Entry |
|
Name |
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1 isoform X1
|
KO |
|
Organism |
bter Bombus terrestris (buff-tailed bumblebee)
|
Pathway |
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:bter00001]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
100642568
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:bter03021]
100642568
Enzymes [BR:bter01000]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
100642568
Transcription machinery [BR:bter03021]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
RNA polymerase I
Core subunits
100642568
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
6:complement(11476682..11482490)
|
AA seq |
1713 aa
MVQHKYHTPRLTPKHLDPKCLMFSMFTANDIRNLSVTKIRTPLSFNILGHPLKGGLYDPT
LGPLLESSDPCGTCGCNVFKCPGHFGHIELPMPVVNPLFHRGLFMLIKLACLNCFSLQIP
PYIKLLLTAKLNLLQQGYLSELEDLEQEIMFVVSCSGNPYEVDVQAVQNVIDNYTENLLN
RPRLNQRIMQYDEIQLNTKNINMQWHTYVENVIKQYATLKVCVNCQEPIPKITTLKNKIM
TTKICETPNTPRTVKSRGVVHKLETVIIMPDQSKDYLRKLWQNERDFLKVLIPCFGMVDI
EYPTDIFFFEVIPVLPPIVRPVNFVNGQMIEHPQSQVYKSIIQDCLVLRNIIQTIQDGDT
NQLTEEGKLVFEQIKGNTAIEKLHNAWQNLQINVDHLMDRDMNRTADSANCQGLKQVIEK
KEGIIRMHMMGKRVNFAARSVITPDPNLNIDEIGIPEAFAMKLTYPTPVTPWNVVQLRQL
VLNGPNIHPGAVMVEHEDGSIQRISNTNAVQREAIAKRLLTTSDKANKFFKGIKIIHRHL
QNGDILLLNRQPTLHKPSIMAHKARILKGEKTLRLHYANCKAYNSDFDGDEMNAHYPQNE
LARSEGYNIANVSNQYLVPKDGTPLSGLIQDHMVSGVRLTVRGTFFSREDYMQLVYAALS
TIQDNIILLPPSIIKPVPLWSGKQIVSTVIINIIPPNQARINLTANAKINVKEWQVEKPR
QWKCGTEFLNPKTMSEAEVIIRNGELLCGVLDKTHYGATPFGLIHCIFELYGGICSTKLL
SAFGKLFQAALQRNGFTLGIEDILLLNKADKKRKEIISNCRKIGENIQRSVLELPDDIPM
DIVTSKIEESYWSDPKFRAQIDRKYKSALDVYTNDINKVCLPAGLLKKFPDNNLQLMVQS
GAKGSTVNTMQISCLLGQIELEGKRPPLMISGKSLPSFSAYDPTPRAGGFIDGRFMTGIK
PQEFFFHCMAGREGLIDTAVKTSRSGYLQRCLIKHLEGLSINYDSTVRDSDGSMVQIYYG
EDGLDIPGSQFLRKEQLNFLIDNKNAILNEEIVKNLKMDSDTDKILKVVRKIKKWESKNG
SVLQKRRISPFTRFSREDMNIKKSKYKEINENNGRSKASLSLMRKWLRTSEEDKKWIYAE
CARCPDPIMSKYRQDIDFGVFSERLENLMDEYIANKSNNSIIKKKDLRDLLSVKVMKIVC
PPGEPVGLLAAQSIGEPSTQMTLNTFHFAGRGEMNVTLGIPRLREILMMASKNIKTPSME
IPFRKDLKNVTKRSNKLRLQLTKCILSNVLDNINVSRKLEQSPNRQLVYTMTINYLPHKC
YKSEFCVQPHEVLKKTEEVFFKEMFKEIKKIAKVTGVLVYVEEEKKSMYEDDALLDQAEP
EEGAESALKHANLGEMHESSDEEAAAEDADATLLRSISRHKENQEYEDPEEEEEIEDINE
REDDIVVEHENEKLKTNDQQQDEDDDDYDTEHEKSDYIVNETYSTQRKRDIKNMYTHVIE
YDYDEDKFTWCKLTFWLPLKMLKLDLPTITRNVANRVVLWEVPCVKRAFTFQNNNGETIL
KTDGINIVEMFKYDKSLNLNKLYSNDIYGISQTYGIEAANRVIIKEVRDVFKMYGITVDS
RHLSLIADYMTFDGRFQPLSRKGMEGSASPLQQMSFESSLNFLKNATLEGKRDNLVSPSS
RLMLGQPCKSGTGSCSLLVKIQKQPETTFSVGG |
NT seq |
5142 nt +upstreamnt +downstreamnt
atggtacaacataaatatcatactccacgtctaactccaaaacatctagatccaaaatgt
ttaatgttttctatgtttactgcaaatgatataagaaatttaagtgttaccaaaataagg
acaccattatcatttaatatcttgggacatccattaaaaggaggtttatatgacccaaca
ttagggccacttttagaaagttcggatccatgtggaacatgtggatgcaacgtattcaaa
tgtccaggtcattttggacatatagaattgcctatgccagtagtaaatccactgtttcat
agaggattatttatgttaatcaaattagcatgtctaaactgtttctctttacaaattcca
ccttatataaaattgttacttactgcaaaattgaacttacttcaacaaggatatctcagt
gaacttgaagatttagaacaagaaataatgtttgttgtttcatgttcaggtaatccttat
gaagttgatgtgcaagctgttcaaaatgtaattgataattatactgaaaatcttctcaat
agaccaagacttaatcagcgtatcatgcaatatgatgaaattcaactaaataccaaaaat
attaatatgcaatggcatacatatgttgaaaatgttataaagcagtatgcaacattgaaa
gtctgtgtaaattgtcaagaacctataccaaaaattacaacactaaaaaataaaattatg
accactaaaatatgtgagacacctaatactcctcggacagtaaaatcacgtggagtagta
cataaattagagacagttataataatgccagatcaatctaaagattacctcagaaagctt
tggcaaaatgagagagatttcttaaaagtacttataccttgctttggaatggtagatatt
gaatatccgactgatatattcttttttgaagtaataccagttttaccacctatagttagg
ccagttaattttgtcaatggacaaatgatagaacatccacaatctcaagtttacaagagt
atcatccaagattgtcttgtacttcgaaatatcattcaaacaattcaagatggtgataca
aatcaactaacagaagagggaaaacttgtttttgaacaaataaaaggtaatacagcaatt
gaaaaattacacaatgcttggcaaaatctgcaaataaatgtggatcatttaatggatcgt
gatatgaatagaactgcagattctgcaaattgtcagggtttaaagcaagttatagaaaaa
aaggaaggaattattagaatgcatatgatgggtaaaagagttaattttgctgctcgttct
gttattacaccagatcctaatttgaacatagatgaaattggcattcctgaagcttttgca
atgaaattaacatatccaacaccagttacaccttggaatgttgtacagttaagacaatta
gttttaaacggtcctaatattcatcctggtgcagtaatggttgaacacgaggatggaagt
atacaacgcatttctaacacaaatgctgttcaaagagaagctattgcaaaacgtcttcta
acaacaagtgataaagcaaacaaattttttaaaggaattaaaattatacataggcattta
caaaatggagacattctgctgttaaatcgtcaaccaactttgcataagcctagtataatg
gctcataaagcacgtattttaaagggagaaaaaacattacgtttgcattatgctaattgt
aaagcctataattcagactttgatggcgatgagatgaatgctcattatccccaaaatgaa
ctagctagaagtgaaggctacaatatagccaatgtatctaatcaatatcttgtacctaaa
gatggtactcctttaagtggtctcattcaagatcatatggtttctggtgtgcgattaaca
gtaagagggacattcttttcacgtgaagattatatgcaactagtttatgctgctttatct
acaatacaagataatataattcttcttcctcccagtattataaaaccagtacccttatgg
tctggtaaacaaattgtatccactgttatcattaatattattccaccaaatcaagcacgc
atcaatttgacagcaaatgccaaaatcaatgtaaaagaatggcaagttgaaaaaccacgg
cagtggaaatgtggtactgaatttttaaatcctaaaacaatgtcagaagccgaagtaata
atacgaaatggagaattattatgtggtgtacttgataagacacattatggtgcaactcca
tttggtcttatacattgtattttcgaattatatgggggaatatgctctacaaagttgtta
agtgcctttggtaaattatttcaagctgctttacaaagaaatggatttactcttggtatt
gaagatattttattgttaaataaagcagataagaaacggaaagaaattatttctaactgt
agaaaaattggagaaaatattcagagatcggtgttagaattacctgatgatatacctatg
gatattgttacatctaaaattgaagaatcttattggagtgaccctaaattccgtgctcaa
atcgatcgaaaatataaaagcgcattagatgtctatactaatgatataaataaagtttgt
ttaccagctggtcttttgaaaaaatttccagataataatctacaattgatggttcaatct
ggtgcaaaaggttctacggtaaatactatgcagatatcttgcttacttgggcagattgag
ttggaaggaaaaaggccacctttaatgatcagtgggaaaagccttccaagtttctctgca
tatgatcctacaccaagagctggtggatttatcgatggtagatttatgacagggatcaaa
cctcaagaattcttttttcactgtatggctggccgcgaaggtcttattgatactgctgta
aaaactagtagatcaggttatttacaaagatgtcttattaaacatcttgaaggattaagt
attaattatgattcaacagtacgagactcagacggtagtatggtgcaaatttattatggc
gaagatgggcttgatataccaggttcacaatttttgaggaaggaacaattaaatttctta
atagacaataaaaatgcgattctcaatgaagaaatagtaaaaaatttaaaaatggactca
gatacagataaaattttaaaagtagtgagaaaaattaaaaagtgggaaagtaaaaacgga
agtgtattacagaagagaagaattagtccatttacaaggttttcaagggaagatatgaat
attaagaaatcgaaatataaggaaattaatgaaaataatgggagaagcaaagcatctctt
tcattgatgagaaagtggttaaggactagtgaagaagataaaaaatggatttatgccgaa
tgtgcaagatgtcctgatccaataatgtcgaaatatagacaagatatagattttggtgta
ttttctgaacgattagaaaatttaatggacgaatatatagccaataaatctaacaattcg
atcataaaaaagaaagatttaagagacctcttgtctgtgaaggtaatgaaaattgtttgt
ccacctggtgaaccagtaggtttattagcagcacaatcaataggggagccatcaactcag
atgactttaaatactttccactttgctggtcgtggagaaatgaacgttactttgggtata
cccagattacgtgaaatacttatgatggcatcgaaaaatattaaaacgcctagcatggag
ataccattccggaaggacttaaagaatgtaacaaaacgctcaaataaattaaggttgcaa
ttaacaaaatgcattttatccaatgttttagacaatattaatgtaagtagaaaattggag
caatcgccaaatagacaattggtgtatactatgactattaattatcttccacataaatgt
tataaatcggaattttgtgttcaaccacatgaggtattgaaaaaaactgaagaagtgttt
tttaaggaaatgtttaaagaaattaaaaagatagctaaagtaacaggtgttttagtgtat
gttgaagaggaaaagaaatctatgtatgaggatgatgctttattagatcaagcagaacct
gaagaaggagcagaatctgcattgaaacatgcaaatttgggagaaatgcacgaatcttca
gatgaagaagcagcagcagaggatgcagatgcaactttactacgatcaatttcgcgccat
aaagaaaatcaagaatatgaggatccagaagaagaagaagaaatagaagatataaatgaa
agagaagatgatattgttgtagagcatgaaaatgaaaaattgaaaactaatgaccaacaa
caagatgaagacgatgatgattatgacacagaacatgagaaatcagactatattgtaaat
gaaacttacagtacacagagaaagagggatattaaaaatatgtatactcatgtaatagaa
tatgattatgatgaggataaattcacatggtgtaaattaacattttggttacctcttaaa
atgttaaaattggatttaccaacgataactagaaatgttgcaaatagagttgttttatgg
gaggtaccttgcgtaaaacgtgcttttacatttcaaaataataatggagagacaattctt
aaaactgatggtatcaacatagtagaaatgttcaaatatgataaatctctaaatttaaac
aaattatattccaatgacatttatggtatttctcaaacatatggtattgaagctgctaac
agagttattataaaagaagtgagagatgtatttaagatgtatggaatcacagttgattct
agacatctatctttaattgcggattacatgacttttgatggtagatttcaacctctcagt
cgtaaaggaatggaaggttcagcatctccattgcaacaaatgagttttgaaagttctctt
aattttttgaaaaatgccactttagaaggaaaacgagataatttagtatcgccttctagt
cgattaatgttaggtcaaccttgtaaatctggtactgggtcatgttcgttattggtaaaa
atacagaaacaaccggaaactaccttttcagtaggtggataa |