Brochothrix thermosphacta: CNY62_05655
Help
Entry
CNY62_05655 CDS
T05089
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
bths
Brochothrix thermosphacta
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpaA
SdrD_B
Collagen_bind
CarboxypepD_reg
SpaA_2
DUF3244
Por_Secre_tail
bMG3
Big_8
Candida_ALS_N
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATF25927
UniProt:
A0A291BXI3
LinkDB
All DBs
Position
complement(1179121..1188117)
Genome browser
AA seq
2998 aa
AA seq
DB search
MGILFSILNTKGINNYYNRGKTGMIKKLQKSFILFVLFTFVAQSVLVHVPVKAAELPTVV
SLTDVLVSDNEELTTEATTLKEKQELFVKLGLTMKDGEITKEATLMALPSQLHGDVFGEG
NVVDEQNKAVGSYTIANNSIKILFNDEAVTGAPYHLVFKATYNAVETDVKAEKIVFSLGE
SMIVKEFTVEQEKAASTDEAKPPKEDEKSSKDDEKPSKEVEKPTTKKIKKAAKQAFIKAE
TRPGAPITENIITSAKITDKDGKPFTVDNPAALDQNVNIDIGWEIPEDLDVVNGDTFEFD
LPNVFKMYSTVNGTLIQDGVELGTYKIDTNGHVTLTFNAEVEDRSEIKGTIKVATVLNKE
IIEGQTQQEIVFPVGDTEITVPIFLKPANGVDISKTGVLDKGYNPTTVKWTVDINTSLSK
IENAVVKDALPTGLKLNKAAVYELNVDVKGNTTQGKLVDPSKYTLAQDGTITFKDPSINK
AYRIIYDTDIENPEQLEGQKDFKNTATLTGVGKNASADSTVSAKYGKPLTKETTKYDPAT
QTYDFAVKYNYNEQTITKDKAKLTDQFGNNLDLVGGLEGVKIYPVKIDENGNEKIDETPI
SPSEYSIKEANNAAEGKNGFEVSFTNAITTAYVIKYSIKHNDIVDGASPVVNNVTTGGGQ
TANAGGTSGQQSLIKTITDSDSDAETVSWKLDVNGNKYTMTDMKINDAFGTAALKLLPET
LKLVDNDNKNALLVNGTDYTLVPKENGKGFDITFIGKYKTTNHKFTLTYDTRYEALENDT
NKYSNTASLSWTGSDNKPHTSTDGKEYTAPVESQSNGSKSGSYNSMTKEITWTIHANYNR
ADLKNAKITDKIPYTNNSNNNQKFIPNSVNVYHYSVDKKGVIVKGAALKPEEFKVTEPNA
SNNYTVEVELLKDFTGKDASIGMDFKTSLDGLVIGGEYKNTATYTNDGKDFPLDATVQVG
FGGSLVTKSGQQNGDNIDWTIGLNNSQSTISGYKIIDTPTANQVLIESSFHIYETKVQSN
GYVEADKTKALVRDVDYSLVITTDGSTGKQSFELKFLKTINKAYVLNYSSAIDASDKESV
SNEITMSGDNVTTVTQKTSEEVIVQTSSGSGDASGVRGGLTITKVDKANKPLIGATFVIL
DKTKKSMLRTGTTDASGTVSFGGLRAGDYVIKETESPAGFSIDPEYAVGKKVKVVVTQQN
PMMTLKVVDPATLVTVSKVNEAGKGLPGATFEVLDEAGYVILPDLKVDADGKLAIEGLLE
GTYTLKEVKAPAGYLLNTTPQTFDVVLDENGVMVTTNIEFKNYQGSASILKTDAKLKGLP
NSIFKVVNAQGDTIKTGLKSNADGIVTADGLAPGNYSFVETTATTGYGINDTPIEFTIAD
SSAGKPTAINAGTLVNYQGTAKLKKENDKGESLEGAVFKLVNEQGATVAENLTTDKNGEL
EVANLAPGKYTFVETKAPTGYILNEETDTFTIDQTTRSEQVLTTTATNYQGSAQLIKVDK
DDQAIQGAVFKVIDSAGKSVAENLVSNAEGVVEISDLAPGDYKFVETKAAAGYVLNKAEA
SFTINTTNTGKPETVLAGNFANYKGSAELKKVTEDNKALEGAIFKVVNDKDEDIITNLST
DKEGKVLAENLAPGTYAFVETAAPAGYVLNPTKTTFTINDSNVDKPAVVAAGELINYKGS
AELTKVDAKGNALENAEFKVIDSEGSTVVEKLTTNADGKITVANLAPGKYTFVETKAPAG
YILNTEAVAFTVADSTEGKPETVVANELTNYKGSAQLTKTDADGKALENAEFKVVNSDGK
TIIEKIISDENGQVVAPELEPGDYEFIETKAPTGYILNDAKTAFTISAENAGKPTVVDAG
KFVNYKGGAELRKIDGNGNELAGAEFKVIDADGNTVIDKLTSNAEGKIKADDLAPGEYQF
VETKAPTGYVLNTDKVSFTVEAKQSYAPKDINSGVFANYMGSAELIKVDKEGNTLEGAEF
KVVNDKNETVIEKITSNEEGIVFAENLAPGTYQFVETKAPTGYIINTNPVEFTIAVAQAA
TPKVVKTIELANYKGSATLTKVDVDGNALENAEFKVVDADGKTVVDNLITNSNGKIAVAD
LAPGDYQFVETKAPTGYVLNTDPVAFTIVDSAAGEPAAVDSNELTNYKGSAVLTKVTADG
KKLENAEFKVVDTDGKTVIEKLVSNEAGEVTATELAPGTYKFIETKAPTGYILNTDPVDF
TIEAEQAAMPKVVNVGEFVNYKGSAVLTKVDVDGKVLENAEFKVIDAEGKTVIEKLVSNE
AGEVTATELAPGTYQFIETKAPTGYVLNTDPVEFTIEAEQAAMPKVVNAGELANYKGSAV
LTKVDVDGKVLENAEFKVIDAEGKTVIEKLVSNETGEVTATELAPGTYQFVETKAPTGYV
LNTDTVEFTIEAEQAAMPKVVNAGELANYKASAVLTKVDVDGKVLENAEFKVIDAEGKTV
IEKLVSNEAGEVTAPELAPGTYQFVETKAPTGYILNTEPVEFTIEAEQAAMPKVVNASEF
VNYKGSAVLTKVDVDGKVLENAEFKVINAEGKTVIEKLVSNEAGEVTATELAPGTYQFVE
TKAPTGYVLNTDTVEFTIEAEQAAMPKVVNVGEFVNYKGSAVLTKVDADGKVLGNAEFKV
INAEGKTVIEKLVSNEAGEVTATELAPGTYQFVETKAPTGYVLNTEPVEFTIEAEQAAMP
KVVNAGELANYKASAVLTKVDAIGKVLENAEFKVVDADGKTIADKLVTDVSGKITVDNLS
PGKYQFVETKAPTGYILNTNPVGFTIEAEQAAVPEVVNAGELVNYQGMASFIKVDENNVP
LPDAEFELIDTNSGEVVKSGLISDEKGRVSASDLAPSNYAFKETKAPQGFVKSEKLLTFT
IIDESDTFVSLDLGIFINKAEEETVIIPPVKPDKPGKPGKPGKPGEPGNPVKPGTTWTPT
PNGSIKPDGPSESVLIPNQPTSLPTTGDNPMDRLFVVLGMFVTMMSAFMLKRRPKKNF
NT seq
8997 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggatattattttcaattttaaatacaaaagggataaataattattataataggggg
aaaacagggatgattaagaaacttcaaaaaagtttcattctctttgtgttgtttacattt
gttgcgcaatcggtattagtacatgtaccagttaaagcagcagaactgccaacagtagta
tcgttaactgatgttttagtttcagacaatgaagaattaactacagaagcaacaacgttg
aaagagaaacaagaacttttcgtcaagttagggttgacgatgaaagatggggaaataacg
aaagaggctacattgatggcattgccaagccaattacatggggatgtttttggtgaagga
aatgttgttgacgaacaaaacaaagcagtcggaagctacactattgctaataatagcatt
aagattttatttaatgatgaagcagtaactggcgcaccgtaccatcttgtttttaaagcc
acctacaatgctgttgaaactgatgtaaaagctgaaaaaattgttttttcattaggtgaa
agcatgattgtcaaagagttcacagtagaacaggaaaaagcagcttctactgatgaagcg
aaacctccgaaagaagatgaaaagtcttcaaaagatgacgagaaaccttccaaggaagtt
gaaaaaccaacaactaaaaaaatcaaaaaagctgcaaaacaggcttttattaaagcagaa
acacgtccaggggcaccaattacagagaatattataacgagtgctaaaattacagataaa
gatggtaaaccctttactgtggataatccagcagcactagatcagaacgtaaatatcgat
ataggttgggaaataccggaagatttagatgttgtgaatggtgatacatttgagtttgat
ttaccaaacgtttttaaaatgtatagtactgttaacggtactttaattcaagatggtgtt
gaattagggacatataaaattgatacaaacggtcacgttactttaacttttaatgcagaa
gtagaagaccgttcagaaataaaaggaacaattaaagttgcgacagttttaaacaaagaa
ataattgaaggtcaaacgcaacaagagattgtttttccagtaggtgatacagaaatcacg
gtacctattttcttgaaaccagcaaatggtgtagatatttctaaaacgggtgtcttagat
aaaggctataacccaacaactgtcaaatggacagtggatatcaatacaagtttgtctaaa
attgaaaatgcagtagttaaagatgctttgccaacaggcttaaagctaaataaagcagct
gtctatgagttgaatgtagatgttaaaggtaatacaacacaaggtaaactagtcgatcca
agcaaatataccttagctcaagatgggaccattacgtttaaggaccctagcatcaacaag
gcatatcgtattatttatgatacggatattgaaaatcctgaacagctagaaggccaaaaa
gatttcaaaaacacagcgactttgacaggcgttggtaaaaatgcaagtgcagatagtaca
gtgagtgcaaagtatggtaaaccacttacaaaggaaacaacaaaatacgacccagctacg
caaacatatgattttgcggttaaatacaactacaatgaacaaacaatcactaaagataaa
gctaaattaaccgatcaatttggtaacaaccttgatttggttggtgggcttgaaggcgtt
aaaatttatcccgttaaaatagatgaaaacggtaatgaaaaaatagatgaaacgcctatt
agtccaagtgagtattcgattaaagaagcaaacaacgcagccgaaggtaaaaatggtttc
gaagtgagtttcacaaacgctatcactacagcgtatgtgatcaaatattcgatcaagcac
aatgatattgttgatggcgcaagtccagtcgttaacaacgttacaactggtggtggccaa
actgcaaatgcaggtggtacatcaggtcaacaatcattgattaaaacaattactgattct
gatagtgatgcagaaacagtgagttggaaattagatgttaatggaaataagtacacgatg
actgatatgaaaatcaatgatgcttttggaacagcagcacttaaattgctgccggaaact
ttaaaattagttgataatgataataaaaatgcattattagttaacggtactgattacaca
ttagttcctaaagaaaatggcaaaggttttgatattacttttataggtaaatacaaaaca
acaaatcataaattcacactgacgtatgatacgcgttatgaagcacttgaaaatgatact
aataagtatagtaatacagcttctttatcatggacaggtagtgataataaaccgcatact
tcaactgatggtaaggaatatacggcacctgtagaatcacaatcaaatggttcgaaatca
ggttcttataattcgatgactaaagaaatcacatggacaattcatgcaaactataaccgt
gctgatttaaaaaatgcaaaaattacagataaaataccgtatacaaataattcaaataat
aaccaaaaattcattcctaattcagtgaatgtttatcattattctgttgataaaaaaggt
gtcattgttaaaggggcagctttaaaacccgaagaatttaaggtgacagagccaaatgct
agcaataattatacagttgaagttgagttgttaaaagacttcactggtaaagatgcttct
atcggaatggactttaaaacatcacttgatggtttggtaattggtggcgaatataaaaat
acggctacttatacaaatgatggcaaagatttcccgctagatgcgactgttcaagttggt
tttggtggttcgcttgtcactaaaagtggccaacaaaatggtgataatattgattggaca
attggtttaaataatagtcaatcaacaattagtggttataaaatcattgatacaccaaca
gctaaccaagttttaattgaaagttcgttccatatctatgaaactaaagttcaatctaac
ggttatgttgaagcagataaaaccaaagctttggtgagggatgttgattacagccttgtc
attacaacggatggttcaacaggaaaacaaagttttgaacttaagtttttaaaaacaatc
aataaagcgtatgttttaaattattcatcagcaatcgatgcgagtgataaagaaagcgta
agcaatgaaattacaatgagtggtgacaacgtcacgacagtgacacaaaaaacgtcagaa
gaagtcattgtacaaacatcatcaggttcaggtgatgcatcaggtgttcgtggtggttta
acaatcactaaggtagacaaagcgaataaaccattgattggtgcgacatttgttatctta
gataaaacgaagaaatcgatgttacgtactggcacaacagatgctagtggtactgtttca
ttcggtggcttgagagctggcgattacgtgattaaagaaacagagtcacctgctggtttc
tcaatcgatccggaatacgcagttggtaagaaagttaaagttgtggtgacacaacaaaat
ccaatgatgacactcaaagttgttgatccagcaacattagtgacagttagtaaagtaaat
gaagctggtaaaggacttcctggtgcaacgtttgaagtgttagacgaggcaggatatgtt
attcttccagacttaaaagtagatgcagatggtaaactagcgattgaaggtttacttgaa
ggaacctatacattaaaagaagttaaagcaccagcgggttatcttttaaatacaacaccg
caaacatttgatgttgttttagatgaaaatggtgtcatggtaacaacaaacattgaattt
aaaaactatcaaggtagcgcttctattctaaaaacagatgcgaaacttaaagggttaccg
aattctattttcaaagttgtaaatgcacaaggtgatacgattaaaacagggcttaaatct
aatgcagacgggattgttactgctgatggcttagcgccgggtaactattcatttgtagag
acgacagcgacaactggttacggtattaacgatacaccaattgaatttacaatcgcagat
tcaagtgcaggtaaaccaacagctatcaacgcagggacattggttaactaccaaggaact
gctaaattgaaaaaagaaaatgataagggcgagtctttagaaggtgcggtctttaagtta
gtgaatgaacaaggtgcaactgtcgcagaaaacttaacgacagataaaaatggcgagctt
gaagtcgctaatttagcacctgggaaatatacatttgttgaaacaaaagcaccaacggga
tacattttaaacgaagaaacagacacgtttacaattgaccaaacaacgcgttcagagcaa
gtcttaacaacaacggcaacaaactatcaaggtagcgctcaattgattaaggttgataaa
gatgatcaagccattcaaggtgcggtatttaaagtaattgatagtgcaggtaaatcagtt
gctgaaaaccttgtgtctaatgcagaaggtgttgtagaaatttctgatttagcacctggt
gactataaatttgtggaaactaaagctgctgcaggctatgtattaaataaagctgaagct
agttttacgattaacacaactaatacaggtaaaccagaaacggttcttgcagggaatttt
gctaactacaaaggtagtgcagaattgaaaaaagttactgaagataacaaagccttagaa
ggtgcaattttcaaagttgttaatgataaagatgaagatatcatcacgaacctttcaaca
gataaagagggtaaagtattggctgagaacttagcgccaggaacttacgcttttgtcgaa
acagcagcaccagcaggctatgttttaaatccaacaaaaactacatttacaattaatgac
tcaaatgttgataaaccagcagtagttgctgcaggcgaattaataaactacaaaggtagt
gcagagttaacaaaagtagatgctaaaggtaacgctttagaaaatgctgaatttaaagtg
attgattcagaaggatcaacagttgttgaaaaattaacaacaaatgcagacggtaaaata
acagttgctaatttagcacctgggaaatatacatttgttgaaacaaaagcaccagcaggc
tatatcctcaatacagaagcagtagcttttacagttgctgattctactgaaggaaaacca
gaaacagtcgtagccaatgaactaacaaactataaaggcagcgcccagttaacaaaaact
gatgcggatggaaaagcgcttgaaaatgctgaatttaaagttgtgaactcagatggaaaa
acaatcattgaaaaaataatttcagatgaaaatggtcaagttgttgcaccagaacttgaa
ccaggtgattatgaatttatagaaacaaaagcaccaacaggctacatcttaaatgatgcg
aaaacagcctttactattagtgctgaaaacgcaggcaaaccaacagtagtagatgctgga
aaatttgttaactacaaaggtggcgcagaacttcgtaaaattgatggcaatggtaacgaa
ttagcgggtgcagaattcaaagtgattgatgcagacggtaatactgtgattgataaattg
acttcaaatgcagaaggtaaaattaaagctgatgatcttgcaccaggcgaatatcaattc
gttgaaacaaaagcaccaacaggctatgttttaaatacagataaagtaagcttcactgta
gaagcaaaacaatcttatgctcctaaagatatcaactcaggtgttttcgcaaactatatg
ggtagcgcagaattaatcaaagttgataaagaaggtaacacacttgaaggcgcagaattt
aaagtagtcaatgataaaaatgagaccgtgattgaaaaaatcacatctaatgaagagggt
attgtctttgcggaaaacttagcgccaggcacatatcaatttgttgaaacaaaagcacca
acaggatacattatcaatactaacccggttgagtttacaattgcggtagcacaagcagca
acgccaaaagtcgtgaaaacaattgagttagcaaattataaaggtagcgcaacattaact
aaagtagatgttgatggaaatgcgctagagaacgcagaatttaaagttgttgacgcagat
ggtaaaacagttgtcgataatttaataacgaattcaaatggtaaaatagctgttgcagat
cttgcgccaggtgattaccaatttgttgaaacgaaagcaccaacaggttacgttttaaat
actgaccccgttgcgtttacaatcgttgactctgctgcaggcgagccagctgctgtagat
tctaacgaattaactaactacaaaggtagcgcagtattaacgaaagtaactgcggatggt
aaaaagttagaaaatgcagagtttaaagttgttgatacagatggtaaaacagtgatcgaa
aaactggtatcaaatgaagcaggtgaagtgacagcaacagaacttgcaccaggaacgtac
aagtttatcgaaacaaaagcaccgacaggttacattttaaatactgatccggtcgatttt
acaatagaagcagagcaagcagcgatgcctaaagtcgtcaatgtaggcgaatttgtaaac
tacaaaggtagtgcagtattaacgaaagtagatgttgatggaaaagttttagaaaatgca
gagtttaaagtaattgatgcagaaggtaaaacagtaatcgaaaaactggtatcaaatgaa
gcaggcgaagtgacagctacagaacttgcaccaggaacttatcagtttatcgaaacaaaa
gcaccaacaggatacgttttaaatactgaccccgttgaatttacaatagaagcagagcaa
gcagcgatgcctaaagttgtgaatgcaggtgaattagcaaactacaaaggtagtgcagta
ttaacgaaagtagatgttgatggaaaagttttagaaaatgcagagtttaaagtaattgat
gcagaaggtaaaacagtaatcgaaaaacttgtatcaaatgaaacaggtgaagtgacagct
acagaacttgcaccaggaacataccagtttgttgagacaaaagcaccaacaggatacgtt
ttaaatactgataccgttgaatttacaatagaagcagagcaagcagcgatgcctaaagtt
gtgaatgcaggtgaattagcaaactacaaagcgagcgcagtattaacgaaagtagatgtt
gatggaaaagttttagaaaatgcagagtttaaagtaattgatgcagaaggtaaaacagta
atcgaaaaactggtatcaaatgaagcaggtgaagtgacagcaccagaacttgcgccagga
acataccagtttgtcgaaacgaaagcaccaacaggatacattttaaatactgaaccggtt
gaatttacaatagaagcagagcaagcagcgatgccaaaagtcgtcaatgccagcgaattt
gtaaactacaaaggtagtgcagtgttaacaaaagtagatgttgatggaaaagttttagaa
aatgcagagtttaaagtaattaatgcagaaggtaaaacagtaatcgaaaaactggtatca
aatgaagcaggcgaagtgacagctacagaacttgcaccaggaacataccagtttgttgag
acaaaagcaccaacaggatacgttttaaatactgacactgttgaatttacaatagaagca
gagcaagcagcgatgcctaaagtcgtcaatgtaggcgaatttgtaaactacaaaggtagt
gcagtattaacgaaagtagatgctgatggaaaagttttaggaaatgcagagtttaaagta
attaatgcagaaggtaaaacagtaatcgaaaaactggtatcaaatgaagcaggcgaagtg
acagctacagaacttgcaccaggaacataccagtttgttgagacaaaagcaccaacagga
tacgttttaaatactgaaccggttgaatttacaatagaagcagagcaagcagcgatgcct
aaagttgtaaatgcaggtgaattagcaaactacaaagcgagcgcagtattaacgaaagta
gatgctattggaaaagttttagaaaatgcagagtttaaagtagtagatgcagacggtaaa
acaattgcagataaattagtaacagatgtaagtggtaaaataacagttgataatttatca
cctgggaaataccaatttgttgaaaccaaagcaccaacaggatacattttaaatactaat
cccgttggatttacaattgaagcagaacaagcagcagtgccagaagttgtaaatgcaggt
gaattagttaactatcaaggtatggcaagcttcatcaaagtagatgaaaataatgtgcca
ttgccagatgcagagtttgagttaatagatacaaattcaggtgaagttgtaaaatctggt
ttgatttcagatgaaaaaggtcgtgtgagtgccagtgatttagcgccaagtaactatgcg
tttaaagaaaccaaagcgccacaaggctttgtgaaatcagagaagttattaacatttaca
attattgatgaatcagacacatttgtttcattagaccttggaatatttattaataaagcg
gaagaagagacagttattattccaccagtgaagccagacaaaccaggtaaaccaggtaaa
ccaggtaaaccaggcgaaccaggtaacccagtgaaaccaggaacaacttggacaccgact
ccaaatggatcaataaaaccagatggaccatcggaatctgttcttattccaaatcagcca
acttcgttgccgactacaggtgataacccaatggatcgcttgttcgtcgttttaggaatg
tttgttacaatgatgagtgctttcatgttgaaacgtcgtcctaagaaaaatttctag
DBGET
integrated database retrieval system