Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-190: F544_3600
Help
Entry
F544_3600 CDS
T03019
Name
(GenBank) Peptidase propeptide and YPEB domain protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
btra
Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-190
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
btra00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
btra02000
]
F544_3600
Transporters [BR:
btra02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
F544_3600
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Trp_ring
YadA_head
ESPR
YadA_anchor
Hia_Tpr_ring_dom
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHG85594
UniProt:
W0R338
LinkDB
All DBs
Position
complement(347114..355516)
Genome browser
AA seq
2800 aa
AA seq
DB search
MNKVFKVVWNTATQTWVAVSELQKAKGKSKTRSVNLSTVAVSAAVAGAVLGSGNALAAVS
IGSNVPDAESTNAVIGNGALSAIAIGSASSSTGRSTIAIGQFANATHIDNLIDPEATQYR
TNSIGEESLNGTGANMALVPSIAIGMEACATSSNAIALGTQTKATGNRATAFGAGAKATG
NRSTVVGWSSVANGTRSFALGSGAKANADFSGAMGDKSVANGTSSLVFGHNASSGASATD
SIAMGHNATANGTDAKNTIAVGHNSTATRRGQIVIGHNASSLATSNAQTIVIGENATAVG
SATGATGANHISYQNPYHPMYNTSLPNSLSDRYTPYVSSTTGNTLLRYAGTTTSVLGTSI
VVGPNATAGSGNIAIGSNAYAETGTAEDGNSYGLGVALGQNAYASTGGVSVGGSTVAQGA
NSVALARQAVASGDSAIAIASSSAAVGEQAIAIGQSATAVGNHSIALGGSQSFGPYDGAT
NTLTYANASIAIGNSSQVSATGVNSVIIGSNTHADSANNVVLGSYANETSVTNTGAAGSQ
NGNQIDNATVNGYTYAGFAGEDKLVGVVSVGNGEQTRQIINVAPGNVSSTSTDAINGSQL
YLITTNMGFNVHNNADSSVARIKSDHHVQFKDGNGTTVDVTSKNDGANVSIAYNVNVDGS
TIKINNDGKLEAVIPEASTIETTTITTDPTTGAVTTPTTDGDKLVNATTVANAIKNAGFT
LKHSVVDGGENLGGDSELINAGDTVEMIAGKNLSVKQGENGTITYATKENVSFSNAQVNS
TFSIGNNTTDNPTVNFNTTAGSPTNVTNNGSTPTNPTALNLTDSEGKPVQIKGVESSLTV
NQLPTNDGNGTTGSTNLLNLTNADPNSAVTVGDLQNYGWVVSTPDNQFTQAVKNANEVKF
TGSDGIKVAGAVDSTGVYNITFEVNAGELKPNANGTISTLTTNGTVATVGDVANAINNSG
WNTTLSNGDQAQINPGDTLNYVDGNGTTATVKQDPNNPNVFNVSFDVNNANPTTVNNNGS
LATPTGNEGANFVNATTLVDAINKAGFTLKHSAVDGGEDLEGDAELINPGDVIEMIAGKN
LSVKQGANGTITYATKENVSFNNVQVNSTLTVGNNTADNPSVTFNTEAGSPTNVTNNGGD
TTNPTALNLTDSEGKPVQIKGVESSLTLQQVPTADKDGSNASNVNLIDLANATDPNSAVT
VGDLQNYGWVVSTPDNAFKQAVKNANQVNFVGSEGVNVEGSVSEEGVYNVTFGVKAGEFT
SNPNGTVSAQTNNGTVATVGDVANAINNSGWNTTLSDGSSAQINPGDTLNYVDGNGTTAV
VKQDPSNPNVFNVSFDVNNANPTTVDNSGKLNTPDAEEGKNFVNATTLVDAINKAGFTLK
HSATSEGKDEGGAEELINPGDVIEMIAGKNLSVKQGANGTITYATKDDVVFENTVVNSTL
TVGNNANGNPSVNFNTEEGTATNVTSNGTENLTPAALNLTDVNGEPVQLKGIESSLTLQQ
IPTADKDGSNPSNVNLINLTNANPNAAVTVADLQNYGWVVATPDNQFQQAVRNANHVNFV
AGTGVSVEGAVSSDGVYNITIATNVSDITGSVTPNNNGTVTANNSTGNVATVGDVANAIN
NSGWNTTLSDGSSAQINPGDTLNYVDGNGTTAVVKQDPSNPNVFNVSFDVNNANLTTADD
SGKLKTPDAEEGKNFVNATTLVDAVNKAAWNVASKAVDGTNGENEYSVDANSSIHAGDTV
NIDAGKNIKITGQGDTIEIHTTDDVVFNTAQVNSTLTVGNNTASNPTVNFNTEAGSDTNV
SNGGGDVFKPTALNLSDATGKPVQINGVESSLTLQQIPTADKDGTNPSSANLINLTGANP
NAVATVGDLQNFGWVVSTPDNQFTQAVRNANHVNFVAGNGVVVEGAVASEGVYNVTIAAQ
VANVTDSNTTSITNDNGTISVDVKTGDIVANNNGSVAGPRTAAQEALTAAQEALNNLPDT
ATEEEKTAAQAAVEAAQANVDNAGNVVATAQNVAEMINASGFTLKHSATSEGKDEGGEEE
LINPGDVIEMIAGKNLSVKQGANGTITYATQDDVVFNSTQVNSTLTVGNNTAANPSVNFN
TEAGTETNVSNGGAETLTPTALNLTDANGKPVQIKGVESTLTLTPVTTTDANGTNPATAN
LIDLANATEPNSAVTVADLQNYGWLVSTPDNNFTQAVRNANQVNFVGTEGASVEGSVSAD
GVYNVTVGVKYDNSTIKLNDNGELVAVLPETLVNGTRVGGDVNFVDSPTTTMQVDGSNIS
VNVNTGDVTANQNGSVSGPVAAAQSALTAAQEALNSLPDTATEAEKAAAQAAVDAAQANV
DNAGNLIATAQNVADAINASGWKVTSGKTGSGKANGTTEELINPAETVKFIAGDNMVLTQ
DGNNFTYSVSHNPVFNGTVTAKEGITIGEGDNAVNMTPTTTVTTNGTTPATPAIDMNGAQ
LTNLSHNLPTEGVTAGDISPVVNQNNAATVQDVLNAGWNLQENGNAKDFVRPYDTVNFAN
GSGTTVKIDSDGKVSTVKVNVNTENSDTINLAVNPATGNIAATAVTAPLDMNSNGTVVVP
ANQNALVSAADVAKAINGSGFDLDIDAAPNTNGKVVANDEKAARVNPGAKVAINAGRNIE
ISRSGNEITVATTENPVFDSVTANSVKLGDTGPQISAAGDTVKVAKADGSAARITNVAPG
VDPTDAVNVSQLNQVKGDLRKQDKRRKAGHASSAASASLMQAYREGQSVVTAGVGQYQGQ
SGLAVGYSRISDNGKVGVKLHLGANTQKELSAGASVGYFW
NT seq
8403 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaagtttttaaagtcgtttggaatacggcaactcaaacgtgggtggcagtttct
gaattgcaaaaagccaaaggcaaatccaaaactagatctgttaatttatcgactgttgca
gtaagtgcggcggttgcgggggctgttttaggctcaggcaatgcattagcagctgtctca
attggtagtaatgtaccagatgccgaatcaacaaatgccgttattggtaatggtgcatta
tcagcgattgctattggctccgcatctagctcaactgggcgttcaaccatcgctattggt
caattcgctaatgcgacccatattgataatttaattgacccagaagcaacacaatatcgc
accaacagtattggtgaagaaagcttaaatggaactggtgcaaatatggctctagtacca
tctattgcgattggtatggaagcttgtgcaacctcttctaacgcaattgcacttggtaca
caaactaaagcaaccggtaaccgtgctactgcatttggtgctggtgcaaaagcaaccggt
aaccgttcaaccgttgttggttggtcttctgtagccaacggcacacgttcatttgcgcta
ggttcaggtgcaaaagccaatgctgacttctctggtgcaatgggggataaatctgttgct
aatggtacttcttctttagtatttggtcataatgcaagctcaggtgcatctgctactgac
agtatcgcaatgggtcacaacgctaccgcaaacggtactgacgcaaaaaacactatcgct
gtaggtcataattcaacagcaacacgccgtggacagattgttatcggccataatgcatcc
tccctggcaacatccaatgctcaaacaattgtaattggtgaaaatgcaactgctgttggt
tctgcaactggtgctacaggtgcaaatcatattagctatcaaaacccataccacccaatg
tacaatacgagcttgccaaatagtttatctgacagatataccccttatgtatcatcaact
acaggtaatacattattacgttacgctggtactacgacatctgtattaggcacttcaatt
gtagttggtccaaatgcaaccgcaggctcaggtaatattgcaattggtagcaatgcttat
gcggagacaggtactgctgaagatggcaatagttatggcttaggcgtagcacttggtcaa
aacgcttatgcctccactggtggggtaagtgttggtggctctacagttgcacaaggagca
aactccgttgccttagcgcgtcaagctgtggcaagcggtgattctgctattgctattgct
tcttcttcagctgcagtgggtgagcaagctattgcaattggtcaatcagcaacagcagtg
ggtaaccattctattgcattaggtggctcacaatctttcggaccttatgatggcgctacg
aataccctcacctatgctaacgcatctattgctattggtaatagttcacaagtttcagca
accggtgtgaactctgttatcattggttcaaatacacacgctgactctgccaataacgtg
gtattgggttcatatgcaaatgagacctctgtaaccaatacaggcgctgctggttcacaa
aatggtaaccaaattgataacgcaacggtaaatggatatacctacgcaggctttgctggc
gaagataaattagtcggtgtggtttctgtaggtaatggtgaacaaacccgccaaatcatc
aacgttgcaccgggtaacgtatctagtacttctacagatgcaatcaacggctcacaatta
tatctaattacaactaatatgggctttaatgtgcacaacaatgctgatagctctgttgcg
cgtattaagagcgatcaccatgttcaatttaaagatggtaacggtaccactgtagatgtc
acttcaaaaaatgacggtgcaaacgttagtattgcttataacgtaaatgtagatggctca
actatcaaaattaataacgatggtaaattagaagcagttattcctgaagcttctacaatc
gaaaccacaactattactaccgatccaactaccggcgcagttactaccccaactactgat
ggtgataagcttgttaatgccaccacagttgctaatgcaattaaaaatgcaggctttacc
ttaaaacactctgttgttgatgggggtgaaaatttaggtggtgattctgagttaatcaat
gcaggtgatacggttgaaatgatcgcaggtaaaaacttatctgtgaaacaaggtgagaac
ggtacaatcacttacgcaaccaaagagaatgtgagctttagcaacgcacaagtaaacagc
acattcagcattgggaacaataccactgataacccgacagtaaactttaatacgactgcc
ggcagcccaaccaatgtgaccaacaatggaagcactcctactaaccctactgccttaaac
ttaacagatagcgaaggcaaaccagtacaaatcaagggtgtagaatcttcattaactgta
aaccaattaccaactaatgatggtaacggtactacaggctcaacaaacttactaaacctc
accaatgcagatccaaattctgctgtaactgtaggtgatttacaaaactatggttgggtg
gtttcaacgcctgataaccaattcacacaagcggtgaaaaacgcgaatgaagttaaattc
actggctctgatggcattaaagtcgcaggtgcagtagatagcacaggcgtttacaacatt
acttttgaagtgaatgcaggtgaactaaaaccaaatgctaacggcactatttcgacttta
actacaaatggcactgtagcaaccgtgggcgatgtggcaaacgcaattaacaacagcggc
tggaacaccacattaagcaatggcgatcaggctcagatcaaccctggtgacaccttaaac
tatgttgatggtaacggtacgactgcaactgtaaaacaagatccaaacaatcctaatgtg
tttaacgtcagctttgatgttaataatgccaacccaactactgttaataataatggtagc
cttgcaacgccaactggcaatgagggcgcaaactttgtcaatgcaaccacgttagttgat
gcaatcaataaagccggctttacgttgaaacactcagcggtagatggtggcgaagattta
gaaggtgatgcagaactgatcaaccctggtgatgtgattgaaatgatcgcaggtaaaaac
ttatctgtgaaacaaggtgcgaatggcacaatcacttacgcaaccaaagagaatgtgagc
tttaacaatgtgcaagtaaacagcacattaaccgtaggtaacaatacagcagataacccg
agtgttaccttcaatactgaagcaggtagccctaccaatgtcactaacaatggtggtgat
acaacaaatcctactgccttaaacttaacggatagcgaaggcaaaccggtacaaatcaag
ggggtagaatcttcattaactttacaacaagtgccaacagcggataaagatggttcgaat
gcaagcaatgtaaacttaattgatcttgctaatgcaactgatccaaattctgcagtcaca
gtaggtgatttacaaaactacggttgggtggtttcaacaccggataatgcatttaagcaa
gccgttaaaaatgcaaatcaagtgaactttgttggttctgaaggtgtaaatgttgaaggc
tctgtttctgaagaaggcgtatataacgttacatttggagttaaagctggtgagtttact
tctaatccaaacggcactgtttcagcgcaaacaaataacggcactgtagcaaccgtgggt
gatgtggcaaacgcaattaacaacagcggctggaacaccacattaagcgatggctcttca
gcacaaatcaacccaggtgacaccttaaactatgttgatggtaacggtacaactgcggta
gtaaaacaagatccaagcaatccaaacgtgtttaacgttagctttgatgttaataatgcc
aacccaacaactgtagataactcaggtaaactcaacacgcctgatgcagaagaaggtaaa
aactttgtcaatgcaaccacgttagttgatgcaatcaacaaagccggctttacgttgaaa
cactctgcaacatcagagggtaaagatgaaggcggtgcggaagagttaatcaacccaggt
gatgtgattgaaatgatcgcaggtaaaaacttatctgtgaaacaaggtgcgaacggcaca
atcacttatgcaaccaaagatgatgtagtatttgagaataccgttgtaaacagcacatta
accgtgggcaacaatgcaaatggtaatccaagcgtaaactttaataccgaagaaggaaca
gcaacgaatgtaactagcaacggtacagaaaacttaacaccagcagcattgaatttaacc
gatgttaatggtgaacctgtacagttgaaaggtattgagtcttcattaaccttacaacaa
atcccaacagcagataaagatggcagcaacccaagcaacgtcaatttaatcaacctgacg
aatgctaacccgaatgcggctgtcactgtggcagatttacaaaactatggctgggtagta
gcaacaccggataaccaattccaacaagcggtacgcaatgcaaaccacgttaatttcgtg
gcaggcacaggcgtaagcgttgaaggtgcagtaagcagcgatggcgtatataacatcacc
attgcaaccaacgtatctgatattaccggcagcgttacaccaaacaacaacggtactgtc
accgcgaataacagcacaggcaatgtagcaactgtgggtgatgtggcaaacgcaattaac
aatagcggctggaacaccacattaagcgatggctcttcagcgcaaatcaacccaggtgat
accttaaactatgttgatggtaacggtacgactgcggtggtaaaacaagatccaagcaat
ccaaacgtatttaacgtcagctttgatgttaataatgcgaacctaactactgcagatgat
tcaggcaaactgaaaacgccagatgcagaagaaggtaaaaactttgtaaatgcaaccaca
ttagtggatgctgtaaacaaagcagcttggaatgttgcctctaaagcggtagatggaaca
aatggtgaaaatgaatactctgtggatgcgaactcaagcattcatgctggggatactgta
aatattgatgcaggtaaaaatatcaagattaccggtcaaggcgatactattgaaattcat
actacagatgacgtggtatttaacacagcccaagtaaacagcactttaactgtgggtaat
aatactgcaagcaacccaacggtgaacttcaataccgaagctggctcagatactaacgtg
agcaatggcggcggtgatgtatttaaaccaactgcattgaatttatcagatgcaacaggc
aaaccagtacaaattaatggtgtagagtcttcattgaccttacaacaaattccaactgct
gataaagatggtacaaacccaagctcagcgaatctgattaaccttactggtgcaaatcca
aatgcagtagcaacagtgggtgatttacaaaactttggttgggtcgtatcaacccctgat
aaccagtttacccaagccgtacgtaatgcaaatcatgttaactttgtcgcaggtaacggc
gtagtggttgaaggtgcagttgcaagtgaaggtgtttacaatgtgaccattgcggcacaa
gtggcgaatgtcacagacagcaataccacctctattactaacgacaatggcactatcagt
gtagatgtgaaaaccggtgatatcgttgctaataacaatggttcagttgcagggcctcgt
actgcagcgcaagaagcattaactgctgcacaagaagcattaaacaacttaccggatacc
gcaacggaagaagaaaaaaccgcagcgcaggcagccgttgaggcagcacaagcaaatgtg
gacaatgcaggtaatgtggttgcaacagcacagaatgtggctgaaatgattaatgcatcg
ggctttactctgaaacactctgcaacctcagagggtaaagatgaaggcggcgaggaagag
ttaatcaacccaggtgatgtaattgaaatgattgcaggtaaaaacttatctgtaaaacaa
ggtgcgaacggcacaatcacttacgcaacccaagatgatgtggtatttaactcaactcaa
gtaaatagcactttaactgtgggcaataatactgcggcaaatccaagtgtgaacttcaac
actgaagcaggcacagaaaccaatgtgagcaatggtggggctgaaaccttaacacctact
gcattgaatttaaccgatgctaacggtaaaccagtgcaaattaaaggggtagaatctacc
ttaacattaacaccggttacaacgacagatgcaaatggtacaaacccagcaaccgcgaat
cttatcgatctcgcgaatgcaactgagccaaattcagcggtaacagttgccgacttacaa
aactacggttggttagtttctacacctgataacaacttcactcaggctgtaagaaatgca
aaccaagtgaattttgtcggcacagaaggtgcttcagtagaaggttcagtgagtgcagat
ggcgtatataacgtgactgtaggtgtgaaatatgacaacagcaccattaaattaaatgac
aacggtgagctggttgccgtattaccagaaaccttggtcaatggtactcgcgttggcggc
gatgttaactttgttgatagcccaaccaccacaatgcaagtagatggcagcaacatttct
gttaatgttaatactggtgatgtgacagcaaatcaaaatggctctgtatctggcccagtt
gctgctgcacaaagcgcattaactgctgcacaagaagcgttaaatagcttaccagatact
gcaacagaagcagaaaaagcggctgcacaagctgctgtggatgcggctcaagcaaatgtg
gataacgcaggtaacttaattgcaacagcacaaaatgtcgcagatgcaattaacgcctca
ggttggaaagtgacctctggcaaaactggttctggtaaggctaatggcacaaccgaagag
cttatcaaccctgctgaaaccgtgaaatttatcgcaggtgacaatatggtattgactcaa
gatggtaataactttacctattctgtcagccataaccctgtctttaatggcacagtaact
gcgaaagaaggtatcactattggtgaaggtgacaatgcagtaaatatgacaccaaccaca
acagttacaacaaacggcactacacctgcaacgcctgctattgatatgaacggcgcgcaa
ttaaccaatttaagccataacttaccaactgaaggcgtcaccgcaggcgatatctcgcca
gttgtgaaccaaaataacgcagcgacagtacaggatgtactcaatgcaggttggaattta
caagaaaatggcaatgcgaaagactttgttcgcccttacgacacagtaaacttcgcaaat
ggttcaggcactaccgtgaaaattgattcagacggtaaagtaagcaccgtgaaagtgaat
gtgaacactgaaaacagtgatactatcaacttagctgttaatcctgccactggcaatatt
gctgcaaccgcggttacagcaccactagatatgaacagtaacggcactgttgttgttcca
gcaaaccaaaacgcactagtgagtgcagcggatgttgcgaaagctatcaatggctcaggc
tttgacctagatatcgatgcagcaccaaacactaacggtaaagttgtagcgaacgatgaa
aaagcggctcgcgtaaaccctggtgcgaaagttgcaatcaatgcaggtcgtaacattgaa
atcagccgttcaggcaatgagatcaccgttgcaaccactgaaaatccagtgtttgatagc
gtaacagcgaacagcgtgaaattaggagatacaggtccacaaattagtgctgcaggcgac
acagttaaagtagctaaagcagatggttccgcggcacgtatcactaacgtagcacctggc
gttgatccaaccgatgctgtaaatgtatcgcaattgaatcaagtaaaaggtgatttacgt
aaacaagataaacgccgtaaagcagggcatgcttcatctgctgcatctgcaagcttgatg
caagcatatcgtgaaggacaatctgtagttactgctggtgttggtcaataccaaggtcag
agcggtcttgcagtaggctattctcgtatttctgataacggcaaagttggtgtgaaatta
cacctcggagcaaatactcagaaagaactgagcgctggtgcttctgtgggttacttctgg
taa
DBGET
integrated database retrieval system