Borreliella turdi: QIA31_03400
Help
Entry
QIA31_03400 CDS
T09185
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
btud
Borreliella turdi
Pathway
btud03030
DNA replication
btud03430
Mismatch repair
btud03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
btud00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
QIA31_03400 (dnaE)
03430 Mismatch repair
QIA31_03400 (dnaE)
03440 Homologous recombination
QIA31_03400 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
btud03032
]
QIA31_03400 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
btud03400
]
QIA31_03400 (dnaE)
Enzymes [BR:
btud01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
QIA31_03400 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
btud03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
QIA31_03400 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
btud03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
QIA31_03400 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
GHMP_kinases_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKC78121
LinkDB
All DBs
Position
591264..594749
Genome browser
AA seq
1161 aa
AA seq
DB search
MLKIKFYFDRIILGMSFRAKFIHLHVHSDYSLLDGAAKISDIISKAKKCNMSHIALTDHG
NLFGAIKFYKEAKKAGIKPIIGIEAYMAKTSKFLKKHDDLGKMSYHLILLAKNELGYKNL
LKLTSISYLEGFYYRPRIDKEDLEKYSEGLICTSACIGGLIPRLILANRFEDAKNEILWF
KKVFGNDFYLELQRHGIKAQDIVNERLVEYSRELGVPLTVANDSHYVNREDAVAQDIIVC
IGTGSKKSDENRLKMETNEFYIKSQEEMCELFNDLPEALENTVRIAEKCDDFKITFPGPI
LPDYQIPIEFNTLGEYLEYLTLEGLKFRYKTLTSKIKDRAFYELSVIIRMGFEGYFLIVW
DFIKFAHDNDIPVGAGRGSGAGSIVAYALRITDIDPLKYNLLFERFLNPERISMPDFDID
FCFEGRDEIIKYVTNKYGEDKVAQIITFGTLKPKAVVKDVARVLDIPFAESNELTKFIPD
GPKVSLKEVLDDNSLKEYFTSKPVYKELMDAALVLEGMNRHASTHAAGIVISKTPLTDYV
PLYKDYKQGSVSTQYTMDLLEECGLVKMDFLGLKTLTLIKNAENLIRSVNPDFKIKNIPD
NDVNTFKMLGEGKSASVFQFESEGMQQILKDAKPDNIEDLIALNALYRPGPMQFIPQFIA
AKKGTKRIKYPHPDLKEVLKPTYGVIVYQEQVMEVAKIIGGFSLGKADILRRAMGKKKED
EMDEMKVDFLRGAVEKGYDKEIASEIFELLKPFSGYGFNKSHAAAYSLIAYQTAYLKANY
PEYFMAANLTNEINNNDKLSYYIEESKAIGINVLKPDINQSFREFRVTDSGISYGLNGIK
NLGGIVVDLIIDEREKNGKYSSFEDFIRRVDNKVINKKFLESAIKSGLFDSLDQNRKTLF
ENLDRLVDVVLEDKNNKKLGQNSLFDVLESQDPIQQNFNYQVFKEYSYSELLGFEKELLG
FYVSGHPLDPYKKAINSFSSLNVLKDLAAKKDSIVQFSGILNSVKVIQTKRNNAKMAFGV
IEDFKGAIDIVVFTESYEKYKNFLLEGNVIGVIGRLTFNRDKFSIVVEKVVSIEKFSEDK
VNNIHIKFLNNKLNDLQLLNSLKESISNFEDNSGFSNVYFYLRENGKDLKLKMNSILNFE
PDEDKLDKLRKCMIVEDVWVD
NT seq
3486 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttaaaaatcaagttttattttgatagaataattttaggtatgagttttagggctaag
tttattcatctccatgttcattcagattattctcttttagatggagctgcaaaaatatca
gatattatatcaaaagcaaaaaaatgcaatatgtctcatattgcattaacagatcatggg
aatctttttggagctattaaattttataaagaagctaaaaaagcaggaattaagccaata
attggcattgaagcttatatggcaaaaacttctaagtttttaaaaaaacacgacgatctt
ggaaaaatgtcttatcatttaattttgcttgccaagaatgagctgggttataaaaaccta
ttaaagttaacaagtatttcttatcttgaagggttttattatcgcccaagaatagataaa
gaggatcttgaaaaatattcagaaggattgatttgtacttcagcttgcattggaggactc
attccaaggcttattttggctaatagatttgaagatgccaaaaatgaaattctttggttt
aaaaaagtttttggtaatgatttttatcttgaacttcaaaggcatggcattaaagctcaa
gacattgtgaatgaaaggttggttgagtattctagggaacttggagttcctttaacagta
gctaatgattctcattatgttaatagagaagatgcagttgctcaagacatcattgtttgc
attggcactggctctaagaaaagcgatgagaatagattgaaaatggagaccaatgaattt
tatattaaatctcaagaggaaatgtgtgaactttttaatgatttgcctgaagctttagaa
aatactgtaaggattgcagaaaagtgtgatgattttaaaataacttttccagggcctatt
ttgcctgattatcaaattcctattgaatttaatactcttggtgaatatttagaatatctc
acccttgaaggtttaaagtttagatataaaactttgacaagcaaaataaaagatagagct
ttttatgaattgagcgtgataattagaatggggtttgaaggctattttttgattgtttgg
gattttattaaatttgctcatgataacgatattcctgttggagctgggcgtggttctggt
gctggttcaattgtagcttatgctcttagaattactgatattgatcctttaaagtataat
ttgctttttgagagatttttaaatcctgagcgtatttctatgcccgattttgatattgat
ttttgttttgaaggcagagatgagattataaaatatgttaccaataaatatggagaagat
aaggtagctcaaataattacttttggaaccttgaagcctaaagctgtagttaaagacgta
gctagagttttagatattccatttgccgaatcgaatgaacttaccaagtttattcctgat
gggcctaaagtttctttaaaagaggttttagatgacaattctttaaaagaatattttact
agcaagcctgtttataaagaattaatggatgctgcattggttcttgaaggaatgaatagg
catgcttcaactcatgctgcaggaattgtaatttctaaaacccctttaaccgattatgtg
cctctttataaggattataagcaaggttctgtttctactcaatatacaatggatttgctt
gaagaatgtggacttgttaaaatggattttcttggtttgaaaacattaactttaataaaa
aatgcagaaaatcttattagaagtgtaaatcccgattttaaaataaaaaatattccagat
aatgatgttaatacttttaagatgctaggagaggggaaaagtgcttctgtttttcaattt
gaatctgagggaatgcagcaaattctaaaagacgcaaagcctgataatattgaagattta
atagccttaaatgctctttataggccgggtcctatgcaatttattccccaatttattgct
gctaaaaaaggtactaaaagaattaagtatcctcatccagatttaaaggaggttttaaaa
ccaacttatggagttattgtttatcaagaacaagtaatggaagttgcaaaaataattgga
gggttttctcttggcaaggccgatattttaagacgtgctatgggcaaaaagaaagaagac
gagatggatgagatgaaggtcgactttttaagaggtgctgttgagaaagggtatgacaaa
gaaattgctagtgaaatttttgaacttttaaagcctttttcagggtatggatttaataaa
tcgcatgcagcagcgtattctttaatagcgtatcaaaccgcgtatcttaaggctaattat
cctgagtattttatggctgccaacttaacaaatgaaatcaataataatgataaactttct
tattacattgaggaatcaaaagctataggtataaacgttctcaagcccgatataaatcaa
tcatttagagaatttcgtgtaactgactctggaatttcttatggacttaatgggattaaa
aatcttggaggaattgttgttgatttaataattgacgaaagagaaaaaaacggcaaatat
agttcttttgaggattttatcagacgtgtagataataaagtaattaataagaaattttta
gaatctgcaataaaatctggactttttgatagtttggatcaaaatagaaaaactttgttt
gaaaatcttgatcgcttggttgatgttgttttagaagataaaaataataaaaagcttggt
cagaatagtttatttgatgttcttgaaagtcaagatccaattcagcaaaattttaattat
caggttttcaaagaatattcttattctgagcttttaggatttgaaaaagaacttttagga
ttttatgtgtcgggtcatcctcttgatccttataaaaaggcaattaatagtttttctagt
ttaaatgttttaaaagatcttgctgcaaaaaaagatagcattgtccaattttctggtatt
ttaaattcagtaaaagttattcaaaccaaaagaaataatgcaaaaatggcttttggagtt
attgaagattttaaaggtgcaatagatattgtagtttttacagaaagttatgagaaatat
aagaattttttacttgaaggtaatgttattggggttataggtaggcttacgtttaacaga
gataaattttcgattgtagttgaaaaagttgtaagtattgagaaattctctgaagataaa
gtaaataatattcatattaaatttttaaataataaattaaatgacttgcaattacttaat
tctttaaaagagagtataagtaattttgaggataattctggattttcaaatgtttacttt
tatttaagggagaatggtaaggatttaaaattaaaaatgaattcaattttaaattttgag
ccagatgaagataagcttgataagttgagaaagtgtatgatagttgaagatgtttgggtt
gactag
DBGET
integrated database retrieval system
