactaaacaacttattgatttatacaataaaaccaaagataaa
aaagttagagacgatctaattacattgttggtccgacaaaaccgtgatgctgaagcttta
tctattagtgaaacttataaattaactgatttttcatcaaatgaattggaatatttggca
agagcggcaagaaacgaacgccaattcagcaaatccttggctttttataatcaattaaat
aaccttgatactaaaaatcctaacggcttgctcggattagctttggtcagtaccgatatg
gctaaattcgagcagtcaaaattatatttatcccgatataagcatcgattcggaacggat
gaacaatataatcaagccaatgcctattttcttgatagcagcgaacctttaattacccgt
tttcatcgctggaattccgaattagatacaaatccaaatgatattgagttagtaaaaaaa
ttataccgtttagccgctcaattgaatatttctcccgttcaagaacaacttatcgcaaaa
taccccgaagtattcactgataacgataaatcgtggttattacatgaccaagctgttcgt
atatcaaaaaattcaccgaataaacaacagttaaatactgcttattctatgttggataag
gtctacatcaaagtacctgaagataattcactcaaacaacaatcgttgcaggatatggtt
gttgtgggctcaaaattaaaaaatgacgatagcaaccgagccaaaaactcttatgaacta
ttaacggaaagcaatcagccgattcctaattatgtaaaagaagcttatgcggattattta
gttgcttcgggctcgccgtttgccgcgttgtctctatataaagaagttgagcaatcacat
cttgcagaaggcggagaagtaccttttacattaggaattaaaattgttcaggcactaaat
gatgcggctaaatatccggaagctcgggattatttagagaataatatcggtgaacccggt
ttaatggttcttgattttacccgttcaagaaaaattgaaaatccggattacggcaattac
ttttcgacaaaagtcagttcattggttgcacagggtgatttatcttccgcaatgcagtta
atcgatgagcgattatccgtaactccgggggacggttggattatgcttactaaagcggaa
ctggaagccgcaagagccagaacagatgatgcggcggattgggttcataaagcacaggca
tttttacctgaagatacggcttgggcggaagtcgcgcaagcaaatttggctttatctgtg
aatgattggcgtaccgcaagccggcttgtcaatacgtggacaacagaagaaaaagacaac
gcgaattggtttatggagcaatatgatcaagccaaatctgcccgtttggttgcaagcagt
ggaatttctcatcgtacatcgccggccggtgagaatgaaagtaatcaagaatattatctt
tattcgccgaaaacagatgatggtcatgatgtttatattcattatttgacgacaaaatcc
cccgatgacggtttaccttttgagcaacagcgtgttggggcgggggttgaagcaaacttt
tacccgttcatggtgaatgcggaagcgggcaaagggatcaaattaaatgataaagcttat
tttgcggcaactattcaatatcagttaaatcagcattggcaatttagtttaaatggcggt
ttaaatagcgctaatacgcctattaaagctatttatcaggatacctatgcaaaagatctc
ggtttttcggtgaattataaatattcggatcgatttgaagccggtgcgggtattacggca
atgaaatttgatgatgaaaacttacgtaaaaatctttcgttctggtcaaatttcaatctg
tttaaacataatcgctggaatttaaacggcagtttatatggttcctatgaacgaaataaa
gcaatacccggtgcctattattacaatccgttaaagagccgttctttagaggataacttc
gatctgtcttattatcagccttttgatcacagtattaccctcactcatcattttaaagca
ggcggcggttattattggcaagacagtttcgcaagcagtaaaacctggtctgttgcttat
ggtcaggaatggcgtttaggtaagaaactaaatatctcttacgatgtcgggcgaaaacgt
tcaatttatgacggttcgccggagtttaataattttattaatttaacgttatcggtttct
ttttaa
DBGET
integrated database retrieval system