Buchnera aphidicola TLW03 (Acyrthosiphon pisum): CWQ_01290
Help
Entry
CWQ_01290 CDS
T01829
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha chain
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
bup
Buchnera aphidicola TLW03 (Acyrthosiphon pisum)
Pathway
bup03030
DNA replication
bup03430
Mismatch repair
bup03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bup00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
CWQ_01290
03430 Mismatch repair
CWQ_01290
03440 Homologous recombination
CWQ_01290
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
bup03032
]
CWQ_01290
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bup03400
]
CWQ_01290
Enzymes [BR:
bup01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
CWQ_01290
DNA replication proteins [BR:
bup03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
CWQ_01290
DNA repair and recombination proteins [BR:
bup03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
CWQ_01290
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
DNA_pol_IIIA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADP66635
LinkDB
All DBs
Position
263988..267473
Genome browser
AA seq
1161 aa
AA seq
DB search
MNEPKFIHLHVHSDYSMIDGLSKPEDLVKKAASLNMPAIAITDYNNLYGVIKFYNMAHKL
GLKPIIGITVNFFSDLINNQLTKLTLLASTQEGYKNLILLISRAYQKGYVHNNHVTIEKK
WFSEINKGLILLSGGPQGELGKVLLNGQSSLISICLSFYQKYFPDSYYLELFRTNRDNEE
TYLHLAVDLSLSTGVPIVATNDVCFLSQEDFKIHKIRIAINEGEILQHSKIQNNYSNQQF
LKTTKEMSDLFSDIPEALINSVEIAKRCNVFIHSGKYFLPQFRTGKISVEKYLIKEAYKG
IKKRLNSRYLDIEKYKDIYSQYINRLDMELTVINKMGFPGYFLIVMEFIQWAKDNNIPVG
PGRGSGAGSLVAYALNITEVDPLSFNLLFERFLNPERISMPDFDIDFCMEKRDQVIDHVS
EIYGKNAVAQIITFGTLTAKAVIRDVGRVLGYPYGFINKLSKLVPLDPGITLKEAFSKES
ELFNLYKNNEDVKNLIDIAKKLEGTNRNIGKHAGGVVISPTKITDFCPLYCDEKGNNPVT
QFDKNDIEYVGLVKFDFLGLRTLTIISYAVEMINTKLNLNKKRTININSIPLDDAKCFNL
LKNSETTGVFQLESYGMKDLIKRLQPDCFEDMIALVALFRPGPLQSGMVDNFINRKHGRE
NISYPDHKWQHILLKPILESTYGIILYQEQVMEIAQVLSGYTLGSADILRRAMSKKNLKD
MSEQRAIFEEGALNNGIDKKLSIKIFDLLEKFAGYGFNKSHSVAYALVSYQTLWLKSHYP
AEFIAAAMTSDIDNTEKIVILINESLNMGVKIIPPNINLSKYEFYVNDQGDIVYGLGAIK
GIGKNSVQVLIKEREENKFFHDLFDLCMRIDSQKITRRVLEKLIMSGSCDCFDKNRNYLL
QSIDDAINASKESFRIKSFKQDSLFGIFQNELNQVKKNNLVNLVCPEKNKLQNEYQVLGF
YLTGHPINQYKKELECYVNGVKLSQLKFIKRNKKILVAGIIVSIKIKITKNKNRIAILVL
DDNTSRLEVVIFTELLNAYESLVKLNKLLFVHGMLNVSFIDKNIKMTAYALIDLSVLRKK
YINKLIIILNKEKTNIFFLNNLYECLDKQSKGNIPVFIFFDNKEVCLNKKLNKKWFVVIT
DDFLNKLKFLVGSKNIELKFN
NT seq
3486 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgaaccaaaatttattcatcttcatgtacatagtgattactcaatgattgatgga
ttatcaaaacctgaagatttagttaaaaaagcagcatctttaaatatgccggctatagct
ataactgattacaataatttatatggtgtaattaaattttataatatggctcataaacta
ggtttaaaacctattattggtattacagtaaattttttttctgatttgataaataatcaa
ttaacaaaattaactttattagcctccactcaggaaggatataaaaatttaattttatta
atttctcgtgcatatcaaaagggatatgttcataataatcatgttactattgaaaaaaaa
tggttttcagaaattaacaaaggattaatattactttctggtggccctcagggtgaactt
ggaaaagttttgcttaatggtcaatcatcattgatatctatttgtttgtcattttatcaa
aagtattttccggattcttactatttagaattatttcgcacaaaccgagataatgaagag
acatatttacatttagctgtagatttatctttatctacaggagttcctattgttgctact
aatgatgtttgttttttaagtcaagaagattttaaaattcataaaattagaattgctatc
aatgaaggtgaaatattacaacattctaaaattcaaaataattatagcaaccagcaattt
ttaaaaactacgaaagaaatgtctgatcttttttcagatattccagaagcacttataaat
agtgtagaaattgcaaaacgctgcaatgtatttatacattccggaaaatattttttacct
cagtttcgaactggaaaaataagtgttgaaaaatatttaattaaagaagcttataaaggt
ataaaaaaaagattaaactcaagatatctagatattgaaaaatataaagatatttacagt
cagtatatcaaccgtttagatatggaattaactgtaattaacaaaatgggttttcctgga
tattttttaattgttatggaatttatacaatgggcaaaagataataatataccagtagga
ccaggacgaggttctggtgcaggttctcttgtagcatatgctttaaatatcacagaagta
gatccattatcttttaatcttttatttgaaaggtttttaaatccagaacgtatttctatg
cctgattttgatattgatttttgtatggaaaaacgtgatcaagtaattgatcatgtttca
gagatatatggtaaaaatgcagtagcacaaattattacctttggaacattaactgcaaaa
gctgttattagagatgtaggtcgagttttaggatatccatatggatttattaataaacta
tctaagttagtacctttagatcccgggataactttaaaagaagctttttccaaggaatct
gaattattcaatttatataaaaataatgaagatgttaaaaatttaattgatattgctaaa
aaattagagggtacaaatagaaatattggcaaacacgcagggggagtggttatttcacct
actaaaattactgatttttgtccattatactgtgatgaaaagggaaataatccagtaact
caatttgataaaaatgatatagaatatgtaggattagtaaaatttgattttcttggttta
cgcacactaactattattagctatgcggtagaaatgattaatacaaaattaaatctgaat
aaaaaaagaacaataaatattaattcaattcctcttgatgacgctaaatgttttaactta
ttaaaaaattctgaaactactggtgtgtttcaattagaatcttatgggatgaaagattta
attaaaagattacaacctgattgttttgaagacatgatcgctttggttgcactttttaga
ccaggtcctctacaatctggaatggtcgataattttattaatcgaaaacatggacgtgag
aacatttcatatcccgatcataaatggcaacatatattattaaaacctatattagaatca
acatatggaattatattataccaagaacaagtaatggaaatagctcaagttttgtcaggt
tatacattaggtagtgcagacattttaagacgagctatgagcaagaaaaatttaaaagat
atgtcagaacaacgtgctatatttgaagaaggagccttaaataatggtatcgataaaaaa
ttatctataaaaatttttgatttactagaaaaatttgcaggatatggatttaataaatct
cattctgtagcttatgctctagtttcctatcaaactttatggttgaaatcacattatcct
gcggaatttatagctgcagctatgacatctgatatagataatacagaaaaaattgttatt
ttaattaatgaatctctaaatatgggggtaaaaattatccctccaaacattaatttaagt
aaatatgaattttatgtaaatgatcaaggtgatatagtttatggtcttggtgctatcaag
ggtataggcaaaaattcagtgcaagttcttattaaagaacgtgaagaaaataaatttttt
catgacttatttgatctttgtatgcgaattgattctcaaaagataacccgtagagtttta
gaaaaattaattatgtctggtagttgtgattgttttgataaaaatagaaattatttactt
caatcaattgatgatgctataaatgcgtcaaaagaatcttttagaataaagtcttttaaa
caagatagtctttttggtatttttcaaaatgagttaaatcaagtaaaaaaaaataatctt
gttaatttagtctgccctgaaaaaaataaattacaaaacgaatatcaagtattgggattt
tatcttacaggacatcctatcaatcaatataagaaagaattagaatgttatgtaaatggt
gtaaaattatcacagttaaaattcatcaaaagaaacaagaaaattttagtagcaggaata
attgtttctatcaaaataaaaataacaaaaaataagaatcgtatagctattttggtattg
gacgataatactagccgtttagaagttgtgatttttacagaattattaaatgcatatgag
tctcttgtaaaattaaacaaactattgtttgttcacggtatgttaaatgtcagtttcatt
gataaaaatattaaaatgacggcctatgcacttatagatttaagtgttttgagaaaaaaa
tacataaataaactaataattatattaaataaagagaaaacaaacatattttttttaaat
aatttatacgaatgtttagataaacaatctaaaggtaatattcctgtttttatttttttc
gataataaagaagtatgtttaaataaaaaattaaataaaaaatggtttgttgtaattact
gatgattttttaaataaattaaaatttttagtaggatctaaaaacatagaattaaaattt
aattaa
DBGET
integrated database retrieval system