Bartonella tribocorum CIP 105476: BT_1788
Help
Entry
BT_1788 CDS
T00636
Name
(GenBank) autotransporter
Organism
btr
Bartonella tribocorum CIP 105476
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
AC_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAK02071
UniProt:
A9IWY8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1910180..1913554)
Genome browser
AA seq
1124 aa
AA seq
DB search
MFKNHLSLWRFTTVIFFFVHNADAGEVFSQKKQYSCDESVSFYHCNDGQTHEISQKTYQL
TGESSDAALEASEENTLIEGTAIIINGVSNTNGHSEKGAWTTAVKASKGGGVALFYSMLN
DVSIGADIDEDGAFEMQDGVIKATRIGISVAGEKSLVSLTKTEIKIPSDAIGLLSHNGAK
MHMKGGKIDFADGIGVQTGGDGEINLEGVSITGKGKQGTNTDNHREGSAFSMLQGKGMIH
FQKGNVNVNAAHGIVLQGNNNATAYIKHSNVFVRGKAFHGMHFFWEAVLEGTKTIIPGKG
AVHLTKTTVMAPESTAIYSRKFESSVKLLQHSTVAGDSLLKAVENSNVKIEADASILVGS
AYVDESSTAKIVLKNGSKWILARPKYEKLQNSNVSGSRLKDTSSLSVVELSDSSLIFEEL
KSSTTNGYQTLLIGKGTGTVYKAHGNVNLYLNAYLDKGGELEKQKTDRLLINGDLDGKTT
VHIYKVPGSPGALTGEGGNDQGISIVQVYGQATEDSFQLKGGYVTLEDSPYQYHLKSYGP
SSALGVAASNQRVLKNAGTFWDFRLESKFVDSSSLDSTKIVPVVESVVPPASNDIPSVPK
THPNTTGDEEKIIDSNSQKKTQKPSFSFPVDSPDKDSHLTTTSDTSDVFVLEVPNHPPVS
PPASGSPIPPSVPSTPSVISPSASGSPVPPSASSTPSVVVPLASGSPVPPSASPTSSVVV
PLASGSPVPPSVSPTPSVVVPLASGSPVPPSVSPTPSVVVPLASGSPVSPSVPPTPSVVV
SPASVSSVTPSVSEFFSHFELNTRVVVPQILTYILVPNTLFYAGLMDISNQNKQLQILRT
FSRQSLKTNENPALFLRGYGGHHRYTSNLSAFEYRYGSDLDYNALEAGILLKKIENAYST
TSFGIMGNYGKLSLRPREVKQRQESIFDKWSITAYGSMQHDTGLYMDGLFSYGLFNGNVL
TRERGKTAALRGKPLSFSLTAGKTFMIGCRCFIFEPQVQFVYQNLQFHNTRDIDNFKIDM
QRPDHWGVRIGGHLTKTLTFTKEAQVLSFYGTLHFVRNFDDKQFVYFKDAFQLGSFGSSL
EAGFGVYSQLSQKITFHSDLIYKHKFTKDGFSGTHFSGGLSYHF
NT seq
3375 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcaaaaatcatctctctttatggcgttttacaacggttatttttttctttgtacac
aatgctgatgctggtgaagttttttctcagaagaagcaatattcatgtgacgaaagtgtt
tcattctatcactgtaacgatggtcaaacccatgaaatttctcagaaaacttatcaactc
acgggtgaaagttctgatgctgccttagaggcatcagaggaaaatacactcattgaagga
acggcgataatcattaacggtgtttcaaataccaatggccattccgaaaaaggcgcttgg
acaacagctgtgaaagcctcaaaagggggaggcgttgctctcttttattccatgttaaat
gatgtgtcgataggggcggatattgacgaggatggggcttttgaaatgcaggatggggtg
attaaagcaactagaatagggattagtgttgcgggtgaaaaatcattggtttctttgacc
aaaacagagattaagataccttctgatgcgatcggtcttttgagtcataatggtgcaaaa
atgcatatgaaaggaggaaagattgactttgctgatggtattggcgttcaaacaggagga
gatggagaaattaatttagagggtgtttctattaccggaaaggggaaacaagggacaaat
acagataatcatcgtgaaggttctgcttttagtatgcttcaggggaaaggcatgattcat
ttccagaagggaaacgttaatgttaacgctgctcatggcattgtgttgcaagggaataat
aatgctactgcttatattaaacattccaatgtttttgtgagagggaaggcatttcatggt
atgcactttttttgggaagctgttttggaggggacaaaaacaattataccaggaaaaggg
gctgtccatttaactaagacaaccgttatggctccagaaagtacggctatttatagccgc
aaatttgaaagttctgttaaactcttacaacattcaacagttgctggtgattcactgctg
aaagctgttgaaaattccaatgtcaagattgaggctgatgcttctatccttgtaggaagc
gcatatgttgatgaaagttctacagccaagatcgtgttaaaaaatggttcaaagtggatt
ttagcgcgaccaaaatatgaaaaattacaaaactctaatgtgtctggttctagattaaaa
gatacttcttctctttcagtggtcgaactttctgatagttctctcatttttgaagaatta
aagtctagcacaacaaatggttatcagacacttctcataggaaaaggaacagggactgtc
tataaagcgcacggtaatgtgaatctttatcttaatgcatatttggataaagggggagag
cttgagaagcaaaaaactgatcgacttttaatcaatggggatcttgacggaaaaacaaca
gtccatatttataaggttcctggaagcccaggggcattgacgggagagggcggtaatgat
caggggatttccattgttcaggtttatggacaagcgactgaagattcttttcagttaaag
ggggggtatgtcacacttgaagactccccctatcagtatcatctaaagagttatggtcca
agttctgctttaggggtggcagcttccaatcaaagagtgcttaaaaacgctggaacattt
tgggatttccgtcttgaaagtaaattcgttgattcttcctctctcgattccacaaaaatt
gttccagtggttgaatccgttgttcctcctgcttctaatgatattccctctgtgccgaaa
actcatcctaatactactggagatgaagagaagattatcgattctaattctcagaaaaaa
actcagaagccaagtttttcttttcctgtagattctcctgataaggattcccatcttacg
accacatctgatacatctgatgtttttgtattagaggttccaaatcatcctcctgtttct
cctcctgcatctggttcacctataccgccatctgttccttccactccttctgttatttct
ccctctgcatctggttcacctgttccaccatctgcttcatccaccccttctgttgttgtg
ccacttgcatctggttcacctgttccaccatctgcttcacccacctcttctgttgttgtg
ccgcttgcatctggttcacctgttccaccatctgtttcacccaccccttctgttgttgtg
ccgcttgcatctggttcacctgttccaccatctgtttcacccaccccttctgttgttgtg
ccgcttgcgtctggttcacctgtttctccatctgttcctcccaccccttctgttgttgtg
tcacctgcgtctgtttcttctgttaccccctctgtttctgagtttttttctcattttgag
ctaaatacgagggttgttgttccacagattctgacttatattcttgtaccaaatacctta
ttttatgctggattaatggatatcagtaatcaaaataagcagttgcaaatactgcgaact
ttttctcgtcagtcattaaaaactaatgaaaatcccgctttgtttttgcgcggttacggt
ggacatcaccgttatacttcaaatttgtctgcatttgaatatagatatggaagcgacctc
gattataatgcactagaggcaggtattttactcaagaaaatcgaaaatgcatacagtaca
acatcctttggaattatgggaaattatggcaaactttctttgcgtcctcgagaggtgaaa
caacgtcaagaaagtatctttgataaatggtccattacagcctatgggagtatgcagcat
gatacgggtctttatatggatggtctcttctcttatggtttgtttaatggcaatgttctt
acacgtgagcgaggtaaaacggctgcattaagaggcaagcccttaagtttttccttaacg
gctggtaaaacatttatgataggctgccgatgttttatttttgaaccacaggtccagttt
gtttatcaaaatcttcagtttcataacacgcgtgatattgataattttaagattgatatg
caaagaccagatcattggggggtgcgtattgggggacatttaaccaaaacactgacattt
acgaaagaggcacaagttctctccttctatgggacgcttcattttgttcgtaattttgat
gataaacaatttgtgtattttaaagatgctttccagcttggttcttttggttcttcttta
gaagctggatttggtgtttattcacaactatcgcaaaaaattacttttcatagcgatctg
atttataagcataaatttacgaaagatggcttttctggaacgcatttttctggtggatta
agctatcatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
