KEGG   Bombus vancouverensis nearcticus: 117154797
Entry
117154797         CDS       T07628                                 
Name
(RefSeq) Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein
  KO
K20190  Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein
Organism
bvan  Bombus vancouverensis nearcticus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:bvan00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:bvan04131]
    117154797
Membrane trafficking [BR:bvan04131]
 Endosome - Lysosome transport
  Others
   BLOC-2 complex
    117154797
SSDB
Motif
Pfam: HPS3_N HPS3_C
Other DBs
NCBI-GeneID: 117154797
NCBI-ProteinID: XP_033185970
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1173 aa
MVRVITVHNFLGQNITQIEEPTASCIANASGHEMLLLALSTHCVEVWELMISDIKLHTVF
PTVDMINQMVHCTKEDYVVTLESKLSRDASINNHTGKTINNFVRIYVNWAMVKDQSQPMR
ARIAGRVTPSLNRPLNSLEMIELPLNVQPTLIACCQSTGNLLVASGNSAILHEFKIETQQ
VSKMKFIDFEARPWSLGFSFSPTHMEIVEDFISIMDKTNLCVFRLTNSMYEDIDQLSSLT
STNSSSIDKTSISTDSSLVENSNNTTNQDDNTILQGINSKCKSSSQDLHFIVSENNDSSG
TSTKFKGRRHRSSKTSIWSKLETGDFRKIKSNNNDTVINLDHLVYNERDELQRLIDQEVI
DGYSQPLTINLPSISLERAGPGHALSPFVLNPSEIRIIIKTNSPDLGWSENYTIKNLLSL
KVMAANNKLDGSSELFSCSLLKPLYMRKECNTSCLKKSILRSDKYTYLQGVSCFLCTLQE
GYLYHFSATSSNPTDATCLTTYPFTAPVNHVALEHTALHALTEAGLESYTLRLSHHVARM
SNDIENVRVTCPSVSEPVCLIGLRPFLGIQKLLHSKNYLILLAKAENSWTLYSLILPKLE
NLYYDVLNAARSHKSSSPSTYRHLLGEAHALIRLAKDAVYNCSDINEFDDIANKNGLKLK
NLYNQSCALLGDYYIRSEYDSDWDFCIPYYKMSGLKPSEVLSRKSSQDAPGLVTFLTDIL
FTMKSGPEADALFQGFNIVEIICKLKKPDLLKLIFSSPVLREYTTEKLIHLLLLYETDEL
VKLALALLYIQAEKQEQAEKVLEPVSALCVKKIVLEHWDLLFDMTAMKKRSPMIPTFSDF
AGTLMRQKNSTFAEILIQLIEEDGILSLHQIIQVFLEYLPSRVGRDGHNAAMTLQVFLEK
YLHNYFSTKLIIDSSVINKNQIRTDFALVEAFKLLVRSYLGKLTQTKVYKIENKENVQEN
YDNFIFVKFRPHYLNGMPPYAKDYQKVLNVSDLKDLADIDKTDSEKTIPTELFKLQSVLS
CDFIPNECLYEVKQFLETQEIDGSLSLKALCIQNTEETTTLLMDNCPQAVMQYAKDMYTK
DSEWKYLIELTQNRIAVSNSRQELQCLYTQIMKAILNYLPHALSLKSLHRVLPKDDVITF
QKCSEMCNQIMHAEHVKSLIIETGQQLLSTLKL
NT seq 3522 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtgcgtgtaatcacagtacataattttctggggcaaaatatcactcaaattgaggag
ccaactgcaagctgtatagcaaatgcatctggacatgaaatgctactcctagcattgtca
actcattgcgtcgaagtttgggaattgatgatatctgatattaaactacatacggttttt
ccaacagttgatatgattaatcaaatggtgcactgtaccaaagaagattatgttgtaacg
ttagaatcaaaattatctagagatgcaagcattaataatcatacagggaaaacaattaat
aattttgttagaatttatgttaactgggctatggtaaaagatcaaagtcaacctatgcgt
gctagaatagctgggcgtgttactccaagtttaaatcgaccattgaatagcttagaaatg
atagagttgccattaaatgtgcaacctacactcattgcttgctgccaaagtactggcaac
ctcctagtggcttccggaaatagtgctattttacatgaatttaaaattgaaacacagcaa
gtatcaaagatgaagtttatagattttgaggctcgaccatggtccttgggcttttcattt
tctcctacacacatggaaattgttgaagattttatatcaattatggataaaacaaattta
tgtgtttttcgattgactaattcaatgtatgaagatattgatcaattgagttctctaact
tccacaaactcttcatctattgataaaacatctatatccactgattcctctcttgtggaa
aacagtaataatacgactaatcaagatgataacacaatattgcaaggaataaattcaaaa
tgtaaaagttctagtcaagatctgcactttattgtatcagaaaacaatgattctagtgga
acaagtacaaaatttaaaggtaggaggcatagaagttccaaaacaagtatatggagtaaa
ttggagacaggagatttcagaaaaataaaatctaataataatgacactgttataaatttg
gatcatttagtgtataatgaaagggatgaattacaaagattaattgatcaagaagttata
gatggatattcacaacccttgactataaatttaccatctataagtttggaaagagcagga
cctgggcatgcattaagtcctttcgtattaaacccatcagaaataaggattataattaaa
acgaattctcctgatttaggatggtcggaaaattatacaataaaaaatttattgtctctt
aaagtaatggcagctaataataaacttgatggaagttctgaactgttcagctgctcttta
ttgaagccattatacatgaggaaggagtgtaatacttcttgtttaaaaaaatcaatcctc
agatcagataaatatacatatttgcagggcgtaagttgcttcttatgcacactgcaagaa
ggatatctttatcatttctctgctactagctcaaatcctacagatgcaacttgtttaact
acttatccatttactgcacctgttaatcatgtagctttggagcatactgctttgcatgca
ttgactgaagctggtcttgaatcttacactctacgtttatctcatcatgttgctagaatg
tctaatgatatagaaaatgtaagagttacatgccctagtgtttctgagcctgtttgttta
ataggattaaggccatttctggggatacagaaattattacatagcaaaaattatctaatc
ctcttagccaaagcagaaaactcttggactttatattctttaattttacctaaattggag
aatttgtattacgatgttttaaacgcagcgaggagtcataaatcttctagtcctagcaca
taccgacatttgttaggggaagctcatgctttgatacgtttagctaaagacgctgtgtat
aattgctcagacattaatgaatttgatgatatcgcaaataaaaatggattgaaattgaag
aacttgtataatcaatcatgcgcgctgcttggagactattatattcgttccgaatatgac
tcagattgggatttctgtataccctattataaaatgtcgggtttaaaaccttcagaagta
ttatctaggaaatcgagtcaagatgcaccgggtctcgttacgtttttgactgatatactt
ttcacgatgaaaagtggtccggaagcagatgccttgttccaaggatttaatattgtagaa
ataatatgtaaattaaagaaaccagacttattgaaattgattttcagtagtcccgtatta
cgagaatatactacagaaaaactaatacatcttttgttattatatgaaacggacgaatta
gtcaagttagctttggcactcttatacatacaagctgaaaaacaagaacaagcagagaaa
gtacttgaaccagtctcagcattatgtgtcaagaaaatagttttagaacattgggacctg
ttgtttgatatgacggcgatgaaaaagagaagtccaatgattcctacgttttcagatttc
gctggaacgttaatgcgtcagaaaaattcaacctttgctgaaattctgatacaattaatc
gaagaggatggaatcctatctcttcatcaaattatacaggtgtttttagaatatttacca
tcaagagtaggacgagatgggcataatgcggcaatgacattacaagtatttctcgaaaaa
tatcttcacaactactttagtacaaaattgattatagattcgtctgttataaataaaaat
caaatacgtacggatttcgctttggttgaagcttttaagctattagtacgatcatactta
ggcaagttaacacaaacaaaagtgtacaaaatagaaaataaagaaaacgtacaagaaaat
tatgataacttcatatttgtgaagtttagacctcattatctaaacgggatgccaccgtat
gcgaaagattatcaaaaagttttgaatgtgagcgatctaaaagatttagctgatatcgat
aagactgactctgaaaaaactataccaacggaattgtttaaattacagtctgtattatct
tgtgattttataccaaatgagtgcttatatgaagttaagcaatttcttgaaacacaagag
attgatggcagtttatctttaaaagcgttgtgcattcaaaatactgaagaaacaacaaca
cttttaatggataattgtcctcaagctgttatgcaatatgcaaaggacatgtatactaaa
gattctgaatggaagtatttaattgagttaacgcaaaataggattgctgtatcgaactct
cgacaagaattgcagtgtttatacacgcaaattatgaaagcaattttgaattatctacca
catgcgttgtccttaaaaagtttacatcgtgttcttccaaaagatgatgtaataacattt
caaaaatgcagtgaaatgtgtaatcaaattatgcacgctgaacatgttaaatctttaata
atagaaactggacaacaacttttatcgactttaaaattgtga

DBGET integrated database retrieval system