Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-189: F543_6510
Help
Entry
F543_6510 CDS
T03018
Name
(GenBank) Cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
KO
K02198
cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
Organism
btrh
Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-189
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
btrh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
btrh02000
]
F543_6510
Transporters [BR:
btrh02000
]
Other transporters
Others
F543_6510
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CcmF_C
Cytochrom_C_asm
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHG83515
LinkDB
All DBs
Position
613771..615726
Genome browser
AA seq
651 aa
AA seq
DB search
MIAELGNYTLSLSLALSVILAVLPLWGAEKNNHTLISLVRPMTWAVFLALTVSFGSLFYL
FAVNDFTVQYVVNNSNSTLPIEYRLSAVWGSHEGSLLLWIWLLSLWSVAVASFSRQMPEE
SVARVLAVMGLVSIGFLIFIIFTSNPFDRTFPNFPVDGRELNPMLQDVGLIFHPPLLYMG
YVGFSVAFAFAIASLMTGRLDTAWARWSRPWTMAAWVFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWW
FWDPVENASLMPWIAGTALIHSLAVTEKRSTFKAWTVLLAILAFSLCLLGTFLVRSGILV
SVHAFASDPTRGLYILAYLVIVIGGSLLLYAYQGNKIKSLDNSERYSRESLLLLNNILLM
AFLSVVFLGTILPLIHKQIGLGTISIGAPFFDQMFMILMVPFAFLLGVGPLVKWRRDQFS
AIRKPVIISTLLMAVLGFALPYLFASKITVSVVLGTMMAVIIIALSLYELHQRATHRHSF
VQGLFKLSRSHWGMVLAHLGVAMTVFGIAFSQNFSIEKDVRMNVGDKTQILDYEFTFKGI
RDSNGANYIGGTADIEITRNGKYEATLEAEKRFYNVSKMGMTEAAIDWGFTRDLYAALGE
RLEDGSWGVRLYYKPFIRWIWFGGIFMALGGLLCMLDRRYRLKVATKSQLA
NT seq
1956 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgctgaattaggcaactataccctttctttgagtttagcactgtcagttatactg
gcagtgttgccactttggggagcggaaaaaaataaccatactttaatctcacttgttcga
ccaatgacatgggcagtattcttagctctgacagtctcttttggctctttattttatctt
tttgctgtaaatgattttacggtgcaatatgtggtaaacaactcaaatagcaccttgccg
attgaatatcgtctatctgctgtttgggggagccacgaaggttctcttcttttatggatt
tggctactctcgctttggagtgttgcagtagcaagctttagccgacaaatgccagaagag
tcggttgctcgtgtattagccgtaatgggcttagtgagtataggttttcttatttttatt
atttttacctctaatccattcgaccgtactttcccaaatttccctgtcgatggacgtgaa
ctcaacccaatgttgcaagatgtgggcttaattttccacccgccattgttgtatatgggt
tatgttggcttttcagtcgcctttgcttttgcgattgcttcattgatgactggccggctt
gataccgcttgggcaagatggtctcgcccttggacaatggcagcatgggtattcttaact
ctcggtatcgtacttggttcttggtgggcatactacgagcttggctggggaggctggtgg
ttctgggaccctgtagaaaacgcatcactaatgccgtggattgcaggtactgccttaatt
cactcattagcagtaaccgaaaaacgcagtacatttaaggcgtggacagtgttactcgca
atccttgctttctcactctgcctactgggtacattcttagtacgttcagggattttagtt
tctgtacatgcctttgcctctgatccaacacgaggcttgtatattttggcttacttagtg
attgtgattggtggctcacttttactttatgcttatcaaggcaacaaaattaagagtttg
gataactcagaacgctattctcgtgaaagcttactattgctgaacaacattttgctgatg
gcatttttgtcagtagtattcttaggcacaattttaccgcttattcataaacagattggg
ctgggcacaatttcgattggtgcaccatttttcgaccaaatgtttatgattttaatggtg
ccttttgcctttttgttaggcgttgggccgctggtaaaatggcgacgcgatcagttctcg
gcaattcgtaagcctgtaattatttcaactctgctaatggcagtattaggttttgctctg
ccatatttatttgccagcaaaatcaccgtaagtgttgtgcttggcacaatgatggcggtg
attatcatcgcattatcgctatacgagctacaccaacgtgcaacccaccgacacagtttt
gtgcaaggtttatttaaactctctcgtagccactggggtatggtgcttgctcacttaggt
gtcgcaatgacggtattcggcatcgcattcagccaaaacttcagtattgaaaaagatgtg
cgaatgaatgtgggtgataaaactcaaattttagattacgaatttactttcaaaggtatt
cgtgacagcaatggggcaaactatatcggcggtacagcggatattgaaatcactcgtaat
ggaaaatacgaagcaactcttgaagcggaaaaacgtttctataacgtaagtaaaatggga
atgaccgaagccgctattgactggggctttactcgtgatttatatgccgcattgggtgag
cgtttggaagatggctcttggggcgtacgcctttactataaaccgtttatccgttggatc
tggttcggtggcatatttatggcactcggtggattgctctgtatgttagatagacgttat
cgtttaaaggttgcaactaagtcacaattagcataa
DBGET
integrated database retrieval system