Candidatus Blochmanniella vafra: BVAF_271
Help
Entry
BVAF_271 CDS
T01398
Symbol
recB
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V, beta subunit
KO
K03582
exodeoxyribonuclease V beta subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
bva
Candidatus Blochmanniella vafra
Pathway
bva03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bva00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
BVAF_271 (recB)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bva03400
]
BVAF_271 (recB)
Enzymes [BR:
bva01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
BVAF_271 (recB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
bva03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
BVAF_271 (recB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
Nop5_56-rel_N_Arc
AAA_11
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADV33669
UniProt:
E8Q653
LinkDB
All DBs
Position
complement(299266..302880)
Genome browser
AA seq
1204 aa
AA seq
DB search
MQDLNIFHLPLNKIRLIEASAGTGKTYSLIILYLRLLLNLHSNQSIYSTPLTVKEILVVT
FTNSAAYDLRKRIKESIQQFRWDCMNKYSNNYIFSKLLLQIRNIDLAITLLFKAEKEIYE
ASIFTIHGFCQKILTENTLELNIPFHTSIIEDELTLYRQICFDFWRRHFYELPLNITSFI
QEFWNNPEELLQNLRPYIGYHNNSKIQNPKFFNQLNKYISEFYNQILFDINNIKKQWVKT
TNNLTKIINNMPNFNRKIYNKKNLAQWINIINQWCEQPTLNHVTPNALKRFRLSILNSSN
NLNEVNVFSLFNSIDQLFQKFTSFKFIILNSALKDIQNNLNVLIYSKSQITFNNIITILL
KNGIENTQNNLTKKILKYYPITIIDEFQDTDFSQYKIFHKLYSHSLKNGLILLGDPKQAI
YGFRGADIFTYMKIRQNLSYKYHLNINWRSSPGMVNAINHLFQSTTNPFKFKDISFIPTQ
AAYKNNRHKLMIHNIPQSAMCFWLYLDKCVTKNSYKTIMAQECAITLKKLIQNINDKKIW
LKTNTDKKTLQTSDITILVRNHLEASLIRLELLKINISTIFLSNRNNIFNTIEAYELLLL
LRAILFPKQETIYPALATIFFGLNAMQIVNVYNNTLKWDQIINEFSKYYFIWKNNSILSM
IQKIIFYYKIPKKLLSTPSGKYNLINILHLGELLNNISTQFNNEYELIIWLELKINQPLN
QYKKESMDYMVRSNRDDHNCIKISTIHKSKGLEFPLTFLPFAATSFNAKAQNTYITHFKY
QLNLKQHNLLHSDFDLLNEEHLSENLRLLYVAITRSIYHCSIGIAPIVRNRSQNSFNELT
DFHRSALGYLIQNNTPNTLKSIKQYLQQLSIRSNKDITFRIISKKNQQYTSNTTTKFVKK
PQLHLLSKIWQPSCMQIRNNSRQITSYSNLKFINNKVAVNVSKLSNFNLEELYQINLNSK
FTKESSKLNLLTTHTFPKGQIYGTFFHNLLKVIIFKQTIDMQWLKIQMERYNVHLNWKTL
IHQWIYTIKHTPINHHNLTLSKIRSSNIQTEMKFSLSIKNCLTAQKLDSLCKFYDELSSK
TACITFPDILGMLQGFIDVVFYWNKKYYLLDYKTNWLGSNNFYYNYSSMQAAMIKYRYEL
QYQLYTIAIHRFLKHKIVSYNYEKDFGGIYYLFIRGMNGISHKNGIFFHRPSWDFIHKLN
NLIS
NT seq
3615 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagacttaaacatattccatttacccttaaacaaaattagattaattgaagcatcc
gctggaactggtaaaacatatagtttaataatactctatcttagattattgttaaactta
catagcaatcaatcaatttattcaactccattgacagtcaaagaaattcttgttgtaacc
tttactaacagtgcagcatacgatttacgcaaacgaatcaaagaaagcattcaacaattt
cgatgggattgtatgaataaatatagtaataattatatattttctaaattattgttacaa
atacgtaatatagatcttgctattaccctattatttaaagcagaaaaagaaatatatgaa
gcatcaatctttaccattcatggcttttgtcaaaaaattttaacagaaaataccctagaa
ttaaatattccatttcatacatccattatagaagatgaattaacgctatatcgtcaaata
tgtttcgatttttggagacgtcatttttatgaattaccattgaatataactagttttatt
caagaattttggaataatccagaagaattattacaaaatttacgtccatatattgggtat
cataacaattctaaaattcaaaaccctaaattttttaatcaactaaataagtatatttct
gaattttataatcaaatactttttgatattaataatattaaaaaacaatgggtaaaaact
acaaataatttaactaaaattattaataacatgccaaattttaatcgtaaaatatacaac
aaaaaaaatttggcacaatggattaatataattaatcaatggtgcgaacaacccactctt
aatcacgtgacacccaacgcccttaaacgttttcgattatccatattgaattctagtaat
aacctcaacgaggttaacgttttttctttatttaattcaatagatcaactatttcaaaaa
ttcacatcatttaaatttataatattaaattcggctcttaaagatattcaaaataatttg
aatgtccttatttattctaaatctcaaataaccttcaataatattataacaattttatta
aaaaatggaattgaaaatacacaaaacaatttaactaaaaaaatactcaaatattatcca
attacaataattgatgaatttcaagacaccgactttagtcaatataaaatatttcataaa
ttatattctcattctttaaaaaatggattgattttactaggagatcctaaacaagctatc
tatggatttcgaggagctgatatatttacgtatatgaaaatacgacaaaatctgtcttat
aaatatcatctaaatattaattggcggtcatcacctggtatggtaaatgctatcaatcac
ttatttcaatcaactactaatccttttaaatttaaagatatctcatttattccaacacaa
gctgcctataaaaataatagacataaacttatgatacataacataccacaatcagctatg
tgtttttggttatacttagataaatgtgttactaaaaatagttataaaacaatcatggca
caagaatgtgctataactttaaaaaaattaatacaaaatataaatgataaaaaaatttgg
ctcaaaaccaatactgataaaaaaactcttcaaacctcagatattaccattttagttaga
aatcatttagaagcttccttaattcgactggaattattaaaaattaatatatctaccata
tttttatctaaccgaaacaatatttttaacactatagaagcgtatgaattactattatta
ctacgagctattttatttccaaaacaagaaacaatttatcccgcacttgcaactattttt
tttggattaaacgcaatgcaaattgtaaacgtttataataatacattaaaatgggatcaa
ataattaacgaattttctaaatattactttatttggaaaaataatagtatactttctatg
attcaaaaaataattttttattacaaaattccgaaaaaattactatctacaccatcggga
aaatataatctaattaatattttgcatttgggggaattattaaataatatttccacacaa
tttaataatgaatacgaattaataatatggttagaactaaaaataaatcagcctttaaat
caatataaaaaagaatctatggattatatggtacggtctaacagggatgatcacaattgt
ataaaaattagcactatacataaatctaaaggcttagagtttccattaacatttttacca
tttgcagcaacaagctttaatgccaaggcacaaaacacttatattactcatttcaaatat
caattaaatttaaaacaacataatctactacactctgactttgacttgttaaatgaagaa
catttatcagaaaatttaagattattatatgtcgctataacacgtagtatttatcattgt
tctataggtatagcaccaattgtgcgtaatcgtagccaaaactcattcaatgaattaact
gattttcatcgcagcgctttaggatacttaattcaaaataatacacccaatactttaaaa
tcgataaagcaatacttacaacaactcagtatacgttctaataaagatattacttttcgc
atcatttcgaaaaaaaaccaacaatatacatctaacacaacaacaaaatttgttaaaaaa
ccccaactacatttactttctaagatatggcaaccctcatgtatgcaaatacgtaacaac
tcacgacaaataacaagttatagtaatttaaaatttattaacaataaggttgctgttaat
gtttctaaattatcaaattttaatcttgaagaattatatcaaattaatttaaattctaag
tttacaaaagaatcttctaaattaaatttattaacaacccatacatttcccaaggggcaa
atatatggtactttttttcataatcttctcaaagttataatttttaaacaaactatagat
atgcaatggttaaaaatccaaatggaacgatataatgttcatttaaattggaaaacgtta
attcatcaatggatttatactattaaacatactccaattaatcatcataatttaactctt
tctaaaattcgttcctcgaacatacaaactgaaatgaaatttagcttatctatcaaaaat
tgtttaacagcacaaaaattagattctctatgcaaattctatgacgaattatcctcaaaa
actgcatgtattacttttccagacatccttggaatgttacaaggctttattgatgtagta
ttttattggaataaaaaatactatttattagattataaaactaattggttaggatcaaat
aatttttattataactactcttctatgcaagcagctatgattaaatatcgttatgaatta
cagtatcaactttataccatagccatacacaggtttttaaaacataaaatagtctcatat
aattatgaaaaagattttggagggatttattacttatttataagaggtatgaatggtatc
tcacataaaaatggcattttctttcatcgaccatcctgggatttcatacacaaattaaat
aatcttatttcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
