Candidatus Blochmanniella vafra: BVAF_090
Help
Entry
BVAF_090 CDS
T01398
Symbol
ytfN
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
bva
Candidatus Blochmanniella vafra
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bva00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bva02000
]
BVAF_090 (ytfN)
Transporters [BR:
bva02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
BVAF_090 (ytfN)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADV33499
UniProt:
E8Q6Q8
LinkDB
All DBs
Position
100761..104711
Genome browser
AA seq
1316 aa
AA seq
DB search
MRRMFLILLFGIVVLCGVFVFLFGTTIGTNLIFTSITNRISGLTFDSVSGFWGNFNIMRM
VYHTPELGVIKVDKCNISVNFKYFLVKKIYINNLLLTDVYIDGRESNLEHVSAENIATNK
IFRKILKNYSIILKNIVCNNICIMLDEMEFKFQNINTGCILKNNLLRVLPSYISEGFVLY
NFFLDDSSNKQTNITLYSAHWIKDLFCIKDVLRNLIDDVLIVIRKKYKFSINFVFTDIQG
KDFNFFYNCKNRYVINRFQIQFSCIKEVINSKFHINSSLGYCNGVANIVLGNRYPVYIVV
DYYHYAYLKNLNDDQLEQKDLGKIKLMITGSLIDELCVDCDILNIISSTVHILMKIKLKN
PTTPIRLLVIGRKIPMFSLGSNKLIFENFNFFLIGNTRNYSIQMHSNLVCSKIAVRYVSM
RAQGNSNSCTISELKIKMLNGYCKMIGTIKWGGDRISWNNIYSFNDVNVNQYLKYSTKEL
SKKIITQDFVNFNVQRLAVLSYPYLQVCRDGSISNDNIIIHNKSVLTERINNRCNISTFI
LESPLGSDKKGGDNILDLQVRGTHQSRIFGVALEVDMINCSIFSSGLSGNLSIYFGLHGT
INSPFILLHIHAQSLNWRSKNISIEKIQINSNINYDALMQSNFFIKLDKVQCRKFALNEL
LVQGMGDIVRHSLRIILYDKELVGIVNLNGEFDLVNPSWNGRLINTIFFTPIGTWKLIND
MIFSYQYTSHKFVFKAHCWESNFCQVSITDRLQRSFLKKISVIINNFNFIFLDLKLIKNV
NIYNMRLYFKDVYWNFGEVLPQGSIVYSITRLDMLFCDKENIDFYHIKVNDLICHTTFTA
TSFSCVSSAEIENDKSYLKFSITDLYNTPKISGNIRLDDMKVGSFFYLLFQSKEYINGLI
NMNLNFKGYLNSPKFYGMIQFKNCDFNQSNFPFVVQDVFLQINFFGNYAILNGVIQTEHG
GQLYLDGKLNSLNSFKNIHLVLNIKGEQINVRISSPSLYAKISTNLICKITTKGIDLTGR
IDVPWAKIEFQEFSRNAIEISSEEILLDSSCLRPTLVNKSKNFGIFTISSIFIHLGHDVH
FNGLGLYTKLQGDLEISYTNNSNDLLVLGHVKMLSGYFKAYGINLIIKQGQVLFSGAVNQ
AYLDIEAVKSASFILNSKDPVTVGIHITGVVDQLKLEFLSNSVLLSQQEIASYLLGEYNT
TLSKLNTIGNNTITSLLIGMGIERYEKFIGKIGRVLGVQDLTINTQDFIGGGYTKSSVVA
LSGYIAPGLQIKYGISIVDLLTTVTVRYCINHQLYLEATSRGHDQALDLLYKFNFG
NT seq
3951 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgaagaatgtttttaattttattattcggaattgttgtcttatgtggagtttttgta
tttttatttgggacaactataggaactaatttaatatttacaagtattacaaatcgaatt
tctggattaacttttgattctgtttcaggattttggggtaattttaatattatgcgtatg
gtgtatcatacgcctgaactaggtgtaataaaagttgataaatgtaatatatcggtaaat
tttaagtattttttagtaaaaaaaatatatataaataatttgttgttaacagatgtttat
atagatggaagagaaagtaacttagaacatgttagtgcagaaaatattgcaacaaataaa
atttttagaaaaattttaaagaattattcgattattttaaagaacatagtatgcaataat
atttgtataatgttagatgagatggaatttaaatttcaaaacattaatactggttgtatt
ttaaaaaataatttattgcgagtgttgccttcttatatctcagagggatttgttttgtat
aatttttttttagatgattcttcaaataaacaaactaatataactttgtattcagcacat
tggataaaagatttattttgtattaaagatgtattacgtaatttaattgatgatgtattg
atagtgattcgtaaaaaatataaattttctataaattttgtgttcacggatattcaagga
aaagattttaattttttttataattgtaaaaatagatatgtaatcaatcgttttcaaata
caattttcttgcattaaggaagtaataaattcaaaatttcatattaattcatctttggga
tattgtaatggtgtagctaatattgtgttaggaaatcgatatccagtatatatagtagtt
gattattatcattatgcttatcttaaaaatttgaatgatgatcaattagaacaaaaggat
ctaggaaaaattaaattaatgataacaggatcattaattgatgaattatgtgtagattgc
gatatcttaaatattatttcttctacagtacatatattaatgaaaattaagctgaagaat
cctactacaccaattagattattggtgattggaagaaaaattccaatgttttcattagga
agtaataaattgatttttgaaaattttaatttttttttaataggaaatacacgtaattat
tctattcaaatgcattctaatctagtttgttcaaagattgcagtaaggtacgtatctatg
cgtgcccaaggaaattctaatagttgtactatttctgaattaaaaataaagatgttaaat
ggatattgtaaaatgataggaacaattaaatggggaggagataggattagttggaacaat
atatattcatttaatgacgttaatgtgaatcaatatttaaaatattcaacaaaagaattg
tccaaaaaaattattactcaagactttgttaattttaatgttcaaagattagcagtatta
tcgtatccttatcttcaggtatgtagggatggaagcattagcaatgataatattatcata
cataataaatcggtattgacggaaagaataaataatcggtgtaatatttctacatttata
ttagaatccccccttggttcagataaaaagggaggtgataatattttagatttacaagta
agaggaacgcatcagagtcgtatttttggtgttgctctagaggttgatatgataaattgt
tctattttttcttctgggttaagtggaaatttaagtatatattttgggcttcatggaaca
attaattccccttttattttattacatattcatgctcaatctttaaattggagaagtaag
aatattagtattgaaaaaattcaaattaatagcaatattaattacgatgcattaatgcaa
agtaatttttttataaagttagataaagtgcaatgtagaaagtttgcattaaatgaatta
cttgttcaagggatgggtgatattgttagacattctttacgtattatattatatgataaa
gaattggttgggatagtaaatttaaatggagaatttgatttagttaatccaagttggaat
ggcaggcttattaatactatttttttcactcctatagggacgtggaaattgataaacgat
atgatttttagttatcaatacacatcccataaatttgtttttaaagctcattgttgggaa
agtaatttttgtcaggtttccattactgatagacttcaaagaagttttttaaaaaaaata
tctgtaataattaataattttaattttatatttttagatttaaaattaataaaaaatgta
aatatatataatatgcgtttatatttcaaggatgtatattggaattttggtgaagtttta
cctcaaggttctatagtttattctataactcggttagatatgttattttgtgataaggaa
aatattgatttttatcatattaaggttaatgatttaatttgtcatacgacatttactgca
actagtttttcttgtgttagttcagcagaaatagaaaatgataagagttatttaaaattt
tcaattactgatttatataatactcctaaaatttcaggaaatataagacttgatgatatg
aaagtcggctcttttttttacttgttatttcaatcaaaggaatatataaatggattgatt
aatatgaatttaaattttaaaggatatttaaattctcctaaattttatgggatgattcaa
tttaaaaattgtgattttaatcaatctaatttcccttttgttgtgcaagatgttttttta
caaattaatttttttggaaattatgcgatattgaatggagtaatacagacagaacatgga
ggacaattatatttagatggaaaattaaatagtttgaattcttttaaaaatattcattta
gtgttaaatataaaaggagagcaaattaatgtgcgcatttcttctccatcattgtatgcc
aaaatttctactaatttgatttgtaaaataactacaaagggtattgatttaacaggtcgt
atagatgtaccttgggctaaaattgaatttcaagaattttcaaggaatgcaatagaaatt
tcttcagaagaaattttattagatagtagttgtttacgtcctactttagtgaataagtct
aaaaatttcggcatatttactatttctagtatttttatacatttaggtcatgatgtacat
tttaatggtttaggtttatatactaagttgcaaggtgatttggaaatttcttatactaat
aatagtaatgatttgttggtattaggtcatgttaaaatgttatctggttattttaaagca
tatggtataaatttgataataaaacaaggacaagtgttattttctggagcagttaatcaa
gcatatcttgatattgaagctgttaaaagtgcttcttttatattaaattcaaaagatcct
gttactgtgggtattcatattactggtgttgtggatcagttaaaattagaatttttatct
aactcagtattattatctcagcaagaaatagcgtcttatttgctgggagaatataataca
actttatctaaattgaatactattggtaataataccataacatcattgttaataggaatg
ggtatagaacggtatgaaaaatttatagggaaaattggtagagttttaggagttcaagat
ttaacaataaatacgcaagattttattggtggtggatataccaaatcatctgtggtagct
ttaagcgggtatatagctcctggattacaaattaaatatgggattagtattgttgattta
cttacaacagtaacagtaaggtattgtataaatcatcagttatatttggaagctacgtct
agaggacatgatcaagcgttagatttattatataaatttaattttggttaa
DBGET
integrated database retrieval system