Candidatus Blochmanniella vafra: BVAF_392
Help
Entry
BVAF_392 CDS
T01398
Symbol
oprC
Name
(GenBank) TonB-dependent copper receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
bva
Candidatus Blochmanniella vafra
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bva00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bva02000
]
BVAF_392 (oprC)
Transporters [BR:
bva02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
BVAF_392 (oprC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADV33785
UniProt:
E8Q691
LinkDB
All DBs
Position
complement(439596..441788)
Genome browser
AA seq
730 aa
AA seq
DB search
MILKYVSNDFLKSVIYFVLYIATCICILCITNNIYANDDYLSSGSLQHKTSSTLTCKKFP
PLFKDSKNNKVVTIIAEVNTSLISVSDSIKSLQHYSFITDSVDYLKNIPGFSMIRNGGTN
NNFVLRGITSSKIRILADSGEIIGACCSGMDPATAYIIPETFDILNIIKGPQTVLWGPVT
SGGILQFRRYHPHFNSPQIKTCSSMIVGSNDSIYRNIDSILGNKYGYIRLIGNCNYSGNY
YDGNNHPVHSAWYKWSADAILSFNFRSNTFIDINLGQGNSRVNYAVTGMDGLCFARESYG
FRIETPGINDVLNSIEIQSWYHHIHHIMIDSTVSFVKNLSSTLIPKQYYCCSTQCKTNVN
DVERSLWGSRGFITCQWENFQFYSGIDIQINQYRKNTQLMCDSKIHNYSLDSGIFNEFIF
NMLPNKKIIGGIRIEHSVVDIHDDCYAVYYRDVTYPAGFMRYEGVIYPEFLYYLGVGVCQ
RLPDYWELILNRFNDNIKSKNLIFQLKPEKTIQIDMGAHLKKTKIDGWITSYIGYIKDFI
CYKYNNNVDSNLIQDNIVDCMKNSNANICGTEMGVSYKLNDYWLGKSNISWAWGINKDNQ
CILPTIPPLEGKFTCQFKKQNYNLGILWRLVSSSQYIEKFLSTFCSYNFLFKKYTQDILH
TPGFGVISAYLAWRIPNYYTYTVGIDNILNKTYREHVNNFLNNYDVTQYNSKKLIYESGR
TWWIKAEIIL
NT seq
2193 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgatactgaaatatgtatctaatgattttttaaaaagcgtaatttattttgttttatat
atagcgacatgtatatgcattttatgcataactaataacatttacgccaatgatgattat
ttatcatctggttcattgcaacataaaacgtcttcaacgcttacttgtaaaaaatttcct
ccgttatttaaagatagtaaaaataacaaagttgttactatcattgctgaagtaaatact
tcattgatttctgtgtctgattctataaaatcattacaacattattcatttattactgat
tctgttgattatttgaaaaatataccaggattttctatgattcgtaatggggggactaat
aataattttgtattaagaggaataactagttccaaaatacgtattttagcggattctggt
gaaataattggagcttgttgttctggcatggatcctgctaccgcttatattattccggag
acttttgatattttaaatataattaaaggtcctcaaacggtgttatgggggccagtaact
tcaggaggtattttacaatttcggcgttatcatccccattttaattcaccacaaatcaaa
acttgtagtagtatgattgttggatcgaatgatagcatatatagaaatatagacagtata
ttaggtaacaaatatggctatattagattgataggtaattgtaattactctggaaattat
tatgatggcaataatcacccagtgcattctgcgtggtacaagtggagtgcagatgctatt
ttatcatttaattttagatctaatacatttatagatattaatttaggtcaagggaattct
agagtaaattatgcagttacaggtatggatggattatgttttgctagagaaagttatgga
tttagaatagaaaccccaggtattaatgatgttttaaattcaattgaaattcaatcctgg
tatcatcatatacatcatatcatgattgattctacggtatcttttgttaaaaatttatca
tcgacattgattccaaaacaatattattgttgttctactcaatgtaaaactaatgttaat
gatgtagaacggtctttatgggggtctcgaggctttattacatgtcaatgggaaaatttt
cagttttatagcggcattgatattcaaattaatcaatatagaaaaaatactcaattgatg
tgtgattctaaaatacataattattctttagattcaggaatatttaatgaatttattttt
aatatgttaccaaataaaaaaattatcggaggaattagaatagaacatagtgttgttgat
atacacgatgattgttatgctgtgtattatagagatgtgacatatccagctgggtttatg
agatatgaaggtgttatttatccggaatttttatattatcttggagtaggtgtatgtcaa
cgtttgcctgattattgggaattgatattaaataggtttaatgacaatataaaaagtaag
aatctaatttttcaattaaagcctgaaaaaactattcagatagatatgggggctcattta
aaaaaaacaaaaatagatggatggataacgtcttatatagggtatataaaagattttatt
tgttataaatataacaataatgttgatagtaatttgatacaggacaatattgttgattgt
atgaagaattcgaatgctaatatatgtgggactgaaatgggtgtaagttataaattaaat
gattattggcttggtaaaagtaatatatcatgggcttggggtataaataaggataatcaa
tgtatattacctactatccctcctttagaagggaaatttacatgtcaatttaaaaaacaa
aattataatttaggaatattatggagattggtctcatcatcgcaatatatagaaaagttt
ttatctactttttgttcctataattttttatttaaaaaatatacacaagatatattgcat
acgccaggttttggggtaatatccgcatatttagcatggagaattcctaattattataca
tatactgttggtattgataatattttgaataaaacttatagagaacatgtaaataatttt
ttaaataattatgatgtaactcaatataactcaaaaaaacttatttatgaatcaggtcga
acatggtggattaaagcagaaattatattataa
DBGET
integrated database retrieval system
