Buchnera aphidicola Ua (Uroleucon ambrosiae): BUAMB_248
Help
Entry
BUAMB_248 CDS
T01830
Symbol
rnb
Name
(GenBank) exoribonuclease II
KO
K01147
exoribonuclease II [EC:
3.1.13.1
]
Organism
buh
Buchnera aphidicola Ua (Uroleucon ambrosiae)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
buh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
buh03016
]
BUAMB_248 (rnb)
Enzymes [BR:
buh01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.13 Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.13.1 exoribonuclease II
BUAMB_248 (rnb)
Transfer RNA biogenesis [BR:
buh03016
]
Prokaryotic type
3'processing and CCA adding factors
3'processing factors
BUAMB_248 (rnb)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNB
OB_RNB
CSD2
S1
S1CSD-TOTE-2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEO08065
UniProt:
G2LPC8
LinkDB
All DBs
Position
278285..280222
Genome browser
AA seq
645 aa
AA seq
DB search
MFQNNPLLTKLKKNLHAQIPRVEGIVKSNERGFGFLEVDTQKSYFIPPKNMKKVMHGDKI
IALLKIEKDREIVEPEKLIEAFLNRFVGKIEKKDNQLFIIPDYPFLKDRIICQPDQNCIN
IFQDGDWAIAQLIQHKLKGDHIFYAKLNEKITHKDDPFIPWWVTLARHKIDKTEPLAEEH
DLILKEHYPRKNLTDLDFITIDNINTKDIDDAIFVNEDSHGNICLTIAIADPTAYIKNDS
KLDHIALERSFTNYLPGFNIPMLPRNLSENLCSLRPNKCRPVLACNITILKDGSLSNNIN
FFLAWIKSKAKLSYDHVADWINKSGSWIPPTKSIQKQILILHRLCLLRIKWRQKNAILFK
DSLEYRFHLSENGNVIDILVEKRLISHKIIEECMILANISAANFLSKHLGFGIYSIHSGF
DIINAEHVVSFLRNYNLNFNAKEITTLKGFCNLKRVLNILSNNYIDNRVRRFQSFGDLSI
LPGPHFSLGFLEYATWTSPIRKYSDMINHRLLKSIIHNEKVTKPSEEIKFKINENKRRNR
IAERDISDWLYVIFFKKQQYQNKKFDAEITDISRNGIRARLIKNGAYVFIPGIFIHSIRK
ELHFNKEIGKVFINNIMRYKISDIIQITLLDIRLESRSIIAKIEC
NT seq
1938 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttcaaaataatccattactcacaaaattaaaaaaaaatctacatgctcaaatacca
agagtggaaggcatagtaaaaagtaatgaacgaggatttggatttttagaagtagataca
caaaaaagttattttataccgcctaaaaatatgaaaaaagtaatgcatggtgataaaata
attgcattactaaaaatagaaaaagatagagaaatagttgaacctgaaaaattgattgaa
gcatttttaaatagatttgttggaaaaatagaaaaaaaagataatcaattatttattata
ccagattatccatttttaaaagatcgtataatatgtcaacctgatcagaactgcataaat
atttttcaagatggagattgggcgatagcacaattaatacaacataaactaaaaggcgat
catattttttacgctaaattaaatgaaaaaattacacataaagatgatccatttatacca
tggtgggttactttagcaagacataaaattgataaaacagaacctttagcagaagaacat
gatcttatattaaaagaacattatcccagaaaaaatttaacagatttagattttattact
atagataatattaatacaaaagatatagatgatgcaatttttgttaatgaagattctcat
ggtaatatttgtttaactatagctattgcagatcctacagcatatattaagaatgatagt
aaattagatcatatagcattagaaagaagttttacaaattatctacctggatttaacatt
cctatgttacctcgaaatttatcagaaaatctatgttcattacgtcctaataaatgtcgc
cctgttttagcatgtaatattactattttaaaagatggtagtctgtctaataatataaac
ttttttttagcatggattaaatcaaaagcaaaattatcttatgatcatgttgcagattgg
attaataaatccggatcatggattcctccaactaaatctattcaaaaacagatattaatt
ttacatcgtttatgtctattacgtataaaatggcgtcaaaaaaatgcaattttatttaaa
gatagcttagaatatcgctttcatttatctgaaaatggtaatgtaatagatattttagtt
gaaaaaagactgatttctcataaaattattgaagaatgcatgatacttgctaatatatct
gcagctaattttttatctaaacatcttggctttggtatatatagcatacatagtggtttt
gatattatcaatgctgaacatgttgtttcttttttaagaaattataatttaaattttaat
gcaaaagaaataactaccttaaaaggtttttgcaatcttaaaagagttttaaatatatta
tcgaataattatattgataatcgtgttcggcgctttcaatcttttggagatttaagtatt
cttcccggccctcatttttcgctaggttttttagaatatgcaacttggacatctcctatt
cgaaaatatagtgatatgattaatcatcgcttattaaaatctattattcataatgaaaaa
gtaactaaaccaagtgaagaaattaaatttaaaataaatgaaaataaacgtcgtaatcgt
atagctgaaagagatatttcagattggttatatgtaatattttttaagaaacaacaatat
caaaataaaaaatttgatgctgaaataactgatatttctagaaatgggataagagctcga
ttaataaagaatggtgcttatgtttttattcctggaatatttattcattctattagaaaa
gaattacattttaataaagaaataggaaaagtatttattaataatattatgcgttataaa
atatctgatatcattcaaattacattattagatattcgtttggaaagtagaagtattatt
gctaaaattgaatgttaa
DBGET
integrated database retrieval system