Candidatus Blochmanniella vafra: BVAF_289
Help
Entry
BVAF_289 CDS
T01398
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
bva
Candidatus Blochmanniella vafra
Pathway
bva03030
DNA replication
bva03430
Mismatch repair
bva03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bva00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
BVAF_289 (dnaE)
03430 Mismatch repair
BVAF_289 (dnaE)
03440 Homologous recombination
BVAF_289 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
bva03032
]
BVAF_289 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
bva03400
]
BVAF_289 (dnaE)
Enzymes [BR:
bva01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
BVAF_289 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
bva03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
BVAF_289 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
bva03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
BVAF_289 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
DNA_pol_IIIA_C
tRNA_anti-codon
tRNA_anti_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADV33687
UniProt:
E8Q6U0
LinkDB
All DBs
Position
320135..323644
Genome browser
AA seq
1169 aa
AA seq
DB search
MVHPNFIHLHTRSDYSMIDSIAKVNELLEKAKLFNMPALALTDFTNLFGLIKFHNYSYEL
GIKPITGSDFCIQDSSSDNIDFHEITCLVINSQGYQNLIQLISKAYKYKSNTSFPVIKMS
WLQEYNKGLILLSGGRNGDIGQYLLKDKKNKIDERLSFYNNYFPNRYYIELIRTGREYEE
LYLQLAIELSKIKGLPVVATNDIRFINEKDFLAHEIRVAIHDGVVVDKIQQLNKYSKQQF
MKNAQDMCLLFKDVPESLTNTVEIAQRCNCIINLNGSFLPKFPTGSISIENFLIKFAQKG
LEKRLLHLFPDDKKRYINRKPYDERLSHELHVIIQMGFPGYFLIVMEFIQWAKNNKIPVG
PGRGSGASSLVAYVLTITELDPIKFDLLFERFLNPERISMPDLDIDFCMEHRDLVIDHVV
KTYGSCAVAQIITFGTMAAKAVIRDVGRALGYPYTFINSIAKLIPSKIGITLSQSYATDS
QLKLMYDNNEEIKKLIDLSLQLEGLIRNVSKHAGGVVIAPSKITDFSPLYYDSDHTHPMT
QFDKNDIERIGLIKFDFLGLRTLTVIDRSLKMINNLRLKSCLSIIDINQISLNDQESFDV
LQTSKTTGIFQLESRGIKALIKRLKPDCFEDLIALIALFRPGPLQSGMVDNFINRKHGYE
AIYYPDSQWEHKSLRPVLKSTYGIILYQEQVMQIAQVLAGYTPGKADILRRAIGKKKPED
MAKQRSIFIDGAVRNGIDKILSKKIFDLMEKFAGYGFNKSHSVAYALLSYQTLWLKTHYP
AEFMASTLNSDMDNLNRTINLLNECKRIGLKIHPPDINNSQYYFCVNKKKEIVYGIGAIK
GIGKTSIDEIVKSRNCHGEFKGLFDFCVRIENLKINFRMVEKLIFSGAFDSFKTHRSKLL
STLKDTINNATQYINKKNSKQTDMFETYINTQVTEYNVLNMSCMTSTKWNNQILLEKEKE
TVGLYLTNHPVDQYIDEIEQYILNINKIKDVFRKKNNEMVCIFGLLSSVRIKLSKKGNYI
LFGILEDKDDQVEIVVFSKLLKKYHYCLKENNLIFIEGILNYDEILDIYKIIVHEIQDIN
DLRKRHVCNLSVLLHNKYCNKKLLHDIYNVFKKNQLTGGIPVYFLYQVDGIQVKLRCHKK
WNVILTDQLLTDLRDLVGYDQIVLELNSD
NT seq
3510 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtacatcctaattttattcatttacatacacgtagcgattactctatgattgatagt
attgctaaggtaaatgagttacttgaaaaagctaagttgtttaacatgccggcattagcg
ctgactgattttactaatttatttggacttattaaatttcacaattattcttatgaatta
ggtataaaaccaattactggttctgatttttgtattcaagattcatcatcagataatatt
gattttcatgaaattacgtgtttagtaattaatagtcaaggttatcaaaatttaattcaa
ttaatttcaaaagcttataaatataaatctaatacttcttttcctgttattaaaatgtcc
tggttacaagaatataataaaggtttaattttgctatctggaggtcgtaacggagatatt
ggtcaatatttattaaaagataaaaaaaataaaatagacgaacgtttatctttttataat
aattattttcccaataggtattatattgaattaattagaactggtcgtgaatatgaagaa
ttatatttacaattagcaatagaactatcaaaaattaaaggattaccagtagtagccacg
aatgatatacgatttattaatgaaaaagattttttagcacatgaaattcgagttgctatt
catgacggggtagttgtggataaaattcagcaattgaataaatatagcaaacaacagttt
atgaaaaacgcacaagatatgtgtcttttatttaaagatgtaccagaatctttaacaaat
actgtagaaattgcgcaaagatgtaattgtattattaatttaaatgggtcttttttacca
aaatttcctactggctctatctctattgaaaattttcttattaaatttgctcaaaaagga
ttagaaaagcgtttattacatttgtttccagatgataaaaaacgttacattaataggaaa
ccatatgatgaaaggttaagtcatgaattacatgtcattattcaaatgggatttcctggt
tattttttaattgttatggagtttattcaatgggctaaaaataataaaattccggttggt
ccaggtagaggatctggtgctagttcattagtggcttatgttttaacaattactgaactt
gatccaattaagtttgatttattatttgaacgatttttaaatccagaacgtatatctatg
ccagatttagatattgatttttgtatggaacatcgggatttagtcattgatcatgttgtt
aagacttatgggtcatgcgctgtagctcaaattattacatttggaactatggcagcaaaa
gcggtaattcgtgatgttggcagagcattaggatatccttatacttttattaatagtata
gcaaagttaattccatctaagataggaataacattaagtcaatcttatgctacggattct
cagttaaaactgatgtacgataataatgaagagattaaaaaattaattgatttatctttg
caattagaagggcttattagaaatgttagcaaacatgcaggaggggtagttattgctcct
agtaaaattactgatttttccccgttatattatgatagtgatcatactcatcctatgact
caatttgataaaaatgatatagagcgaattgggttaataaaatttgatttccttgggtta
cgtactttaacagtaattgatcgatctttaaaaatgattaataatttaagattgaaatcc
tgtttatcaataattgatattaatcagatatcattaaatgatcaggaaagttttgatgta
ttacaaacttcaaaaacaactggcatatttcaattagaatcaagaggaataaaggcatta
attaaacgattaaaaccagattgttttgaagatttaatagctttaattgctttatttagg
ccaggtcctttgcaatcaggtatggtggataactttattaatcggaaacatggatatgaa
gccatatattatcccgattctcaatgggaacataaatctttacgtcctgtattaaagtcc
acttatgggattattttgtatcaagaacaagtaatgcaaattgctcaagttttagctgga
tatactcctggaaaggcagatatattaaggcgagctattggaaaaaaaaaacctgaagat
atggcaaagcaacgttctatttttattgatggagcagtacgtaatggcatagataaaata
ttatctaaaaaaatttttgatttaatggaaaaattcgcaggttatgggtttaataaatct
cattccgttgcatatgcgttactatcatatcaaacattatggttaaaaactcattatcct
gctgaatttatggcatctacattaaattcagatatggataatttaaatagaacaattaat
ttattaaacgagtgcaaaagaataggattaaaaatccatcccccagatatcaacaatagt
caatattatttttgtgtaaataaaaagaaagaaattgtttacggaattggggcgattaaa
ggtataggaaaaacatcaatagatgaaattgtcaaatctcgtaattgtcatggagaattt
aaaggattatttgatttttgtgttcgtattgaaaatttaaaaataaattttcgtatggtt
gaaaagttaattttttctggagcatttgattcatttaagacacatagatctaaattactg
tctacattaaaggatacaattaataacgcaactcaatatattaataaaaaaaatagcaaa
caaacagatatgtttgaaacatatataaatactcaagttactgaatataatgtattaaat
atgagttgtatgacatctacaaaatggaataatcaaattttattagaaaaagagaaagaa
actgtagggttatatttaactaatcaccctgttgatcaatatattgatgaaattgaacaa
tatatccttaatataaataaaataaaggatgtatttcgaaagaaaaataacgaaatggtt
tgtatttttggattactttcatctgtacgtataaaattaagtaaaaaaggtaactatata
ttatttgggatattagaagataaagatgatcaagtagaaatagttgtgttttcaaaatta
cttaaaaagtatcattactgtttgaaagaaaacaatttaatttttattgaaggtatttta
aattatgatgaaattctcgatatttataaaataattgtacacgaaattcaggatattaat
gatcttcgtaaacgtcatgtttgtaatttatctgttttattgcataataagtattgcaat
aaaaaattattacacgacatttataatgtttttaaaaaaaatcaacttaccgggggtatt
ccagtgtattttctatatcaagttgatggaatacaagttaaattacgctgtcataaaaaa
tggaatgttattttaactgatcaattattaactgatttacgtgatcttgttggatacgat
cagatcgtattagaattgaatagtgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
