Bartonella tribocorum CIP 105476: BT_1105
Help
Entry
BT_1105 CDS
T00636
Name
(GenBank) helicase/methyltransferase
Organism
btr
Bartonella tribocorum CIP 105476
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Type_ISP_C
Mrr_cat_2
ResIII
DEAD
Helicase_C
N6_Mtase
SWI2_SNF2
SNF2-rel_dom
SLFN-g3_helicase
CbiA
Eco57I
DUF1878
SmpA_OmlA
DUF2884
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAK01480
UniProt:
A9ITV9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1173598..1178559)
Genome browser
AA seq
1653 aa
AA seq
DB search
MLQSLKSDHEHVTLRSLLEYYRQQAKSLRELGTLFENLVIAYLTKDPLHYGRYEKVETYY
EWAKEREGWNKNDIGIDLVAKLRNQEGYVAIQCKFYQADHQISKKDIDSFIAASGKDIFK
YRLLVDSTEVELSDNVNAMIKGQAIPVYRIDLRHMENSRIDWQIYATKKEVLLKSTKKPR
PHQEEAIKKVCEGLKEADRGKLIMACGTGKTFTSLKIAETLAGKGKRVLFLVPSLALVSQ
TIREWTTDAQVPLRSFAVCSDTKVGKRRKNQEDIVGMETSDLVLPATTDAQALAKEACEN
LEDAMTVVFSTYHSIQVISDAQKEHGLPEFDLIICDEAHRTTGASLGSEDNESEFIKVHD
NSIIRGKKRLYMTATPRIFSDTAKRRADEINAVLASMDDETLFGKQLHHYTFAEAVDNEL
LTPYKIVVLGINETYITPAIQEIIANENREIDLDDAAKIIGCYRALTKIDKQAAIDDDDT
EPMQCALAFCKDINTSQYITKLFNKIIKSHIDDFLQTVPFLNCEVRHIDGTQSVKKRNEE
LDWLKEDTGQNVCRILSNVRCLSEGIDVPALDAIMFLHPRNSQVDVIQAVGRVMRRAPNK
KTGYIILPIIIPSHLEAKKALKNNKRYRVIWQVLDALHSHDERLARTINQMSLGQDSSHT
IEIIEIKRANELQELTTTVDEISIPSKTESSGHTIGTAESKTQSVSGGQGDLFPRSEFFD
FVKAIFLDSFKITDYWGIWANNVAEIAQNHINHLKDMISDEKSEAFHAFDAFHKELKNNV
NSEIKKEEAIEMLAQHLVTRPVFEALFDGNEFVQNNAISQAMDKILTELDKTNIEEKTKD
LDKFYKSVTFCTAGITETHAKQNLIIKLYESFFAKAFKKTTDKLGIVYTPVKVVDFIIHS
VDDVLRNEFGKSLGSRGVSILDPFTGTGTFITRLLQSNLIKPEDMEYKFRHDIHANEIVL
LAYYIAAINIETTYHSLMKGEYIPFKHIGLTDTFRMLEEKNLLQELFKENSEYLEYQKKL
DIKVIFGNPPYSVGQKNENDNAKNTPYPILDNRIRETYAAQSKVTNIRALYDSYIRAIRW
ASDRIDNAGVIGFVSGSGYIDKPTMDSLRKSLAKEFTSIYVLNLRGDIRKNMMNKNNAQE
GENVFGNGSMTGIAVTLFIKNPNVSGDCKIYYHDIGDNLTTKEKLTALEYFGSIGGVMRE
SGWQLIKPDEHGDWIKQRDDSFATFLTLGDKKGNNNKKLFETFSRGIITTRDIWAYNASH
QALANNMSNMIAFYNSEVERFNDAYTDTDRKKRAKAVNDFVNTDERKISWSRALKQDLVK
GKIFEFEETYLTQSLYRPFTRQWLYYSRTFNEMVYQIPRIFPMEKVVENMVIQVASVGTM
SGFSVLMSKDLPNLHAIDTGQCFPRYIYEDTTVSESKNERQSHLFTEANTTAGLQRRDAI
TDEGLAHFKAAYPNEKITKDDLFYYVYGLLHSEDYRARYADNLCKELPRIPCVKNADDFW
KFVTAGRELGHLHVNYEDVEPYPVTFKKGNPKLTDISNPEKFYYVTEMKFAGNSKEKDKS
TVIYNSNITITDIPLEAYEYIVNGKPALEWVMGRQCVKTDKKSGIVNDANRYAVETIGNP
AYPLELFQRVITVSLETMKIVKNLPKLEIRETE
NT seq
4962 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgcaatctcttaagtctgatcatgaacatgtcacgctacgctctctgttggaatat
taccgtcaacaagcaaaatcacttcgtgaattaggaactctgtttgaaaaccttgtcata
gcttatttgacgaaagaccctctccattatggacgctacgaaaaggtagaaacctattat
gaatgggcgaaagagcgtgaaggttggaataaaaatgatatcggtattgatctggttgct
aagcttcgcaatcaagagggctatgtcgctattcaatgtaagttttatcaagcagaccac
cagattagtaaaaaggatattgatagctttatcgcggcatctggaaaagacatctttaaa
tatcgtcttcttgttgatagtacggaagtggaattaagtgacaatgtgaatgccatgatt
aaaggacaagcgatacccgtttatcgcattgaccttcgtcatatggaaaacagtcggata
gattggcaaatctatgcaaccaaaaaagaagttcttcttaaatcaacaaaaaagcctcgt
ccccatcaagaagaagctatcaagaaagtctgtgaaggtttaaaagaagcagaccgtggc
aagctcattatggcatgtggtacggggaaaactttcaccagtttgaagatagcagaaacc
cttgctgggaaaggcaagcgtgttttgtttctggttccttctctggctttagtctcacaa
acaatccgtgaatggacaaccgatgcacaagtcccgttgcgttcctttgcggtgtgttcg
gatacaaaagtaggcaagcgtcgtaaaaaccaagaggatattgttggcatggaaacatca
gatcttgttctccctgctaccacggatgcccaagcccttgccaaagaagcttgtgaaaac
ctagaagatgcaatgacggtggttttttcaacttaccattctatccaagtgatttcggat
gcgcaaaaagagcatggattacccgaatttgatttgatcatctgtgatgaagcgcataga
acgactggggcttcattgggaagtgaagacaatgaatccgaatttatcaaggttcacgat
aacagcatcattcggggcaaaaaacgtctgtatatgactgcaacgcctcgtatctttagt
gacactgccaaaaggcgtgctgatgagattaatgccgttctcgcatctatggatgacgaa
acgctttttggaaaacaactccatcattataccttcgcggaagctgtcgataatgaactt
ttaactccttacaagattgtggtcttgggtattaatgaaacctatatcacaccagccata
caggagattattgccaatgaaaaccgtgaaattgatttagatgatgcggcaaaaattatt
ggttgttatagagcactgactaaaatagataagcaagcagctatcgatgatgatgataca
gagcccatgcaatgtgctttagctttttgcaaagacatcaacacctctcaatatattaca
aagctcttcaataaaattatcaaatctcatattgatgatttccttcaaaccgttcctttt
ttgaactgtgaagtaagacatatcgacggaacgcaaagcgtcaaaaaacgcaatgaggaa
ttggattggcttaaagaagatacgggtcaaaacgtttgtcggattttaagcaatgttcgg
tgtctgtctgaagggattgatgttcctgctcttgatgccatcatgtttttacacccgcgc
aatagccaagtcgatgtgatacaggcggtagggcgtgtgatgcgtcgtgctccaaataag
aaaacaggctatatcattttacccattatcattccttcacacttagaagccaaaaaggct
ttaaaaaacaataagagataccgtgttatttggcaagttttggatgctttacattctcat
gatgaaagacttgctcggacgattaatcaaatgtctttaggacaagatagcagccatacg
attgagattatagagattaagcgtgccaatgaattacaagaactcaccacaacggttgat
gagatctcgataccatcaaaaacagaaagttctgggcataccattggaacagcagaaagc
aaaactcaatcggtatctggaggacaaggagacttattcccccgttctgaattttttgat
tttgtcaaagccatttttctggatagttttaaaatcacggattattggggcatatgggcg
aacaatgttgctgagattgctcaaaaccatatcaatcatcttaaagatatgatttccgat
gaaaagagtgaagcctttcatgcttttgatgcctttcataaggaattaaagaacaacgtc
aacagtgaaatcaaaaaagaggaagccattgagatgttagcccaacatcttgtcacgcgt
cccgtgtttgaagctttatttgacggtaatgaatttgtacagaacaatgccatttcgcaa
gctatggataagatcttaacggaactggataaaacgaatatcgaagagaaaacgaaagat
cttgataaattctacaaaagtgtcacattctgtacagcaggcatcaccgaaactcatgca
aaacagaatcttattatcaaactttatgaaagtttttttgccaaggcatttaagaaaacc
acggataagcttggaattgtttatacgcccgttaaggttgttgattttatcattcattct
gttgatgatgtgttgcgtaatgaatttggaaaaagcttagggtcacgtggtgtgtctatt
cttgacccctttacgggaacgggtacttttatcacacggcttttacaatccaatctcatc
aaaccagaggatatggaatataagttccgtcatgatatccatgccaatgaaattgttttg
ctagcctattacatagcagcgattaacattgaaacgacgtatcatagtcttatgaaaggt
gagtacatccctttcaagcatattggcttgaccgatacattccgcatgcttgaagagaag
aatctgctacaggaattgtttaaagaaaacagtgaatatttggaatatcaaaagaaactg
gatatcaaagttatctttggtaatcctccttattcggtaggacaaaaaaatgaaaatgat
aatgcgaagaataccccttatcctatactcgataatcgtattcgtgaaacctatgctgct
caatctaaagtaacgaatatacgagcgctttatgacagttatattcgtgctatacgctgg
gctagtgaccgtattgataatgcgggggtaatcggctttgtctctggatctggttacata
gacaagccaacaatggacagtttacgaaaatctttagccaaagaatttacgagtatttat
gtacttaatttacggggggatatccgtaaaaatatgatgaataaaaataacgcccaagaa
ggagaaaatgtttttggcaatggaagtatgacgggtattgctgtgacactatttatcaaa
aatcccaatgtttctggagattgtaaaatttactatcacgacattggtgataatctcaca
acaaaagaaaaacttacagctctcgaatactttggtagtattggtggtgtcatgcgtgaa
agcggttggcaattgattaaaccagacgagcatggcgactggattaagcaacgtgatgac
agttttgctacctttctaaccttgggtgataagaaaggtaataataataaaaagctcttt
gaaacgttttctcgtggaattataaccactcgcgatatttgggcatataatgcaagccat
caggctttagctaacaacatgagtaatatgattgccttttataacagtgaagtggagcgt
tttaatgatgcttacacagatactgaccgtaaaaaacgtgcaaaggctgtaaatgatttc
gtcaatacagatgagagaaagataagttggagccgtgcacttaaacaagatttggtaaaa
ggaaaaatttttgaatttgaagagacataccttacgcaaagtttgtatcgcccatttaca
cgacagtggctctattatagtcgaaccttcaatgaaatggtttatcaaatcccgcgtata
ttccctatggagaaggtagttgaaaatatggtaatacaagttgcttctgtaggaactatg
agtggtttttctgttttgatgagtaaggatttacctaaccttcatgcaatagatactggt
caatgctttccacgctatatttacgaagatactacggtttcagaaagcaaaaatgagagg
caatcccatttatttacagaagcaaacacaacagctggtttacaacgccgtgatgccata
actgatgaaggattagcgcattttaaagcggcttatcctaatgaaaaaatcactaaagat
gatctattctattatgtttacggtttgcttcattcggaagattatcgcgcccgttatgct
gataatttatgcaaagaattacctcgtatcccttgtgtaaagaatgctgatgacttttgg
aagtttgtaacagcagggcgtgaactgggtcatctgcacgtgaattatgaagatgtagag
ccttatccagtaacttttaaaaagggtaatccaaaattaactgatatctctaatccagaa
aaattctattatgtaactgaaatgaaattcgctgggaatagtaaggaaaaggataaatca
acagttatttataatagcaatattaccataacagatatccctcttgaagcttatgaatat
attgtcaatggtaaacccgctcttgaatgggttatggggcgtcaatgtgttaagactgat
aaaaagagtggcattgtgaatgatgccaatcgctatgctgttgagaccattggcaacccc
gcctaccctctagagttgtttcaaagggttattaccgtaagtttagagacaatgaaaatc
gtaaaaaacttaccaaaattagaaataagagaaactgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
