Bombus terrestris (buff-tailed bumblebee): 100646172
Help
Entry
100646172 CDS
T04364
Name
(RefSeq) condensin-2 complex subunit D3 isoform X1
KO
K11491
condensin-2 complex subunit D3
Organism
bter
Bombus terrestris (buff-tailed bumblebee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bter00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
bter03036
]
100646172
Chromosome and associated proteins [BR:
bter03036
]
Eukaryotic type
Chromosome condensation proteins
Condensin II
100646172
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cnd1
HEAT
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100646172
NCBI-ProteinID:
XP_003394237
UniProt:
A0A9B0BUE8
LinkDB
All DBs
Position
3:3797411..3803260
Genome browser
AA seq
1322 aa
AA seq
DB search
MEPLKIFDNFKFSELNEDWIQSVWDGEFMIYNEPPDEYQMFLESEDMRLLLNESCTVVKT
WLEKGDDQNNSENYDSEISWNTLISMDINVRALLAVLGYIIKNGQSKTANEETRQSCLYA
TNLYFILLAIPGSCAFNVFHPTLYQRAIETIKIGSEHLLPSVKKYNKTIGLDDLNITEQS
MNETIILSQSEKESLIQNLNIIICSFILMIKSFWFKDHAQLLDITILKLIEVTKIEDNYI
IGQCFNKKAGTLNVSLPQNAYAALKELCNNKHGPVKITITIIAKYLLPCLLYSHMDAQTK
IITNIREHTINFVKNLLDEYEKEAKTAILTLIQHIMLFCPDRLEARQKQANVLLKLFGIC
NQNIALEAFKDLMLLSHHSKIPFRLFAQEIIGKLLLESFLVNCSITDYLKAKVKRVFFAI
VLTRCMDCSSMVRGKAMAIIAEFTESSNEKDKEIFLTIFKKSDVDKQFLTFHDIKNSLSE
DTDLLPGSNALITMLADRVEDERAMVRRSTLQILKNLIVMVPFLIHEIVPIISLRCRDPV
LIVRRFAVQVLSQLLEQFPDNSQLLNEWVQTVIPQIFDIEIKVQEKVLGCLEELLLNRIQ
NISTTTDTIADNLPWKILNAVANMKMRRHLSKACSLWVKNGVITKSIMKNIQSHIGTNNN
IEAWVFLVALAENTKLPDMNKYFSNYQQIFLENNFYTSLVLQVLRCSWKSLDYEILEDLH
TYLYKCLQQFKINFGLISICLDIIHNITHYLNPDKNNNLLESNMLNLVKISEIEIAKIFK
DENEDVEAPPNYLRAMFTLGHATILCSCKISPLTLRILQGMLLEWETLPEIIKPIEELQA
SAVVILGQQAMRDREIAKEVVQIFGKLMREETNLDSIVQIAVKINAAKALADICVRFTAL
VEPYLSDMCVSMKNSTPQVREAIVVIFIQLLLEDYIKIKGPFFFHILTMLSDSDNMIREL
TIFLIEERLLTKNKSLISQQFLQSIYHYNNYQSQHKIYHHKMCEKEKKALTLPGRRNEKK
RRIIYDFMLDHLDPPGKMKLLVKVTSQILDGTCVDLIDIKKEEGAGVLKDALYIISHERL
RPSSFNRQGDDDQQEDEECRAQTNIPTSNAISIIIEGIKKYGLDVLLPRLIKLRIKLSTL
KSPLENVVKKILVKTYSEYNKDQLLNIVTEYPELEKEVEQFKKQMEDITVDDENFTEEEN
SASEINNQSASNKNLDLTMCNLHPKIVLERLSVPQLLNSNSPIRALDSLNSPTYSNSILC
SPSQPGPSTSTPTCFNSESNNTVGRASRVRRLSSFFQNENELFDHEIRERNIFQVQDDSE
SD
NT seq
3969 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacctttaaaaatattcgataattttaaatttagtgaattaaacgaagactggatt
caatctgtgtgggatggagaatttatgatttataatgaaccacctgatgagtatcaaatg
tttttagagagtgaggacatgagattgcttttaaacgaatcctgtactgttgtaaaaact
tggctagaaaaaggtgatgatcagaataactcagaaaattatgattctgaaatatcttgg
aatacattgatttctatggatataaatgtacgtgctttattagctgtattgggttatata
ataaaaaatggtcaaagcaaaacagccaatgaagaaacaagacaatcatgtttatatgcg
actaatttatattttatacttttggccattccgggtagctgcgcattcaatgtatttcat
cctactttatatcaacgagccatagagacaataaaaataggctctgaacatttattgcct
tctgttaagaaatataataaaacaataggtctagatgatctaaatatcactgaacaatca
atgaatgaaaccataattctttcacaaagtgaaaaagaaagtctcatacaaaatttaaat
attataatttgcagttttattttgatgataaaatcattctggtttaaagatcatgcacag
ttactagatattaccattcttaaattaattgaagttacaaagatagaggataattacata
attggtcaatgttttaataaaaaagcaggtactttgaatgtttcattgccacaaaatgct
tatgcagctttgaaagaattatgtaataataaacatggaccagtcaaaataactataacc
atcatagcaaagtacctattaccatgtttgttatatagtcatatggatgcacaaacaaaa
attattacaaatattcgtgagcatactataaattttgtaaaaaatttattggatgaatat
gagaaagaagccaaaactgcaattttaacattgatacaacatataatgttgttctgtcca
gatcgacttgaagctagacaaaaacaagctaatgtgttgctaaaactgtttggaatatgt
aaccagaatattgcactagaagcctttaaggatttaatgctattgtcacatcattcaaag
ataccttttagattattcgcccaagaaataattggaaaattattacttgagtcctttttg
gtgaattgcagtataactgattacttaaaagctaaggtaaaaagagtattctttgcaatt
gtattgactagatgtatggattgttcaagtatggtaagaggaaaagccatggctataatt
gctgaatttacagaatcaagcaatgaaaaggacaaagaaatatttttaactatatttaaa
aagtcagatgtagataaacaatttcttacatttcatgacataaagaattctctatctgag
gatactgatttattaccaggatcaaatgcactaataactatgttggcagatagagtagaa
gatgaaagagcaatggtaagacgaagcacattgcaaatcttaaaaaatttgattgtaatg
gttccatttctgatacatgaaattgtacctataattagtctcagatgcagagatccagta
ttaatcgtgcggcgatttgctgtacaagttctatctcaacttttagaacaatttccagat
aattctcaactcctaaatgaatgggtacagactgttataccacaaatatttgacattgaa
attaaagtacaagaaaaggtgctaggttgtttagaagagttattattaaatagaatacaa
aatatttctacaactactgatactattgcagataatttgccatggaaaattttaaatgct
gtagcaaatatgaaaatgagaagacatttatcaaaagcctgtagcttatgggttaaaaat
ggtgttattactaaatctataatgaaaaatatacaatctcatattggaacaaataataac
atagaagcttgggtctttttggttgcattggctgaaaataccaagttaccagatatgaac
aaatatttttcaaattatcagcaaatttttctagaaaataatttttacacaagtttagtt
ttgcaagttttaagatgttcttggaagtctttagattatgagattctagaagatcttcat
acctatctatataaatgcttgcaacaattcaagattaattttggattaattagcatttgt
ttggatattatacacaatataactcattatttaaatcctgataaaaataataatttgtta
gaatcaaacatgctaaatctggtaaagatttcagagatagaaattgcaaaaatttttaaa
gatgaaaacgaagatgtagaggcaccacccaattatttaagagctatgtttacattagga
catgcaacaattttatgcagctgcaagatttcaccattaacgctacggattttgcaagga
atgttattagaatgggaaacactaccagaaattataaaaccaatagaagaactgcaagct
tcagcagttgttattcttggacagcaagcaatgagagatcgtgaaattgctaaagaagta
gtccaaatatttggtaaattaatgagagaagaaacaaatctagattcgattgttcaaatt
gctgtgaaaataaatgctgcaaaagctttagctgatatttgtgttaggttcactgctttg
gtggaaccatacttatcagatatgtgtgtaagtatgaaaaattcaactccacaagtacga
gaggctattgtggtgatatttattcaacttcttctggaagattacataaaaattaagggt
cctttcttttttcatatattaacaatgttgtcggattcggacaatatgatacgtgaatta
acaatttttctcatagaagaacggcttttaacaaagaataagtcattaatatcacaacaa
tttctacagagcatatatcattataataattatcaatctcaacataaaatttatcaccat
aaaatgtgtgagaaagaaaagaaagctttaacacttcctggaagaagaaatgaaaagaaa
cggagaataatttatgatttcatgctggatcatttagatcctccaggaaagatgaaattg
cttgtaaaagtaactagtcaaatacttgatggaacttgtgttgatttgattgacattaaa
aaagaagaaggagcaggtgtattaaaggatgcattgtatataataagtcacgagcgtcta
cgaccatcatcttttaacagacaaggtgatgatgaccaacaagaagatgaagaatgtaga
gctcaaacaaatattccaacttctaatgctattagcattattattgaaggaattaagaaa
tatggtttagatgttctactacctagattaataaaacttagaataaaattatctacttta
aaatcaccattagaaaatgttgtaaaaaagattctagttaaaacatattctgaatataac
aaggaccaactattaaacatagtaaccgaatatcctgaattggaaaaagaagtggagcag
tttaaaaaacagatggaagacattacagttgatgatgagaattttactgaagaagaaaat
tctgcatcagaaattaataatcaaagtgcgtccaataaaaatttagatctaacgatgtgt
aatttacaccctaagattgtattagagcgtctttcggttccgcaattgttaaattctaat
tcaccaatcagggctttagatagtttgaattccccaacatattcaaactcaattttatgt
tcaccttcacaacctggtcctagtacaagtacacctacatgttttaattctgaatctaat
aacactgtaggtcgtgcttcaagagttagaagactttccagtttctttcaaaatgaaaat
gaactatttgatcacgaaataagagaaagaaatattttccaggttcaagatgatagtgag
tctgattag
DBGET
integrated database retrieval system