Bacillus thuringiensis YBT-1518: YBT1518_20370
Help
Entry
YBT1518_20370 CDS
T02930
Name
(GenBank) collagen triple helix repeat protein
Organism
bthu
Bacillus thuringiensis YBT-1518
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHA73206
LinkDB
All DBs
Position
4026350..4028284
Genome browser
AA seq
644 aa
AA seq
DB search
MSRYNDNQNKFSKPCFPSSAGRIPNTPSIPITKAQLRTFRAIIIDLTKIIPTLFANPSPQ
NIEDLIDTLNLLSNFICSLDATSSLKAQGLAIIKNLITILRNPTFVASAVFIELQNLINY
LLYITKLFRIDPCTLQELLKLIAALQTALVNSASFIQGPTGPTGPAGATGATGPRGNTGA
TGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGA
TGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGATGPRGN
TGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGATGPRGNTGATGATGPQGNTGATGATGA
TGPRGNTGATGATGPQGVQGNTGATGATGATGPQGAQGNTGATGPQGVQGNTGATGATGP
QGAQGNTGATGATGATGPQGVQGNTGATGPQGIQGPTGATGATGPQGVQGNTGATGPQGI
QGPTGATGATGIGVTGPTGPSGGPTGPTGPTGPSFPIATIVVTNNIQQTVLQFNNFIFST
AINVNNIIFNGTDTVTVINGGIYVISVSISTTAPGCAPLGVGISINGAVATDNFSSNLIG
DSLSFTTIETLAAGARISVQSTLNEITIPATGNTNIRLTVFRIA
NT seq
1935 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctcgttataacgacaatcaaaacaaattctccaaaccatgctttccaagtagcgct
ggacgaatcccaaatactccatcaatcccaattactaaagctcaacttagaacatttcgt
gcgattattattgatttaacaaaaataatcccaacactttttgcaaatccatctccccaa
aatattgaagatctaatcgatacattgaacctactaagtaattttatttgttcactagac
gctacttcctccctgaaagcacaagggttagctattattaaaaacttaataactatatta
agaaatccaacctttgtagcaagcgctgtatttattgagcttcaaaatctcattaactat
ttactatacattacaaaattattccgaattgacccttgcacacttcaagagcttcttaaa
ttaatagcagcattacaaactgctctagttaattctgcttcgttcattcaaggacctacc
ggacctactggaccagcaggcgctactggtgctaccggacctcgaggtaacacgggcgct
actggcgctaccggtgccactggacctcgaggtaacacgggcgctactggcgctaccgga
cctcaaggtaacacgggcgctactggcgctaccggtgccactggacctcgaggtaacacg
ggcgctactggcgctaccggacctcaaggtaacacgggtgctaccggcgctaccggtgcc
actggacctcgaggtaacacgggcgctactggcgctaccggacctcaaggtaacacgggc
gctactggcgctaccggtgccactggacctcgaggtaacacgggcgctactggcgctacc
ggacctcaaggtaacacgggcgctactggcgctaccggtgccactggacctcgaggtaac
acgggcgctaccggtgccactggacctcgaggtaacacgggcgctaccggcgctactgga
cctcaaggtaacacgggcgctactggcgctaccggtgccactggacctcgaggtaacacg
ggcgctaccggcgctactggacctcaaggtaacacgggcgctactggcgctaccggtgcc
actggacctcgaggtaacacgggtgctactggcgctactggacctcagggtgttcaaggt
aacacaggtgctactggtgctaccggcgctactggacctcaaggtgctcaaggtaacaca
ggtgctactggacctcaaggcgttcaaggtaacacaggtgctactggtgctaccggacct
caaggtgctcaaggtaacacaggtgctactggtgctactggcgctactggacctcaaggc
gttcaaggtaacacgggtgctaccggacctcaaggcattcaaggaccaacaggtgctacc
ggcgctactggacctcaaggcgttcaaggtaacacgggtgctaccggacctcaaggcatt
caaggaccaacaggtgctaccggcgctactggtataggagttactggacctactggacct
tctggtggacctaccggacctactgggccaactggacctagcttccctatagcaacaatt
gttgtaacaaacaatattcagcaaacagtactgcaatttaataactttatttttagtact
gcaattaacgtaaacaatattatcttcaacggcacagatacagttactgttattaacggt
ggtatttatgtaattagcgtatccatttctacaactgcgccaggatgcgctccactcgga
gtaggaatttcaattaatggagcagtcgcaactgataatttctcttcaaatttaataggc
gactcactttcatttactacaatcgaaacattagcagctggtgcaagaatttctgttcaa
tctactcttaatgagattacgatccctgcgacaggaaatactaacatccgccttactgta
tttagaatcgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system