Candidatus Bostrichicola ureolyticus: NHG04_01840
Help
Entry
NHG04_01840 CDS
T09984
Symbol
clpB
Name
(GenBank) ATP-dependent chaperone ClpB
Organism
bus
Candidatus Bostrichicola ureolyticus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_2
AAA_lid_9
AAA
ClpB_D2-small
AAA_5
Clp_N
AAA_16
AAA_22
Sigma54_activat
AAA_14
nSTAND3
AAA_7
Zeta_toxin
AAA_18
RuvB_N
bpMoxR
Mg_chelatase
ATPase_2
NACHT
IstB_IS21
T2SSE
TniB
AAA_3
TsaE
RNA_helicase
AAA_24
DNA_pol3_delta2
AAA_28
NBD_SMAX1
AAA_19
ResIII
Torsin
CLP1_P
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGH27379
LinkDB
All DBs
Position
331667..334228
Genome browser
AA seq
853 aa
AA seq
DB search
MNFNKFTIKTQEVIQQAQLIAQENRQQFIENAHILKSILKIDDNIAPFILKNINLKLIED
NLNKIINTYPKITSQTQQHLSTNVVNMLNQANRLAENLHDEYISIEHILWGLLKVGDQIS
KLLIDIGVTEKNIINIIEEMRKKNGNINSPTNENIYNALNKYSKNFNKLAREGKLDPVIG
RDEEIRRVLQILSRRTKNNPILIGEPGVGKTAIVEGIAHRIVSGDVPDNLKYKEVFALDI
SGLIAGAKYKGEFEERIKSVIKEVIQSNGMVILFIDEIHTLVGAGASEGAMDAANILKPA
LARGELRAVGATTLNEYQKYFEKDKALERRFQKVYVSEPDTESAISILRGIKEKYETHHK
VRIKDEAIIASVELSQRYISDRFLPDKAIDLIDEAAAKLRMEINSKPEEIDVLDRKIMQL
EIQREAIKREDDKKQLASIKELILKLNEQRNQLTDQWKCEKELVEGIQKSKEIIENFKFE
AEQAERVGNYGKVAELRYGRIKDEESKVKALEKELIKYKGNKMIREEVCSEDIAEVVSKW
TGIPITKMLQSESKKLLLLEEVLHKRVIGQELPIEAVANAIRRSRAGLKDEKRPIGSFLF
MGPTGVGKTELAKALAEYLFDDENNMVRIDMSEYQEPHSVSRLIGAPPGYIGYEEGGQLT
EYVRRRPYTVILLDEIEKAHSDTFNILLQVLDDGRLTDNKGRTVNFKNTIIIMTSNIGSD
IIRDNFKDIKNIKNQLITLLKTILRPEFLNRIDDIILFKPLTIKEIHKIVKLQLTDLVNI
LSKRNIRLKVTDEVIEYLSEKGYDPYFGARPIKRVIQHYVLNKLSKEMLKGNISDNSKVL
LDYNKEKGFIINK
NT seq
2562 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttaataaattcactataaaaactcaagaagttatacaacaagctcagttaatt
gcacaagaaaataggcaacaatttatagaaaatgcgcatatcttaaaaagtatattaaaa
attgatgataatattgctccttttatattaaaaaatattaatttaaaactaattgaagat
aatttaaataaaataattaatacttatcctaaaataacatcacaaacacaacaacatcta
agtaccaatgtagttaatatgttaaatcaagctaataggctagctgaaaatttacatgat
gaatatatatctatagaacatatattatggggtctcctaaaagtaggagatcaaatatct
aaattattaattgatataggagttacagaaaaaaatataataaatattattgaagaaatg
cgaaaaaaaaatggtaatataaattcaccaacaaatgaaaatatatataacgctttaaat
aaatactctaaaaattttaataaattagcacgtgaaggaaaattagatcctgttattgga
agagatgaagaaatacgaagggtattacaaattctatctagaagaacaaaaaataatcct
atacttataggtgaacctggagttggtaaaacagctattgttgaaggtattgctcatcgt
attgttagtggtgatgttccagataatttaaaatacaaagaagtttttgctttagatata
tctggattaattgctggagcaaaatataaaggagaatttgaagaacgaattaaatcggtt
attaaagaagttattcaatctaatggtatggttattttatttattgatgaaattcataca
ttagtaggtgcaggagccagtgaaggagctatggacgctgctaatattttaaaacctgct
ttggccagaggcgaattacgagctgttggagctactactctaaatgaatatcaaaaatat
tttgaaaaagataaggcacttgaaagaagatttcaaaaagtatatgttagtgaaccagac
acagaatcggctatttctattcttagaggaattaaggaaaaatatgaaacacatcataaa
gttcgtattaaagatgaagctattattgcgtcagtagaactttcacaacgatacattagt
gatagatttttgcctgataaagcaatagatcttattgacgaagcagctgctaaattacgt
atggaaattaattcaaaacctgaagaaattgatgtattagacagaaagataatgcaatta
gaaatacagagagaagctataaaaagagaagatgataaaaaacaattagcttcaattaaa
gaattgattttaaaattaaacgaacaacgtaatcaattgacggatcaatggaaatgtgaa
aaagaattagtagaaggtatacaaaaatctaaagaaattatagaaaattttaaatttgaa
gctgaacaagctgaacgtgttggaaattatggaaaagtagctgaacttagatatggaaga
atcaaagacgaagaatctaaagtaaaagcacttgaaaaagaattgataaaatataagggt
aataaaatgattagagaagaagtttgtagtgaagatatagctgaagtagtttctaaatgg
actggtattccaataactaaaatgttacaaagtgaaagtaaaaaattacttcttctagaa
gaagtccttcataaacgtgttattggtcaagaattacctattgaagctgtagctaatgct
atacgtcgttctagagcaggtcttaaagatgaaaaacgtcccataggatcttttcttttt
atgggtcctactggagtaggaaaaacagagttagctaaagctttagctgaatatttattc
gatgatgaaaataatatggttcgtattgatatgagtgaatatcaagaacctcattcggtt
agtcgactaattggtgcacctccaggatatattggttatgaagaaggtgggcaattaaca
gaatatgtccgtcgtcgtccttatactgttattctacttgatgaaatagaaaaagctcat
tcagatacttttaatattttattacaagtattagatgatggtaggctaactgacaataaa
ggtcgtacagtaaattttaaaaatactataattatcatgacttctaatattgggtcagat
attatacgtgataattttaaagatattaaaaatattaaaaatcaattaataacattgttg
aaaacaatattacggccagaatttttaaatcgtattgatgatattattttatttaaaccg
ttaactataaaagaaatacataaaattgtcaaattacagttgactgacttagtcaatatt
ttatctaaaagaaacattaggttaaaagtaactgatgaagtaattgaatatttgtctgaa
aaaggttatgatccttattttggagcacgtcctataaaacgtgtaattcaacattatgta
ttaaataagctttcaaaagaaatgttaaaaggcaatatatcagataatagtaaagtttta
ttagactataataaagaaaaaggttttataataaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system